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患有壞死性小腸結(jié)腸炎的早產(chǎn)兒腸道菌群分析

2023-08-13 17:15:31王英豪戴立英
山東醫(yī)藥 2023年18期
關(guān)鍵詞:厚壁菌門雙歧

王英豪,戴立英

1 蘇州大學(xué)附屬第二醫(yī)院兒科,江蘇蘇州 215008;2 安徽省兒童醫(yī)院新生兒科

壞死性小腸結(jié)腸炎(necrotizing enterocolitis,NEC)是新生兒期最常見的胃腸道急癥,主要見于早產(chǎn)兒,極低出生體質(zhì)量(<1 500 g)早產(chǎn)兒中發(fā)病率5%~10%[1]。NEC的病死率高達20%~30%[2-3]。NEC主要表現(xiàn)為不同程度腸壞死,以缺血性腸壞死為主要病理特征,治療不及時可并發(fā)腸外營養(yǎng)相關(guān)的膽汁淤積和肝功能障礙、營養(yǎng)不良、代謝性骨病、短腸綜合征、膿毒癥、嚴重感染和神經(jīng)認知障礙[4]。目前,NEC的確切病因仍未完全了解,研究普遍認為NEC的發(fā)病可能是多因素導(dǎo)致的,可能包括細菌定植異常、免疫不成熟、腸屏障功能不成熟、微血管發(fā)育不全等。健康的腸道環(huán)境可以有助于早產(chǎn)兒減少腸道炎癥和損傷。異常定植的細菌可導(dǎo)致早產(chǎn)兒腸道微生物群落紊亂。NEC早產(chǎn)兒的腸道菌群多樣性是否與正常新生兒不同,目前相關(guān)研究較少。為此,我們對患有NEC 早產(chǎn)兒的腸道菌群結(jié)構(gòu)進行分析,旨在為后續(xù)NEC的診療提供理論依據(jù)?,F(xiàn)將結(jié)果報告如下。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 選擇2020 年1 月—7 月安徽省兒童醫(yī)院收治的早產(chǎn)兒66 例,發(fā)生NEC 44 例(觀察組,其中觀察1 組22 例、觀察2 組22 例)、未發(fā)生NEC 22例(對照組)。觀察組納入標準:①符合NEC臨床診斷標準,Ⅰ期為“可疑”期,X 線片以胃潴留和輕度腹脹為特征;Ⅱ期為“腸梗阻”期,主要表現(xiàn)為腸梗阻、水腫、腸壁積氣征等;Ⅲ期為疾病的晚期,進展迅速惡化,易發(fā)生腸壞死、膿毒性休克、消化道出血,穿孔等嚴重并發(fā)癥;②明確診斷NEC Ⅱ或Ⅲ度的早產(chǎn)兒;③標本收集前后均不使用免疫制劑及微生物制劑。排除標準:排除腸閉鎖、巨結(jié)腸等腸道發(fā)育畸形患兒。對照組納入標準:①同期在安徽省兒童醫(yī)院住院的早產(chǎn)兒;②對照組的日齡、胎齡、出生體質(zhì)量、喂養(yǎng)方式、出生方式等臨床特征與NEC 組基本匹配,避免引起潛在NEC 及菌群失調(diào)的因素;③標本收集前后均不使用免疫制劑及微生態(tài)制劑。排除標準:排除腸閉鎖、巨結(jié)腸等腸道發(fā)育畸形患兒。觀察組中男10 例、女12 例,出生胎齡(35 ± 2)周,出生體質(zhì)量(2 274 ± 236)g;剖宮產(chǎn)率41%(9/22),母乳喂養(yǎng)率36%(8/22);對照組中男10例、女12例,出生胎齡(35 ± 3)周,出生體質(zhì)量(2 358 ± 227)g,剖宮產(chǎn)率41%(9/22),母乳喂養(yǎng)率36%(8/22)。 本研究已通過安徽省兒童醫(yī)院倫理委員會批準(EYLL-2017-023),并獲得患兒父母或監(jiān)護人書面知情同意。觀察組采取禁食、抗感染、維持內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定、支持治療等綜合管理;對照組針對原發(fā)病進行對癥治療、抗感染、維持內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定、支持治療等綜合管理。

1.2 三組患兒腸道菌群檢測 觀察1 組在診斷NEC 24 h 內(nèi)、對照組于入院24 h 內(nèi)收集糞便標本,觀察2 組在治療后(NEC 臨床癥狀明顯好轉(zhuǎn),全量喂養(yǎng)時)采用一次性無菌糞便采集管從患兒尿布上收集糞便標本。采用16S rRNA 基因高通量測序技術(shù)檢測三組患兒糞便腸道菌群DNA,明確腸道菌群種類,測算三組腸道菌群多樣性指數(shù)(Shannon 指數(shù)、Sobs 指數(shù)、Simpson 指數(shù)及Chao 值)。① 糞便DNA提?。杭S便DNA 的提取采用試劑盒的方法,所用試劑盒為德國QIAGEN 公司生產(chǎn)的QIAamp Stool Mini Kit。完成基因組DNA 提取后,采用1%瓊脂凝膠電泳檢測抽取的基因組DNA。② PCR 擴增:指定測序區(qū)域,合成含有barcode 的特異引物。用于16S rRNA V3 區(qū) PCR 擴增的引物:338F:(5’-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3’),806R:(5’-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3')。③ Miseq 測序及生物信息分析:Miseq 測序得到的PE reads 首先根據(jù)overlap 關(guān)系進行拼接,同時對序列質(zhì)量進行質(zhì)控和過濾,區(qū)分樣本后進行OUT 聚類分析和物種分類學(xué)分析,基于OUT 聚類分析結(jié)果,可以對OUT 進行多種多樣性指數(shù)分析以及對測序深度的檢測;基于分類學(xué)信息,利用Circos 軟件測算每組樣本的物種組成比例。

1.3 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS 22.0 統(tǒng)計軟件進行數(shù)據(jù)處理。正態(tài)分布計量資料以±s表示,組間比較采用獨立樣本t檢驗;計數(shù)資料以%表示,組間或細菌種屬者統(tǒng)計學(xué)差異采用Mann-Whitney 檢驗。P<0.05為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 三組患兒腸道菌群類型比較 觀察1 組和對照組共有63 種菌群種類,獨有菌群種類分別為27、23 種。觀察2 組和對照組共有67 種相同菌群種類,獨有菌群種類分別為23、23 種。觀察1 組患兒腸道菌群的優(yōu)勢菌群主要為腸球菌(40%)、厚壁菌門(21%)、變形菌門(23%)、雙歧桿菌(10%);觀察2 組患兒腸道菌群的優(yōu)勢菌群主要為大腸桿菌(28%)、腸球菌(21%)、雙歧桿菌(28%)、厚壁菌門(8%)、變形菌門(5%);對照組腸道菌群的優(yōu)勢菌群主要為大腸桿菌(42%)、腸球菌(25%)、雙歧桿菌(30%)、厚壁菌門(2%)。觀察1 組與對照組患兒腸道菌群種類構(gòu)成比較,P<0.05;觀察1 組與觀察2 組患兒腸道菌群種類構(gòu)成比較,P<0.05。

2.2 三組患兒腸道菌群多樣性比較 觀察1 組、觀察2 組及對照組患兒腸道菌群Shannon 指數(shù)分別為0.93 ± 0.50、0.91 ± 0.51、1.10 ± 0.34;Sobs 指數(shù)分別為19.36 ± 7.08、21.23 ± 6.43、21.96 ± 4.76;Simpson 指數(shù)分別為0.51 ± 0.26、21.23 ± 6.43、0.46 ± 0.16;Chao 值分別為22.16 ± 7.62、24.25 ±7.10、25.44 ± 6.97。三組腸道菌群多樣性指數(shù)間比較,P均>0.05。

3 討論

NEC 是一種危及生命的消化系統(tǒng)疾病,常發(fā)生于早產(chǎn)兒,以腸缺血壞死為特征,除了發(fā)病率和病死率較高,腸狹窄粘連、膽汁淤積、短腸綜合征、發(fā)育不良和神經(jīng)發(fā)育遲緩等長期并發(fā)癥發(fā)病率較高。腸道微生物群落擁有數(shù)千種細菌,它們在維持體內(nèi)微生物平衡方面起著至關(guān)重要的作用,NEC 作為一種典型的腸道感染性疾病,腸道微生物菌群失調(diào)參與NEC 的發(fā)病機制[5]。PATEL 等[6]研究表明正常菌群可在上皮細胞表面的生長繁殖形成生物屏障,優(yōu)先占領(lǐng)生存空間,抑制外來致病菌的定植,當(dāng)腸道菌群正常的定植過程遭到破壞或延遲,將導(dǎo)致菌群結(jié)果發(fā)生改變,使正常菌群與宿主間的生態(tài)平衡失調(diào),一些正常菌群成為機會致病菌,觸發(fā)炎癥反應(yīng),導(dǎo)致NEC的發(fā)生。

雖然腸道微生物菌群對NEC 的發(fā)展至關(guān)重要,但它們在其發(fā)病機制中的確切作用仍不清楚[7]。在過去的幾十年里,高通量測序已經(jīng)成為評估糞便和其他人體基質(zhì)中微生物群落的一種非常流行的方法[8],最常見的是通過對細菌16S rRNA 基因進行測序,使研究人員能夠獲得腸道內(nèi)微生物多樣性信息,以幫助識別與疾病相關(guān)的微生物組變化。在本研究中我們使用高通量測序技術(shù),針對16S rRNA 基因的v3~v5 區(qū)發(fā)現(xiàn)觀察組治療前后和對照組菌群豐度無明顯差異,且NEC 組和對照組之間的Shannon 指數(shù)和Chao1 指數(shù)沒有顯著差異,表明菌群多樣性的缺乏并非NEC 發(fā)生的關(guān)鍵因素,與DOLLINGS 等[9]研究一致。同時通過本研究測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)觀察組治療前后和對照組菌群種類存在顯著差異,其中觀察組(治療前)以腸球菌、厚壁菌門、變形菌門為主,而觀察組(治療后)和對照組以腸球菌、雙歧桿菌為主,提示厚壁菌門及變形菌門優(yōu)勢,且雙歧桿菌減少可能導(dǎo)致NEC發(fā)生。 LINDBERG 等[4]對5例NEC患兒和5 例匹配對照患兒糞便樣本進行16S rRNA 基因測序分析,發(fā)現(xiàn)NEC 患兒中變形桿菌豐度較高,雙歧桿菌豐富較低,與本研究一致。STEWART 等[10]采用16S rRNA 基因測序技術(shù)對13 例NEC 患兒術(shù)后切除腸段和16 例自發(fā)性穿孔術(shù)后切除腸段對比研究發(fā)現(xiàn),NEC 患兒切除腸段中變形桿菌及厚壁菌門相對豐度較高,且微生物多樣性較低。有研究表明胎齡越小NEC 發(fā)病率越高[11],確診時的中位胎齡往往隨著胎齡的增加而減少,提示在發(fā)育中的腸道中,微生物定植和微生物識別受體的表達水平之間的聯(lián)合作用可能對NEC 的發(fā)生很重要。在對動物模型和手術(shù)切除的早產(chǎn)兒腸道研究表明,變形桿菌在腸道中通過識別G-脂多糖并激活TLR-4 后,可通過誘導(dǎo)微生物相關(guān)分子模式(microbe-associated molecular patterns, MAMPs)激活特定的TLRs,開啟特異性免疫反應(yīng),通過激活轉(zhuǎn)錄因子NF-κβ 啟動炎癥級聯(lián)反應(yīng),反過來引起腸上皮細胞凋亡和炎癥因子(IL-1、IL-6、TNF-α)過度釋放,更容易引起細胞因子介導(dǎo)的腸系膜血管炎癥,破壞腸道免疫功能,造成腸組織局部缺血壞死,被認為是NEC發(fā)病的關(guān)鍵[12-13]。

本研究中經(jīng)治療后的NEC 患兒和非NEC 患兒雙歧桿菌豐度較高,提示雙歧桿菌豐度較高的早產(chǎn)兒不容易發(fā)生NEC[14-15]。腸道微生態(tài)失調(diào)作為NEC發(fā)展的高危因素,使得益生菌作為單菌株或多菌株活微生物補充劑在早產(chǎn)和足月新生兒中進行了大量研究,其中以雙歧桿菌和乳酸桿菌是最為常見。LUESCHOW 等[16]一項對小鼠NEC 模型研究表明雙歧桿菌可通過減少炎癥細胞因子釋放,降低腸上皮細胞通透性和增強腸上皮細胞中的緊密連接,改善腸道上皮屏障來預(yù)防NEC 的發(fā)生。另外一項動物觀察表明在妊娠和哺乳期間,小鼠通過母體給予嗜酸乳桿菌和雙歧桿菌可促進腸道發(fā)育,改善腸道屏障功能,減少斷奶前炎癥反應(yīng)[17]。李忠堂等[18]以87 例NEC 早產(chǎn)兒為研究對象,分析其病原體特點,觀察不同治療方法對患兒血清炎癥因子的影響,并通過Logistic 回歸分析影響NEC 患兒預(yù)后的危險因素,發(fā)現(xiàn)雙歧桿菌干預(yù)可顯著降低NEC 早產(chǎn)兒血清IL-1β、IL-10 水平及TLR-4 表達。楊小慶等[19]對220 例早產(chǎn)兒隨機接受雙歧桿菌補充研究指出,接受雙歧桿菌補充早產(chǎn)兒胃潴留、腹脹及NEC 發(fā)生率均較未補充早產(chǎn)兒低。HAGEN 等[20]一項多中心對照試驗發(fā)現(xiàn)出生后第一個月單獨給予雙歧桿菌的早產(chǎn)兒NEC發(fā)生率明顯降低。

綜上所述,NEC 患兒與正常早產(chǎn)兒的腸道菌群種類構(gòu)成沒有差異。與正常早產(chǎn)兒比較,NEC 患兒腸道菌群厚壁菌門及變形菌門的豐度增加,雙歧桿菌豐度減少。腸道菌群多樣性可能不是NEC 發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵,補充外源性雙歧桿菌可能有效減少早產(chǎn)兒NEC的發(fā)生。

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