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熒光定量PCR在高致病性豬藍(lán)耳病檢測(cè)上的應(yīng)用

2010-05-10 06:15:08曹火仁顧曉峰沈林輝孫文梅曹向英
四川畜牧獸醫(yī) 2010年6期
關(guān)鍵詞:耳病致病性試劑

曹火仁,顧曉峰,朱 駿 ,沈林輝,孫文梅,曹向英

(1.上海市松江區(qū)動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心,上海 201611;2.上海交通大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物學(xué)院,上海 200240;3.上海市松江區(qū)食用農(nóng)產(chǎn)品安全監(jiān)督檢測(cè)中心,上海 201611)

豬繁殖與呼吸綜合征(PRRS)又稱豬藍(lán)耳病,是由PRRSV引起的一種嚴(yán)重危害養(yǎng)豬業(yè)的傳染病。近年來,我國南方大部分地區(qū)在高溫高濕季節(jié)發(fā)生的豬“無名高熱病”,經(jīng)研究證實(shí)主要是由高致病性豬藍(lán)耳病病毒(豬繁殖與呼吸綜合征病毒)變異株引起的。由于當(dāng)前的疫苗并不能提供完全有效的保護(hù),因此,加強(qiáng)對(duì)高致病性豬藍(lán)耳病的監(jiān)控對(duì)該病防制具有重要意義。為了了解松江地區(qū)高致病性豬藍(lán)耳病的隱性感染狀況,我們開展了高致病性豬藍(lán)耳病的實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)。

1 材料與方法

1.1 主要儀器設(shè)備 ABI Prism 7500熒光PCR儀、SIGMA高速冷凍離心機(jī)、生物安全柜。

1.2 試劑 高致病性豬藍(lán)耳病實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測(cè)試劑盒;病毒RNA提取試劑盒。

1.3 試驗(yàn)材料 來源于松江區(qū)10個(gè)規(guī)模化豬場(chǎng)及8個(gè)生豬重點(diǎn)養(yǎng)殖地區(qū)的脾、淋巴結(jié)等組織病料以及血液樣品。

1.4 操作方法

1.4.1 樣本前處理 血液樣品經(jīng)8000 r/min離心2min,取血清100μL加入300μL變性液混勻;組織樣品取0.5g加入1.5mL pH 7.2的PBS,研磨勻漿后,8000r/min離心2 min,取上清液100 μL加入300 μL變性液混勻。

1.4.2 模板制備 取若干個(gè)1.5 mL經(jīng)DEPC水處理的滅菌離心管,加入已處理樣品 30μL,醋酸鈉溶液30μL,酚-氯仿-異戊醇液 300μL,顛倒 10次后,冰浴15min,4℃ 12000r/min 離心 15min,取 300μL上清液。再加入300μL異丙醇液混勻,置液氮中3min或-70℃冰箱中30min,取出,室溫溶化后,經(jīng)4℃ 15000r/min離心20min后棄上清,緩緩滴入1mL 75%乙醇,旋轉(zhuǎn)一周后倒掉并倒扣于吸水紙上1 min,真空抽干15 min,加入10μL滅菌去離子水與RNA酶抑制劑混合液,-20℃儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>

1.5 擴(kuò)增試劑準(zhǔn)備 根據(jù)所需反應(yīng)管總數(shù)(包括樣本和陰陽性對(duì)照)計(jì)算出所需溶解的試劑球數(shù)(0.5×反應(yīng)管數(shù));每個(gè)試劑球需要40μL試劑球溶液及0.5 μL Taq酶;在冰上溶解試劑,并輕輕扣擊使其充分混勻,含酶試劑不要旋渦振蕩;計(jì)算好各試劑的使用量,加入1.5mL到經(jīng)DEPC水處理的滅菌離心管中,充分混勻,2000r/min離心10s,向設(shè)定的PCR反應(yīng)管中分別加入20μL,再加入5μL到樣本模板及陰陽性對(duì)照管中,蓋上管蓋,置ABI 7500熒光PCR儀上。

1.6 熒光RT-PCR擴(kuò)增與信號(hào)收集 熒光RT-PCR反應(yīng)條件:42℃ 30 min,95℃ 10 min,1 個(gè)循環(huán);95℃10min,45℃ 30s,72℃ 60s,5 個(gè)循環(huán);95℃ 15s,58℃60s(收集熒光信號(hào)),40個(gè)循環(huán)。反應(yīng)體系為25μL。

2 結(jié)果分析

2.1 結(jié)果判定標(biāo)準(zhǔn) 檢測(cè)樣本Ct值小于等于35,且擴(kuò)增曲線有明顯的指數(shù)增長期,可判定為陽性。檢測(cè)樣本Ct值大于35且小于40時(shí),重復(fù)1次,如果Ct值仍處于35~40,且擴(kuò)增曲線有明顯的指數(shù)增長期,可判為陽性,否則判為陰性。檢測(cè)不到樣本Ct值或Ct值在40或以上,可判為陰性。

2.2 敏感性試驗(yàn) 對(duì)已知高致病性豬藍(lán)耳病陽性核酸用紫外分光光度法測(cè)定其濃度,為4.98×109拷貝/μL,對(duì)其進(jìn)行10倍梯度稀釋,仍能檢測(cè)到10-7(見圖1),表明熒光定量RT-PCR方法的靈敏度很高。

圖1 高致病性豬藍(lán)耳病熒光RT-PCR敏感性試驗(yàn)

2.3 特異性試驗(yàn) 設(shè)定非靶DNA(豬細(xì)小病毒、豬傳染性腦心肌炎病毒、豬偽狂犬病毒、豬流感病毒)及空白對(duì)照,驗(yàn)證熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法的特異性,結(jié)果全部為陰性反應(yīng)(見圖2)。

圖2 高致病性豬藍(lán)耳病熒光RT-PCR特異性試驗(yàn)

2.4 重復(fù)性與穩(wěn)定性試驗(yàn) 分別用熒光定量RT-PCR方法重復(fù)3次檢測(cè)病毒核酸含量為 1.0×109、1.0×108、1.0×107拷貝/μL的樣品,圖 3 中可以看出,R2=0.997124,說明Ct值在小于等于33時(shí),具有很好的線性關(guān)系,表明該方法的穩(wěn)定性好;圖4說明在3個(gè)濃度梯度稀釋下,其檢測(cè)結(jié)果一致。

圖3 高致病性豬藍(lán)耳病熒光RT-PCR敏感性試驗(yàn)線性圖

圖4 高致病性豬藍(lán)耳病熒光RT-PCR重復(fù)性試驗(yàn)

2.5 樣品檢測(cè) 運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR方法對(duì)所采集的8個(gè)生豬重點(diǎn)養(yǎng)殖地區(qū)的60份樣品(血液樣品50份、組織病料10份),以及10個(gè)規(guī)?;i場(chǎng)的100份樣品(血液樣品81份、組織病料19份)進(jìn)行高致病性豬藍(lán)耳病的檢測(cè),結(jié)果均為陰性,表明松江區(qū)豬群中沒有高致病性豬藍(lán)耳病的隱性感染和健康帶毒。

3 討論

3.1 藍(lán)耳病的常用診斷方法有病毒中和試驗(yàn)、酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn)、間接免疫熒光試驗(yàn)等,但存在操作復(fù)雜費(fèi)時(shí)、靈敏度或特異性不強(qiáng)等缺點(diǎn),而普通RT-PCR雖有很大提高,但易出現(xiàn)假陽性,且易造成EB等有害物質(zhì)的污染,對(duì)人體健康有很大的危害。而TaqMan探針實(shí)時(shí)熒光RT-PCR技術(shù)以其敏感、特異、快速、準(zhǔn)確的優(yōu)點(diǎn),在高致病性豬藍(lán)耳病的檢測(cè)上得到了廣泛應(yīng)用。

3.2 鑒于近年來高致病性豬藍(lán)耳病的流行情況,我們?nèi)匀恍枰哟蟛≡瓕W(xué)監(jiān)測(cè)力度,做好預(yù)測(cè)預(yù)警,防止疫情的發(fā)生。在做好高致病性豬藍(lán)耳病免疫工作的同時(shí),應(yīng)做好免疫抗體檢測(cè)工作,摸清其抗體消長規(guī)律,完善免疫程序,做到科學(xué)、有效的防控。

3.3 通過本次應(yīng)用實(shí)踐,熟悉并完善了高致病性豬藍(lán)耳病實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR檢測(cè)方法。今后,可以在此基礎(chǔ)上摸索對(duì)禽流感、新城疫、豬瘟、豬偽狂犬、豬乙腦等重要疫病的監(jiān)測(cè),拓展實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)方法的應(yīng)用范圍,為畜牧業(yè)健康發(fā)展構(gòu)筑更高的技術(shù)平臺(tái)。

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[3]范忠軍,柴 虹,王永明,等.豬繁殖與呼吸綜合征診斷技術(shù)研究[J].上海畜牧獸醫(yī)通訊,2007,(3):62-63.

[4]蔡寶祥,姜 平.我國PRRS診斷技術(shù)與疫苗研究進(jìn)展[J].畜牧與獸醫(yī),2007,39(8):1-4.

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