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減氮配施有機肥對燕麥土壤細(xì)菌群落特征影響與生態(tài)功能預(yù)測

2023-10-14 19:05:00鄭敏娜鄒璨陽康佳惠
山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2023年10期
關(guān)鍵詞:菌門燕麥群落

鄭敏娜,鄒璨陽,康佳惠,楊 富

(山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 高寒區(qū)作物研究所,山西 大同 037008)

燕麥(Avena sativaL.)為1 年生禾本科糧飼兼用型作物,在全球42 個國家和地區(qū)廣泛栽培,居世界谷物生產(chǎn)第6 位,主要分布于歐洲、亞洲和非洲的溫帶地區(qū)[1]。我國是燕麥的起源地之一,主要分布在華北、西北和西南等地區(qū)。燕麥具有耐貧瘠、耐鹽堿、耐寒、抗旱、抗風(fēng)沙等特點[2-3],適應(yīng)性廣泛,且栽培措施簡易,在營養(yǎng)價值、生產(chǎn)性能、利用方式、開發(fā)潛力等方面優(yōu)勢突出,是山西省傳統(tǒng)優(yōu)勢雜糧作物之一,尤其是大同地區(qū)的特色優(yōu)勢雜糧作物,很受市場的青睞,具有很大的發(fā)展空間和利用潛力,在山西區(qū)域經(jīng)濟建設(shè)中發(fā)揮著重要作用。

施肥是燕麥田間管理中非常重要的措施之一,對燕麥田生產(chǎn)力的提升和土壤生態(tài)具有重要作用。肥料(包括無機肥和有機肥)輸入土壤后,會對土壤生態(tài)環(huán)境產(chǎn)生巨大影響,合理施用不但可以直接提升作物產(chǎn)量,而且可以改變土壤微生態(tài),有利于土壤微生物的正向演替;但在實際生產(chǎn)中,為了追求更高的產(chǎn)量,化肥施用量偏高,有機肥投入不足,造成土壤質(zhì)量下降等問題,不但造成了土壤資源嚴(yán)重污染,而且會威脅食品安全[4]。因此,在燕麥生產(chǎn)過程中,探索合理的減氮配施有機肥比例,將有利于促進土壤和生產(chǎn)的可持續(xù)發(fā)展,對晉北地區(qū)燕麥田土壤生態(tài)系統(tǒng)的可持續(xù)發(fā)展具有重要意義。

在土壤生態(tài)系統(tǒng)中,微生物是重要的參與者,其對土壤養(yǎng)分循環(huán)、能量流動和物質(zhì)轉(zhuǎn)化等起到至關(guān)重要的作用[5-9],是生態(tài)系統(tǒng)健康可持續(xù)發(fā)展的重要保障。在土壤生態(tài)系統(tǒng)中,相同的微生物種群可以行使不同的土壤功能,相同的土壤過程也可由不同微生物種群完成,其種群會因環(huán)境變更或管理分異產(chǎn)生微生物多樣性及其生態(tài)功能的變化[9]。目前,眾多學(xué)者在施肥與土壤微生物及其生態(tài)系統(tǒng)方面進行了大量研究,大多試驗結(jié)果都表明,配施一定比例的有機肥料后土壤微生物量碳、氮、磷和生物活性均有不同程度的提高,具體效果會因配施比例或施肥種類而有所差異[10-14]。然而,也有研究顯示,長期氮磷肥配施對土壤微生物生物量的影響不大[15]。

本研究通過田間小區(qū)試驗,研究在不同劑量無機有肥料配施下,燕麥田土壤環(huán)境及其微生物的生態(tài)差異,揭示不同劑量肥料的輸入對燕麥田土壤生態(tài)功能的影響,優(yōu)選出最佳施肥模式,為晉北地區(qū)燕麥的種植和提質(zhì)增效提供參考意見。

1 材料和方法

1.1 試驗地概況

試驗于2022 年在山西農(nóng)業(yè)大學(xué)高寒區(qū)作物研究所毛皂試驗基地(N112°34′~114°34′,E39°03′~40°44′)進行。該地海拔1 050 m,屬中溫帶干旱區(qū),土壤有機質(zhì)含量為12.61 g/kg,土壤全氮含量為0.81 g/kg,土壤有效磷含量為5.03 mg/kg,土壤pH值為8.37。

1.2 試驗材料

選用燕麥品種晉燕17 號為試驗材料,由山西農(nóng)業(yè)大學(xué)高寒區(qū)作物研究所提供。試驗所用肥料為尿素和自制有機肥,其中,尿素N 含量≥46%;自制有機肥以牛糞為主要原料,其有機質(zhì)含量為15.8%,N 含量為0.046 g/kg。

1.3 試驗設(shè)計

試驗采用隨機區(qū)組排列。播前進行精細(xì)耙耱鎮(zhèn)壓,平整后人工開溝條播,小區(qū)面積為10 m2(2 m×5 m),3 次重復(fù),種植密度為400 萬株/hm2,播種深度3~5 cm,行間距約25 cm。

試驗共設(shè)7 個處理,以不施肥處理為對照(CK),分別設(shè)置僅施用氮肥(T1)和氮肥與有機肥分別按照9∶1(T2)、8∶2(T3)、7∶3(T4)、6∶4(T5)和5∶5(T6)的比例配施,共計21 個小區(qū),其中,T1 處理N 的施用量為180 kg/hm2,T2~T6 等5 個處理N 的總用量與T1 處理一致,對應(yīng)有機肥施用量按照配施比例計算,P、K 施用量各小區(qū)均相同,試驗期間各處理田間管理保持一致,具體施用量如表1 所示。

表1 各處理的肥料施用時期和施用量Tab.1 The fertilizer application period and dosage of each treatment

1.4 測定項目及方法

1.4.1 土壤樣品采集與測定 于燕麥成熟期,各小區(qū)按對角線5 點采集燕麥根際土壤,采用四分法取0.2 kg 土壤樣品,3 次重復(fù)。取樣后,一部分土樣,風(fēng)干后測定常規(guī)土壤化學(xué)指標(biāo)[16],包括全氮(TN)、速效氮(AN)、速效磷(AP)、速效鉀(AK)、有機質(zhì)(OM);另一部分土樣-80 ℃保存進行土壤微生物分析。

1.4.2 籽粒產(chǎn)量測定 于燕麥成熟期,收獲測定各小區(qū)的種子產(chǎn)量。

1.4.3 土壤微生物總DNA 提取及生物信息學(xué)分析 使用MN NucleoSpin 96 Soil(Germany)試劑盒進行DNA 的提取,每個樣品重復(fù)3 次,采用PacBio 測序平臺的通用引物(正向27F 和反向1492R),以細(xì)菌16SrRNA 基因全長序列(V3-V4)為目的片段進行PCR 擴增,擴增體系參照艾鋒等[17],擴增合格的樣品在北京百邁克生物有限公司進行測序分析,對得到的高質(zhì)量CCS 序列進行生物信息學(xué)分析,具體方法參照艾鋒等[17]文獻(xiàn)。最后,使用PICRUSt 軟件進行細(xì)菌功能類群預(yù)測[18]。此外,利用STAMP 和R 軟件進行方差分析等。

1.5 數(shù)據(jù)分析

利用Microsoft Excel 2009 進行數(shù)據(jù)整理,采用SPSS 22.0軟件用單因素方差分析不同處理間的差異顯著性(P<0.05),采用Pearson法進行相關(guān)性分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 不同處理下土壤養(yǎng)分及籽粒產(chǎn)量的變化

不同處理下土壤特性和籽粒產(chǎn)量如表2 所示。

表2 不同處理下土壤特性和籽粒產(chǎn)量比較Tab.2 Comparison of soil characteristics and seed yield under different treatments

由表2 可知,與CK 相比,各處理的土壤全氮(TN)和速效氮(AN)含量均有所增加,但各處理間差異不顯著;對土壤速效鉀(AK)、速效磷(AP)和有機質(zhì)(OM)含量則有顯著影響,其中,速效鉀(AK)和速效磷(AP)含量均在T3 處理時最高,分別為251.14、10.99 mg/kg,與其他處理間差異顯著(除T4處理外,P<0.05);隨著施入有機肥肥量的增加,土壤中有機質(zhì)的含量逐漸增加,在T6 處理時達(dá)到最大,為14.86 g/kg,與其他各處理間差異顯著(除T5、T4處理外,P<0.05)。此外,籽粒產(chǎn)量T4 處理最大,為4 357.61 kg/hm2,與其他處理間差異顯著(P<0.05)。

2.2 土壤微生物特征的變化

2.2.1 土壤細(xì)菌群落多樣性分析 本研究計算了減氮配施有機肥處理下燕麥根際土壤細(xì)菌群落的Alpha 多樣性。豐富度指數(shù)評估(圖1)發(fā)現(xiàn),Chao1和ACE 指數(shù)具有相似的變化規(guī)律,表現(xiàn)為T6 處理高于其他處理;多樣性評估表明,T3 處理Shannon多樣性指數(shù)最高(8.78),與最低的T2 處理間差異顯著(P<0.05);T1 處理的Simpson 指數(shù)最高,仍以T2 處理的最低,二者間差異顯著(P<0.05)。

圖1 不同處理下土壤細(xì)菌群落Alpha 多樣性Fig.1 Alpha diversity of soil bacterial communities under different treatments

采用主坐標(biāo)分析(Principal co-ordinates analysis,PCoA)結(jié)果表明(圖2),T5、T6 處理落在第1 象限,T4 處理落在第1 象限和第4 象限,T3 處理落在第1 象限和第2 象限,T1 和CK 落在第2 象限,而T2 處理則落在第3 象限,與其他處理間無交集產(chǎn)生,且T2 處理與其他6 個處理間存在顯著差異(P<0.05)。

圖2 不同處理下土壤細(xì)菌群落的PCA 分析Fig.2 The PCA analysis of soil bacterial communities under different treatments

2.2.2 細(xì)菌群落組成 分析結(jié)果顯示(圖3-A),相對豐度占比較高的是變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、放線菌門(Actinobacteria)、綠彎菌門(Chloroflexi),它們占細(xì)菌群落相對豐度的76.6%以上。

圖3 不同處理下細(xì)菌門(A)和屬(B)的組成結(jié)構(gòu)Fig.3 Composition and structure of bacterial phyla(A)and genus(B)under different treatments

圖4 不同處理下環(huán)境因子和土壤細(xì)菌的相對豐度間的RDA 分析Fig.4 Redundancy analysis(RDA)of environmental factors and relative abundance of soil bacteria under different treatments

在這些占主要優(yōu)勢的門中,CK、T1、T2 這3 個處理中的優(yōu)勢菌為變形菌門,它的相對豐度占比最高,分別為44.21%、45.64%和43.93%,且CK、T1、T2 與T3、T4、T5、T6 處理間差異顯著(P<0.05);隨著有機肥施入量的增加,變形菌門的相對豐度占比出現(xiàn)下降,厚壁菌門成為優(yōu)勢菌,其中,以T4 處理中相對豐度占比最高,達(dá)到36.12%,與CK、T1和T2 處理間差異顯著(P<0.05);擬桿菌門作為第三豐富的優(yōu)勢門,在T2 和T4 處理中相對豐度較高,分別為23.16%和20.64%,與其他5 個處理間差異顯著(P<0.05);放線菌門在T3 處理中最為豐富(17.53%),但與CK(16.21%)間差異不顯著;綠彎菌門則在T3 處理中相對占比最高(8.26%),與CK(7.88%)間差異不顯著,與其他5 個處理間差異顯著(P<0.05)。

在屬水平(圖3-B)上,已分類的相對豐度較高的屬(>1%)有不可培養(yǎng)c-Subgroup-6(unculturedbacterium-c-Subgroup-6)、鞘脂單胞菌屬(Sphingomonas)、不可培養(yǎng)bacterium(uncultured-bacterium)、乳酸菌屬(Lactobacillus)、擬桿菌屬(Bacteroides)等。其中,鞘脂單胞菌屬(Sphingomonas)為第1 優(yōu)勢菌屬,在CK 中相對豐度占比最豐富(5.42%);乳酸菌屬(Lactobacillus)和擬桿菌屬(Bacteroides)兩類菌屬則主要分布在T4、T5、T6處理中,相對豐度顯著優(yōu)于其他4個處理(P<0.05);不可培養(yǎng)c-Subgroup-6(uncultured-bacterium-c-Subgroup-6)則在CK、T1 處理中相對豐度較高,占比均超過5.20%。

2.2.3 不同處理的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與其環(huán)境因子的關(guān)系 在屬水平上,冗余分析(RDA)結(jié)果表明(圖4),第1 種和第2 種RDA 成分能夠累積解釋細(xì)菌菌群30.11%的變化,且不同環(huán)境因子對屬水平上細(xì)菌群落的影響有所差異,其中,AN 與Lamia、鞘脂單胞菌屬(Sphingomonas)相對豐度呈顯著正相關(guān)(P=0.004),而與WCHB1-32、假單胞菌屬(Pseudomonas)呈顯著負(fù)相關(guān)(P=0.003);OM、AK、TN與紅球菌屬(Rhodococcus)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、巨單胞菌屬(Megamonas)、乳酸菌屬(Lactobacillus)相對豐度呈顯著正相關(guān)(P=0.003),亦與WCHB1-32 呈顯著負(fù)相關(guān)(P=0.004)。

2.3 土壤細(xì)菌PICRUSt 基因功能預(yù)測

為了解減氮配施有機肥處理下沙壤土細(xì)菌代謝功能,使用PICRUSt 軟件比對測序數(shù)據(jù)獲得的物種組成信息,進行功能基因預(yù)測(圖5-A),經(jīng)與KEGG 數(shù)據(jù)庫比對發(fā)現(xiàn),不同肥料處理下的土壤菌群基因序列,在一級功能代謝通路下注釋到的功能主要分為新陳代謝(Metabolism)、環(huán)境信息處理(Environment information processing)、遺傳信息處理(Genetic information processing)、細(xì)胞轉(zhuǎn)化(Cellular processes)、人類疾?。℉uman diseases)和生物體系統(tǒng)(Organismal systems)等6 類,其余為PICRUSt 目前無法鑒定的細(xì)菌類群。與不施肥處理(CK)相比,細(xì)胞轉(zhuǎn)化功能基因的豐度表現(xiàn)為T3、T4、T5、T6 處理有顯著降低的趨勢,而遺傳信息處理和生物體系統(tǒng)功能基因的豐度表現(xiàn)為T4、T5、T6 處理有顯著增加的趨勢,但新陳代謝、環(huán)境信息處理和人類疾病功能基因的豐度在各處理間無顯著差異。

圖5 不同施肥處理下土壤細(xì)菌功能基因KEGG 豐度(一級功能層(A)和二級功能層(B))Fig.5 KEGG abundance of soil bacterial functional genes under different fertilization treatments(primary functional layer(A) and secondary functional layer(B))

在二級功能預(yù)測中(圖5-B),不同肥料處理下的土壤菌群差異基因主要集中在10 個通路中,其中,全局和概覽通路(Global and overiew maps,41.17%~43.51%)、碳水化合物代謝(Carbohydrate metabolism,8.26%~9.71%)、氨基酸代謝(Amino acid metabolism,6.27%~8.01%)、能量代謝(Energy metabolism,3.95%~5.88%)、輔助因子和維生素代謝(Metabolism of cofactors and vitamins,3.37%~5.09%)為主要子功能。與不施肥處理(CK)相比,各處理的氨基酸代謝和輔因子和維生素代謝功能基因顯著增加(除TI、T2 外,P<0.05),氨基酸代謝功能顯著降低(除T2 外,P<0.05),而其他功能基因未有顯著差異。

3 結(jié)論與討論

在燕麥生產(chǎn)中,施肥是向農(nóng)田系統(tǒng)輸入養(yǎng)分元素的最主要途徑,也是人為調(diào)控、管理養(yǎng)分不可替代的技術(shù)手段。但傳統(tǒng)的燕麥田施肥是以作物高產(chǎn)為唯一目標(biāo),年復(fù)一年投入大量的化學(xué)肥料,不但造成營養(yǎng)元素利用率較低,而且還引起土壤有機質(zhì)含量減少、土壤污染等問題。因此,科學(xué)、合理的肥料配施(有機肥和無機肥)有助于燕麥田養(yǎng)分高效利用。本研究發(fā)現(xiàn),隨著施入有機肥肥量的增加,有機質(zhì)含量明顯增加,與劉佳遙等[18]、商麗榮等[19]、XU 等[20]的研究結(jié)果基本一致。此外,T4 處理下籽粒產(chǎn)量達(dá)到最大,這也說明在該處理下不但可以保證燕麥正常生長發(fā)育所需的氮素,而且對土壤生態(tài)最有利。

土壤生態(tài)系統(tǒng)中所有的微生物種類以及它們與環(huán)境之間相互作用的多樣化程度被稱為土壤微生物多樣性[9],包括了物種多樣性、功能多樣性、結(jié)構(gòu)多樣性及遺傳多樣性等不同層面[8]。其中,土壤生態(tài)系統(tǒng)中微生物的物種豐富度和均一度,是微生物多樣性的最直接表現(xiàn)形式[21]。本研究表明,Chao1 和ACE 指數(shù)表現(xiàn)為T6 處理最高,與T4、T5處理間差異不顯著。此外,肥料措施作為對土壤擾動的一種重要方式,也將會給微生物群落結(jié)構(gòu)和成分帶來顯著的影響[4,17]。在本研究中,變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidota)、放線菌門(Actinobacteriota)、綠彎菌門(Chloroflexi)等5 個菌門最具優(yōu)勢,它們占細(xì)菌群落相對豐度的76.6%以上,這與前人的研究基本一致[22-24]。而且不同減氮配施比例引起的土壤環(huán)境因子變化對不同微生物群體的影響各不相同[17]。本試驗RDA 分析結(jié)果表明,AN、OM、AK、TN 對處理中的細(xì)菌群落有著更為顯著的影響作用,例如,OM、AK、TN 與紅球菌屬(Rhodococcus)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、巨單胞菌屬(Megamonas)、乳酸菌屬(Lactobacillus)相對豐度呈顯著正相關(guān)。

PICRUSt 功能預(yù)測表明,燕麥田減氮配施有機肥后土壤細(xì)菌群落的主要功能是新陳代謝,表明代謝是細(xì)菌群落主要的核心功能,同時具有環(huán)境信息處理、遺傳信息處理、細(xì)胞轉(zhuǎn)化、人類疾病和生物體系統(tǒng)等5 個功能,其中,減氮增施有機肥提高了遺傳信息處理和生物體系統(tǒng)功能基因豐度,這可能是由于有機肥添加顯著富集了與碳循環(huán)相關(guān)功能基因,有助于提升有機質(zhì)的轉(zhuǎn)化及碳源的利用率,后續(xù)將結(jié)合宏基因組學(xué)測序進一步分析燕麥田減氮配施有機肥后土壤細(xì)菌的群落功能。

綜上所述,減氮配施有機肥處理下,隨著有機肥比例的增加,土壤中有機質(zhì)的含量逐漸增加,在T6 處理時達(dá)到最大,籽粒產(chǎn)量在T4 處理下達(dá)到最大。與不施有機肥土壤相比,增施有機肥后顯著提升了變形菌門、厚壁菌門的相對豐度。并且減氮配施有機肥后明顯降低了土壤細(xì)菌細(xì)胞轉(zhuǎn)化功能基因的豐度,明顯增加了生物體系統(tǒng)功能基因的豐度。

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