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Menke-Hennekam 綜合征表型及基因型分析

2023-08-23 21:47唐雅楠葉賢濤顧學(xué)范余永國
臨床兒科雜志 2023年8期
關(guān)鍵詞:面容外顯子表型

唐雅楠 葉賢濤 顧學(xué)范 余永國 肖 冰 孫 昱

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬新華醫(yī)院 上海市兒科醫(yī)學(xué)研究所內(nèi)分泌遺傳代謝科(上海 200092)

Menke-Hennekam 綜合征(Menke-Hennekam syndrome,MKHK)是近年來新發(fā)現(xiàn)的常染色體顯性遺傳病,由CREBBP基因錯義雜合變異所致,2016年由Menke等[1]首次報道,迄今為止已報道了約30個病例、20 種CREBBP基因致病變異位點,變異均位于CREBBP基因的30 外顯子末端至31 外顯子首端(NM_004380.3: c.5128_5614)[1–6]。臨床表現(xiàn)為精神運動發(fā)育遲緩、不同程度智力障礙、矮身材、小頭畸形以及特殊面容(上斜眼瞼、內(nèi)眥距寬、塌鼻梁、短鼻、長人中、招風(fēng)耳、低耳位、小下頜等)。

Rubinstein-Taybi 綜合征(Rubinstein-Taybi syndrome,RSTS)是經(jīng)典的常染色體顯性遺傳病,其顯著臨床特征包括寬指/趾、矮身材,中至重度智力障礙、特殊面容(詭秘微笑,高拱眉、長睫毛、鷹鉤鼻、下斜眼瞼、高顎等)等[7–8]。RSTS由CREBBP基因的功能喪失(loss of function,LOF)變異(移碼變異、無義變異等)所致,變異廣泛分布于MKHK 變異區(qū)域以外的CREBBP基因區(qū)域。

CREBBP不同區(qū)域和類型變異導(dǎo)致的RSTS 和MKHK 均有發(fā)育遲緩、智力發(fā)育落后、小頭畸形等臨床特征,但特殊面容特征具顯著差異。目前對于RSTS 的臨床表型、基因型及致病機制均有較多報道,而對于MKHK 的研究較少,并且尚無中國病例的大規(guī)模報道。本文總結(jié)7 例CREBBP基因變異所致MKHK的臨床特征及基因變異特點,進一步擴大MKHK的臨床表型譜和基因變異譜。

1 對象與方法

1.1 研究對象

選取2012—2022年就診于新華醫(yī)院內(nèi)分泌/遺傳科門診確診為Menke-Hennekam 綜合征的7 例患兒。診斷符合以下2條:①基因檢測,CREBBP基因雜合致病/可能致病變異且位于30外顯子末端至31外顯子首端區(qū)域(NM_004380.3: c.5128_5614);②臨床表現(xiàn),患兒具MKHK 特征性臨床表現(xiàn)(特殊面容包括上斜眼瞼、內(nèi)眥距寬、塌鼻梁、短鼻、長人中、招風(fēng)耳、低耳位、小下頜等)。

本研究獲得患兒監(jiān)護人的知情同意,并經(jīng)新華醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會批準(zhǔn)(No.XHEC-D-2023-028)。

1.2 方法

1.2.1 臨床資料收集 通過回顧門診、住院及隨訪資料或聯(lián)系患兒家屬獲得臨床數(shù)據(jù),使用標(biāo)準(zhǔn)化表格收集整理信息,包括一般資料、臨床表現(xiàn)、出生與母孕史、家族遺傳史、實驗室檢查結(jié)果、影像學(xué)檢查結(jié)果、基因檢測結(jié)果等。患兒臨床表型由具有經(jīng)驗的兒內(nèi)分泌/遺傳科醫(yī)師進行評估,形態(tài)學(xué)評估標(biāo)準(zhǔn)參考文獻[9–18]。隨訪資料通過內(nèi)分泌/遺傳科門診復(fù)診或電話隨訪采集,隨訪周期不定,隨訪內(nèi)容包括患兒的身高、體重、精神運動發(fā)育情況及醫(yī)療問題等。

1.2.2 基因檢測方法 應(yīng)用EDTA 抗凝管抽取患兒及家長外周靜脈血2 mL 行核心家系外顯子組測序(Trio whole exome sequencing,Trio-WES)。采用全基因組DNA 提取試劑盒(Qiagen 公司,德國)提取DNA,用Covaris S220超聲破碎儀(Covaries公司,美國)將基因組DNA片段化為200 bp左右片段,用exome research panel(IDT公司,美國)進行捕獲,用Illumina NovaSeq 6000測序儀(Illumina公司,美國)對捕獲片段進行雙端測序(pair-end sequencing),測序片段長度為150 bp。測序產(chǎn)生的fastq數(shù)據(jù)用BWA比對到hg19參考基因組,按照GATK最佳實踐(v3)進行數(shù)據(jù)分析檢測變異。變異用vcfanno 和SNPEff進行注釋,排除人群數(shù)據(jù)庫中高頻變異,選擇錯義、無義、剪切位點、框移插入缺失及框內(nèi)插入缺失作為候選變異。候選變異參考美國醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)與基因組學(xué)學(xué)會(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)指南對變異位點進行致病性評估,利用Sanger 測序?qū)蚁颠M行基因變異驗證并判斷變異的來源。

2 結(jié)果

2.1 臨床資料

7 例MKHK 患兒4 男3 女;平均就診年齡(2.6±1.7)歲;平均出生身長(48.8±2.3)cm,平均出生體重(2 548±369)g。除患兒2、4有宮內(nèi)發(fā)育遲緩?fù)猓? 例均無異常出生史,7 例均有產(chǎn)后發(fā)育遲滯。

7 例MKHK 患兒均以發(fā)育落后就診,為全面性發(fā)育遲緩,以運動及語言發(fā)育落后為主。存在多種表觀畸形,其中7例存在內(nèi)眥距寬、招風(fēng)耳、低耳位,6例存在眼瞼上斜、短瞼裂、塌鼻、長人中,均無多毛、高鼻梁和詭秘微笑。其余特殊表現(xiàn)見表1。

表1 7例Menke-Hennekam綜合征患兒臨床特征總結(jié)

7例患兒隨訪時長為2個月至4年,平均(11±16)月,末次隨訪日期見表1。末次隨訪時身高小于同年齡同性別兒童第三百分位數(shù)、體重低于同年齡同性別兒童第三百分位數(shù)均為6例(85.7%)。

2.2 基因型分析

7 例患兒的基因檢測結(jié)果顯示均攜帶CREBBP基因的雜合致病/可能致病變異,共涉及2種類型基因變異(6/7 錯義變異、1/7 不影響閱讀框的插入缺失),均為新發(fā)(de novo),其中2例攜帶c.5602C>T(NM_004380.3)位點雜合變異。經(jīng)查詢HGMD、ClinVar及PubMed數(shù)據(jù)庫,c.5218C>T與c.5225T>A(NM_004380.3)既往文獻未報道過。根據(jù)ACMG遺傳變異分類標(biāo)準(zhǔn)與指南,對7 例患兒的基因檢測結(jié)果進行變異致病性分析,共有5 例“致?。≒)”、2例“可能致病(LP)”,評析結(jié)果見表2。

表2 7例Menke-Hennekam綜合征患兒基因變異及致病性分析

結(jié)合臨床表現(xiàn)、家族基因測序及靶向測序驗證的結(jié)果,7例患兒均診斷為MKHK。

3 討論

本研究發(fā)現(xiàn)2 例CREBBP基因新發(fā)錯義變異,c.5218 C>T 及c.5225 T>A,為國際上未報道的病例,屬于報道較少的MKHK 疾病的變異區(qū)域,豐富了CREBBP基因變異譜。MKHK的臨床表型異質(zhì)性強,無統(tǒng)一的臨床診斷標(biāo)準(zhǔn),需結(jié)合基因測序結(jié)果確定致病原因。目前尚無MKHK中國人群的大型報道,臨床醫(yī)師對此病認識可能不足,容易導(dǎo)致誤診和延遲診斷。

本研究7 例患兒攜帶的變異均位于CREBBP基因的30外顯子末端至31外顯子首端區(qū)域,且具有不同于RSTS 的特殊面容,本組病例雖然均屬亞洲血統(tǒng),但仍與Menke等[1-2]于2016與2018年報道的疾病表型相近,支持MKHK診斷。既往文獻表明,變異位于c.5595_5614(NM_004380.3)區(qū)域的MKHK患者具較集中的特殊面容,表現(xiàn)為上瞼下垂(33%)、上斜眼瞼(58%)、短瞼裂(42%)、內(nèi)眥距寬(54%)、塌鼻梁(54%)、短鼻(50%)、前傾鼻孔(46%)以及長人中(50%),嬰兒時期的面容特征最顯著,隨著年齡增長疾病表型越不明顯[2]。本研究患兒4、5、6、7的基因變異位于該區(qū)域內(nèi),且面容特征與文獻報道相符,進一步為該區(qū)域變異病例可能屬于MKHK獨特亞型提供臨床依據(jù)[2]。另外,相比于其他區(qū)域的MKHK 患兒,c.5595_5614 區(qū)域變異的患兒具更嚴(yán)重的視聽障礙(3/3聽力問題、3/3眼部問題),這一發(fā)現(xiàn)有待繼續(xù)收集病例提供證據(jù)支持。c.5357G>A是文獻報道過的變異,同一堿基位點報道過的變異還有c.5357G>C,相鄰區(qū)域變異還有c.5354G>A[2,4]。文獻指出c.5354 及c.5357 位點變異的MKHK 患者具與RSTS 相似的特征[4],如下斜眼瞼、長睫毛、禿鼻梁、寬鼻尖、高顎以及輕度寬指/趾等。本研究c.5357G>A病例的特殊面容為前額突出、面頰飽滿、眼瞼下斜、眼距寬、寬鼻尖、牙齒不整齊、嘴唇上翻、小下頜,部分表型與上述研究[4]報道相近,需繼續(xù)收集更多病例以進行表型特征總結(jié)。此外本例患兒語言運動發(fā)育落后,經(jīng)康復(fù)訓(xùn)練后癥狀部分改善,也提示早期康復(fù)訓(xùn)練對于患者治療有指導(dǎo)意義?;純?、6 是本研究中有手指及腳趾畸形者,表現(xiàn)為并指及多趾。2018年Menke等[2]報道中C19病例也有手指皮膚并指表現(xiàn),但他們都不具RSTS典型的大拇指寬及向橈側(cè)彎曲特征。

目前CREBBP變異導(dǎo)致RSTS的研究較為充分。RSTS 可由CREBBP雜合變異所致,約80%經(jīng)測序分析確定為基因內(nèi)的小缺失/插入、錯義、無義和剪接位點變異,約20%通過基因靶向缺失/重復(fù)分析確定為外顯子或整個基因缺失[8,19]。CREBBP基因編碼的蛋白是具有乙酰轉(zhuǎn)移酶活性的轉(zhuǎn)錄共激活因子,以往研究表明CREBBP缺失可影響轉(zhuǎn)錄識別、降低乙酰化活性及破壞染色質(zhì)重組,繼而導(dǎo)致RSTS的發(fā)生[20-22]。與MKHK 相關(guān)的CREBBP基因變異研究主要與鋅指結(jié)構(gòu)域Zinc finger 2(1701-1744)及Zinc finger 3(1765-1846)相關(guān),研究表明這兩個介導(dǎo)鋅離子結(jié)合的結(jié)構(gòu)域都包含半胱氨酸殘基,后者可穩(wěn)定蛋白螺旋折疊并介導(dǎo)與轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合,c.5170G>A(p.Glu1724Lys)的變異位點與ZNF2的第二個高度保守的半胱氨酸殘基(Cys 1723)相連,此變異導(dǎo)致的氨基酸改變引起靜電勢差,可能對蛋白質(zhì)相互作用產(chǎn)生重要影響[3],進而解釋MKHK的病理機制。

綜上,本文報道了CREBBP基因的6個新發(fā)變異,其中2 個既往未報道過,進一步擴大了MKHK 的基因變異譜。由于MKHK臨床表型異質(zhì)性強且無國際上認可的診斷指南,診斷較難確立,臨床醫(yī)師在工作中遇到臨床表型疑似者,應(yīng)盡早行高通量測序以協(xié)助診斷。

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