吳鑒超,趙源,陳久林,劉特,郁志華?
(1.上海中醫(yī)藥大學(xué),上海市中醫(yī)老年醫(yī)學(xué)研究所,上海 200031;2.上海中醫(yī)藥大學(xué),上海 201203)
急性肺損傷(acute lung injury,ALI)是臨床上引起嚴(yán)重呼吸窘迫、供氧難治低氧性呼吸衰竭的重要原因,發(fā)展到一定程度可以定義為急性呼吸窘迫綜合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)。ALI/ARDS的病因有很多,包括但不限于感染、膠原血管疾病、藥物作用、攝入劑作用、吸入劑作用、休克、急性嗜酸性肺炎、免疫介導(dǎo)的肺出血和血管炎以及放射性肺炎等[1]。
根據(jù)急性肺損傷的臨床癥狀,如咳嗽、呼吸困難,喘息鼻張等,可將其歸于“喘脫”“結(jié)胸”“暴喘”等范疇[2]。中醫(yī)古籍中對(duì)本病亦有論述,如《靈樞·五閱五使》[3]言:“故肺病者,喘息鼻張?!薄吨胁亟?jīng)》[4]載:“不病而暴喘促者死?!薄度数S直指方·喘嗽方論》曰[5]:“惟失邪氣伏藏,痰涎浮涌,呼不得呼,吸不得吸,于是上氣喘息?!必惸腹鲜V散出自清代程國(guó)彭所著《醫(yī)學(xué)心悟·卷三·痰飲》[6],載其:“肺燥則潤(rùn)之,貝母瓜蔞散?!庇韶惸浮⒐鲜V、天花粉、桔梗、茯苓、化橘紅6味藥組成。具有潤(rùn)肺清熱、化痰止咳之效,為潤(rùn)燥化痰之代表方?!渡鼾S遺書·虛損》[7]有言:“如金衰衛(wèi)弱而多外感之來,則氣傷而肺損。”可知急性肺損傷的病機(jī)多為邪氣入侵,正邪交爭(zhēng),傷及正氣,邪盛正衰而致肺損。本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證的方法,分析貝母瓜蔞散治療ALI干預(yù)效果及可能的作用機(jī)制。
貝母瓜蔞散的化學(xué)成分來自中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平臺(tái)(TCMSP,http://tcmspw.com/tcmsp.php)[8]。按文獻(xiàn)報(bào)道設(shè)定藥物相似性(DL ≥ 0.18)和口服生物利用度(OB ≥ 30%)[9]作為篩選貝母瓜蔞散組方中藥活性成分的標(biāo)準(zhǔn)。通過PubChem數(shù)據(jù)庫(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)[10]得到活性成分的2D結(jié)構(gòu)的SDF格式文件。利用活性成分的SDF格式文件使用瑞士靶點(diǎn)預(yù)測(cè)數(shù)據(jù)庫(http://www.swisstargetprediction.ch/)[11]進(jìn)行預(yù)測(cè),即可得到對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)信息,同時(shí)整合TCMSP數(shù)據(jù)庫貝母瓜蔞散組方中藥的靶點(diǎn)信息。最后再使用UniProt數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/)[12]將靶點(diǎn)信息標(biāo)準(zhǔn)化。利用Cytoscape 3.8.0軟件構(gòu)建成分-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò),篩選出貝母瓜蔞散活性成分的潛在靶點(diǎn)。
從GeneCards數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org/)[13]中以“acute lung injury”為關(guān)鍵詞搜索與ALI有關(guān)的基因,得到ALI相關(guān)靶點(diǎn)。
將收集的貝母瓜蔞散組方活性成分靶點(diǎn)與ALI相關(guān)靶點(diǎn),通過Venny 2.1.0在線軟件篩選出二者共同靶點(diǎn)作為研究靶點(diǎn),即貝母瓜蔞散治療ALI可能的靶點(diǎn)。用STRING(https://string-db.org)平臺(tái)[14]構(gòu)建共同靶點(diǎn)的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)。
將共同靶點(diǎn)導(dǎo)入Metascape(http://metascape.org/)[15]平臺(tái),進(jìn)行Gene Ontology(基因本體)分析。Reactome(https://reactome.org/)數(shù)據(jù)庫[16]囊括NCBI、Ensembl、UniProt、UCSC基因組瀏覽器、KEGG化合物、ChEBI小分子數(shù)據(jù)庫和PubMed文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫等多個(gè)不同的在線生物信息學(xué)資源庫,借助Reactome平臺(tái)對(duì)共同靶點(diǎn)進(jìn)行信號(hào)通路富集分析。
1.4.1 藥品與試劑
貝母瓜蔞散由川貝母4.5 g,瓜蔞3 g,天花粉2.5 g,茯苓2.5 g,化橘紅2.5 g,桔梗2.5 g配伍組成,采用中藥配方顆粒制劑(川貝母、瓜蔞、天花粉、茯苓、化橘紅、桔梗批號(hào)分別為18120462、18020402、19050172、20020212、19080072、19110202,江蘇江陰天江藥業(yè)有限公司);連花清瘟顆粒(北京以嶺藥業(yè)有限公司);脂多糖(LPS,碧云天生物技術(shù)有限公司);TRIzol(Thermo);異丙醇、氯仿(國(guó)藥);cDNA合成試劑盒、qPCR試劑盒(Servicebio)。
1.4.2 動(dòng)物分組與模型制備
雄性6周齡C57小鼠48只,由維通利華有限公司提供,許可證號(hào):SCXK(浙)2019-0001,飼養(yǎng)于上海中醫(yī)藥大學(xué)實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心,具體飼養(yǎng)條件為:溫度24~26 ℃,相對(duì)濕度50%~70%,12/12 h明暗周期,自由飲食,提供充足的食物和水。所有動(dòng)物程序均經(jīng)上海中醫(yī)藥大學(xué)機(jī)構(gòu)動(dòng)物倫理和使用委員會(huì)批準(zhǔn)(批準(zhǔn)號(hào):PESHUTCM200703011),相關(guān)操作嚴(yán)格按照我國(guó)《實(shí)驗(yàn)動(dòng)物管理?xiàng)l例》進(jìn)行。
將小鼠隨機(jī)分為4組,每組12只,分別為空白組(灌胃等量生理鹽水)、模型組(腹腔注射1 mg/kg LPS),貝母瓜蔞散組(灌胃8 mL/kg貝母瓜蔞散藥液,腹腔注射1 mg/kg LPS)作為治療組,連花清瘟組(灌胃8 mL/kg連花清瘟藥液,腹腔注射1 mg/kg LPS)作為陽性對(duì)照組。造模開始第1天注射1 mg/kg LPS,第2天起給予人等效劑量中藥灌胃治療,此后每?jī)商熳⑸?次LPS,連續(xù)給藥30 d后,小鼠腹腔注射2.5%戊巴比妥鈉50 mg/kg麻醉,收集肺組織,-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.4.3 肺組織病理學(xué)檢查
將小鼠肺組織固定于4%多聚甲醛,石蠟包埋,切成5 μm切片。然后,切片脫蠟至水,蘇木素染液染色15 min,雙蒸水漂洗5 min;1%鹽酸酒精分化30 s,雙蒸水室溫浸泡15 min,將切片置于伊紅染液染色2 min,雙蒸水漂洗5 min;常規(guī)脫水,透明,封片。在顯微鏡(BX51,OLYMPUS,Japan)40倍顯微鏡物鏡下觀察肺組織病理學(xué)的變化并拍照。
1.4.4 肺組織MASSON染色
將小鼠肺組織石蠟切片用蘇木素染色液染色5 min,雙蒸水漂洗5 min;將切片于Masson藍(lán)化液靜置處理5 min,然后放入雙蒸水漂洗1 min;麗春紅酸性品紅液染8 min;用0.2%冰醋酸水溶液洗1 min;用1%磷鉬酸水溶液分化約5 min,然后重復(fù)用0.2%冰醋酸水溶液洗1 min;入苯胺藍(lán)染液復(fù)染5 min,用0.2%冰醋酸水溶液洗1 min;最后脫水封片。封片后同樣在顯微鏡40倍顯微鏡物鏡下拍照。
1.4.5 肺組織細(xì)胞因子RT-qPCR檢測(cè)
從肺組織中提取總RNA,定量后用ReVertAid First Strand cDNA合成試劑盒將分離的mRNA反向轉(zhuǎn)錄成cDNA。用LightCycler96實(shí)時(shí)PCR系統(tǒng)和2 × SYBR Green qPCR Master Mix試劑盒進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR,引物序列見表1。檢測(cè)肺組織中IL-1α、IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α mRNA表達(dá),用2-ΔΔCT方法測(cè)定候選基因的表達(dá)水平,表達(dá)水平對(duì)照參考基因18S進(jìn)行歸一化。
表1 引物序列表
1.4.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
MASSON染色圖片采用ImageJ進(jìn)行圖像分析。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)采用SPSS 25.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,若數(shù)據(jù)呈正態(tài)分布、方差齊,則選用單因素方差分析或t檢驗(yàn),否則采用秩和檢驗(yàn)。檢驗(yàn)水準(zhǔn)取雙側(cè)α = 0.05,P< 0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
通過 TCMSP 數(shù)據(jù)庫,篩選出同時(shí)符合DL ≥ 0.18和OB ≥ 30%這兩個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的貝母瓜蔞散化學(xué)成分48個(gè),其中貝母化學(xué)成分10個(gè)、瓜蔞化學(xué)成分8個(gè)、天花粉化學(xué)成分2個(gè)、茯苓化學(xué)成分15個(gè)、化橘紅化學(xué)成分9個(gè)、桔?;瘜W(xué)成分4個(gè),合并重復(fù)項(xiàng)后得到44個(gè)活性成分,見表2。通過TCMSP 數(shù)據(jù)庫和Swiss target prediction平臺(tái)預(yù)測(cè)這44個(gè)活性成分的靶點(diǎn),最終獲得了606個(gè)靶點(diǎn)。利用Cytoscape 3.8.0軟件構(gòu)建“藥材-成分-靶點(diǎn)”網(wǎng)絡(luò),見圖1。
圖1 貝母瓜蔞散活性成分核心靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)
表2 貝母瓜蔞散活性成分表
通過 GeneCards 數(shù)據(jù)庫共搜集到ALI相關(guān)靶點(diǎn)1 701個(gè),將1 701個(gè)靶點(diǎn)與貝母瓜蔞散606個(gè)候選靶點(diǎn)在 Venny 2.1.0 中映射篩選出258個(gè)共同靶點(diǎn),結(jié)果見圖2。將258個(gè)基因帶入STRING數(shù)據(jù)庫進(jìn)行分析(要求的最低互動(dòng)分?jǐn)?shù) = 0.96),結(jié)果形成包含258個(gè)節(jié)點(diǎn),477條邊的PPI網(wǎng)絡(luò),見圖3。
圖2 貝母瓜蔞散-ALI靶點(diǎn)交集韋恩圖
圖3 貝母瓜蔞散-ALI靶點(diǎn)蛋白PPI網(wǎng)絡(luò)圖
將網(wǎng)絡(luò)導(dǎo)入到Cytoscape 3.8.0并分析,其中度值(Degree) > 26的靶點(diǎn)有20個(gè),可能為“貝母瓜蔞散”治療ALI的核心靶點(diǎn),見表3。
表3 貝母瓜蔞散組方治療ALI的核心靶點(diǎn)及參數(shù)
利用Metascape平臺(tái)對(duì)258個(gè)共同靶點(diǎn)進(jìn)行GO分析,P< 0.05前10條見圖4,生物過程主要涉及激酶活性的正調(diào)控、細(xì)胞運(yùn)動(dòng)的正調(diào)控、創(chuàng)傷反應(yīng)等過程;細(xì)胞組分主要涉及受體復(fù)合物、膜筏、黏著斑等過程;分子功能主要涉及蛋白激酶活性、蛋白酪氨酸激酶活性、激酶結(jié)合等過程。
圖4 貝母瓜蔞散靶向基因GO分析
將258個(gè)共同靶點(diǎn)輸入到Reactome數(shù)據(jù)庫中,得到238條通路(P< 0.01),對(duì)其進(jìn)行富集分析并查閱相關(guān)文獻(xiàn),對(duì)排名前40的通路進(jìn)行可視化處理,圖中節(jié)點(diǎn)大小反映P值的大小,見圖5。信號(hào)通路的基因富集分析發(fā)現(xiàn),主要有白細(xì)胞介素信號(hào)、白介素-4和白介素-13的信號(hào)、癌癥中的PI3K/Akt信號(hào)、負(fù)調(diào)控PI3K/Akt網(wǎng)絡(luò)、受體酪氨酸激酶的信號(hào)、核外雌激素信號(hào)、免疫系統(tǒng)中的細(xì)胞因子信號(hào)傳遞等通路。
圖5 信號(hào)通路的基因富集分析
肺組織HE染色結(jié)果顯示,模型組小鼠肺組織肺泡增厚情況明顯,肺泡組織結(jié)構(gòu)損傷和炎癥細(xì)胞浸潤(rùn)增加,肺泡水腫液積累、肺泡毛細(xì)血管充血;與模型組相比,貝母瓜蔞散組較模型組肺泡增厚情況減輕,鏡下肺泡結(jié)構(gòu)破壞程度減少,肺間質(zhì)和肺泡充血水腫較模型組減輕,肺泡內(nèi)有炎癥細(xì)胞浸潤(rùn),但程度較模型組亦有所減輕。提示貝母瓜蔞散減輕了LPS引起的肺損傷。見圖6。
圖6 各組小鼠肺組織HE染色(× 400)
空白組僅可見少量膠原纖維陽性染色;與空白組比較,模型組小鼠肺組織水腫嚴(yán)重且有大量炎癥細(xì)胞浸潤(rùn),并且膠原纖維染色陽性明顯(P< 0.001),提示肺組織炎癥伴纖維化;貝母瓜蔞散組肺組織藍(lán)染的膠原纖維表達(dá)少量存在,較模型組上述肺組織水腫、損傷和纖維化有顯著改善,膠原纖維染色面積減少(P<0.01)。見圖7、圖8和表4。
圖7 各組肺組織Masson染色圖(× 400)
圖8 各組小鼠肺組織MASSON染色陽性率比較
表4 各組小鼠肺組織MASSON染色陽性率比較(±s)
表4 各組小鼠肺組織MASSON染色陽性率比較(±s)
注:與空白組比較,***P < 0.001;與模型組比較,## P < 0.01。
組別空白組模型組貝母瓜蔞散組連花清瘟組陽性率/%23.87±4.236 42.96±3.115***30.31±1.766##30.75±4.855##n3 3 3 3
與空白組比較,模型組小鼠肺組織IL-1α、IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α mRNA表達(dá)增加(P< 0.01);與模型組比較,貝母瓜蔞散組和連花清瘟組小鼠IL-1α、IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α mRNA表達(dá)下降(P<0.01)。見表5。
表5 各組小鼠肺組織IL-1α、IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α mRNA水平比較(±s)
表5 各組小鼠肺組織IL-1α、IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α mRNA水平比較(±s)
注:與空白組比較,** P < 0.01;與模型組比較,## P < 0.01。
組別空白組模型組貝母瓜蔞散組連花清瘟組TNF-α 1.005±0.112 11.231±0.917**1.296±0.325##0.038±0.004##n4 4 4 4 IL-1α 1.014±0.185 36.529±8.341**1.678±0.285##8.710±2.428##IL-2 1.008±0.145 2.909±0.456**1.821±0.231##0.739±0.096##IL-6 1.010±0.158 14.389±1.454**0.809±0.144##0.167±0.031##IL-10 1.026±0.259 8.646±2.388**0.772±0.234##0.024±0.005##
急性肺損傷(ALI)存在多種免疫細(xì)胞共同介導(dǎo)的過度、失控的肺部炎癥反應(yīng),同時(shí)肺部和全身炎癥之間的相互影響促進(jìn)了ALI的發(fā)展,是ALI發(fā)病過程中重要病理因素[17-19]。有研究者觀察臨床ALI患者的中醫(yī)證候發(fā)現(xiàn),痰熱壅肺證是其中最主要的證型[2]。貝母瓜蔞散,載于《醫(yī)學(xué)心悟·卷三·痰飲》,主治燥痰澀而難出;由貝母1錢5分,瓜蔞1錢,天花粉8分,茯苓8分,橘紅8分,桔梗8分組成;有潤(rùn)肺清熱、理氣化痰之效。方以貝母清熱潤(rùn)肺、止咳化痰為君;瓜蔞、天花粉清熱滌痰而潤(rùn)燥為臣;茯苓、橘紅健脾理氣以祛痰為佐;桔梗載諸藥入肺,宣肺利氣為使;共奏清熱潤(rùn)燥、理氣化痰之功,使肺陰得潤(rùn)而燥痰可除,清肅有權(quán)則咳逆可止。宗紹波等[20]研究發(fā)現(xiàn),具有祛痰止咳作用的中成藥金振口服液能夠有效改善LPS誘導(dǎo)的ALI小鼠肺組織間質(zhì)性水腫及降低致炎細(xì)胞因子的含量。貝母瓜蔞散中君藥貝母具有祛痰、鎮(zhèn)咳和抗炎作用[21-22]。基于以上原因,本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對(duì)貝母瓜蔞散治療ALI進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,篩選貝母瓜蔞散治療ALI的靶點(diǎn)和通路,并進(jìn)行實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。
本研究采用腹腔注射LPS模擬全身感染,間接導(dǎo)致炎性反應(yīng)性ALI?,F(xiàn)有研究發(fā)現(xiàn),膿毒血癥患者也極易發(fā)生ALI,因此以LPS為代表的生物因素誘導(dǎo)膿毒血癥致ALI是最常見的ALI造模方法[23-24]。此外,本研究參考既往文獻(xiàn)報(bào)道,采取了小劑量間斷腹腔注射LPS,在保證小鼠存活率的同時(shí)觀察到了ALI炎癥反應(yīng)和肺纖維化表現(xiàn)[25-26]。
本研究通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)篩選出貝母瓜蔞散活性化合物44個(gè),相對(duì)應(yīng)靶點(diǎn)606個(gè)。急性肺損傷關(guān)聯(lián)分析確定了258個(gè)共同靶點(diǎn),PPI 網(wǎng)絡(luò)分析表明,HSP90AA1、IL-6、TNF-α等免疫與炎癥相關(guān)蛋白均具有較高的度值(≥ 28),處于網(wǎng)絡(luò)的中心位置,可能是貝母瓜蔞散治療ALI的關(guān)鍵靶點(diǎn)。在一項(xiàng)輸血相關(guān)急性肺損傷患者預(yù)后的研究中[27],患者入院時(shí)血清促炎因子IL-6、TNF-α的表達(dá)水平和發(fā)生肺損傷患者存活和死亡呈正相關(guān),存活組IL-6和TNF-α表達(dá)水平均顯著低于死亡組。本研究的動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中,通過實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)法檢測(cè)各組小鼠肺組織IL-1α、IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α mRNA表達(dá),相較空白組,模型組中這些細(xì)胞因子的mRNA表達(dá)顯著升高。同時(shí),這些在模型組中顯著高表達(dá)的炎癥性細(xì)胞因子mRNA,經(jīng)貝母瓜蔞散干預(yù)后,均呈現(xiàn)低表達(dá)。提示貝母瓜蔞散能夠抑制LPS引起的小鼠肺組織IL-1α、IL-2、IL6、IL-10、TNF-α mRNA過度表達(dá)。
同時(shí)GO分析結(jié)果顯示,貝母瓜蔞散對(duì)ALI的作用主要涉及了激酶活性的正調(diào)控、受體復(fù)合物、蛋白激酶活性等過程。從信號(hào)通路的基因富集分析結(jié)果來看,貝母瓜蔞散可能調(diào)控白細(xì)胞介素信號(hào)、IL-4和IL-13的信號(hào)、免疫系統(tǒng)中的細(xì)胞因子信號(hào)傳遞等信號(hào)通路發(fā)揮ALI治療作用。白介素是目前發(fā)現(xiàn)種類最多,調(diào)控作用最廣泛的一類細(xì)胞因子,而研究發(fā)現(xiàn)許多中藥對(duì)白介素類細(xì)胞因子具有干預(yù)作用,通過抗炎、抗病毒、改善免疫狀態(tài)等,可以減輕或抑制炎癥反應(yīng)對(duì)機(jī)體的損傷[28]。貝母瓜蔞散可能從改善機(jī)體細(xì)胞因子風(fēng)暴方向發(fā)揮對(duì)急性肺損傷的治療作用。細(xì)胞因子風(fēng)暴,即炎癥風(fēng)暴,最早由FERRARA等[29]于1993年在graft-versus-host disease(GVHD)中提出,是由感染、藥物或某些疾病引起的機(jī)體過度免疫。本研究中的HE染色結(jié)果提示,與模型組相比,貝母瓜蔞散減輕了LPS引起的小鼠肺組織損傷,改善了LPS引起的肺組織形態(tài)學(xué)異常。
本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法研究貝母瓜蔞散治療急性肺損傷可能的作用機(jī)制,發(fā)現(xiàn)貝母瓜蔞散可能通過多靶點(diǎn)多途徑發(fā)揮對(duì)急性肺損傷的治療作用,其作用機(jī)制或許和白細(xì)胞介素信號(hào)密切相關(guān),特別是白細(xì)胞介素信號(hào)通路的調(diào)控可能是關(guān)鍵機(jī)制之一。本研究還通過動(dòng)物實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)貝母瓜蔞散對(duì)LPS誘導(dǎo)的小鼠急性肺損傷有潛在的治療作用,貝母瓜蔞散可減少模型小鼠肺組織細(xì)胞因子IL-1α、IL-2、IL-6、IL-10、TNF-α釋放,抑制肺組織炎癥反應(yīng)和纖維化,避免炎癥反應(yīng)對(duì)肺組織的進(jìn)一步損傷,發(fā)揮急性肺損傷治療作用。