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粉葛PtERF98基因克隆及表達(dá)分析

2024-10-16 00:00劉羽佳于白音羅可發(fā)何彬榮謝杰盈方曉婕劉博婷
山東農(nóng)業(yè)科學(xué) 2024年9期

摘要:乙烯響應(yīng)因子(e山y(tǒng)lene responsive facLor,ERF)是植物特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,在乙烯信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、植物生長(zhǎng)發(fā)育和逆境脅迫響應(yīng)中起重要的調(diào)控作用。為探明PLERF98轉(zhuǎn)錄因子在粉葛(Pueraria thomsonii Benth.)塊根采后生理性變質(zhì)(posL-harvesL physiological deIerioration,PPD)過(guò)程中的表達(dá)調(diào)控機(jī)制,本研究采用RT-PCR技術(shù)從火山粉葛葉組織中克隆PtERF98基因,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)、組織表達(dá)特異性分析和在PPD過(guò)程中的表達(dá)分析。結(jié)果顯示,PtERF98基因CDS序列長(zhǎng)450 bp,編碼149個(gè)氨基酸殘基,PIERF98蛋白理論分子量為16.93 kDa,理論等電點(diǎn)為8 06,為親水性不穩(wěn)定蛋白。蛋白結(jié)構(gòu)分析顯示,PtERF98具有典型的AP2保守結(jié)構(gòu)域,屬于ERF轉(zhuǎn)錄因子家族成員,定位于細(xì)胞核,無(wú)跨膜螺旋結(jié)構(gòu),含有1個(gè)信號(hào)肽和16個(gè)磷酸化位點(diǎn)。氨基酸序列同源性和系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析表明,PtERF98與大豆(Clycine max)CmERF98同源性最高且親緣關(guān)系最近。組織表達(dá)分析顯示,PtERF98基因在火山粉葛的根、莖、葉中均有表達(dá),且在不同組織中的相對(duì)表達(dá)量存在差異,葉中表達(dá)量最高。此外,PtERF98的表達(dá)受到PPD的顯著誘導(dǎo),表達(dá)水平隨著PPD時(shí)間延長(zhǎng)呈先升高后下降趨勢(shì),并在采后48 h達(dá)到最高,推測(cè)該基因可能參與粉葛塊根的PPD過(guò)程。本研究可為深入了解PtERF98基因的功能及其在粉葛PPD過(guò)程中的表達(dá)調(diào)控作用奠定研究基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞:粉葛;乙烯信號(hào)通路;PIERF98轉(zhuǎn)錄因子;采后生理性變質(zhì);生物信息學(xué)分析;表達(dá)分析

中圖分類號(hào):Q781:S567.9 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)號(hào):A 文章編號(hào):1001-4942(2024)09-0006-07

粉葛(Pueraria thomsonii Benth.)是豆科蝶形花亞科葛屬藤本植物,在我國(guó)廣泛分布。它的莖基部木質(zhì)化,并帶有肥厚的塊狀根。研究發(fā)現(xiàn),粉葛含有多種活性成分,主要包括葛根素、大豆苷元、染料木素、異甘草素等異黃酮類化合物,以及皂角精醇、槐二醇、大豆苷醇等皂苷類物質(zhì)?;鹕椒鄹鹗侵袊?guó)國(guó)家地理標(biāo)志產(chǎn)品之一,因生長(zhǎng)在廣東省韶關(guān)市曲江區(qū)大塘鎮(zhèn)火山地區(qū)而得名。與其他產(chǎn)地的粉葛相比,火山粉葛具有肉質(zhì)根,口感綿軟細(xì)嫩,味道甘甜,淀粉含量高,水分和纖維含量低,素有食不留渣的優(yōu)越品質(zhì)。作為一種“藥食同源”作物,火山粉葛具有保護(hù)心腦血管系統(tǒng)、降血糖和血脂、抗腫瘤、抗氧化、解酒等生物活性。此外,火山粉葛富含優(yōu)質(zhì)蛋白質(zhì)、多糖及多種微量元素,不僅可以作為美食,還有清熱、養(yǎng)肝、理氣、養(yǎng)顏等醫(yī)用功效,具有極高的食用價(jià)值和保健價(jià)值。同時(shí)植株還具有耐寒、抗旱和耐貧瘠等特性,是一種具有巨大發(fā)展?jié)摿Φ木G色能源植物。然而,粉葛的塊根在采收后2-3 d便會(huì)發(fā)生腐爛霉變等采后生理性變質(zhì)(post-harvest physiological deterioration,PPD)現(xiàn)象,嚴(yán)重制約它的貯藏、加工、運(yùn)輸和利用。因此,研究粉葛PPD的分子機(jī)制對(duì)于粉葛產(chǎn)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展具有重要意義。

乙烯(2-chloroethylphosphonic acid)是植物重要的內(nèi)源激素,對(duì)植物的生長(zhǎng)發(fā)育和非生物脅迫響應(yīng)起重要作用。例如,在植物缺水時(shí),乙烯水平迅速升高,以促進(jìn)植物葉片老化和脫落,維持植物體內(nèi)水分平衡。乙烯前體處理能顯著提高擬南芥(Arabidopsis thaliana)幼苗在高鹽脅迫下的存活能力。此外,乙烯信號(hào)與活性氧含量變化的相關(guān)性也得到研究證實(shí)。在皇冠梨(Pyrus bretschneideri)中,乙烯通過(guò)提高過(guò)氧化氫酶和超氧化物歧化酶的活性來(lái)抑制采后腐爛。擬南芥中的乙烯信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的關(guān)鍵成員包括乙烯受體(ethylene receptors)、CTR1蛋白激酶(Raf-like CTRl)、EIN2( ethylene insensitive 2)、EIN3(ethylene insensitive 3)/EILl(ethylene insensitive like l)、ERFl( ethylene response factor l)以及EBFl/2(EIN3 binding F-box l and 2)等。作為乙烯信號(hào)途徑中的核定位轉(zhuǎn)錄因子,ERF(ethylene responsive factor)轉(zhuǎn)錄因子屬于具有典型ERF結(jié)構(gòu)域的AP2/ERF轉(zhuǎn)錄因子大家族。ERF98是ERF家族的重要成員,在多種非生物脅迫應(yīng)激反應(yīng)中發(fā)揮調(diào)控功能。例如,擬南芥AtERF98通過(guò)調(diào)控維生素C合成關(guān)鍵基因的表達(dá),增強(qiáng)維生素C的合成能力,以清除鹽脅迫下積累的活性氧,提高鹽脅迫的耐受性。桃樹(shù)(Prunus persica)的PpERF98與PpERFl相互作用,共同介導(dǎo)茉莉酸/乙烯信號(hào)途徑中的ERF分支,從而負(fù)調(diào)控桃樹(shù)對(duì)流膠病菌(Lasiodiplodia theobromae)的抗性。然而,目前有關(guān)粉葛ERF轉(zhuǎn)錄因子的研究鮮有報(bào)道。

以往的研究顯示,活性氧積累是塊根類作物發(fā)生PPD的根本原因之一,而酶促褐變是PPD過(guò)程中最為明顯的表現(xiàn),其誘因是細(xì)胞組織中原有的酚類物質(zhì)被氧化成醌類化合物進(jìn)而聚集形成褐色或黑色物質(zhì)。課題組前期研究顯示,乙烯處理能夠通過(guò)提高抗氧化系統(tǒng)相關(guān)基因的表達(dá)來(lái)提升抗氧化酶的活性,繼而顯著抑制火山粉葛PPD進(jìn)程,但響應(yīng)機(jī)制尚不明確。因此,本研究基于前期火山粉葛轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析,從火山粉葛葉組織中克隆PtERF98基因編碼區(qū)(CDS)序列,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)和組織表達(dá)特異性分析,以明確該基因在PPD不同階段的表達(dá)模式,為深入研究PtERF98基因功能及其在粉葛PPD過(guò)程中的分子調(diào)控機(jī)制提供基礎(chǔ),也為通過(guò)現(xiàn)代育種技術(shù)培育火山粉葛優(yōu)良品種提供基因資源。