李成,莫雪,牛文霞,李明明,付麗娟,,3
1.湖北省孝感市中心醫(yī)院,湖北孝感 432000;2.廈門大學(xué)附屬翔安醫(yī)院感染科,福建廈門 361000;3.廈門市感染性疾病質(zhì)量控制中心,福建廈門 361000
慢性乙型肝炎是乙型肝炎病毒持續(xù)感染引起的以肝臟慢性炎癥性改變?yōu)橹饕卣鞯囊活悅魅静?。長期慢性感染會導(dǎo)致肝纖維化、肝硬化、肝癌等終末期肝病的發(fā)生,嚴(yán)重危害人民群眾的健康。慢性乙型肝炎病毒感染依然是全球公共衛(wèi)生健康問題之一。據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計,全球約有20 億人曾經(jīng)感染過HBV,近2.57 億人為慢性感染者,其中每年約78 萬人死于HBV 相關(guān)肝病及其并發(fā)癥,嚴(yán)重威脅人類健康[1]。接種乙肝疫苗是預(yù)防乙肝病毒感染最有效的途徑。乙肝疫苗在我國廣泛接種使得新發(fā)感染率逐年下降,我國現(xiàn)在屬于HBV 中度流行區(qū)的國家,目前我國有7 400 萬人為HBV 攜帶者[2]。
當(dāng)前臨床上使用的抗乙肝病毒治療藥物主要為聚乙二醇化干擾素α(polyethylene glycol interferon, PEG-IFNα)和核苷(酸)類似物[nucleos(t)ide analogues, NAs][3]。雖然這兩類藥物均能有效抑制HBV 復(fù)制,阻止炎癥進展和改善預(yù)后。但兩者都不能影響最初形成的共價閉合環(huán)狀DNA(covalently closed circular DNA, cccDNA),同時對感染肝細(xì)胞核內(nèi)現(xiàn)存的cccDNA 沒有清除作用,也不能對整合到肝細(xì)胞染色體上的病毒基因起到清除作用。因此,患者往往需要長期使用抗乙肝病毒藥物治療來抑制病毒復(fù)制。目前臨床上使用的抗病毒治療方案都無法徹底地清除感染肝細(xì)胞核內(nèi)cccDNA,難以實現(xiàn)慢性乙型肝炎的完全治愈[4]。為了達到徹底治愈HBV 感染的目標(biāo),關(guān)鍵在于可以靶向根除感染肝細(xì)胞核內(nèi)cccDNA 的抗病毒治療策略[5]。本文對HBV cccDNA 清除的研究進展進行綜述,旨在尋找徹底清除cccDNA 的方法。
感染肝細(xì)胞核內(nèi)的cccDNA 是HBV 感染肝細(xì)胞后由雙鏈環(huán)狀不完全閉合DNA(relaxed circular DNA, rcDNA)在核內(nèi)利用細(xì)胞的DNA 損傷修復(fù)機制轉(zhuǎn)化形成的。病毒以cccDNA 為模板轉(zhuǎn)錄合成所有的RNA 和子代病毒基因組。具有超螺旋結(jié)構(gòu)的cccDNA 與細(xì)胞組蛋白、非組蛋白等結(jié)合形成微染色體穩(wěn)定存在于被感染肝細(xì)胞核內(nèi),加之目前缺乏直接靶向cccDNA 的抗病毒治療藥物,使得HBV 能長期存在于乙肝患者肝臟內(nèi)并導(dǎo)致慢性感染。因此,研究HBV cccDNA 的形成機制和HBV 與宿主相互作用對于研發(fā)清除cccDNA 藥物、治愈慢性乙型肝炎具有重大意義。
研究表明進入肝細(xì)胞核內(nèi)的rcDNA 轉(zhuǎn)化形成cccDNA 的過程至少包括負(fù)鏈5’端病毒聚合酶、負(fù)鏈5’端和3’端的冗余片段、正鏈5’端的RNA 引物的去除和正鏈3’端缺口及雙鏈間隙的填補[6]。在此過程中,酪氨酰-DNA-磷酸二酯酶2(tyrosyl-DNA-phosphodiesterase 2, TDP2)[7]參與去除rcDNA負(fù)鏈5’端共價連接病毒聚合酶的過程,促進rcDNA向cccDNA 的轉(zhuǎn)化。然而,在另一項研究中發(fā)現(xiàn)TDP2 并不是體內(nèi)cccDNA 形成過程中不可或缺的宿主DNA 修復(fù)酶[8]。Flap 核酸內(nèi)切酶1(flap endonuclease 1, FEN1)[9]結(jié)合并切割rcDNA 負(fù)鏈5’端的冗余片段促使rcDNA 向cccDNA 的轉(zhuǎn)化。DNA 聚合酶κ、α、DNA 連接酶(DNA ligases, LIG)參與cccDNA形成過程中DNA 缺口的修復(fù)[10-12],其中細(xì)胞內(nèi)cccDNA 擴增需要DNA 聚合酶α、δ 和ε 的參與,HBV從頭感染過程中需要DNA 聚合酶κ 和λ 的參與。此外,研究發(fā)現(xiàn)DNA 拓?fù)洚悩?gòu)酶、共濟失調(diào)毛細(xì)血管擴張與RAD3 相關(guān)(ataxia telangiectasia and RAD3-related, ATR)途徑也參與了cccDNA 形成過程中rcDNA 的損傷修復(fù)[13-14]。
最近一項由rcDNA 底物經(jīng)過酵母和人肝癌細(xì)胞提取物及純化人蛋白修復(fù)形成cccDNA 的實驗篩選確定了rcDNA 修復(fù)形成cccDNA 過程中的5 個關(guān)鍵宿主因子:增殖細(xì)胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen, PCNA)、復(fù)制因子C 復(fù)合物(replication factor C complex, RFC)、POLδ、FEN1 和LIG1[15]。rcDNA 向cccDNA 轉(zhuǎn)化過程中正鏈和負(fù)鏈缺口修復(fù)所需要的宿主因子不完全相同[16],其中正鏈缺口修復(fù)需要PCNA、RFC、POLδ、FEN1 和LIG1 這5 個宿主因子的參與,而負(fù)鏈的修復(fù)只需要FEN1 和LIG1 的參與。這對于全面了解rcDNA 是如何轉(zhuǎn)化形成cccDNA 的過程及研發(fā)新的靶向藥物至關(guān)重要。
脫蛋白的松弛環(huán)狀DNA(deproteinized relaxed circular DNA, DP-rcDNA)是rcDNA 轉(zhuǎn)變形成cccDNA 過程中重要中間產(chǎn)物。通過HBeAg 的比例表達來監(jiān)測cccDNA 水平的細(xì)胞篩選策略研究發(fā)現(xiàn)兩種結(jié)構(gòu)相關(guān)的雙取代磺酰胺(disubstituted sulfonamides, DSS)(CCC-0975 和CCC-0346),DSS 化合物通過降低HepDES19 細(xì)胞中DP-rcDNA 的水平抑制rcDNA 向cccDNA 的轉(zhuǎn)化來減少cccDNA 的生物合成[17]。DSS 化合物有望成為臨床治療HBV 的新型藥物。一項對包含大約1 000 個參與DNA 損傷反應(yīng)、表觀遺傳和核酸結(jié)合途徑的基因文庫進行siRNA 篩選研究確定了剪接體成分前mRNA 加工因子31(pre-mRNA processing factor 31, PRPF31)參與cccDNA 的形成[18]。該研究表明PRPF31 與HBx 共定位于細(xì)胞核內(nèi),只有當(dāng)PRPF31-HBx 共同過表達時cccDNA 的形成才會顯著增加。PRPF31-HBx 復(fù)合物如何促進cccDNA 形成機制有待進一步研究。抑制PRPF31 與HBx 之間的相互作用可以作為抗HBV 治療的新靶點。
肝細(xì)胞核內(nèi)的cccDNA 并不都是以簡單的超螺旋結(jié)構(gòu)游離形式存在,部分與組蛋白、非組蛋白等結(jié)合形成微染色體結(jié)構(gòu)。因此cccDNA 的轉(zhuǎn)錄受到微染色體上組蛋白及非組蛋白的化學(xué)修飾調(diào)控作用的影響,其中包括DNA 甲基化、組蛋白及非編碼RNA 修飾。HBV cccDNA 包含3 個CpG 島,該區(qū)域的甲基化狀態(tài)可以參與調(diào)控HBV 復(fù)制和轉(zhuǎn)錄,這為CpG 甲基化在調(diào)節(jié)HBV cccDNA 轉(zhuǎn)錄功能提供了新的見解[19]。此外,組蛋白甲基化、乙?;刃揎椧矃⑴c調(diào)節(jié)cccDNA 的轉(zhuǎn)錄過程。陳娟等[6]通過篩選并確定了沉默交配類型信息調(diào)控2 同源物3(silent mating type information regulation 2 homolog 3, SIRT3)可以通過與組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶協(xié)同作用來限制cccDNA 轉(zhuǎn)錄所需要的宿主因子而起到沉默cccDNA 轉(zhuǎn)錄的作用[20]。這為SIRT3 將來被應(yīng)用于治療慢性乙型肝炎提供了相關(guān)的理論依據(jù)。Pollicino T[21]等研究表明cccDNA 的轉(zhuǎn)錄水平受H3 和H4組蛋白乙?;降挠绊懀湟阴;梢源龠McccDNA 的轉(zhuǎn)錄,反之則抑制cccDNA 的表達。有研究發(fā)現(xiàn)組蛋白脫乙酰基酶11(histone deacetylase 11, HDAC11)被招募到cccDNA 中,通過降低與cccDNA 結(jié)合的H3 組蛋白賴氨酸H3K9 和H3K27 的乙?;絹硪种芻ccDNA 的轉(zhuǎn)錄[22]。最近一項研究報道顯示,組蛋白乙酰基轉(zhuǎn)移酶1(histone acetylbased transferase 1, HAT1)可以促進微染色體的組裝和組蛋白乙?;揎棧捎贖AT1 可以使新合成的組蛋白發(fā)生乙?;揎棧沟眯潞铣傻慕M蛋白上的乙酰化狀態(tài)在宿主細(xì)胞中核小體的組裝過程中起到重要作用,進一步解釋了cccDNA 調(diào)控的分子機制,這為宿主HAT1 信號調(diào)節(jié)游離病毒基因組復(fù)制機制提供了新的思路[23]。新的一項研究發(fā)現(xiàn)SIRT7 通過與HBx 相互作用催化與cccDNA 結(jié)合的組蛋白H3K122 脫琥珀?;诒碛^遺傳上沉默cccDNA 的轉(zhuǎn)錄[24]。該項研究將SIRT7 確定為研發(fā)抗HBV 感染的新型表觀遺傳治療提供潛在靶點。
除了DNA 甲基化及組蛋白修飾,非組蛋白也可以參與cccDNA 的表達調(diào)控。HBx 可以通過與宿主蛋白的相互作用降解維持染色體結(jié)構(gòu)復(fù)合物Smc5/6 來消除Smc5/6 對cccDNA 轉(zhuǎn)錄的抑制作用,從而促進cccDNA 的轉(zhuǎn)錄[25]。一項在感染HBV 的原代肝細(xì)胞研究中發(fā)現(xiàn)了一種噻唑類抗感染藥硝唑尼特(nitazoxanide, NTZ)可以有效抑制HBx 和損傷特異性DNA 結(jié)合蛋白1(damage specific DNA binding protein 1, DDB1)的相互作用,進而能夠恢復(fù)Smc5蛋白表達來沉默cccDNA 的轉(zhuǎn)錄及相關(guān)病毒蛋白的產(chǎn)生[26]。靶向HBV 相關(guān)病毒與宿主蛋白之間相互作用的NTZ 可能為治療慢性乙型肝炎提供新的抗病毒方案。另一項研究發(fā)現(xiàn)具有先天傳感器來識別和結(jié)合細(xì)胞核中cccDNA 功能的干擾素誘導(dǎo)蛋白16(interferon-inducible protein 16, IF16)通過靶向作用于cccDNA 上的干擾素刺激反應(yīng)元件(interferonstimulated response element, ISRE)進而表觀遺傳抑制cccDNA 的轉(zhuǎn)錄[27]。該項研究表明IF16 可以作為治療HBV 感染的潛在靶點。通過表觀遺傳修飾途徑沉默cccDNA 的轉(zhuǎn)錄來抑制HBV 的復(fù)制,這為抗HBV 藥物的研發(fā)提供新的思路。
HBV 慢性感染患者體內(nèi)的cccDNA 是不斷變化并維持相對平衡。機體可以通過細(xì)胞溶解和非細(xì)胞溶解兩個途徑來降解部分cccDNA。細(xì)胞溶解途徑是通過免疫損傷和細(xì)胞凋亡過程使被感染的肝細(xì)胞發(fā)生溶解破壞,cccDNA 從細(xì)胞內(nèi)釋放出來被巨噬細(xì)胞吞噬或與抗體結(jié)合形成免疫復(fù)合物后被巨噬細(xì)胞吞噬,從而清除cccDNA。相反,非細(xì)胞溶解途徑是在免疫應(yīng)答過程中產(chǎn)生的細(xì)胞因子(如干擾素、腫瘤壞死因子和白細(xì)胞介素等)在不發(fā)生細(xì)胞溶解的前提條件下清除細(xì)胞內(nèi)的cccDNA。Xia Y等[28]研究表明T 細(xì)胞產(chǎn)生的IFNγ 和TNFα 通過誘導(dǎo)cccDNA 脫氨基作用降低肝細(xì)胞內(nèi)cccDNA 的表達水平。另外,有研究發(fā)現(xiàn)高劑量IFNα 和淋巴毒素β受體分別誘導(dǎo)胞嘧啶脫氨酶3A 和3B 的表達,通過HBV 核心蛋白與cccDNA 的相互作用,使cccDNA 發(fā)生脫氨基作用形成脫嘌呤/脫嘧啶位點,進而降解cccDNA[29]。隨后,Bockmann JH[30]等研究發(fā)現(xiàn)與IFNα 相比,IFNβ 和IFNλ 可以更為持久地誘導(dǎo)載脂蛋白B 信使RNA 編輯酶催化多肽樣(apolipoprotein b messenger rna-editing enzyme-catalytic polypeptidelike, APOBEC)脫氨酶的表達,使肝細(xì)胞內(nèi)cccDNA發(fā)生脫氨基作用造成G-A 序列的變化來降解cccDNA。
最近研究發(fā)現(xiàn)IFN 通過非細(xì)胞溶解途徑誘導(dǎo)cccDNA 的降解過程依賴于干擾素刺激基因20(interferon-stimulated Gene 20, ISG20)[31]。ISG20 是促使IFN 誘導(dǎo)cccDNA 降解的核酸酶,這為研發(fā)抗HBV 藥物提供潛在靶點。此外,研究還發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化生長因子β 在肝細(xì)胞中可以通過激活胞苷脫氨酶來誘導(dǎo)cccDNA 脫氨基作用進而降解cccDNA[32]。目前,隨著對細(xì)胞因子的研究及PEG-IFNα 在臨床上慢性乙型肝炎表現(xiàn)出的治療效果來看,細(xì)胞因子相關(guān)藥物的研發(fā)將成為臨床上治療HBV 感染新型抗病毒治療方案。然而,有關(guān)細(xì)胞因子如何通過非細(xì)胞溶解途徑來降解cccDNA 機制仍需要深入進行研究。
近年來隨著基因編輯技術(shù)的快速發(fā)展并在生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域中得到廣泛應(yīng)用,部分研究學(xué)者在構(gòu)建的體外細(xì)胞或動物模型中采用基因編輯技術(shù)方法研究cccDNA 降解機制,其中包括鋅指核酸酶(zinc finger nuclease, ZFNs)[33]、轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶(transcription activator like effector nucleases, TALENs)[34]和成簇規(guī)律間隔短回文重復(fù)序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)/CRISPR 相關(guān)蛋白9(CRISPR/Cas9)技術(shù)[35]。但是,由于目前基因編輯技術(shù)存在脫靶效應(yīng)和缺乏相應(yīng)的體內(nèi)遞呈載體,使得靶向降解cccDNA 的基因編輯技術(shù)在臨床上無法得到有效的應(yīng)用,需要進行相關(guān)研究并找到解決這些問題的對策。
HBV 復(fù)制周期的復(fù)雜性和cccDNA 的穩(wěn)定性是治療慢性乙型肝炎達到完全治愈的難題。隨著對HBV 在宿主肝細(xì)胞內(nèi)復(fù)制周期和cccDNA 形成過程的深入研究,這將為作用在HBV 復(fù)制周期各階段潛在靶點的新型抗病毒藥物的研發(fā)提供新的思路。因此,應(yīng)用多途徑的免疫治療聯(lián)合多靶點的藥物治療是目前抑制HBV 基因組表達并促使cccDNA 清除的有效抗病毒策略[36]。隨著國內(nèi)外學(xué)者們對HBV與宿主相互作用是如何參與cccDNA 形成確切機制的不斷探索和研究,相信未來一定會實現(xiàn)對cccDNA 的清除和慢性乙型肝炎的治愈。