摘 要 黑線姬鼠(Apodemus agrarius)是農(nóng)林業(yè)典型害鼠,為探究黑線姬鼠對(duì)食物資源利用的變化特征,選取張廣才嶺東部地區(qū)三道關(guān)針闊葉混交林為研究地點(diǎn),分別于夏季(2020年6—8月)和秋季(2020年9—11月),采用鋏日法和樣線法采集黑線姬鼠樣本,利用DNA宏條形碼技術(shù)進(jìn)行黑線姬鼠食性分析。結(jié)果表明:黑線姬鼠的夏季食物主要為草本植物,胃容物包含14科19屬21種,其中以稗(Echinochloa crus-galli,87. 0%)和堪察加費(fèi)菜(Phedimus kamtschaticus,7. 0%)為主;秋季食物主要為喬木植物果實(shí),胃容物包含15科40屬44種,其中以蒙古櫟(Quercus mongolica,48. 3%)、濕地風(fēng)毛菊(Saussurea umbrosa,17. 0%)、樟子松(Pinus sylvestris var. mongolica,7. 9%)和葎草(Humulus scandens,6. 2%)為主;夏秋兩季均攝食的有14種,以濕地風(fēng)毛菊為主。通過(guò)Shannon-Wiener指數(shù)(夏季,H′ = 0. 50;秋季,H′ = 0. 83)、Simpson指數(shù)(夏季,D = 0. 77;秋季,D = 0. 62)和Chao1 指數(shù)(夏季,Chao1 = 12. 29;秋季,Chao1 =13. 50)等多樣性指數(shù)分析,發(fā)現(xiàn)黑線姬鼠的秋季食物組成較夏季更豐富,食物物種多樣性更高。研究結(jié)果探明了張廣才嶺三道關(guān)林區(qū)黑線姬鼠夏秋兩季的食物資源利用特征,為科學(xué)開(kāi)展鼠害防治提供基礎(chǔ)資料。
關(guān)鍵詞:黑線姬鼠;食性;季節(jié)變化;DNA宏條形碼;張廣才嶺
中圖分類號(hào):Q958. 1
文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
文章編號(hào):2310 - 1490(2024)- 04 - 0727 - 07
DOI:10.12375/ysdwxb.20240405
食物是物種生存和群落動(dòng)態(tài)變化的物質(zhì)與能量基礎(chǔ),是生存的資源[1]。對(duì)于嚙齒動(dòng)物來(lái)說(shuō),食物資源是否充沛不僅影響個(gè)體的行為特征,也會(huì)影響種群數(shù)量的動(dòng)態(tài)變化。研究發(fā)現(xiàn),在食物資源相對(duì)匱乏時(shí),營(yíng)養(yǎng)不良的鼠類比營(yíng)養(yǎng)正常的鼠類更傾向于打斗,以獲得更多的食物資源[2]。通過(guò)附加食物的實(shí)驗(yàn)研究表明,相比無(wú)附加食物的種群,附加食物能有效降低鼠類種群內(nèi)部的競(jìng)爭(zhēng)行為,并使種群數(shù)量維持在較高水平[3]。上述研究表明食物資源的可利用性對(duì)鼠類種群數(shù)量變化具有潛在影響。
黑線姬鼠(Apodemus agrarius)是一種小型農(nóng)林業(yè)害鼠[4],遍布于我國(guó)東部各地及新疆西北部[5]。黑線姬鼠屬雜食性偏植物食性,具有較寬泛的食物資源利用類型[6?7]。根據(jù)本課題組2014—2018年對(duì)張廣才嶺東部地區(qū)的持續(xù)監(jiān)測(cè)可知,初期黑線姬鼠主要分布于農(nóng)田生境[8],而后期針闊葉混交林中的黑線姬鼠數(shù)量急劇增加,并成為三道關(guān)林區(qū)的優(yōu)勢(shì)物種[9]。在黑線姬鼠分布區(qū)域轉(zhuǎn)變以及種群數(shù)量增加這一過(guò)程中,黑線姬鼠的食物資源利用特征如何變化尚未可知。食性分析是掌握鼠類對(duì)食物資源利用和環(huán)境適應(yīng)能力情況的重要手段[10?11]。傳統(tǒng)食性分析方法一般包括糞便顯微組織分析法[12]、胃容物分析法、剖胃目視法[13?15]、野外觀察法[16]和幾何形態(tài)學(xué)法[17],其優(yōu)點(diǎn)是成本低、易操作[18],但具有工作量大、食物組分難以準(zhǔn)確區(qū)分的缺點(diǎn)[19]。隨著分子生物技術(shù)的發(fā)展,目前多數(shù)研究采用基于高通量測(cè)序的DNA宏條形碼技術(shù)進(jìn)行食性分析,這大大提高了食物分析的準(zhǔn)確性[20?23]。本研究應(yīng)用DNA宏條形碼技術(shù)分析張廣才嶺東部地區(qū)黑線姬鼠夏秋兩季的植物性食性特征,在野生動(dòng)物食性研究方面突破了傳統(tǒng)的顯微分析方法,為野生動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)生態(tài)學(xué)的研究提供了新的方法和思路,以期為科學(xué)制定鼠害防治策略提供基礎(chǔ)資料。
1 材料與方法
1. 1 研究區(qū)概況
三道關(guān)林場(chǎng)(44°41′—44°51′ N,129°17′—129°35′ E)位于牡丹江市西北部,屬長(zhǎng)白山系張廣才嶺東坡。該區(qū)域?qū)贉貛Т箨懶约撅L(fēng)氣候,年平均降水量為537 mm,海拔380 ~ 550 m,屬于流水侵蝕山地[24]。研究區(qū)為針闊葉混交林生境,主要有紅松(Pinus koraiensis)、蒙古櫟(Quercus mongolica)、胡桃楸(Juglans mandshurica)、樟子松(Pinus sylvestrisvar. mongolica)、紫椴(Tilia amurensis)和毛榛(Cory?lus mandshurica)等[25?26]。
1. 2 樣品采集
分別于夏季(2020年6—8月)和秋季(2020年9—11月)采用鋏日法(15 cm × 8 cm鐵板捕鼠鋏)采集黑線姬鼠樣本。在三道關(guān)林場(chǎng)設(shè)置2塊生境環(huán)境相同的調(diào)查樣地,每塊樣地按3條樣線布鋏,樣線間隔20 m,鋏距5 m,每條樣線放置100個(gè)捕鼠鋏。以炒熟的白瓜子為誘餌,24 h后查看捕獲情況并補(bǔ)充誘餌。排除捕獲的其他鼠類物種后,共采集黑線姬鼠21只,其中夏季 7只(樣本名稱:XH1、XH2、XH3、XH4、XH5、XH6和XH7)、秋季14只(樣本名稱:QH1、QH2、QH3、QH4、QH5、QH6、QH7、QH8、QH9、QH10、QH11、QH12、QH13和QH14)。本研究已通過(guò)牡丹江師范學(xué)院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物福利倫理委員會(huì)的審查(2023002)。
1. 3 樣品制備與DNA 宏條形碼分析
在無(wú)菌環(huán)境下解剖黑線姬鼠獲取胃容物,取0. 3 ~ 0. 5 g 胃容物置于2 mL 離心管中,放入冰箱-80 ℃保存,以待后續(xù)分析。在無(wú)菌條件下向胃容物中加入TE緩沖液進(jìn)行研磨,加入10 μL蛋白酶K,于56 ℃恒溫條件下消化12 h 后,使用FAST 土壤DNA提取試劑盒(MP Biomedicals, Santa Ana,CA)提取DNA。所得產(chǎn)物溶于TE緩沖液中,經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)(110 V,20 min)后于冰箱-20 ℃保存。
對(duì)合格樣本的檢測(cè)區(qū)域設(shè)置3個(gè)重復(fù)實(shí)驗(yàn),進(jìn)行高保真PCR擴(kuò)增,同時(shí)以標(biāo)準(zhǔn)基因組DNA Mix作為陽(yáng)性對(duì)照,擴(kuò)增引物選用葉綠體基因trnL(UAA)內(nèi)含子序列中的P6環(huán)(10 143 bp)。以胃容物DNA為模板,16S UAA為目的區(qū)域,用引物trnL(UAA)-F(5′-GGGCAATCCTGAGCCAA-3′)和trnL(UAA)-R(5′-CCATTGAGTCTCTGCACCTATC-3′)[27]對(duì)trnL 葉綠體基因片段進(jìn)行擴(kuò)增。PCR 擴(kuò)增體系總體積為25. 00 μL,包括5×反應(yīng)緩沖液5. 00 μL,5 × GC緩沖液5. 00 μL,dNTP(2. 5 mmol/L)2. 00 μL,正向引物(10 μmol/L)1. 00 μL,反向引物(10 μmol/L)1. 00 μL,模板DNA(DNA Template)2. 00 μL,雙蒸餾水8. 75 μL,Q5 DNA聚合酶0. 25 μL。PCR擴(kuò)增程序:98 ℃預(yù)變性2 min;98 ℃變性15 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共20個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸5 min,4 ℃保存。將PCR產(chǎn)物用磁珠純化回收,將上清液移到1. 5 mL離心管中保存,采用Illumina MiSeq/NovaSeq高通量測(cè)序平臺(tái)制備文庫(kù)以及對(duì)群落DNA片段進(jìn)行雙端(paired-end)測(cè)序。測(cè)序由上海天昊生物科技有限公司完成。
1. 4 數(shù)據(jù)分析
原始數(shù)據(jù)經(jīng)過(guò)QIIME2軟件的cutadapt插件去除可能包含的adapter序列和引物后,統(tǒng)計(jì)原始數(shù)據(jù)質(zhì)量。為得到高質(zhì)量的測(cè)序數(shù)據(jù),以提高后續(xù)生物信息分析的準(zhǔn)確性,使用QIIME2軟件的DADA2插件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)量過(guò)濾、降噪、拼接及去嵌合體。采用擴(kuò)增序列變體(amplicon sequence variant,ASV)僅去掉重復(fù)序列,不進(jìn)行相似度聚類,使用QIIME2 的DADA2插件進(jìn)行質(zhì)控后直接生成分類單元,并對(duì)每個(gè)樣品進(jìn)行ASV抽平,然后選取有效的OTU代表性序列,與數(shù)據(jù)庫(kù)(16S默認(rèn)Greengenes Database 13_8版本)進(jìn)行比對(duì),采用樸素貝葉斯分類器(na?veBayes classifier)注釋被挑選出來(lái)的有效特征序列,將每個(gè)樣本的分類信息按照不同的分類水平整合到一起,導(dǎo)入QIIME2 軟件,再運(yùn)用QIIME2 軟件的DADA2插件進(jìn)行質(zhì)控后直接生成物種注釋信息,在物種注釋信息的基礎(chǔ)上,去掉注釋信息為葉綠體和不能注釋到界級(jí)別的OTU及其包含的序列,并刪除豐度小于0. 005% 的特征,基于OTU 的絕對(duì)豐度及注釋信息,對(duì)每個(gè)樣品在7個(gè)分類水平(界、門(mén)、綱、目、科、屬、種)上的所有序列數(shù)目所占總序列數(shù)的比例進(jìn)行統(tǒng)計(jì),根據(jù)ASV/OTU表,統(tǒng)計(jì)研究樣本在界、門(mén)、綱、目、科、屬、種7 個(gè)分類水平上的物種豐度。用R軟件包中的ggplot2和VennDiagram分析物種相對(duì)豐度柱狀圖,進(jìn)而分析黑線姬鼠夏秋季植物性食物組成,由于在物種注釋時(shí)可能存在錯(cuò)配現(xiàn)象,導(dǎo)致出現(xiàn)的物種不是本地物種,在這種情況下,將非本地物種所在屬作為注釋結(jié)果。采用觀測(cè)物種數(shù)、Shannon-Wiener指數(shù)(H')、Simpson指數(shù)(D)和Chao1指數(shù)進(jìn)行兩季食物多樣性比較,公式為
式中:Pi為第i 種植物的相對(duì)豐度;N 為所有序列數(shù),ni指第i 個(gè)ASV所含的序列數(shù)。
2 結(jié)果
2. 1 黑線姬鼠夏季植物性食性特征分析
黑線姬鼠夏季胃容物中共鑒定出14科19屬21種植物,植物相對(duì)豐度(relative abundance,RD)大于1. 0%的植物有5種。黑線姬鼠夏季優(yōu)勢(shì)食物為禾本科(Poaceae)稗屬(Echinochloa)稗(E. crus-galli),達(dá)植物總豐度的87. 0%,其后依次為景天科(Crassu?laceae)費(fèi)菜屬(Phedimus)堪察加費(fèi)菜(Ph. kamts?chaticus)、菊科(Asteraceae)風(fēng)毛菊屬(Saussurea)濕地風(fēng)毛菊(S. umbrosa)、菊科蒿屬(Artemisia)蔞蒿(A. selengensis)和松科(Pinaceae)松屬(Pinus)樟子松,分別占植物總豐度的7. 0%、1. 4%、1. 4% 和1. 1%(圖1)。
2. 2 黑線姬鼠秋季植物性食性特征分析
黑線姬鼠秋季胃容物中共鑒定出15科40屬44種植物,其中RD gt; 1. 0%的植物有10種。黑線姬鼠秋季優(yōu)勢(shì)食物為殼斗科(Fagaceae)櫟屬(Quercus)蒙古櫟,RD = 48. 3%。此外,RD大于5. 0%的植物包括濕地風(fēng)毛菊(RD = 17. 0%)、樟子松(RD = 7. 9%)、大麻科(Cannabaceae)葎草屬(Humulus)葎草(H. scan?dens,RD = 6. 2%)(圖2)。
2. 3 黑線姬鼠夏秋兩季植物性食性的差異
經(jīng)Illumina高通量測(cè)序后,在21份樣本中共得到1 517 392條reads,經(jīng)降噪等處理后得到1 418 287條有效序列用于數(shù)據(jù)分析。經(jīng)聚類獲得77個(gè)ASV,其中黑線姬鼠夏季ASV有33個(gè)(占比42. 9%)、秋季ASV有58個(gè)(占比75. 3%,圖3)。夏季特有ASV共19個(gè),秋季特有ASV共44個(gè),夏秋兩季共有14個(gè)ASV,均少于兩季特有ASV數(shù),說(shuō)明黑線姬鼠夏秋季植物性食物組成有差異。黑線姬鼠夏季主要以草本植物為食,取食種類主要有5種,而秋季主要以喬木植物果實(shí)為食,取食種類主要有10種。兩季相同的食物種類為濕地風(fēng)毛菊和樟子松,但夏季取食量較少(圖4)。
從黑線姬鼠的植物性食物多樣性特征來(lái)看,秋季的觀測(cè)物種數(shù)、Chao1指數(shù)和Shannon-Wiener多樣性指數(shù)均高于夏季,而夏季Simpson 指數(shù)高于秋季(表1),表明黑線姬鼠秋季食物組成多樣性明顯高于夏季,取食植物種類和數(shù)量更為豐富。
3 討論
動(dòng)物食性分析方法是科學(xué)掌握鼠類食物資源利用特征和環(huán)境適應(yīng)方式的重要手段。傳統(tǒng)食性分析方法簡(jiǎn)單、成本低,但在確定食物組成方面準(zhǔn)確性不高,很多植物碎屑難于鑒定[13],而近年來(lái)應(yīng)用較多的分子分析方法能較好地解決這一問(wèn)題[28],因此當(dāng)前嚙齒動(dòng)物的食性分析研究中多采用DNA宏條形碼技術(shù)[29?30],但該方法也存在一定的局限性,如在實(shí)驗(yàn)操作時(shí),樣本里混入了污染物或測(cè)序時(shí)發(fā)生序列錯(cuò)誤等,都會(huì)影響后續(xù)測(cè)序結(jié)果的準(zhǔn)確性[19]。Brandon-Mong et al. [31]研究發(fā)現(xiàn),DNA宏條形碼分析結(jié)果中出現(xiàn)高水平OTUs的原因一方面是文庫(kù)測(cè)序時(shí)引物雜交引起的錯(cuò)誤,另一方面是在檢測(cè)中發(fā)現(xiàn)存在殘留組織,如卵、微小標(biāo)本和內(nèi)共生細(xì)菌(如沃爾巴克氏體)等。
不同生境類型中的鼠類可利用的食物資源類型存在明顯差異。張旭新[32]研究發(fā)現(xiàn),鼢鼠(Myospa?lacinae)在不同生境類型樣地中的食物種類組成明顯不同,說(shuō)明鼢鼠的取食在很大程度上受生境中植被類型的影響。本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),在三道關(guān)林場(chǎng)針闊混交林生境中,黑線姬鼠夏季以草本植物為主要食物資源,秋季以喬木植物果實(shí)為主要食物資源。與以往研究相比,張廣才嶺農(nóng)田生境中黑線姬鼠在夏秋季主要利用人工種植的大豆(Glycine max)、馬鈴薯(Solanum tuberosum)等作為食物資源,在冬春季則以動(dòng)物性食物和綠色植物為食[23]。這一結(jié)果表明,一方面黑線姬鼠對(duì)果實(shí)等食物資源存在偏好,會(huì)優(yōu)先利用果實(shí)作為主要能量補(bǔ)充[33],另一方面,不同生境中的食物資源類型會(huì)驅(qū)動(dòng)黑線姬鼠取食發(fā)生變化。
本研究表明,季節(jié)變化也會(huì)引起黑線姬鼠可利用的植物性食物資源類型發(fā)生轉(zhuǎn)變。三道關(guān)林場(chǎng)屬于溫帶大陸性季風(fēng)氣候,本研究所選樣地氣候濕潤(rùn),低矮植被茂盛,喬木主要以蒙古櫟和樟子松為主。根據(jù)研究結(jié)果可知,黑線姬鼠夏秋兩季食物種類組成差異較大,依據(jù)植物科學(xué)數(shù)據(jù)中心(https://www.plantplus. cn/cn)查詢得知,對(duì)于本研究所鑒定出的植物,夏季大部分植物的花期在6—7月,果期在8—10月,此時(shí)食物資源豐富,黑線姬鼠食物組成豐富,多為草本植物;秋季喬木的果期在9—10月,草本植物的果期在8—9月,食物種類較少,且多為果實(shí),該查詢結(jié)果與夏秋兩季生長(zhǎng)的植物花果期相符,說(shuō)明了該數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性。有研究表明,黑線姬鼠主要食用植物的根、莖和葉,較少食用種子[13],而本研究夏季食物中發(fā)現(xiàn)樟子松,可能是秋冬季節(jié)果實(shí)成熟自然脫落和貯食遺留。
黑線姬鼠為雜食性鼠類,除了以植物為主要食物外,還以蝗蟲(chóng)、蚯蚓等無(wú)脊椎動(dòng)物為食[13,23]。本研究未進(jìn)行動(dòng)物性食性檢測(cè),尚不能獲取黑線姬鼠動(dòng)物性食物構(gòu)成的有效信息,后續(xù)需開(kāi)展相關(guān)研究。
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基金項(xiàng)目:研究生科技創(chuàng)新項(xiàng)目(kjcx2023-118mdjnu);黑龍江省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(SS2021C006);牡丹江師范學(xué)院橫向課題(2021H001)