張玉清,王宜,杜志強(qiáng),楊彩俠
(長(zhǎng)江大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖北 荊州 434025)
雞ZZ/ZW 染色體遺傳體系異于哺乳動(dòng)物的XY/XX 體系,其雌性還具有獨(dú)特的兩側(cè)性腺不對(duì)稱發(fā)育方式[1]。雞胚胎孵化到E6.5 期性腺分化,E8.5期雌性胚胎的左右卵巢開始出現(xiàn)差異,左側(cè)卵巢繼續(xù)發(fā)育,而右側(cè)卵巢逐步退化。雞原始生殖細(xì)胞(Primordial germ cell, PGC)是卵子的始祖細(xì)胞,其通過血流遷移到達(dá)并定植于生殖嵴。于E8.0~E10.0期,PGC 開始迅速增殖并形成卵原細(xì)胞,E12.5 期增殖減慢,減數(shù)分裂相關(guān)基因開始表達(dá)。E15.5 期卵原細(xì)胞開始進(jìn)入第一次減數(shù)分裂,至E17.5 期多數(shù)卵母細(xì)胞進(jìn)入減數(shù)分裂,E18.5 期絕大部分卵母細(xì)胞進(jìn)入減數(shù)分裂,且多個(gè)卵母細(xì)胞會(huì)形成細(xì)胞簇,其后卵母細(xì)胞停滯在第一次減數(shù)分裂前期的雙線期,直至孵化出雛[2]。
表觀修飾是不改變序列順序,通過修飾DNA/RNA/組蛋白, 從而改變?nèi)旧|(zhì)結(jié)構(gòu),影響基因的表達(dá)活性,這種效應(yīng)可以遺傳[3]。研究表明表觀修飾在生理、病理等多方面發(fā)揮重要作用,例如配子發(fā)生與早期胚胎生長(zhǎng)發(fā)育過程[4]。DNA 5mC 甲基化發(fā)生在胞嘧啶的C5 位置(C5-methylcytidine,5mC), 主要由DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶 (DNA methyl-transferase,DNMT)催化S-腺苷甲硫氨酸(S-adenosylmethionine, SAM)作為甲基供體,將CG 兩個(gè)核苷酸的胞嘧啶選擇性地添加甲基,而其去甲基則由TET(teneleven translocation)酶催化。DNA 5mC 甲基化廣泛存在于真核生物細(xì)胞核中,調(diào)控基因表達(dá),參與卵子發(fā)生和早期胚胎發(fā)育[5-6]。DNMT1、DNMT3A 和TET 酶影響雌性動(dòng)物卵母細(xì)胞減數(shù)分裂和早期胚胎發(fā)育[7-9]。RNA 的m6A 甲基化發(fā)生在腺嘌呤的N6位置(N6-methyladenosine, m6A),由甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3 和METTL14 催化添加、去甲基化酶ALKBH5 和FTO 去除甲基,參與調(diào)控性腺發(fā)育、雌性生殖和卵子減數(shù)分裂等生殖生理過程[10-12]。組蛋白H3 在其不同賴氨酸殘基位點(diǎn)可以添加1~3 個(gè)甲基進(jìn)行修飾,由甲基轉(zhuǎn)移酶和去甲基化酶催化其動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié),影響多種生物學(xué)過程,包括性腺發(fā)育[13-14]。
本研究旨在研究雞胚左側(cè)卵巢卵母細(xì)胞由開始到全部進(jìn)入減數(shù)分裂,其后阻滯,直至孵化出雛前的時(shí)間段,DNA/RNA/組蛋白H3 甲基化修飾酶基因的動(dòng)態(tài)表達(dá)規(guī)律,結(jié)果為揭示雞胚卵巢中卵母細(xì)胞減數(shù)分裂進(jìn)入和阻滯的表觀調(diào)控提供基因表達(dá)基礎(chǔ)信息,從而為優(yōu)化家禽種業(yè)的擴(kuò)繁系統(tǒng)提供理論支撐。
1.1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
AA 肉雞種蛋,購自湯陰縣全達(dá)家禽育種有限公司。
1.1.2 試驗(yàn)儀器
孵化箱(KFZ528,德州科裕孵化設(shè)備有限公司)、分光光度計(jì)(Nano-400A,杭州奧盛儀器有限公司)、梯度PCR 儀(Nexus gradient,德國Eppendorf)、電泳儀(HS120,北京萊普特科學(xué)儀器有限公司)、熒光定量PCR 儀(CFX96,美國Bio-Rad)。
1.1.3 試驗(yàn)試劑
Trizol(15596026,Thermo Scientific)、反轉(zhuǎn)錄試劑盒(Revert Aid First Strand cDNA Synthesis Kit,K1622,Thermo Scientific)、PCR 引物合成(上海生物工程有限公司)、DEPC 水(Biosharp)、瓊脂糖(Biosharp)、定量PCR 試劑(ChamQ Universal SYBR qPCR Master mix,Q711- 02,諾唯贊)。
1.2.1 準(zhǔn)備
孵化前,種蛋消毒并標(biāo)記稱重。蛋重在65.0±5.0 g 范圍內(nèi)的種蛋置于溫度37.8 ℃、相對(duì)濕度為60%的孵化箱孵化。于孵化第5 d、9 d 和13 d 照蛋去除未受精蛋和死胚。于雞胚孵化的E12.5 期、E15.5 期、E17.5 期、E18.5 期和E20.5 期各收集6個(gè)雞胚左側(cè)卵巢放至凍存管中,液氮速凍后,置于-80 ℃保存。
1.2.2 RNA 提取及反轉(zhuǎn)錄
采用Trizol 和酚氯仿抽提法提取雞胚左側(cè)卵巢RNA,檢測(cè)RNA 純度和濃度。取1 μg RNA 反轉(zhuǎn)錄成cDNA。反轉(zhuǎn)錄條件為:37 ℃2 min,55 ℃15 min,85 ℃5 min。cDNA 稀釋10 倍,-20 ℃保存。
1.2.3 定量PCR
采用Premier5.0 設(shè)計(jì)表觀修飾相關(guān)基因的引物(表1),所設(shè)引物均跨外顯子,防止基因組DNA對(duì)PCR 結(jié)果的影響,NCBI (National Center for Biotechnology Information)上比對(duì)引物擴(kuò)增區(qū)域的唯一性和位置正確性。引物用DEPC 水稀釋至10μM。普通PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)目的條帶的唯一性和片段大小的正確性(圖1)。普通PCR 條件:94 ℃2 min;94 ℃30 s,60 ℃60 s,35 循環(huán),72 ℃5 min。定量PCR 采用10 μL的反應(yīng)體系,包括:5 μL 2× ChamQ Universal SYBR qPCR Master mix,3.4 μL 水,1 μL cDNA,0.6 μL 10 μM 上下游引物。定量PCR 反應(yīng)條件為:95 ℃10 min;95 ℃15 s, 60 ℃60 s,40 個(gè)循環(huán)。評(píng)價(jià)定量PCR 的溶解曲線確定擴(kuò)增產(chǎn)物為單峰。每個(gè)樣品點(diǎn)3 個(gè)重復(fù)孔,以內(nèi)參基因EEF1A 和RPL15 對(duì)結(jié)果進(jìn)行矯正(兩個(gè)內(nèi)參基因分別標(biāo)準(zhǔn)化后的幾何平均值),用2-ΔΔCt方法計(jì)算基因的相對(duì)表達(dá)水平。
圖1 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)RT-PCR 產(chǎn)物的唯一性和片段大小的正確性
使用SPSS25.0 軟件中的單因素方差分析和Duncan 檢驗(yàn)對(duì)定量PCR 結(jié)果進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。當(dāng)P<0.05、0.01 或0.001 時(shí),分別以*、**或***表示差異顯著、0.01 或0.001 水平上的差異極顯著。
對(duì)于DNA 5mC 甲基化酶基因的表達(dá),RTqPCR 結(jié)果表明,DNMT1 和DNMT3A 在雞胚孵化到E12.5~E20.5 期時(shí)左側(cè)卵巢中的表達(dá)無顯著的變化(P>0.05;圖2A)。DNMT3B 在E12.5 期表達(dá)最高,跟E12.5 期相比,E15.5 期(1.00 vs. 0.58; P<0.05), E17.5 期(1.00 vs. 0.42; P<0.01),E18.5 期(0.57 vs. 1.00; P<0.05)和E20.5 期(0.34 vs. 1.00;P<0.001)的表達(dá)均顯著下降(圖2A)。DNA 5mC 去甲基化酶基因TET1 和TET3 在雞胚卵巢發(fā)育的E12.5~E20.5 期mRNA 的表達(dá)無顯著變化(P>0.05),而TET2 在E18.5 期的表達(dá)顯著高于E12.5期(2.06 vs. 1.00; P<0.05)(圖2B)。
圖2 DNA 5mC(去)甲基化酶基因的mRNA 表達(dá)
RNA m6A 甲基化酶METTL3 在雞胚左側(cè)卵巢發(fā)育的E12.5~E20.5 期mRNA 表達(dá)無顯著變化(P>0.05),METTL14 的表達(dá)E12.5~E15.5 期沒有顯著變化,其后到E20.5 期逐漸上升到最高值,E20.5 期相較于E12.5 期(1.91 vs. 1.00; P<0.05)、E15.5 期(1.91 vs. 0.90; P<0.01)和E17.5 期(1.91 vs. 1.16;P<0.05)表達(dá)呈現(xiàn)顯著上升(圖3A)。RNA m6A 去甲基化酶ALKBH5 的表達(dá)E12.5~E15.5 期沒有顯著的變化,到E17.5 期(0.78 vs. 1.00; P>0.05)有輕微的下降,E18.5~E20.5 期再逐步升高,其中E20.5期相對(duì)E17.5 期表達(dá)有顯著差異(1.49 vs. 0.78;P<0.05)(圖3B)。RNA m6A 去甲基化酶FTO 的表達(dá)E12.5~E18.5 期沒有顯著的變化,到E20.5 期顯著升高,與E12.5 期(2.31 vs. 1.00; P<0.01)、E15.5期(2.31 vs. 0.90; P<0.01)、E17.5 期(2.31 vs. 0.74;P<0.001)和E18.5 期(2.31 vs. 1.37; P<0.05)相比均有顯著上升(圖3B)。
圖3 RNA m6A(去)甲基化酶基因的mRNA 表達(dá)
組蛋白H3 賴氨酸甲基化酶基因MLL2、SUV39H2、EED 和SETD2 的表達(dá)在雞胚左側(cè)卵巢發(fā)育的E12.5~E20.5 期無顯著變化(P>0.05;圖4A)。組蛋白H3 賴氨酸去甲基化酶基因KDM4A 的表達(dá)在E12.5~E20.5 期也無顯著變化(P>0.05),但KDM1B 的表達(dá)在E20.5 期相較于E12.5 期呈顯著上升(3.29 vs. 1.00; P<0.05),KDM1A 在E15.5 期相較于E12.5 期呈顯著下降(0.60 vs. 1.00; P<0.05)(圖4B)。
圖4 組蛋白H3 賴氨酸(去)甲基化酶的mRNA 表達(dá)
有研究顯示,隨小鼠年齡增長(zhǎng),DNA 5mC 甲基化酶DNMT1 的mRNA 表達(dá)在卵巢中逐漸降低[15],而DNMT3A 和DNMT3B 表達(dá)水平顯著升高[16]。敲低DNMT 酶損害胚胎發(fā)育,導(dǎo)致胚胎停滯[7]。RNA m6A 修飾參與了非洲爪蟾減數(shù)分裂與胚胎發(fā)育[17]。敲除RNA m6A 甲基化酶METTL3 導(dǎo)致小鼠胚胎致死,卵泡發(fā)育缺陷、雌性不育[18]。RNA m6A 甲基化酶METTL3/14 和去甲基化酶ALKBH5/FTO 在豬卵母細(xì)胞中表達(dá),L-抗壞血酸處理顯著降低METTL14 mRNA 水平[19]。卵巢早衰病人卵巢的FTO 表達(dá)顯著降低,RNA m6A 修飾水平升高[20]。本研究表明,雞胚左側(cè)卵巢在孵化的E12.5 ~E20.5 期DNMT1/3A/3B 和TET1/2/3 均表達(dá), 其中DNMT3B 和TET2 mRNA 表達(dá)呈現(xiàn)顯著變化; RNA m6A (去)甲基化酶基因和組蛋白H3賴氨酸(去) 甲基化酶基因在雞胚孵化E12.5~E20.5 期的左側(cè)卵巢表達(dá),其中METTL14、FTO、ALKBH5、KDM1A 和KDM1B 呈顯著的動(dòng)態(tài)變化。但是,在雞胚發(fā)育中,DNA、RNA 和組蛋白甲基化表觀修飾酶基因的表達(dá)和調(diào)控功能缺乏報(bào)道,因此,本研究在雞胚E12.5~E20.5 期卵巢中鑒定具有表達(dá)和表達(dá)顯著變化的表觀修飾酶基因的調(diào)控功能有待進(jìn)一步研究。
本研究表明DNA 5mC、RNA m6A 和組蛋白H3賴氨酸(去)甲基化表觀修飾酶基因在雞胚E12.5~E20.5 期左側(cè)卵巢中表達(dá),且DNMT3B、TET2、METTL14、FTO、ALKBH5、KDM1A 和KDM1B 呈顯著的動(dòng)態(tài)變化,為進(jìn)一步解析這些基因在雞胚左側(cè)卵巢發(fā)育、卵子減數(shù)分裂進(jìn)入和阻滯過程中的表觀調(diào)控功能提供了重要的表達(dá)信息?!?/p>