摘" 要： 針對現(xiàn)有的醫(yī)學(xué)文本關(guān)系抽取任務(wù)模型在訓(xùn)練過程中存在語義理解能力不足，可能導(dǎo)致關(guān)系抽取的效果不盡人意的問題，文中提出一種融合MacBERT和Talking?Heads Attention的實體關(guān)系聯(lián)合抽取模型。該模型首先利用MacBERT語言模型來獲取動態(tài)字向量表達(dá)，MacBERT作為改進(jìn)的BERT模型，能夠減少預(yù)訓(xùn)練和微調(diào)階段之間的差異，從而提高模型的泛化能力；然后，將這些動態(tài)字向量表達(dá)輸入到雙向門控循環(huán)單元（BiGRU）中，以便提取文本的上下文特征。BiGRU是一種改進(jìn)的循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（RNN），具有更好的長期依賴捕獲能力。在獲取文本上下文特征之后，使用Talking?Heads Attention來獲取全局特征。Talking?Heads Attention是一種自注意力機(jī)制，可以捕獲文本中不同位置之間的關(guān)系，從而提高關(guān)系抽取的準(zhǔn)確性。實驗結(jié)果表明，與實體關(guān)系聯(lián)合抽取模型GRTE相比，該模型[F1]值提升1%，precision值提升0.4%，recall值提升1.5%。

關(guān)鍵詞： MacBERT； BiGRU； 關(guān)系抽??； 醫(yī)學(xué)文本； Talking?Heads Attention； 深度學(xué)習(xí)； 全局特征； 神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)

中圖分類號： TN911.1?34" " " " " " " " " " " " " 文獻(xiàn)標(biāo)識碼： A" " " " " " " " " " " "文章編號： 1004?373X（2024）05?0127?05

Entity relation joint extraction model fusing MacBERT and Talking?Heads Attention

WANG Chunliang1， YAO Jieyi1， 2， LI Zhao1， 2

（1. Hubei Key Laboratory of Intelligent Vision Based Monitoring for Hydroelectric Engineering， Yichang 443000， China;

2. College of Computer and Information Technology， China Three Gorges University， Yichang 443000， China）

Abstract： The existing models for the task of relation extraction of medical text have the deficiency of insufficient semantic comprehension during the training process. This may result in unsatisfactory extraction outcomes. Therefore， a joint extraction model that fuses MacBERT and Talking?Heads Attention for entity relation joint extraction is proposed. In the model， the MacBERT language model is utilized to obtain dynamic word vector representations. MacBERT， as an upgraded BERT model， can lessen the differences between the pre?training and fine?tuning stages， so as to improve the model′s generalization capability. The dynamic word vector representations are then fed into a bidirectional gated recurrent unit （BiGRU）， so as to extract textual contextual features. BiGRU is an improved recurrent neural network （RNN） with better long?term dependency capture. After obtaining the text context features， the Talking?Heads Attention is used to obtain the global features. It is a self?attentive mechanism that can capture the relations between different locations in the text， so as to improve the accuracy of relation extraction. The experimental results show that the proposed model can improve the [F1] value by 1%， the precision value by 0.4% and the recall value by 1.5% in comparison with the entity relation joint extraction model GRTE.

Keywords： MacBERT; BiGRU; relation extraction; medical text; Talking?Heads Attention; deep learning; global feature; neural network

0" 引" 言

隨著生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的不斷發(fā)展，醫(yī)療數(shù)據(jù)的數(shù)字化記錄日益增多。這些中文醫(yī)療文本中包含了豐富的醫(yī)學(xué)知識，如病歷、醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)等。這些文本數(shù)據(jù)中包含著大量的實體和關(guān)系信息，如疾病、癥狀、藥物等實體以及這些實體之間的關(guān)系。因此，構(gòu)建一個穩(wěn)定的關(guān)系抽取模型，將非結(jié)構(gòu)化文本信息精準(zhǔn)和全面地自動轉(zhuǎn)化為符合大眾需求的結(jié)構(gòu)化信息，對于支持醫(yī)療領(lǐng)域的各種應(yīng)用，如知識圖譜[1]、信息檢索等具有重要的意義。在關(guān)系抽取領(lǐng)域，大量學(xué)者進(jìn)行了研究，以從非結(jié)構(gòu)化的醫(yī)學(xué)文本數(shù)據(jù)中提取出有用的信息，并服務(wù)于下游子任務(wù)。醫(yī)學(xué)教材以及電子病例數(shù)據(jù)等均為非結(jié)構(gòu)化的醫(yī)學(xué)文本數(shù)據(jù)，從這些文本中識別出醫(yī)學(xué)實體，并確定醫(yī)學(xué)實體之間關(guān)系的過程即為醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的關(guān)系抽取。

基于深度學(xué)習(xí)的關(guān)系抽取方法在解決手動特征工程問題[2]方面取得了比較好的成果?；谏疃葘W(xué)習(xí)的流水線實體關(guān)系抽取方法[3]主要是將命名實體識別和關(guān)系抽取作為兩個獨立的任務(wù)來完成。雖然這些方法能夠自動獲取文本特征，但它們無法有效解決錯誤傳播的問題。與之不同，基于深度學(xué)習(xí)的聯(lián)合抽取方法[4]的主要目的是同時實現(xiàn)句子中實體的識別和實體對關(guān)系之間關(guān)聯(lián)信息的抽取，這顯著提高了模型的性能。然而，現(xiàn)有的聯(lián)合實體關(guān)系抽取模型在訓(xùn)練過程中存在語義理解能力不足的問題。針對上述問題，本文提出了一種融合MacBERT和Talking?Heads Attention的實體關(guān)系聯(lián)合抽取模型。該模型旨在提高對醫(yī)學(xué)文本的語義理解能力，從而更好地實現(xiàn)醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的實體關(guān)系抽取。

本文貢獻(xiàn)如下：

1） 通過結(jié)合MacBERT的中文預(yù)訓(xùn)練模型和BiGRU的長距離依賴捕獲能力，可以增強模型在復(fù)雜任務(wù)中的語義理解能力。

2） 通過引入Talking?Heads Attention，可以在保持較低計算復(fù)雜度的同時提高模型的準(zhǔn)確性。

3） 將DuIE和CMeIE數(shù)據(jù)集應(yīng)用于該模型得到了最好的結(jié)果。

1" 相關(guān)工作

關(guān)系抽取是指自動識別文本數(shù)據(jù)中實體并確定它們之間關(guān)系的任務(wù)。近年來，隨著關(guān)系抽取技術(shù)的快速發(fā)展，基于深度學(xué)習(xí)的流水線和聯(lián)合實體關(guān)系抽取方法在關(guān)系抽取方向得到廣泛的應(yīng)用。

1.1" 流水線實體關(guān)系抽取方法

基于神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的流水線實體關(guān)系抽取方法受到了廣泛關(guān)注。其中，文獻(xiàn)[5]提出了一種基于注意力機(jī)制的圖卷積網(wǎng)絡(luò)模型，該模型采用軟剪枝方法，能夠有選擇地自動學(xué)習(xí)對關(guān)系提取任務(wù)有用的相關(guān)子結(jié)構(gòu)。文獻(xiàn)[6]融合了Bi?LSTM和CNN的特點，這種模型能夠更好地捕捉實體之間的關(guān)系信息，提高了關(guān)系抽取的準(zhǔn)確性和效率。文獻(xiàn)[7]使用了兩個獨立的編碼器，一個用于實體識別，另一個用于關(guān)系抽取，使用相同的預(yù)訓(xùn)練模型就達(dá)到了良好的性能。

1.2" 實體關(guān)系聯(lián)合抽取方法

為了解決流水線關(guān)系抽取帶來的誤差傳遞和特征共享等問題，基于深度學(xué)習(xí)的實體關(guān)系聯(lián)合抽取方法引起了越來越多研究者的關(guān)注。文獻(xiàn)[8]提出一種編碼器?解碼器體系結(jié)構(gòu)實體關(guān)系聯(lián)合抽取方法（WDec）。文獻(xiàn)[9]設(shè)計兩種不同的編碼器在學(xué)習(xí)過程中獲取這兩種不同類型的信息。考慮到關(guān)系三元組重疊問題，文獻(xiàn)[10]提出一種基于多任務(wù)學(xué)習(xí)的模型（CopyMTL），具有新的實體復(fù)制體系結(jié)構(gòu)。為了解決實體重疊問題，文獻(xiàn)[11]提出了一個新的級聯(lián)二進(jìn)制標(biāo)記框架（CasRel），該框架采用Span標(biāo)記的方法，這種方法根據(jù)每個關(guān)系識別出相應(yīng)的客體。然而，局部Span實體抽取方案缺乏魯棒性。文獻(xiàn)[12]提出了TPLinker關(guān)系抽取模型，該模型采用token對預(yù)測方案，通過執(zhí)行兩個[O（n2）]矩陣操作來提取實體，導(dǎo)致了關(guān)系冗余判斷問題。文獻(xiàn)[13]提出基于表格填充的面向全局特征的新型關(guān)系三元組提取模型（GRTE），該方法認(rèn)為現(xiàn)有的方法在填充關(guān)系表時僅僅依賴于局部特征，局部特征從單一的token pair或者從有限的token pairs的填充歷史中提取得到，然而卻忽略了兩種有價值的全局特征（Global Feature），即token pairs和各類關(guān)系的全局關(guān)聯(lián)關(guān)系。文獻(xiàn)[14]提出一種集合生成網(wǎng)絡(luò)（SPN4RE），該模型通過二位圖執(zhí)行[O（n2）]矩陣操作匹配出最優(yōu)三元組。文獻(xiàn)[15]提出基于依存圖卷積的實體關(guān)系抽取模型，該模型使用依存句法分析文本構(gòu)圖，然后通過雙向GraphSage提取其結(jié)構(gòu)特征，融入句法結(jié)構(gòu)的特征向量在預(yù)測關(guān)系時有著更好的表現(xiàn)。

2" 模型算法架構(gòu)

2.1" 編碼器模塊

圖1展示了本文提出的模型框架，該框架由四部分組成：MacBERT編碼器層、BiGRU層、表格填充模塊和解碼層。其工作原理如下：

首先，利用MacBERT編碼器層將中文文本數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為字符向量；然后，將MacBERT提取到的字符向量輸入到BiGRU層中進(jìn)行特征提??；接著，利用解碼器對生成的字符向量進(jìn)行解碼，生成相應(yīng)的標(biāo)簽序列。

本文中使用預(yù)訓(xùn)練Chinese?MacBERT?Base（Cased）模型與BiGRU作為編碼器。首先編碼器將給定的句子編碼成一個字符特征序列[H]（[H∈Rn×dh]），然后將[H]輸入到兩個分離的前饋網(wǎng)絡(luò)（FFN）中，生成初始的主體特征和客體特征（分別表示為[H1s和H1o]），其公式如下：

[H1s=W1H+b1]" （1）

[H1o=W2H+b2]" （2）

式中：[W1/2∈Rdh×dh]是可訓(xùn)練的權(quán)重；[b1/2∈Rdh]是可訓(xùn)練的偏差。

2.1.1" MacBERT層

為了提升實體關(guān)系抽取模型的準(zhǔn)確性，本文將MacBERT引入到本模型中。MacBERT是一種基于Transformer的中文自然語言處理模型，是在RoBERTa基礎(chǔ)上進(jìn)行修改得到的。MacBERT采用了一種改進(jìn)的掩碼策略，使用相似的詞來進(jìn)行掩碼，而不是使用[MASK]標(biāo)記，使得模型能夠?qū)W習(xí)到豐富的詞匯和句子表示。將MacBERT引入本模型中，可以使模型在抽取實體關(guān)系時更好地理解句子中的語義信息，從而提高關(guān)系抽取的精確性。其次，MacBERT是在大規(guī)模無標(biāo)簽文本數(shù)據(jù)上進(jìn)行預(yù)訓(xùn)練，學(xué)習(xí)到通用的語言表示，可以使模型在關(guān)系抽取任務(wù)上具備更強的泛化能力。

2.1.2" BiGRU層

為了改進(jìn)RNN，引入LSTM并進(jìn)行了修改。LSTM包含三個門控單元：輸入門、輸出門和遺忘門。GRU將輸入門和遺忘門合并成為更新門，以簡化計算。GRU通過引入“記憶元素”和“門元素”，保存長期序列信息?！坝洃浽亍遍L期保存信息，不隨時間流逝而消失；“門元素”包含更新門和重置門，處理輸入數(shù)據(jù)和更新重置。重置門決定新輸入與記憶元素的結(jié)合方式，更新門決定保存多少記憶元素到當(dāng)前步長。其計算公式如下：

[zt=σ（Wzxt+Uzht-1+bz）] （3）

[rt=σ（Wrxt+Urht-1+br）] （4）

[ht=tanh（Wxt+rt?Uht-1）] （5）

[ht=zt?ht-1+（1-zt）?ht] （6）

GRU結(jié)構(gòu)如圖2所示。因單向GRU傳輸特征向量只能向前單向傳播，易丟失重要特征，因此提出雙向GRU網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)，利用MacBERT層獲取的字向量輸入到雙向GRU中進(jìn)行特征提取，可充分利用特征向量聯(lián)系上下文信息。

2.2" 表格填充模塊和解碼器模塊

該方法將為每個關(guān)系維護(hù)一個表，該表中的項通常表示擁有該特定關(guān)系的兩個實體的開始和結(jié)束位置。因此三元組關(guān)系抽取任務(wù)被轉(zhuǎn)換為準(zhǔn)確有效地填充這些表的任務(wù)。首先，給出一個句子[S]=[w1，w2，…，wn]，將為每個關(guān)系[r]（[r∈R]，[R]是關(guān)系集）維護(hù)一個表[tabler]（大小為[n]×[n]）。TFG模塊將第[t]次迭代時的主體特征和客體特征分別表示為[H（t）s]和[H（t）o]。然后將它們作為輸入，該模塊為每個關(guān)系生成一個表特征。關(guān)系[r]在第[t]次迭代時的表特征為[TF（t）r]，它與[tabler]具有相同的大小，[TF（t）r]中的每個項表示實體對的標(biāo)簽特征。具體地說，對于一對（[wi]，[wj]），把它的標(biāo)簽特征表示為[TF（t）r（i，j）]，用公式（7）計算：

[TF（t）r=WrGeLU（H（t）s，i°H（t）o，j）+br] （7）

式中：“[°]”表示哈達(dá)瑪積；GeLU是激活函數(shù)；[H（t）s，i]和[H（t）o，j]分別是第[t]次迭代時字符[wi]和[wj]的特征表示。GFM模塊挖掘期望的兩類全局特征，在此基礎(chǔ)上生成新的主體和客體特征，然后這兩個新生成的特征將反饋給TFG進(jìn)行下一次迭代。具體來說，該模塊包括以下三個步驟：

步驟1：組合表特征。假設(shè)當(dāng)前迭代是[t]，首先將所有關(guān)系的表特征串聯(lián)在一起，生成一個統(tǒng)一表特征（表示為[TF（t）]），并且這個統(tǒng)一表特征將包含實體對和關(guān)系的信息；然后，在[TF（t）]上使用最大池化操作和FFN模型，分別生成主體相關(guān)表特征[TF（t）s]和客體相關(guān)表特征[TF（t）o]等，如式（8）、式（9）所示：

[TF（t）s=Wsmaxpool（TF（t））+bs] （8）

[TF（t）o=Womaxpool（TF（t））+bo] （9）

式中：[Ws/o∈R（|L|×|R|）×dh]是可訓(xùn)練權(quán)重；[bs/o∈Rdh]是可訓(xùn)練偏差。

步驟2：挖掘期望的兩類全局特征。首先，在[TF（t）s/o]上使用交談注意力方法來挖掘全局關(guān)聯(lián)關(guān)系；其次，采用交談注意力方法挖掘字符對的全局關(guān)聯(lián)。句子向量[H]也作為輸入的一部分，由于輸入句子是作為一個整體編碼的，因此[H]可能在一定程度上包含了字符的全局語義信息，從而有助于從整個句子的角度挖掘字符對之間的全局關(guān)聯(lián)；最后利用FFN模型生成新的主體和客體的特征。整個全局關(guān)聯(lián)挖掘過程可以用以下公式計算：

[TF（t）（s/o）=TalkingHeadAtt（TF（t）（s/o））] （10）

[H（t+1）（s/o）=TalkingHeadAtt（TF（t）（s/o），H，H）] （11）

[H（t+1）（s/o）=GeLU（H（t+1）（s/o）W+b）] " " "（12）

步驟3：進(jìn)一步調(diào)整步驟2生成的主體和客體特征。如果深度迭代TFG和GFM模塊，本文的模型相當(dāng)于一個非常深的網(wǎng)絡(luò)，因此可能出現(xiàn)梯度消失。為了避免這種情況，使用殘差網(wǎng)絡(luò)生成最終的主體和客體特征，如公式（13）所示：

[H（t+1）（s/o）=LayerNorm（H（t）（so）+H（t+1）（so））]" （13）

TG模塊以最后一次迭代時的表特征[TF（N）]為輸入，式（14）、式（15）解碼輸出所有三元組：

[tabler（i，j）=softmax（TF（N）r（i，j））] " " （14）

[tabler（i，j）=argmax?∈L（tabler（i，j）[?]）] " （15）

損失函數(shù)為：

[L=i=1nj=1nr=1R-logp（yr，（i，j）=tabler（i，j））=i=1nj=1nr=1R-logtabler（i，j）[yr，（i，j）]] " （16）

式中[yr，（i，j）∈1，?]是（[wi]，[wj]）關(guān)于關(guān)系[r]的真實標(biāo)簽索引。

3" 實驗與結(jié)果分析

3.1" 數(shù)據(jù)集

為了測試本文提出模型的性能，選取了兩個公開的中文數(shù)據(jù)集。CMeIE是在CHIP2020中發(fā)布[16]的基于schema的中文醫(yī)學(xué)信息抽取數(shù)據(jù)集。在數(shù)據(jù)集中近7.5萬三元組數(shù)據(jù)，2.8萬條疾病語句并定義了53個關(guān)系，包括10個同義子關(guān)系和其他43個其他子關(guān)系。DuIE是中國第一個大規(guī)模、高質(zhì)量的IE數(shù)據(jù)集[17]，數(shù)據(jù)集中包括49種常用的關(guān)系類型，45萬個獨特的主語謂語對象（SPO）三元組和21萬條句子。

表1統(tǒng)計了2個數(shù)據(jù)集中的訓(xùn)練集和測試集的數(shù)據(jù)。

3.2" 實驗設(shè)置

本實驗環(huán)境如下：使用Ubuntu 20.04操作系統(tǒng)，顯卡為RTX3090，顯卡大小為64 GB，Python版本為3.8.10，深度學(xué)習(xí)框架為PyTorch版本為1.7.0。具體超參設(shè)置如表2所示。

3.3" 結(jié)果分析

為了驗證本文提出的模型在抽取任務(wù)中的性能，將幾種模型與本文所提出的模型進(jìn)行了對比，如表3所示。從表3的深度神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)對比結(jié)果可以看出，本文提出的方法取得了最好的結(jié)果。

通過觀察得出，本文提出的模型在所有的評估指標(biāo)方面幾乎都較優(yōu)于其他關(guān)系抽取模型。值得注意的是，本文模型在CMeIE數(shù)據(jù)集上[F1]值相比GRTE值取得了1.0%的提升。其原因在于：本文提出的新模型在模型編碼器模塊將MacBERT預(yù)訓(xùn)練模型與BiGRU結(jié)構(gòu)相結(jié)合，增強了模型的語義理解能力；其次引入Talking?Heads Attention模塊，這是一種輕量級的注意力機(jī)制，通過將注意力權(quán)重映射到一個低維空間來減少計算復(fù)雜度。這種方法可以在保持高性能的同時，降低計算成本和內(nèi)存需求。

3.4" 模型消融實驗

為了分析本文提出的實體關(guān)系聯(lián)合抽取模型中各個模塊在模型中的貢獻(xiàn)，在CMeIE數(shù)據(jù)集上做了相關(guān)消融實驗。表4展示了消融實驗的性能指標(biāo)結(jié)果。

BiGRU對模型性能的貢獻(xiàn)：BiGRU能更好地捕捉到文本句子中的長距離依賴關(guān)系，提高模型語義理解能力。移除BiGRU后，模型可能在處理復(fù)雜句子結(jié)構(gòu)時表現(xiàn)較差。

Talking?Heads Attention對模型性能的貢獻(xiàn)：通過引入Talking?Heads Attention，可以在保持較低計算復(fù)雜度的同時提高模型的準(zhǔn)確性。

4" 結(jié)" 論

本文為提高模型語義理解能力，提出一種融合MacBERT和Talking?Heads Attention的實體關(guān)系聯(lián)合抽取模型。MacBERT可以通過對中文文本進(jìn)行編碼，得到更加準(zhǔn)確和豐富的語義表示，BiGRU可以捕捉到文本中的上下文信息，并將這些信息應(yīng)用于關(guān)系抽取任務(wù)中，兩者結(jié)合可以進(jìn)一步提高模型性能。通過引入Talking?Heads Attention，可以在保持較低計算復(fù)雜度的同時提高模型的準(zhǔn)確性。由于Talking?Heads Attention降低了計算復(fù)雜度，因此可以加速模型的訓(xùn)練和推理過程，使其適用于大規(guī)模數(shù)據(jù)集和實時應(yīng)用。然而，關(guān)系抽取任務(wù)中還存在一些挑戰(zhàn)和問題：數(shù)據(jù)集中存在噪聲和不一致性，這會對模型性能產(chǎn)生影響；數(shù)據(jù)集中存在長尾問題，即模型難以學(xué)習(xí)到數(shù)量較少的類別，如何處理長尾問題也是一個值得關(guān)注的問題。

注：本文通訊作者為王春亮。

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