吳丹丹 許敏敏 劉兆明 梁 靜 馬 引 李 峰 李 娟
(合肥戩谷生物科技有限公司,安徽合肥 230031)
水稻是我國三大主糧之一,水稻穩(wěn)產(chǎn)對我國糧食供應(yīng)和社會穩(wěn)定具有至關(guān)重要的作用。雜草為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的生物逆境之一,與蟲害、病害等共同危害著農(nóng)業(yè)生產(chǎn)。農(nóng)田雜草的發(fā)生不僅妨礙農(nóng)事操作,而且與作物爭奪土壤養(yǎng)分、光照、水分、空間等資源,滋生病蟲害,嚴重影響了全球糧食作物的產(chǎn)量和品質(zhì),造成了巨大的經(jīng)濟損失[1]。除草劑是目前最主要的除草手段,具有高效、經(jīng)濟、省力的優(yōu)點,能有效防控雜草[2]。但是,雜草與農(nóng)作物共同生長在農(nóng)田中,除草劑使用不當(dāng)必然對農(nóng)作物造成一定傷害,極容易導(dǎo)致對除草劑敏感的作物死亡[3]。此外,稻田雜草抗藥性問題日趨嚴重,據(jù)統(tǒng)計,我國每年由雜草引起的水稻產(chǎn)量損失約1000 萬t[4]。因此,創(chuàng)制和利用具有除草劑抗性的水稻品種尤為重要,是降低雜草危害、防治稻田雜草最經(jīng)濟有效的措施。
乙酰輔酶A 羧化酶(ACCase)是催化脂肪酸從頭合成反應(yīng)中第一步的限速酶,在合適的條件下可以催化乙酰輔酶A 生成丙二酰單酰輔酶A[5],是生物不可缺少的酶。乙酰輔酶A 羧化酶自1958 年被發(fā)現(xiàn)可以作為除草劑的靶標酶之后,得到了廣泛的應(yīng)用。以ACCase 作為靶標的除草劑,造成植物死亡的方式是抑制稗草等禾本科植物體內(nèi)的脂肪酸合成,而對闊葉作物安全無害[6],且具有高效、低毒、對后茬作物安全等特點[7]。研究發(fā)現(xiàn),水稻OsACC基因某些位點的突變可以賦予其對ACCase 抑制劑類除草劑的抗性,江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院張保龍團隊通過篩選發(fā)現(xiàn),水稻OsACC基因第1796、2015、2038、2052、2089、1796、1731、2276 位氨基酸發(fā)生突變,可對高效蓋草能、喹禾靈等除草劑產(chǎn)生抗性[8-10]。Xu 等[11]通過先導(dǎo)編輯方法結(jié)合抗性篩選獲得OsACC基因第2125 位氨基酸突變體。
甲磺酸乙酯(EMS,Ethyl methanesulfonate)作為效果顯著且負面影響小的化學(xué)誘變劑,被廣泛應(yīng)用于構(gòu)建具有優(yōu)良性狀的水稻突變體[12-14],在水稻抗除草劑資源創(chuàng)制及篩選中也起到至關(guān)重要的作用。王俊梅等[15]利用輻照和EMS 誘變84 份水稻材料,通過草甘膦的篩選獲得了5 份耐草甘膦水稻遺傳資源。廣東創(chuàng)新科研團隊通過化學(xué)誘變篩選方法研發(fā)出非轉(zhuǎn)基因抗除草劑材料潔田稻[16]。顧佳清等[17]利用EMS 處理粳稻品種中花11,從誘變的水稻群體中篩選出高產(chǎn)的突變體,經(jīng)過后代的純化,得到了可以直接推廣應(yīng)用的水稻突變新品系申化1 號。江群等[18]利用EMS 誘變水稻品種鎮(zhèn)糯19,創(chuàng)制出抗乙酰輔酶A 羧化酶抑制劑類除草劑種質(zhì)。陳天子等[19]以9311 為受體材料,利用EMS 誘變的方法創(chuàng)制出抗咪唑啉酮除草劑種質(zhì)。
本研究通過EMS 誘變水稻種子,然后通過植物組織培養(yǎng)的方法在培養(yǎng)基中添加ACCase 抑制劑類除草劑氟吡甲禾靈對愈傷組織進行篩選,并分化再生獲得了抗性植株,通過測序分析明確其突變類型并移栽大田自交收獲M2種子,之后在正季對M2種子進行大田抗性水平鑒定以及重要農(nóng)藝性狀鑒定,為水稻抗除草劑育種提供了新的種質(zhì)資源。
1.1 材料與試劑供試水稻材料R1010 由安徽未來種業(yè)有限公司提供,是已審定水稻品種未兩優(yōu)10號的父本,對本研究中所用除草劑高效蓋草能沒有抗性。所用試劑及除草劑相關(guān)信息見表1。
表1 本試驗所用試劑
1.2 水稻種子EMS 誘變、組織培養(yǎng)及抗除草劑突變體篩選取R1010 水稻種子50g,用清水浸泡2h,接著用5mg/mL 的EMS 水溶液浸泡14h,之后再用硫代硫酸鈉中和20min,誘變處理之后在無菌工作臺對種子進行消毒處理。先用75%乙醇消毒90s,用無菌水沖洗干凈之后,再用50%的84 消毒液振蕩消毒30min,用無菌水沖洗干凈接種于不加篩選劑的愈傷誘導(dǎo)培養(yǎng)基上并置于28℃培養(yǎng)室恒溫培養(yǎng)。每天保持18h 光照和6h 黑暗。培養(yǎng)20d之后,將長出來的愈傷組織轉(zhuǎn)移至加有除草劑氟吡甲禾靈(0.25g/L)的篩選培養(yǎng)基進行第1 輪抗性篩選,2 周后,將抗性小顆粒轉(zhuǎn)移至加有氟吡甲禾靈(0.5g/L)的篩選培養(yǎng)基進行第2 輪抗性篩選。第2輪抗性篩選2 周后,將篩選出來的抗性愈傷小顆粒轉(zhuǎn)移至加有氟吡甲禾靈(0.25g/L)的愈傷分化培養(yǎng)基,讓抗性愈傷組織再生成抗性植株。
1.3 抗除草劑突變體ACCase 基因的序列分析通過在國家水稻數(shù)據(jù)中心數(shù)據(jù)庫輸入基因號LOC_Os05g22940,獲得ACCase基因的序列,并根據(jù)其保守序列在NCBI 網(wǎng)站(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/index.cgi)在線設(shè)計特異性擴增引物,具體引物序列見表2。將再生的抗性單株生根培養(yǎng),單株標號并取葉片,使用傳統(tǒng)CTAB 法[20]提取基因組DNA 并用已提取的基因組DNA 作為模板,用設(shè)計的引物加上KOD mix 分別擴增基因片段,之后用1%的瓊脂糖凝膠進行電泳檢測分析,并將條帶正確的PCR 產(chǎn)物送生工生物工程有限公司進行測序。使用SnapGene 6.0.2 軟件分析測序結(jié)果,分析突變體與野生型的ACCase基因堿基差異并確定產(chǎn)生除草劑抗性的ACCase突變位點。
表2 ACCase 基因擴增引物序列
1.4 抗除草劑突變體的抗性水平鑒定及農(nóng)藝性狀調(diào)查經(jīng)過序列分析將確定突變位點的單株移栽大田并單株收獲得到M2種子,正季在安徽未來種業(yè)有限公司舒城水稻基地進行除草劑抗性水平鑒定試驗,5 月上旬播種,6 月上旬移栽,突變體和野生型材料R1010 分別移栽264 個單株,24 行,11列,行距0.27m,株距0.17m。對突變體和野生型材料R1010 噴施清水和3 個不同濃度的高效蓋草能:2 倍(60mL/667m2),4 倍(120mL/667m2),6 倍(180mL/667m2)。田間肥水使用參照常規(guī)大田管理。分別在除草劑噴施后的第21 天以及黃熟期對突變體及野生型材料R1010 進行農(nóng)藝性狀統(tǒng)計調(diào)查。
2.1 抗除草劑突變體篩選用加有除草劑氟吡甲禾靈的培養(yǎng)基對5000 顆水稻愈傷組織進行篩選4 周后,非抗性愈傷組織基本停止生長并褐化甚至死亡,而只有25 顆抗性愈傷組織生長旺盛并長出很多鮮黃色的次生小顆粒。抗性愈傷組織在加有氟吡甲禾靈的分化培養(yǎng)基上繼續(xù)分化培養(yǎng),24 顆愈傷組織都褐化并停止生長,只有1 顆愈傷組織再生出新的抗性植株(R1010-W2125C),將抗性植株轉(zhuǎn)移至生根培養(yǎng)基中直接生根壯苗,見圖1。
圖1 組織培養(yǎng)篩選抗性水稻突變體
2.2 突變體的ACCase 基因序列分析為確定唯一的一株抗性植株的突變位點以及突變類型,使用14 對引物對野生型材料R1010 以及突變體材料的ACCase基因分別進行擴增,都獲得了預(yù)期大小的片段(圖2)。
圖2 R1010 野生型和突變體中OsACC 基因的PCR 擴增結(jié)果
分別以野生型R1010 以及抗除草劑突變體的DNA 為模板擴增的PCR 產(chǎn)物經(jīng)一代測序分析和比對,發(fā)現(xiàn)與野生型ACCase基因開放閱讀框(ORF)相比,突變體ACCase基因中存在一個點突變,其開放閱讀框的第6375 位堿基由G 突變成C,從而引起編碼的第2125 位氨基酸由色氨酸突變?yōu)榘腚装彼幔▓D3)。
圖3 R1010 野生型和突變體中OsACC 基因序列的比對結(jié)果
2.3 M2 抗性水平鑒定及農(nóng)藝性狀調(diào)查野生型R1010 與抗除草劑突變體R1010-W2125C在不同濃度高效蓋草能噴施后表現(xiàn)出明顯差異,噴施除草劑3d 之后,野生型植株心葉開始死亡,到3 周左右整個植株逐步枯死,而突變體植株在4 種不同濃度的除草劑高效蓋草能噴施后依然生長旺盛,沒有藥害。
成熟期對野生型空白對照以及抗除草劑突變體進行農(nóng)藝性狀調(diào)查,發(fā)現(xiàn)在株高、全生育期、抽穗期、有效穗數(shù)、穗長、每穗粒數(shù)、千粒重、結(jié)實率等農(nóng)藝性狀上野生型空白對照與突變體無顯著差異(表3)。
表3 野生型R1010 及抗除草劑突變體R1010-W2125C 田間噴施不同濃度除草劑后的農(nóng)藝性狀
近年來,隨著社會經(jīng)濟的發(fā)展,水稻的生產(chǎn)模式正在發(fā)生巨大變革,水稻直播在生產(chǎn)中越來越普遍,伴隨直播而產(chǎn)生的稻田草害和雜草稻已成為制約水稻生產(chǎn)提質(zhì)增效的關(guān)鍵問題。為了緩解稻田草害問題,抗除草劑水稻新種質(zhì)的創(chuàng)制已成為迫切需求,各大高校和科研院所利用轉(zhuǎn)基因、物理化學(xué)誘變以及基因編輯等技術(shù)手段創(chuàng)制了一系列抗除草劑水稻種質(zhì),針對的除草劑類型包括草甘膦、草銨膦、咪唑啉酮類等。其中,草甘膦和咪唑啉酮類除草劑抗性水稻種質(zhì)較多,草甘膦抗性水稻種質(zhì)主要依賴轉(zhuǎn)基因技術(shù)手段,但是目前在我國仍然受到監(jiān)管,在生產(chǎn)應(yīng)用上受到限制??惯溥蜻惓輨┧痉N質(zhì)多由物理化學(xué)誘變或者自然變異而來,可以推廣應(yīng)用,但是咪唑啉酮類除草劑在土壤中半衰期和殘留期長,過量使用易對后茬作物造成藥害,導(dǎo)致減產(chǎn)甚至絕產(chǎn)[21]。芳氧苯氧丙酸酯類除草劑則兼有高效、低毒、對后茬作物安全等特點,但水稻不抗ACCase抑制劑類除草劑,該類藥物目前多在播種前作為田間封閉劑使用,且該類除草劑靶標位點單一,抗性雜草問題尤為嚴重。
本研究通過EMS 誘變水稻種子,并通過植物組織培養(yǎng)過程對誘變處理后的水稻種子進行愈傷誘導(dǎo),之后用除草劑氟吡甲禾靈對愈傷組織進行3 次抗性篩選,獲得抗ACCase 抑制劑類除草劑水稻植株,通過對ACCase基因進行測序分析,發(fā)現(xiàn)是由于ACCase基因開放閱讀框的第6375 位堿基由G 突變成C 從而引起編碼的第2125 位氨基酸由色氨酸突變?yōu)榘腚装彼?,使得ACCase 抑制劑類除草劑不能作用于ACCase 蛋白,因而植株表現(xiàn)出對相應(yīng)除草劑的抗性;后續(xù)通過對突變體M2材料進行抗性鑒定以及農(nóng)藝性狀調(diào)查,發(fā)現(xiàn)該突變材料可以抗6倍濃度蓋草能乳油,且生長發(fā)育過程中農(nóng)藝性狀無顯著變化,為水稻機械化生產(chǎn)提供了種質(zhì)基礎(chǔ)。本研究首次使用植物組織培養(yǎng)對抗除草劑突變體進行篩選,不僅減少了大量的田間種植和篩選的工作量,且在一定程度上減少了溫度、天氣、病蟲害等外部條件因素的影響,極大地提高了篩選效率,后續(xù)還需要對該材料進行多濃度精準抗性鑒定,并與母本雜交進行配合力分析,培育抗ACCase 抑制劑類除草劑的水稻新品種。