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4個(gè)異源四倍體棉種自然群體遺傳多樣性解析

2024-12-31 00:00:00劉平許艷超王恒蔡小彥周忠麗侯宇清王玉紅劉記陳全家劉方袁有祿鄭杰
中國棉花 2024年7期
關(guān)鍵詞:遺傳多樣性聚類分析表型

摘要:利用4個(gè)四倍體棉種(陸地棉野生種系、海島棉、毛棉、達(dá)爾文氏棉)共116份材料的9個(gè)表型性狀數(shù)據(jù)進(jìn)行遺傳多樣性和聚類分析發(fā)現(xiàn):毛棉的遺傳多樣性高于其他3個(gè)四倍體棉種;氣孔導(dǎo)度與蒸騰速率、細(xì)胞間隙CO2濃度,葉蜜腺到葉柄距離與葉蜜腺數(shù)、葉綠素含量、葉面積,葉蜜腺數(shù)與葉綠素含量、葉面積呈極其顯著正相關(guān)關(guān)系;主莖茸毛數(shù)與葉面積、葉蜜腺到葉柄距離、葉綠素含量、葉蜜腺數(shù)呈極其顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系;通過對4個(gè)四倍體棉種表型性狀進(jìn)行主成分分析和聚類分析,得出本研究中的陸地棉野生種系材料與海島棉材料之間親緣關(guān)系最近,但與毛棉材料親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。本研究為有效利用陸地棉野生種系和野生棉種質(zhì)資源提供了理論依據(jù)。

關(guān)鍵詞:四倍體棉種;遺傳多樣性;表型;聚類分析

Study on genetic diversity of four tetraploid species of Gossypium

Liu Ping#,Xu Yanchao#, Wang Heng, Cai Xiaoyan, Zhou Zhongli, Hou Yuqing, Wang Yuhong, Liu Ji,

Chen Quanjia, Liu Fang*, Yuan Youlu* , Zheng Jie*

棉花在全球多個(gè)國家和地區(qū)廣泛種植,是我國重要的經(jīng)濟(jì)作物。新疆是我國棉花的主要產(chǎn)區(qū),但大量植棉區(qū)分布在鹽堿地和干旱地區(qū)[1]。陸地棉栽培品種遺傳多樣性狹窄,極大地限制了高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、多抗棉花品種的選育和遺傳改良[2]。為此,拓展棉花選育的資源庫是培育棉花新品種,實(shí)現(xiàn)品種優(yōu)勢性狀利用及遺傳改良的重中之重。栽培棉品種的野生近緣種的利用也將極大擴(kuò)展棉花育種的基因資源。迄今為止,已發(fā)現(xiàn)的棉屬植物有50多個(gè)種,其中有40多個(gè)二倍體種(2n=2x=26)和7個(gè)異源四倍體種(2n=4x=52)[3-4]。異源四倍體棉種包括陸地棉(Gossypium hirsutum)和海島棉(G. barbadense)2個(gè)栽培棉種,毛棉(G. tomentosum)、達(dá)爾文氏棉(G. darwinii)、黃褐棉(G. mustelinum)、艾克曼棉(G. ekmanianums)和斯提芬氏棉(G. stephensii)5個(gè)野生棉種。7個(gè)異源四倍體棉種在分類學(xué)研究中可以分成3個(gè)不同分支,栽培種陸地棉與野生種艾克曼棉、斯提芬氏棉、毛棉為一個(gè)分支,栽培種海島棉與野生種達(dá)爾文氏棉為一個(gè)分支,黃褐棉獨(dú)立為一個(gè)分支,是四倍體棉種中最先分化出來的棉種[5]。

陸地棉植株較高大,葉片多為卵形,纖維較細(xì)長一般呈白色。陸地棉野生種系被稱為半野生棉,一般都沒有被栽培馴化,其抗病性和抗逆性較好,是重要的種質(zhì)資源[6]。按照其形態(tài)和地理特征,將其分為7個(gè)不同種系[7],分別為:闊葉棉(G. hirsutum race latifolium)、帕默爾棉(G. hirsutum race palmeri)、尖斑棉(G. hirsutum race punctatum)、尤卡坦棉(G. hirsutum race yucatanense)、雷奇蒙地棉(G. hirsutum race richmondi)、瑪麗加郎特棉(G. hirsutum race marie-galante)、莫利爾棉(G. hirsutum race morrilli)。此外還有1種在我國南方的多個(gè)海島生長了數(shù)百年的陸地棉多年生半野生棉——蓬蓬棉(G. hirsutum race purpurascens)[8]。毛棉是1種僅存在于夏威夷群島的棉種,研究表明,毛棉與陸地棉之間遺傳關(guān)系較近[9-10]。毛棉的很多優(yōu)良性狀在棉花育種中被應(yīng)用,如抗旱、耐鹽、抗蟲(葉片多毛、無蜜腺)、纖維細(xì)且斷裂比強(qiáng)度高。海島棉是繼陸地棉之后種植最為廣泛的栽培棉種。其植株高大健壯,葉片較大,棉鈴較小,籽棉產(chǎn)量和衣分都較低,生育期比較長,其最顯著的特點(diǎn)是纖維品質(zhì)優(yōu)良,還具有優(yōu)異的抗寒性、耐旱性和抗病蟲性[11]。達(dá)爾文氏棉起源于厄瓜多爾加拉帕戈斯群島,因其外觀形態(tài)與早期的海島棉極為相似,長期以來一直被認(rèn)為是海島棉的1個(gè)變種[12]。經(jīng)過深入的研究和廣泛的基因組分析,證明達(dá)爾文氏棉是1個(gè)完全獨(dú)立的棉種[5],但達(dá)爾文氏棉、海島棉和陸地棉種間雜交分析表明,達(dá)爾文氏棉和海島棉的遺傳相似系數(shù)高達(dá)0.958[13]。

本研究擬通過對4個(gè)四倍體棉自然群體的表型進(jìn)行分析,比較其遺傳多樣性,探討四倍體棉種表型分化,以期為棉花新品種選育提供參考。

1" " 材料與方法

1.1" "試驗(yàn)材料

試驗(yàn)材料為4個(gè)四倍體棉種的116份材料,包括陸地棉野生種系29份、海島棉25份、毛棉38份、達(dá)爾文氏棉24份。所有試驗(yàn)材料均由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所野生棉課題組提供,材料保存于海南三亞的國家野生棉種質(zhì)資源圃。

1.2" "試驗(yàn)設(shè)計(jì)

試驗(yàn)在海南省三亞市中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所國家野生棉種質(zhì)資源圃進(jìn)行。于2020年9月種植116份四倍體棉種材料,采用育苗移栽的方式,每份材料種植5穴,每穴2株,行距0.8 m、株距0.8 m,單行區(qū)順序排列,試驗(yàn)地土壤肥力良好,灌排通暢且地力均勻一致,采用的管理方法與大田相同。

1.3" "表型性狀測定方法及標(biāo)準(zhǔn)

試驗(yàn)對116份材料的主莖茸毛數(shù)、葉面積和葉綠素含量(SPAD)、腺體數(shù)量、葉蜜腺數(shù)和葉蜜腺到葉柄距離、蒸騰速率進(jìn)行調(diào)查測定。每一材料隨機(jī)取5株進(jìn)行性狀觀察及數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì),各性狀描述方法參照《棉花種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)》[14]。

1.4" "數(shù)據(jù)處理

表型數(shù)據(jù)經(jīng)過統(tǒng)計(jì)整理后,使用Microsoft Excel 2007和SPSS 25.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。使用R語言vegan包計(jì)算香農(nóng)-維納指數(shù)(Shannon Wiener diversity index),使用R語言cor函數(shù)計(jì)算皮爾遜相關(guān)系數(shù)(Pearson product-moment correlation coefficient);使用R語言hclust函數(shù)進(jìn)行層次聚類(hierarchical clustering),通過計(jì)算Gower距離,用類平均法進(jìn)行聚類分析;使用R語言prcomp函數(shù)進(jìn)行主成分分析。

2" " 結(jié)果與分析

2.1" 不同四倍體棉種性狀多樣性分析和比較

對4個(gè)四倍體棉種的116份材料的性狀調(diào)查統(tǒng)計(jì)分析,比較表型性狀特征分布(圖1)發(fā)現(xiàn):除個(gè)別材料外陸地棉野生種系材料均只有1個(gè)葉蜜腺;達(dá)爾文氏棉葉蜜腺數(shù)的中位數(shù)為0;海島棉均有葉蜜腺,其個(gè)數(shù)的中位數(shù)為1;毛棉材料均沒有葉蜜腺。達(dá)爾文氏棉樣本葉蜜腺到葉柄距離的中位數(shù)為0 cm,陸地棉野生種系和海島棉樣本的葉蜜腺到葉柄距離的中位數(shù)分別為1.2 cm和1.4 cm;毛棉沒有葉蜜腺,其到葉柄距離都計(jì)為0 cm。陸地棉野生種系除了少數(shù)幾個(gè)樣本的主莖含有較多茸毛外,大部分樣本都為0級(只有很少的茸毛);毛棉均有較多茸毛,所有樣本都為5級;大部分達(dá)爾文氏棉材料的主莖茸毛數(shù)分布在3~4級;海島棉主莖有少量茸毛,主要分布在0~1級。毛棉的氣孔導(dǎo)度整體稍高于其他3個(gè)四倍體棉種,有利于其植株與外界進(jìn)行氣體交換。陸地棉野生種系細(xì)胞間隙CO2濃度的中位數(shù)略高于其他3個(gè)四倍體棉種。陸地棉野生種系和毛棉材料的蒸騰速率的中位數(shù)高于達(dá)爾文氏棉和海島棉。在4個(gè)四倍體棉種中,毛棉材料的葉片腺體數(shù)的中位數(shù)低于其他3個(gè)四倍體棉種。達(dá)爾文氏棉的葉綠素含量的中位數(shù)低于其他3個(gè)四倍體棉種。海島棉材料的葉面積中位數(shù)大于其他3個(gè)四倍體棉種。

經(jīng)多樣性分析發(fā)現(xiàn),毛棉除葉蜜腺數(shù)、葉蜜腺到葉柄距離和主莖茸毛香農(nóng)-維納多樣性指數(shù)為0外,其細(xì)胞間隙CO2濃度、蒸騰速率、氣孔導(dǎo)度、葉面積、腺體數(shù)、葉綠素含量(SPAD)的多樣性指數(shù)均高于其他棉種,表明毛棉的這些表型在4個(gè)四倍體棉種中最豐富(表1)。

2.2" "四倍體棉種性狀相關(guān)分析

4個(gè)棉種材料表型性狀的相關(guān)分析結(jié)果顯示(表2),部分性狀間具有顯著(P<0.05)、極顯著(P<0.01)或極其顯著(P<0.001)的相關(guān)關(guān)系。氣孔導(dǎo)度與蒸騰速率、細(xì)胞間隙CO2濃度,葉蜜腺到葉柄距離與葉蜜腺數(shù)、葉綠素含量、葉面積,葉蜜腺數(shù)與葉綠素含量、葉面積之間呈極其顯著正相關(guān)關(guān)系,主莖茸毛數(shù)與葉面積、葉蜜腺到葉柄距離、葉蜜腺數(shù)、葉綠素含量呈極其顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系;葉面積與葉綠素含量、主莖茸毛數(shù)與蒸騰速率呈極顯著正相關(guān)關(guān)系。

2.3" "四倍體棉種性狀聚類分析

從4個(gè)四倍體棉種的9個(gè)性狀的聚類分析結(jié)果(圖2)可以看出,試驗(yàn)材料聚為4大類。其中陸地棉野生種系(GH04)單獨(dú)聚為一類(Class Ⅰ);陸地棉野生種系(GH19)與達(dá)爾文氏棉(GD09、GD23)聚為一類(Class Ⅱ);除GH04、GH19外的其他陸地棉野生種系與所有海島棉、少部分達(dá)爾文氏棉(GD19、GD20、GD21、GD22)聚集為一類(Class Ⅲ),其中達(dá)爾文氏棉(GD03)與陸地棉野生種系(GH09)聚為一亞類,達(dá)爾文氏棉(GD19、GD20、GD21、GD22)與陸地棉野生種系(GH05、GH24)、海島棉(GB02、GB16)聚為一亞類;其余的達(dá)爾文氏棉和毛棉聚為一類(Class Ⅳ)。因此,從聚類結(jié)果可以看出陸地棉與海島棉親緣關(guān)系較近,陸地棉與毛棉親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

2.4" "四倍體棉種性狀主成分分析

將4個(gè)四倍體棉種的9個(gè)性狀數(shù)據(jù)統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn)化后進(jìn)行主成分分析(圖3,參見封二彩版)。其中第一主成分(PC1)的貢獻(xiàn)率為31.59%,第二主成分(PC2)貢獻(xiàn)率為16.11%,累計(jì)貢獻(xiàn)率為47.70%。陸地棉野生種系、達(dá)爾文氏棉、海島棉3個(gè)四倍體棉種兩兩之間相互聚集,說明陸地棉野生種系、達(dá)爾文氏棉和海島棉兩兩之間具有一定的遺傳相似性,親緣關(guān)系較為接近。陸地棉野生種系、海島棉與毛棉均無重疊,說明它們之間的表型相似性較低,親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。毛棉只與達(dá)爾文氏棉有重疊,說明這2個(gè)四倍體棉種的表型間具有較高的相似性。

3" " 討論與結(jié)論

本研究對收集的116份陸地棉野生種系、海島棉、達(dá)爾文氏棉、毛棉4個(gè)四倍體棉種性狀進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析和相關(guān)分析,并根據(jù)相關(guān)性狀對材料進(jìn)行了聚類分析和主成分分析,發(fā)現(xiàn)116份材料具有較豐富的表型遺傳多樣性。主成分分析結(jié)果顯示,陸地棉野生種系、達(dá)爾文氏棉、海島棉3個(gè)四倍體棉種材料間相互聚集,表型具有一定遺傳相似性,親緣關(guān)系較為接近;陸地棉野生種系和海島棉與毛棉沒有重疊,表型相似性較低,親緣關(guān)系較遠(yuǎn);毛棉只與達(dá)爾文氏棉有重疊,表型間具有較高的相似性。聚類分析結(jié)果顯示,4個(gè)四倍體棉種的116份材料聚為4類,陸地棉野生種系GH04單獨(dú)聚為一類;陸地棉野生種系GH19與達(dá)爾文氏棉GD09、GD23聚為一類;除GH04、GH19外的其他陸地棉野生種系與所有海島棉和5份達(dá)爾文氏棉GD03、GD19~GD22材料聚集為一類;除GD03、GD19~GD22外的所有達(dá)爾文氏棉材料與全部毛棉材料聚為一大類。與前人分析1 383對同源基因在陸地棉、海島棉、毛棉、達(dá)爾文氏棉和黃褐棉花瓣組織轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)的毛棉和陸地棉的親緣關(guān)系較近[15]的結(jié)果不一致。造成本研究4個(gè)四倍體棉種與棉種分類[3]不完全相符的原因包括:試驗(yàn)中主要采用的是表型性狀的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),并且調(diào)查的性狀不全面;試驗(yàn)使用的樣本材料與前人研究所用材料存在差異;試驗(yàn)材料從各地收集時(shí)就已經(jīng)發(fā)生了變異。

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(責(zé)任編輯:付毓 責(zé)任校對:秦凡)

中國棉花 · 4個(gè)異源四倍體棉種自然群體遺傳多樣性解析 · 2024, 51(7):12-17

https://doi.org/10.11963/cc20230097

收稿日期:2023-06-14" " " " "第一作者簡介:劉平,碩士,助理研究員,研究方向?yàn)槊藁ㄔ耘?,liuping42@163.com;許艷超,博士,研究方向?yàn)樽魑镞z傳育種,xuyanchao2016@163.com;#同等貢獻(xiàn)。*通信作者:劉方,博士,研究員,研究方向?yàn)樽魑锓N質(zhì)資源創(chuàng)新與利用,liufcri@163.com;袁有祿,博士,研究員,研究方向?yàn)槊藁ǚ肿佑N,youluyuan@hotmail.com;鄭杰,博士,助理研究員,研究方向?yàn)槊藁ㄆ贩N改良與雜種優(yōu)勢利用,zhengjieself@163.com

基金項(xiàng)目:三亞中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院國家南繁研究院“南繁專項(xiàng)”(YBXM2309,YBXM2324);國家自然科學(xué)基金(32171994,32272090)

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