摘""要:磷酸丙糖/磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(triose-phosphate/phosphate"translocator,"TPT)是一種磷酸丙糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,在植物碳代謝途徑以及非生物脅迫中發(fā)揮重要作用。蔗糖具有廣泛的食用價值和重要的經(jīng)濟(jì)價值,甘蔗是制糖的主要原料,蔗糖占中國產(chǎn)糖量的80%以上,因此實(shí)現(xiàn)甘蔗高產(chǎn)高抗目標(biāo)至關(guān)重要。本研究以甘蔗品種新臺糖22號(ROC22)為材料,克隆獲得甘蔗磷酸丙糖/磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因ShTPT,利用生物信息學(xué)方法對ShTPT進(jìn)行蛋白理化性質(zhì)、保守結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測和蛋白序列比對。結(jié)果顯示:ShTPT基因CDS全長1221"bp,編碼406個氨基酸,蛋白分子量為43.63"kDa,等電點(diǎn)(pI)為9.80,富含丙氨酸、亮氨酸,不穩(wěn)定系數(shù)為42.51,親水系數(shù)為0.583,是一種不穩(wěn)定的疏水性蛋白;ShTPT蛋白不含信號肽并具有9個跨膜結(jié)構(gòu)域;保守結(jié)構(gòu)域預(yù)測顯示ShTPT含有1個TPT結(jié)構(gòu)域,符合TPT家族特征;進(jìn)化分析結(jié)果顯示,ShTPT與高粱SbTPT(XP_002454867.1)、玉米ZmTPT(NP_001105497.1)聚在一起,同源性分別為97.04%和94.13%。進(jìn)一步對ShTPT進(jìn)行亞細(xì)胞定位分析發(fā)現(xiàn)ShTPT定位在葉綠體。甘蔗組織表達(dá)模式分析表明,ShTPT主要在葉片中表達(dá),在根部和莖中的表達(dá)量極低。在PEG模擬的干旱脅迫條件下ShTPT的表達(dá)量表現(xiàn)出升-降-升的趨勢,表明其響應(yīng)干旱脅迫。該研究結(jié)果表明ShTPT是一個定位于葉綠體的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,可能參與甘蔗葉片中的原初碳代謝化合物的轉(zhuǎn)運(yùn),響應(yīng)干旱脅迫。本研究初步確定甘蔗ShTPT基因在葉片中碳同化物的轉(zhuǎn)運(yùn)和非生物脅迫方面發(fā)揮重要作用,為進(jìn)一步研究其功能提供理論依據(jù)。
關(guān)鍵詞:甘蔗;磷酸丙糖/磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(TPT);亞細(xì)胞定位;干旱脅迫;表達(dá)分析中圖分類號:S566.1""""""文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
Cloning"and"Expression"Analysis"of"the"Phosphate"Triose/Phosphate"Transporter"Gene"ShTPT"in"Sugarcane
ZHAO"Xueting1,2,"ZHAO"Tingting1,2,"FENG"Cuilian1,2,"GAO"Liyan1,2,"LIN"Jishan1,2"FENG"Xiaoyan1,2,"WANG"Wenzhi1,2,"SHEN"Linbo1,2,"ZHANG"Shuzhen1,2,"WANG"Jungang1,2*
1."National"Key"Laboratory"for"Tropical"Crop"Breeding"/"Key"Laboratory"of"Biology"and"Genetic"Resources"of"Tropical"Crops,"Ministry"of"Agriculture"and"Rural"Affairs"/"Hainan"Institute"of"Tropical"Agricultural"Resources"/"Key"Laboratory"for"Biology"and"Genetic"Resources"of"Tropical"Crops"of"Hainan"Province"/"Institute"of"Tropical"Bioscience"and"Biotechnology,"Chinese"Academy"of"Tropical"Agricultural"Sciences,"Haikou,"Hainan"571101,"China;"2."Sanya"Research"Institute,"Chinese"Academy"of"Tropical"Agricultural"Sciences,"Sanya,nbsp;Hainan"572024,"China
Abstract:"The"triose-phosphate/phosphate"translocator"(triose-phosphate/phosphate"translocator,"TPT)"is"a"triose"phosphate"transporter"that"plays"an"important"role"in"plant"carbon"metabolism"pathways"as"well"as"abiotic"stresses."Sucrose"has"a"wide"range"of"edible"value"and"important"economic"value."Sugarcane"is"the"main"raw"material"for"sugar"production,"and"sucrose"from"sugarcane"accounts"for"more"than"80%"of"China's"sugar"production,"so"it"is"very"important"to"achieve"the"goal"of"high"yield"and"high"resistance"of"sugarcane."In"this"study,"the"sugarcane"variety"ROC22"was"used"as"the"material"to"clone"the"sugarcane"triose/phosphate"transporter"gene"ShTPT,"and"the"physicochemical"properties,"conserved"domains,"transmembrane"structure"prediction"and"protein"sequence"comparison"of"ShTPT"were"carried"out"by"bioinformatics"methods."The"results"showed"that"the"CDS"of"ShTPT"was"1221"bp,"encoding"406"amino"acids,"the"molecular"weight"of"the"protein"was"43.63"kDa,"and"the"isoelectric"point"(pI)"was"9.80."It"was"rich"in"alanine"and"leucine,"its"instability"coefficient"was"42.51,"and"its"hydrophilic"coefficient"was"0.583,"which"was"an"unstable"hydrophobic"protein."ShTPT"did"not"contain"signal"peptides"but"had"9"transmembrane"domains."Conserved"domain"prediction"showed"that"ShTPT"contained"a"tpt"domain,"which"was"consistent"with"the"characteristics"of"the"TPT"family."The"results"of"phylogenetic"analysis"showed"that"ShTPT"was"clustered"with"Sorghum"bicolor"SbTPT"(XP_002454867.1)"and"Zea"mays"ZmTPT"(NP_001105497.1)"with"homology"of"97.04%"and"94.13%,"respectively."Further"subcellular"localization"analysis"of"ShTPT"showed"that"ShTPT"was"localized"in"chloroplasts."Tissue"expression"pattern"analysis"of"sugarcane"showed"that"ShTPT"was"mainly"expressed"in"leaves,"and"the"expression"level"in"roots"and"stems"was"very"low."Under"the"drought"stress"conditions"simulated"by"PEG,"the"expression"of"ShTPT"showed"an"upward"trend,"indicating"that"it"responded"to"drought"stress."The"results"of"this"study"suggest"that"ShTPT"is"a"chloroplast-localized"transmembrane"transporter,"which"may"be"involved"in"the"transport"of"primary"carbon"metabolic"compounds"in"sugarcane"leaves"and"responsive"to"drought"stress."This"study"preliminarily"determined"that"ShTPT"gene"plays"an"important"role"in"the"transport"of"carbon"assimilates"in"leaves"and"abiotic"stress,"which"provides"a"theoretical"basis"for"further"study"of"its"function.
Keywords:"sugarcane;"triose-phosphate"/"phosph"ate"translocator"(TPT);"subcellular"localization;"drought"stress;"expression"analysis
DOI:"10.3969/j.issn.1000-2561.2024.11.004
光合器官通過卡爾文循環(huán)將CO2同化為有機(jī)化合物,為地球上所有生命提供必不可少的基礎(chǔ)物質(zhì)。在植物和藻類中,固定的碳以磷酸丙糖的形式通過磷酸丙糖轉(zhuǎn)運(yùn)體(triose-phosphate/"phosphate"translocator,"TPT)從葉綠體輸出。TPT在葉綠體內(nèi)膜上催化無機(jī)磷酸鹽(Pi)與三磷酸甘油醛(3-GAP)、二羥丙酮磷酸(DHAP)與3-磷酸甘油醛等三磷酸酯的交換運(yùn)輸[1-4],磷酸丙糖轉(zhuǎn)運(yùn)體屬于質(zhì)體磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn)體(pPTs)家族,能夠與Pi對向轉(zhuǎn)運(yùn)磷酸化C3、C5和C6化合物[5],其成員在所有光合生物真核生物和其他具有質(zhì)體的生物中廣泛分布,多數(shù)被子植物基因組中有2個TPT基因,而莧科(Amaranthaceae)和十字花科(Brassicaceae)物質(zhì)只有1個TPT基因[6-7]。陸生植物擁有4個pPT亞型,包括磷酸丙糖/磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)體(TPT)、磷酸烯醇丙酮/磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)體(PPT)、葡萄糖-6-磷酸/磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)體(GPT)和木糖醇-5-磷酸/磷酸轉(zhuǎn)運(yùn)體(XPT),分別轉(zhuǎn)運(yùn)不同的糖磷酸并在各種代謝途徑中發(fā)揮關(guān)鍵作用[8-9],因此它們被視為用于改善作物產(chǎn)量的基因操縱的主要目標(biāo)[10-11]。
在過去的幾十年里,對TPT的生理功能進(jìn)行了比較詳細(xì)的研究。通過敲除植物體內(nèi)TPT基因和減少其表達(dá)量,發(fā)現(xiàn)植株的表型均無明顯的變化。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn),TPT活性降低能夠促進(jìn)同化物向臨時儲存淀粉轉(zhuǎn)化,并在光照階段同時增加淀粉的轉(zhuǎn)化率,從而彌補(bǔ)了TPT活性的缺失,此過程代謝中間產(chǎn)物釋放無機(jī)磷(Pi),以維持光合碳同化過程[12-14]。而在水稻(Oryza"sativa)的突變TPT基因植株葉片中蔗糖濃度升高、淀粉和可溶性糖含量減少、植物光合速率降低,且植株生長矮小,表明通過臨時淀粉儲存不能補(bǔ)償水稻TPT突變帶來的影響[4]。
甘蔗(Saccharum"spp.)葉片淀粉含量相對較低,因此可能無法利用這種淀粉儲備來循環(huán)Pi以緩解當(dāng)蔗糖合成受限時的光合抑制。在本研究中,基于本課題組前期的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),從新臺糖22號(ROC22)中克隆得到磷酸丙糖轉(zhuǎn)運(yùn)體基因ShTPT,利用生物信息學(xué)方法對該基因的理化性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測,并分析其亞細(xì)胞定位情況。同時,采用qRT-PCR技術(shù)分析ShTPT基因在干旱和非生物脅迫條件下的表達(dá)模式,以期探明ShTPT與光合作用直接的關(guān)系。本研究結(jié)果將為甘蔗抗逆性遺傳改良提供重要的基因資源。
1.1""材料
1.1.1""植物材料""供試材料為甘蔗品種新臺糖22號(ROC22)?;虮磉_(dá)分析材料為ROC22成熟期苗,種植于中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院文昌基地;PEG脅迫處理材料為ROC22組培苗,由本實(shí)驗(yàn)室提供。所有材料均用液氮速凍備用。
1.1.2""載體及菌株""DH5ɑ感受態(tài)購自上海唯地生物技術(shù)有限公司,pMD-19T購自TaKaRa公司,pBWA(V)HS-ccdb-GLosgfp為本實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2""方法
1.2.1""ShTPT基因全長CDS克隆""取0.1"g"ROC22葉片,充分研磨,利用Omega公司RNA提取試劑盒提取總RNA,并用RevertAid"First"Strand"cDNA"Synthesis"Kit(Thermo"Scientific)合成cDNA第一鏈,具體方法參照試劑盒說明書,-20"℃保存。根據(jù)甘蔗轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)利用NCBI網(wǎng)站設(shè)計(jì)特異性引物ShTPT-F/R(表1),以cDNA為模板,利用高保真酶2×Phanta"Max"Master"Mix(Vazyme)進(jìn)行PCR擴(kuò)增,反應(yīng)程序:95"℃"1"min";95"℃"20"s,58"℃"30"s,72"℃"1"min,35個循環(huán);72"℃"10"min。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證后,回收純化后利用TA克隆與pMD-19T載體連接,轉(zhuǎn)化DH5α大腸桿菌感受態(tài),通過氨芐霉素篩選以及菌液PCR進(jìn)行驗(yàn)證,送至生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測序驗(yàn)證。
1.2.2""ShTPT生物信息學(xué)分析""對獲得的ShTPT序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析。利用SnapGene軟件得到ShTPT氨基酸序列,在NCBI網(wǎng)站進(jìn)行序列相似性比對后用DNAMAN軟件進(jìn)行多重序列比對,進(jìn)一步用最大似然法在MEGA"7.0軟件中構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。用Prot"Param(http://web.ex pasy.org/"protparam)在線軟件推導(dǎo)ShTPT蛋白的分子質(zhì)量等理化性質(zhì),并用NPSA-PRABI(https://"npsa.lyon.inserm.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=/
NPSA/npsa_server.html)和SWISS-MODEL(https://"swissmodel.expasy.org/interactive)在線軟件對其二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測。用NetPhos"3.1"Server軟件對ShTPT進(jìn)行磷酸化位點(diǎn)預(yù)測。
1.2.3""構(gòu)建ShTPT-GFP融合表達(dá)載體對ShTPT進(jìn)行亞細(xì)胞定位""設(shè)計(jì)ShTPT開放閱讀框擴(kuò)增引物ShTPT-G-F/R(表1),引物兩端引入Bsa"I酶切位點(diǎn),下游引物去除終止密碼子,以ShTPT-19T為模板,經(jīng)PCR擴(kuò)增后酶切,與線性化的pBWA(V)HS-ccdb-GLosgfp質(zhì)粒連接,轉(zhuǎn)化大腸桿菌后通過卡那霉素篩選,PCR鑒定后送至生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行測序。
將水稻培養(yǎng)至7~15日齡,按照YOO等[15]方法提取水稻葉片的原生質(zhì)體,將構(gòu)建好的"pBWA(V)HS-ShTPT-GLosgfp融合質(zhì)粒轉(zhuǎn)入原生質(zhì)體進(jìn)行瞬時表達(dá),最后通過激光共聚焦顯微鏡(Nikon,"C2-ER)進(jìn)觀察ShTPT蛋白亞細(xì)胞定位結(jié)果并拍照。
1.2.4""甘蔗ShTPT的差異表達(dá)分析""選用田間生長至成熟期的ROC22植株研究ShTPT在甘蔗不同部位的表達(dá)情況,分別取其-1葉(IL)、+1葉(ML)、1-2節(jié)莖(S1)、4-5節(jié)莖(S2)、7-8節(jié)莖(S3)、10-11節(jié)莖(S4)、12-13節(jié)莖(S5)、14-15節(jié)莖(S6)和根(RS)。干旱脅迫處理選用生長至6~7葉的ROC22甘蔗組培苗,在含有20%"PEG6000的MS液中進(jìn)行脅迫處理,處理時間分別為0、6、12、24、48、72、96"h時取樣,整株取樣后迅速用液氮固定。每個處理設(shè)置3個生物學(xué)重復(fù),樣品的總RNA提取及反轉(zhuǎn)錄方法同1.2.1。
根據(jù)獲得的ShTPT序列設(shè)計(jì)特異引物ShTPT-"Q-F/R(表1),以磷酸甘油醛脫氫酶基因(GAPDH)為內(nèi)參基因并設(shè)計(jì)甘蔗內(nèi)參引物GADPH-F/R(表1)。利用Roche羅氏qPCR儀Light"Cycler"96進(jìn)行RT-qPCR,反應(yīng)體系:2×Q3"SYBR"qPCR"Master"Mix"10"μL、上/下游引物(10"μmol/L)各0.4"μL、cDNA模板1"μL、ddH2O"7"μL。反應(yīng)程序:95"℃"2"min;95"℃"10"s,58"℃"30"s,72"℃"30"s,40個循環(huán)。每個樣品設(shè)置3個重復(fù)。根據(jù)2-??Ct公式計(jì)算ShTPT相對表達(dá)量。采用IBM"SPSS"Statistics"25軟件通過單因素的方差分析對ShTPT的表達(dá)水平的差異顯著性進(jìn)行檢驗(yàn)。
2.1""ShTPT基因克隆
以甘蔗品種ROC22葉片的cDNA為模板,利用特異性引物進(jìn)行擴(kuò)增,獲得1300"bp左右的條帶(圖1)。測序結(jié)果顯示其與參照序列一致。利用BioMX"2.6軟件對ShTPT核酸序列進(jìn)行分析,CDS長1221"bp,編碼406個氨基酸。
2.2""生物信息學(xué)分析
通過ProtParam在線軟件對ShTPT蛋白進(jìn)行理化性質(zhì)分析,結(jié)果顯示,ShTPT蛋白分子量為43.63"kDa,等電點(diǎn)(pI)為9.80,分子式C2038H3184"N512O526S11,含有丙氨酸(13.8%)、亮氨酸(11.3%)等20種氨基酸,不穩(wěn)定系數(shù)為42.51,親水系數(shù)為0.583,是一種不穩(wěn)定的疏水性蛋白。
ShTPT蛋白具有一個TPT結(jié)構(gòu)域,起止氨基酸為103—401位,ShTPT蛋白具有植物TPT家族特有的典型保守區(qū)域(圖2)。在NCBI網(wǎng)站下載其同源序列進(jìn)行比對發(fā)現(xiàn),甘蔗ShTPT與高粱SbTPT、水稻OsTPT、柳枝稷PvTPT、玉米ZmTPT等蛋白都具有相同的保守結(jié)構(gòu)域,但不同物種之間存在少數(shù)氨基酸的差異,其中甘蔗ShTPT與高粱SbTPT同源性達(dá)到97.04%(圖3)。
蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果顯示,ShTPT蛋白中的α-螺旋(alpha"helix,"Hh)占比51.48%,無規(guī)則卷曲(random"coil,"Cc)占比40.39%,延伸鏈(extended"strand,"Ee)占比8.13%,無β-轉(zhuǎn)角(beta"turn,Tt)和其他元件(圖4)。
蛋白三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果顯示ShTPT具有跨膜結(jié)構(gòu),包含α-螺旋、無規(guī)則卷曲和延伸鏈,且主要以α-螺旋的形式完成跨膜(圖5),與蛋白二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果一致。
利用在線軟件TMHHM對ShTPT蛋白的跨膜結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測,發(fā)現(xiàn)其具有9個典型的跨膜結(jié)構(gòu)域(圖6A),與ShTPT三級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果一致。利用SignalP-5.0在線軟件進(jìn)行信號肽預(yù)測結(jié)果顯示該蛋白不含有信號肽結(jié)構(gòu),表明ShTPT是一個不具有信號肽的跨膜蛋白。
對ShTPT磷酸化進(jìn)行位點(diǎn)分析發(fā)現(xiàn),ShTPT蛋白有20個Ser(絲氨酸)位點(diǎn)、9個Thr(蘇氨酸)位點(diǎn)、2個Tyr(酪氨酸)位點(diǎn)可發(fā)生磷酸化修飾(圖6B),推測ShTPT翻譯后可能通過磷酸化修飾發(fā)揮其功能。
2.3""ShTPT蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析
通過Blast比對在數(shù)據(jù)庫中獲取了10條與甘蔗ShTPT蛋白同源性較高的蛋白序列,使用MEHA"7.0軟件通過鄰接法(neighbor-joining"algorithm)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。聚類結(jié)果表明,甘蔗ShTPT與高粱SbTPT同源性極高,被聚類在一小支,序列比對后發(fā)現(xiàn)同源性高達(dá)97.04%。另外ShTPT與同屬禾本科的玉米ZmTPT、粟SiTPT、黍PmTPT、柳枝稷PvTPT、水稻OsTPT、小麥TaTPT的親緣關(guān)系較近,被聚類在同一簇中。而屬于雙子葉植物的豌豆PsTPT、擬南芥AtTPT與菠菜SoTPT則被聚類于另一簇,與甘蔗ShTPT親緣關(guān)系較遠(yuǎn)(圖7)。
2.4""ShTPT亞細(xì)胞定位
利用Plant-mPLoc在線網(wǎng)站預(yù)測ShTPT的亞細(xì)胞定位,結(jié)果顯示甘蔗ShTPT定位在葉綠體。為了驗(yàn)證預(yù)測結(jié)果,構(gòu)建了pBWA(V)HS-"ShTPT-GLosgfp融合表達(dá)載體,與pBWA(V)HS-ccdb-GLosgfp(對照)分別轉(zhuǎn)入水稻原生質(zhì)體進(jìn)行瞬時表達(dá),研究ShTPT的亞細(xì)胞定位。結(jié)果顯示,含GFP空載體使水稻原生質(zhì)體的細(xì)胞核、細(xì)胞膜、葉綠體等部位均有熒光,ShTPT-GFP融合蛋白只在葉綠體部位發(fā)出熒光(圖8),表明ShTPT是一種葉綠體定位蛋白,與預(yù)測結(jié)果一致。
2.5""ShTPT基因的表達(dá)分析
通過對甘蔗ShTPT基因進(jìn)行熒光定量PCR分析發(fā)現(xiàn),該基因主要在甘蔗葉片中表達(dá),在莖和根中的表達(dá)量極低(圖9)。在20%"PEG6000模擬的干旱脅迫下,ShTPT的表達(dá)呈現(xiàn)升-降-升的趨勢,在24"h達(dá)到最高,為0"h表達(dá)量的2.2倍,48"h時降為0"h的1.3倍,96"h"時又回升至0"h的2倍以上(圖10)。表明ShTPT響應(yīng)干旱脅迫。
植物中缺乏TPT引起的效應(yīng)幾乎可以通過植物夜間淀粉的轉(zhuǎn)化途徑完全補(bǔ)償,該途徑促使淀粉降解為葡萄糖和麥芽糖的形式,并通過麥芽糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(MEX1)和葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(pGlcT)輸出葉綠體[16-17]。此外,在植物中,淀粉的降解也可能發(fā)生在光照時期,與淀粉的合成同時進(jìn)行[13-14]。與藻類相比,植物細(xì)胞運(yùn)輸固定碳的能力似乎更為靈活,且大多數(shù)被子植物一般含有較多數(shù)量的pPTs(5~16個)[7],擬南芥有6個pPTs,包括1個TPT、2個GPTs、2個PPTs、1個XPT[7],而藻類有4個pPTs,其中有2個TPTs,1個推測的PPT,以及1個推測的GPT/XPT[18]。TPTs白天在植物葉綠體中導(dǎo)出碳的過程中發(fā)揮著重要作用,而XPT已被證明在中低光和高光條件下運(yùn)輸三磷酸甘油醛,并在一定程度上補(bǔ)償了TPT功能的喪失[9,"19],因此植物中固定碳輸出的途徑是相互合作的,涉及使用各種糖、糖磷酸和三磷酸甘油醛的轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,而干旱脅迫可能對碳同化代謝途徑產(chǎn)生影響,從而調(diào)控磷酸丙糖轉(zhuǎn)運(yùn)體的表達(dá)。
本研究從甘蔗品種ROC22中克隆了含有完整cDNA序列的ShTPT基因,對其編碼的氨基酸序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),ShTPT蛋白具有1個TPT結(jié)構(gòu)域,具有植物TPT家族特有的典型保守區(qū)域。ShTPT的亞細(xì)胞定位結(jié)果也顯示此蛋白定位在葉綠體,在葉片中表達(dá)高,此與其他作物的研究結(jié)果一致,可能能夠快速響應(yīng)非生物脅迫[20-21]。干旱脅迫降低了光合速率,同時卡爾文循環(huán)相關(guān)基因下調(diào),碳的同化效率下降,參與碳水化合物代謝的干旱響應(yīng)基因HxK、FK、SuT、GPT、FBPA、SuS、SPP、PFP均發(fā)生顯著的變化[22-24],碳同化的減少將減少從葉綠體到細(xì)胞質(zhì)的三磷酸鹽的輸出,而在睡茄(Withania"somnifera)中磷酸丙糖轉(zhuǎn)運(yùn)體的基因在干旱脅迫早期和后期的葉片中顯著下調(diào)。這表明在干旱脅迫下,對三磷酸鹽輸出的需求減少[21]。而本研究中發(fā)現(xiàn),干旱脅迫后磷酸丙糖轉(zhuǎn)運(yùn)體基因呈現(xiàn)先升后降的趨勢,和其他研究有些不同。甘蔗為異源同源多倍體,相同的基因家族可能存在協(xié)同機(jī)制,相同的功能蛋白不同的基因表達(dá)存在差異,在玉米(Zea"mays)的干旱處理磷酸丙糖轉(zhuǎn)運(yùn)體基因表達(dá)也出現(xiàn)不一致的趨勢[20],另外甘蔗為葉片淀粉含量較低的單子葉植物,不同物種磷酸丙糖轉(zhuǎn)運(yùn)體功能可能會體現(xiàn)不同的差異性,如水稻中磷酸丙糖轉(zhuǎn)運(yùn)體突變能夠造就表型的巨大變化,而在擬南芥(Arabidopsis"thaliana)和煙草(Nicotiana"tabacum)中沒有觀測到此變化[4,"25]。以上結(jié)果可以推測甘蔗ShTPT可能參與甘蔗干旱和鹽脅迫應(yīng)答,而其作用機(jī)制有可能有其特異性,下一步對其功能的詳細(xì)解析,將來可作為甘蔗抗旱性工程的候選新基因。
本研究在甘蔗中克隆ShTPT基因,對其基因序列及對應(yīng)蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)行解析,并對其在甘蔗不同組織部位中的表達(dá)以及干旱條件下的表達(dá)模式進(jìn)行探究,為后續(xù)甘蔗高產(chǎn)抗逆育種提供參考。
參考文獻(xiàn)
[8]"FISCHER"K,"KAMMERER"B,"GUTENSOHN"M,"ARBINGER"B,"WEBER"A,"H?USLER"R"E,"FLüGGE"U"I."A"new"class"of"plastidic"phosphate"translocators:"a"putative"link"between"primary"and"secondary"metabolism"by"the"phosphoenolpyruvate/phosphate"antiporter[J]."Plant"Cell,"1997,"9(3):"453-462.
[9]"EICKS"M,"MAURINO"V,"KNAPPE"S,"FLüGGE"U"I,"FISCHER"K."The"plastidic"pentose"phosphate"translocator"represents"a"link"between"the"cytosolic"and"the"plastidic"pentose"phosphate"pathways"in"plants[J]."Plant"Physiology,"2002,"128(2):"512-522.
[10]"WEBER"A"P"M,"BR?UTIGAM"A."The"role"of"membrane"transport"in"metabolic"engineering"of"plant"primary"metabolism[J]."Current"Opinion"in"Biotechnology,"2013,"24:"256-"262.
[11]"WANGnbsp;Y,"LONG"S"P,"ZHU"X"G."Elements"required"for"an"efficient"NADP-malic"enzyme"type"C4"photosynthesis[J]."Plant"Physiology,"2014,"164(4):"2231-2246.
[12]"RIESMEIER"J"W,"FLüGGE"U"I,"SCHULZ"B,"HEINEKE"D,"HELDT"H"W,"WILLMITZER"L,"FROMMER"W"B."Antisense"repression"of"the"chloroplast"triose"phosphate"translocator"affects"carbon"partitioning"in"transgenic"potato"plants[J]."Proceedings"of"the"National"Academy"of"Sciences,"1993,"90(13):"6160-6164.
[13]"H?USLER"R"E,"SCHLIEBEN"N"H,"SCHULZ"B,"FLüGGE"U"I."Compensation"of"decreased"triose"phosphate/phosphate"translocator"activity"by"accelerated"starch"turnover"and"glucose"transport"in"transgenic"tobacco[J]."Planta,"1998,"204(3):"366-376.
[14]"WALTERS"R"G,"IBRAHIM"D"G,"HORTON"P,"KRUGER"N"J."A"mutant"of"Arabidopsis"lacking"the"triose-phosphate/"phosphate"translocator"reveals"metabolic"regulation"of"starch"breakdown"in"the"light[J]."Plant"Physiology,"2004,"135(2):"891-906.
[15]"YOO"S"D,"CHO"Y"H,"SHEEN"J."Arabidopsis"mesophyll"protoplasts:"a"versatile"cell"system"for"transient"gene"expression"analysis[J]."Nature"Protocols,"2007,"2(7):"1565-1572.
[16]"NIITTYL?"T,"MESSERLI"G,"TREVISAN"M,"CHEN"J,"SMITH"A"M,"ZEEMAN"S"C."A"previously"unknown"maltose"transporter"essential"for"starch"degradation"in"leaves[J]."Science,"2004,"303(5654):"87-89.
[17]"CHO"M"H,"LIM"H,"SHIN"D"H,"JEON"J"S,"BHOO"S"H,"PARK"Y"I,"HAHN"T"R."Role"of"the"plastidic"glucose"translocator"in"the"export"of"starch"degradation"products"from"the"chloroplasts"in"Arabidopsis"thaliana[J]."New"Phytologist,"2011,"190(1):"101-112.
[18]"HUANG"W,"KRISHNAN"A,"PLETT"A,"MEAGHER"M,"LINKA"N,"WANG"Y,"REN"B,"FINDINIER"J,"REDEKOP"P,"FAKHIMI"N,"KIM"R"G,"KARNS"D"A,"BOYLE"N,"POSEWITZ"M"C,"GROSSMAN"A"R."Chlamydomonas"mutants"lacking"chloroplast"TRIOSE"PHOSPHATE"TRANS PORTER3"are"metabolically"compromised"and"light"sensitive[J]."Plant"Cell,"2023,"35(7):"2592-2614.
[19]"HILGERS"E"J"A,"STAEHR"P,"FLüGGE"U"I,"H?USLER"R"V"E."The"xylulose"5-phosphate/phosphate"translocator"supports"triose"phosphate,"but"notphosphoenolpyruvate"transport"across"the"inner"envelope"membrane"of"plastids"in"Arabidopsis"thaliana"mutant"plants[J]."Frontiers"in"Plant"Science,"2018,"9:"1461.
[20]"ZHANG"Q,"LIU"H,"WU"X,"WANG"W."Identification"of"drought"tolerant"mechanisms"in"a"drought-tolerant"maize"mutant"based"on"physiological,"biochemical"and"transcriptomic"analyses[J]."Nature"Public"Health"Emergency"Collection,"2020,"20(1):"315.
[21]"SINGH"R,"GUPTA"P,"KHAN"F,"SINGH"S"K,"MISHRA"T,"KUMAR"A,"DHAWAN"S"S,"SHIRKE"P"A."Modulations"in"primary"and"secondary"metabolic"pathways"and"adjustment"in"physiological"behaviour"of"Withania"somnifera"under"drought"stress[J]."Plant"Science,"2018,"272:"42-54.
[22]"XUE"G"P,"MCINTYRE"C"L,"GLASSOP"D,"SHORTER"R."Use"of"expression"analysis"to"dissect"alterations"in"carbohydrate"metabolism"in"wheat"leaves"during"drought"stress[J]."Plant"Molecular"Biology,"2008,"67(3):"197-214.
[23]"VALENTINA"T"N"Z,"OZTURK"H"J,"BOHNERT"R"T."Barley"transcript"profiles"under"dehydration"shock"and"drought"stress"treatments:"acomparative"analysis[J]."Journal"of"Experimental"Botany,"2007,"58(2):"229-240.
[24]"WANG"J"P,"BUGHRARA"S"S."Monitoring"of"gene"expression"profiles"and"identification"of"candidate"genes"involved"in"drought"responses"in"Festuca"mairei[J]."Molecular"Genetics"and"Genomics,"2007,"277:"571-587.
[25]"ZIRNGIBL"M"E,"ARAGUIRANG"G"E,"KITASHOVA"A,"JAHNKE"K,"ROLKA"T,"KüHN"C,"N?GELE"T,"RICHTER"A"S."Triose"phosphate"export"from"chloroplasts"and"cellular"sugar"content"regulate"anthocyanin"biosynthesis"during"high"light"acclimation[J]."Plant"Communications,"2023,"4(1):"100423.