宋一曉,孫坤,劉學美,李子雁,隋智海*
(1.臨沂大學生命科學學院,山東 臨沂 276000;2.山東臨沂市河東區(qū)農(nóng)村農(nóng)業(yè)局,山東 臨沂 276034)
草魚(Ctenopharyngodon idellus),為典型的草食性淡水魚類,隸屬于鯉形目(Cypriniformes),雅羅魚亞科(Leuciscinae),草魚屬(Ctenopharyngodon)[1],與青魚、鳙、鰱并稱為“四大家魚”,為中國養(yǎng)殖產(chǎn)量較高的淡水經(jīng)濟魚類之一,2021 年養(yǎng)殖產(chǎn)量為557 萬t[2-3]。因其肉質(zhì)鮮美、營養(yǎng)豐富、價格低廉等,廣受消費者喜愛。但隨著養(yǎng)殖規(guī)模的擴大和養(yǎng)殖密度的增加,草魚病害如草魚呼腸孤病毒(Grass carp reovirus, GCRV)、柱狀黃桿菌(Flavobacterium columnare)、維氏氣單胞菌(Aeromonas veronii)等頻發(fā),造成了較大的經(jīng)濟損失,嚴重制約了草魚養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)健康發(fā)展[4-6]。
2022 年5 月,山東省臨沂市蒙陰縣某草魚養(yǎng)殖場暴發(fā)病害,病魚出現(xiàn)游動緩慢、覓食困難、口腔和體表出血、皮膚潰爛、脾臟腫大呈暗紅色和肝臟腫大充血等癥狀。為查明病因,從患病草魚脾肝腎混合組織中,分離純化出一株細菌,基于形態(tài)觀察、生理生化試驗、16S rRNA 序列和系統(tǒng)發(fā)育分析等,進行了種類鑒定,并測定了其藥物敏感性。擬為草魚病害的有效防控提供參考。
2022 年5 月。試驗地位于臨沂大學膜蛋白與藥物工程實驗室。
1.2.1 試驗魚從臨沂蒙陰縣某草魚養(yǎng)殖場收集瀕臨死亡的草魚,體長約25 cm,體質(zhì)量約1.5 kg。
1.2.2 試劑和儀器
LB 培養(yǎng)基(酵母提取物5 g/L,氯化鈉10 g/L,蛋白胨10 g/L)、瓊脂粉、瓊脂糖、2×Taq PCR Master Mix[生工生物工程(上海)股份有限公司]、細菌基因組DNA 提取試劑盒(DP302)(天根生化科技(北京)有限公司);革蘭染色液試劑盒(HB8278)、生理生化鑒定管(青島海博生物有限公司);藥敏紙片(杭州微生物試劑有限公司);生物安全柜BSC-1304IIA(蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司)、低速研磨器(天根生物有限公司)、臺式離心機Pico-21(Thermo Fisher)、電泳儀(北京市六一儀器廠)、凝膠成像系統(tǒng)FR-1000(上海復日科技有限公司)、PCR 儀ETC 811(北京東勝創(chuàng)新生物科技有限公司)、恒溫搖床QYC-200(上海?,攲嶒炘O(shè)備有限公司)、培養(yǎng)箱DMJM-358(寧波江南儀器廠)。
1.3.1 病原菌分離與純化
用75%乙醇噴灑患病草魚體表并擦拭。用滅菌手術(shù)剪剖開魚腹部,采集病魚肝臟、脾、腎等組織,加入無菌PBS,采用低速組織研磨器,碾碎混勻。用接菌環(huán),蘸取組織懸液,于LB 瓊脂培養(yǎng)基上劃線,置于28 ℃培養(yǎng),選擇具有生長及生物學優(yōu)勢的菌株,在LB 瓊脂培養(yǎng)基上純化2 次。將處在生長對數(shù)期的菌株溶液,與同體積50%甘油混勻,于-80 ℃冰箱中保存,備用。
1.3.2 病原菌形態(tài)學觀察
將細菌LB 液體培養(yǎng)至對數(shù)期,用接種環(huán)于LB固體平板上劃線,28 ℃過夜培養(yǎng),觀測單菌落形態(tài)、大小和顏色等特征。取10 μL 對數(shù)期菌懸液,涂布在載玻片上,按照革蘭染色液試劑盒說明書,經(jīng)結(jié)晶紫初染、碘液媒染、95%乙醇脫色、沙黃復染和自然干燥后,用光學顯微鏡觀察其結(jié)構(gòu)特征。
1.3.3 病原菌生理生化試驗
將細菌LB 液體培養(yǎng)至對數(shù)期,向生理生化鑒定管加50 μL 菌懸液,用無菌封口膜封住管口,置于37 或42 ℃培養(yǎng),完成MR-VP、賴氨酸脫羧酶肉湯、ONPG、尿酸酶、明膠、鳥氨酸脫羧酶肉湯、氨基酸脫羧酶對照、42 ℃生長試驗、不同濃度的胰胨水、糖類、醇類、精氨酸雙水解酶肉湯、氧化酶試紙等生理生化鑒定。試驗重復3 次。
1.3.4 16S rRNA 的PCR 擴增與系統(tǒng)發(fā)育分析
取4 μL 菌液接種至新鮮的4 mL LB 液體中,過夜培養(yǎng),將菌液12 000 g 離心5 min,收集1.5 mL菌體,用細菌基因組DNA 提取試劑盒,提取其基因組,作為PCR 擴增的模板。采用16S rRNA 基因通用引物27F:5’-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3’和1492R:5’-ACGGCTACCTTGTTACGACTT-3’擴增目的片段,預期大小為1 500 bp。PCR 反應體系(50 μL):2×Taq PCR Master Mix 25 μL、基因組DNA1 μL、27F 2.5 μL、1492R 2.5 μL、無菌水19 μL。
PCR 反應程序:(1)95 ℃預變性10 min;(2)94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸90 s,共30 次循環(huán);(3)72 ℃保溫10 min。PCR 反應產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測后,送至生工生物工程(上海)股份有限公司測序。采用在線BLASTN 程序(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/blast),進行序列同源性比對,下載同源性的16S rRNA 基因序列,采用MEGA-X軟件鄰接法(Neighborjoining method, NJ),構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.3.5 藥敏試驗
采用紙片擴散法進行藥敏特性測定。選用分別含一定濃度的羧芐西林、氨芐西林、米諾環(huán)素、頭孢唑啉、新霉素、紅霉素、頭孢拉定、丁胺卡那、四環(huán)素、環(huán)丙沙星、頭孢哌酮、復方新諾明、頭孢曲松、克林霉素、諾氟沙星、呋喃唑酮、多黏菌素B、哌拉西林、麥迪霉素、氯霉素等20 種抗生素藥敏紙片。在無菌條件下,將60 μL 培養(yǎng)至對數(shù)期的新鮮菌液,均勻涂布在LB 瓊脂平板上,待瓊脂培養(yǎng)基表面基本干燥后,將藥敏紙片分別貼于瓊脂培養(yǎng)基上,倒置培養(yǎng)24 h,觀察抑菌圈并測量直徑大小,按照試劑盒說明書,判定其對藥物的敏感性。試驗重復3 次。
從病魚肝脾腎混合組織中分離得到一株優(yōu)勢菌株,該菌株在LB 平板上形成表面光滑、邊緣整齊、不透明的圓形菌落[圖1(a)]。經(jīng)革蘭染色后,呈現(xiàn)紅色、短桿狀,表明該菌株為革蘭陰性菌[圖1(b)]。
圖1 病原菌形態(tài)特征
以該菌株基因組DNA 為模板,PCR 擴增16S rRNA 基因序列,擴增條帶單一,無非特異性擴增,位于1 000~2 000 bp 之間,符合預期大小,見圖2。經(jīng)BLASTN 序列比對后,發(fā)現(xiàn)其與魯氏耶爾森菌MYR-184(Yersinia ruckeriMYR-184)(GenBank No.MK290740.1)相似度高達100%。基于16S rRNA 基因序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果顯示,該菌株與魯氏耶爾森菌親緣關(guān)系最近,聚在同一分支,表明該菌株可能為魯氏耶爾森菌,見圖3。
圖2 菌株16S rRNA 的PCR 擴增
圖3 基于16S rRNA 基因序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹
通過生理生化鑒定管試驗,測定菌株生理生化特征。結(jié)果表明,該菌株在1%~3%氯化鈉(NaCl)、42 ℃條件下均可生長,在鳥氨酸脫羧酶、賴氨酸脫羧酶、MR-VP、β-半乳糖苷酶、甘露糖、甘露醇試驗中,結(jié)果為陽性;在尿素酶、精氨酸雙水解酶、6%~10%NaCl、乳糖、纖維二糖、阿拉伯糖、蔗糖、氧化酶、明膠的試驗中,結(jié)果為陰性,見表1。該試驗結(jié)果與魯氏耶爾森菌標準菌株的生理生化特征相似。
表1 菌株生理生化特征①
通過紙片擴散法,檢測分離菌株對藥物的敏感性。結(jié)果表明,該菌株對環(huán)丙沙星、頭孢曲松、諾氟沙星等11 種藥物呈高度敏感;對四環(huán)素、米諾環(huán)素、呋喃唑酮藥物呈中度敏感;對萬古霉素、麥迪霉素、頭孢唑啉等6 種藥物呈耐藥性,見表2。
表2 菌株藥物敏感性測定①
病原細菌感染的草魚,經(jīng)常引起腸炎、爛鰓、肝膽綜合征、出血癥等,導致其大量死亡[7]。其中,魯氏耶爾森菌(Yersinia ruckeri)是一種短桿狀的革蘭陰性病原菌,隸屬于腸桿菌科、耶爾森菌屬,易感染鮭、鱒類和溫水性魚類,可引起典型的紅口病,并伴有不同程度的內(nèi)臟發(fā)炎充血癥狀[8-10]。魯氏耶爾森菌具有較強的環(huán)境適應力和廣泛的宿主范圍,目前已從不同國家養(yǎng)殖的魚類如虹鱒、鰱、鳙、斑點叉尾等分離和鑒定出[11-15]。此外,耶爾森氏菌還可與其他病原菌如嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)、柱狀黃桿菌(F.columnare)和殺鮭氣單胞菌(A.salmonicida)等混合感染魚類,引發(fā)病害[16-17]。本試驗從患病草魚內(nèi)臟組織內(nèi)分離純化出一株菌株,經(jīng)過形態(tài)學、生理生化、16S rRNA 序列分析等確定其為魯氏耶爾森菌,通過表型鑒定和分子遺傳學鑒定相結(jié)合,使鑒定結(jié)果更加準確可靠。
藥敏試驗結(jié)果表明,該菌株已具備多重耐藥性,但也存在對一定數(shù)量的抗生素敏感。這與其他的研究結(jié)果既有相似之處,也有不同之處。例如:與Y. ruckeriXB2 對麥迪霉素耐受結(jié)果一致[18],與Y.ruckeriFF003 對新霉素中度耐受結(jié)果不一致[16]。
根據(jù)水產(chǎn)養(yǎng)殖用藥明白紙2022 年2 號規(guī)定,今后可考慮適當使用硫酸新霉素粉(水產(chǎn)用)、維生素C 磷酸醋鎂鹽酸環(huán)丙沙星預混劑、鹽酸環(huán)丙沙星鹽酸小檗堿預混劑來防治魯氏耶爾森菌,避免濫用藥物導致耐藥菌加速進化。