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膽紅素與牛血清白蛋白低親合力相互作用的研究

2010-06-05 00:47玲,陳娟,周建剛
化學(xué)與生物工程 2010年8期
關(guān)鍵詞:游離態(tài)結(jié)合態(tài)等溫

人們?cè)谂潴w-蛋白相互作用方面的研究取得了很大的進(jìn)展,可采用多種方法測(cè)定配體-蛋白相互作用的動(dòng)力學(xué)參數(shù)。

核磁共振波譜(NMR)方法可用于分子間相互作用的動(dòng)力學(xué)研究,包括蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)-配體絡(luò)合物的溶液結(jié)構(gòu)測(cè)定、同位素編輯/濾波或核Overhauser效應(yīng)(NOE)技術(shù)迅速測(cè)定蛋白-配體絡(luò)合物中配體的結(jié)構(gòu)[1]。在配體與受體發(fā)生作用時(shí),許多NMR參數(shù)將發(fā)生變化。NMR方法可以通過(guò)幾種途徑測(cè)定藥物和蛋白的相互作用,如化學(xué)位移、線寬變化、轉(zhuǎn)移NOE及脈沖梯度場(chǎng)實(shí)驗(yàn)等[2~5]。

Langmuir吸附等溫方程[6]是物理化學(xué)中用以描述氣體分子在固體表面吸附和脫附動(dòng)力學(xué)平衡的方程,可用于研究氣體和固體的相互作用及液體和固體的相互作用[7]。

作者在此研究了水溶液中膽紅素(BR)與牛血清白蛋白(BSA)的低親合力相互作用,結(jié)合NMR動(dòng)力學(xué)測(cè)量、Langmuir吸附等溫方程測(cè)定牛血清白蛋白對(duì)膽紅素的最大結(jié)合中心數(shù)目(n),并推斷配體-生物大分子絡(luò)合物的絡(luò)合常數(shù)(K),為該領(lǐng)域的研究開(kāi)辟了一條新途徑。

1 實(shí)驗(yàn)

1.1 試劑與儀器

牛血清白蛋白,中國(guó)華美生物工程公司;膽紅素,瑞士Fluka Chemika;所用試劑均為分析純;實(shí)驗(yàn)用水為二次蒸餾水。

Unity Inova 600型核磁共振譜儀,美國(guó)瓦里安公司。

1.2 原理

Langmuir吸附等溫方程采用了兩個(gè)基本假定:第一,固體具有吸附能力是因?yàn)槲絼┍砻娴脑恿?chǎng)沒(méi)有飽和,有剩余價(jià)力。當(dāng)氣體分子碰撞到固體表面時(shí),其中一部分就被吸附并放出吸附熱,但是氣體分子只有碰撞到尚未被吸附的空白表面才能夠發(fā)生吸附作用;當(dāng)固體表面已覆蓋滿一層吸附分子,這種力場(chǎng)得到了飽和,因此吸附是單分子層的。第二,已吸附在吸附劑表面上的分子,當(dāng)其熱運(yùn)動(dòng)的動(dòng)能足以克服吸附劑引力場(chǎng)的位壘時(shí),又重新回到氣相。再回到氣相的機(jī)會(huì)不受鄰近其它吸附分子的影響,也不受吸附位置的影響。換言之,被吸附的分子之間不互相影響,并且表面是均勻的。

與膽紅素相比,分子量高達(dá)66 000 Da的BSA分子能夠提供足夠大的表面吸附或者結(jié)合膽紅素分子。由于膽紅素與蛋白間的低親合力,其相互作用很弱,結(jié)合態(tài)和游離態(tài)膽紅素分子處于快速交換中,因此可以合理地假設(shè)Langmuir吸附等溫方程的兩個(gè)基本假定適用于BR與BSA的低親合力相互作用。結(jié)合過(guò)程可用式(1)描述:

BR+BSA=Complex

(1)

假設(shè)每一個(gè)BSA分子最多有n個(gè)結(jié)合中心可用于接受BR分子,則:

ncP=[LB]+[P]

(2)

cL=[LF]+ [LB]

(3)

式中:cP、cL分別為溶液中BSA和BR的總濃度;[P]為BSA分子中游離態(tài)結(jié)合中心的濃度;[LF]、[LB]分別為游離態(tài)和結(jié)合態(tài)BR的濃度。

由Langmuir吸附等溫方程的兩個(gè)基本假定,可以得到:

吸附速率=k1[LF](ncP-[LB])

(4)

脫附速率=k-1[LB]

(5)

當(dāng)吸附過(guò)程和脫附過(guò)程達(dá)到平衡,則吸附速率等于脫附速率,式(4)和式(5)右邊也相等。這樣,就得到與Langmuir吸附等溫方程類似的方程:

(6)

(7)

式中:K=k1/k-1= [LB]/{[LF](ncP-[LB])},是BR-BSA絡(luò)合物的絡(luò)合平衡常數(shù)。

一旦得到了[LB]和[LF]的具體數(shù)據(jù),將1/[LB]對(duì)1/[LF]作圖并用式(7)擬合所得直線,就可以同時(shí)得到兩個(gè)參數(shù):n和K。

[LB]和[LF]的具體數(shù)據(jù)可通過(guò)NMR測(cè)量獲得。某些NMR參數(shù),如馳豫速率和自擴(kuò)散系數(shù)的觀測(cè)值(Yobs),應(yīng)該是游離態(tài)和結(jié)合態(tài)分子相應(yīng)參數(shù)的權(quán)重平均值,即:

Yobs=XBYB+XFYF=XB(YB-YF)+YF

(8)

式中:Yobs為馳豫速率或自擴(kuò)散系數(shù)的觀測(cè)值;YB、YF分別為結(jié)合態(tài)和游離態(tài)BR分子的馳豫速率觀測(cè)值;XB、XF分別為結(jié)合態(tài)和游離態(tài)BR分子的摩爾分?jǐn)?shù),XB=[LB]/cL,XF=[LF]/cL。

通過(guò)改變BSA與BR的濃度比cP/cL測(cè)量一系列Yobs數(shù)據(jù),將此數(shù)據(jù)對(duì)cP/cL作圖,分別外推cP/cL到0和無(wú)窮大,就可以得到Y(jié)F和YB。根據(jù)式(6)~(8)就可計(jì)算出[LB]和[LF]。

1.3 方法

定量溶解BR于溶液中,得到9個(gè)NMR樣品,其中BSA濃度均為4.00×10-5mol·L-1,BR濃度(×10-3mol·L-1)則分別為6.33、5.50、5.13、4.95、4.40、4.00、3.42、3.30、2.80,對(duì)應(yīng)BSA與BR濃度比(cP/cL)分別為:1∶158、1∶138、1∶128、1∶124、1∶110、1∶100、1∶85.5、1∶82.5、1∶70.0,含有10%(體積分?jǐn)?shù))的重水(D2O)。在310 K下測(cè)定樣品的自旋晶格馳豫時(shí)間。

2 結(jié)果與討論

2.1 核磁圖譜

BR溶液的1HNMR圖譜如圖1所示。

cBR:5.50×10-3 mol·L-1 cBSA:4.00×10-5 mol·L-1

由圖1可看出,由于BSA濃度很小,加之存在快速馳豫而引起譜線加寬現(xiàn)象,所以在含BSA的樣品溶液中BSA信號(hào)都很弱。同時(shí),由于溶液的高粘度及結(jié)合態(tài)和游離態(tài)分子間交換所造成的影響,含BSA的樣品溶液中所有來(lái)自BR的信號(hào)也都變寬了,由于微環(huán)境的改變,化學(xué)位移值均發(fā)生了一定改變。

2.2 馳豫時(shí)間

測(cè)定BR分子中2-CH3中H的縱向馳豫時(shí)間,馳豫速率的觀測(cè)值Yobs隨BSA與BR濃度比(cP/cL)的變化如圖2所示。

圖2 BR分子的2-CH3中H的馳豫速率觀測(cè)值隨濃度比(100cP/cL)的變化曲線

從圖2可以看出,隨著濃度比cP/cL的增大,馳豫速率的觀測(cè)值Yobs不斷增大。

外推cP/cL為無(wú)窮大,可得YB=1.85 s-1;外推cP/cL為0,得YF=0 s-1。由式(8)所描述的快速交換模型及XB和XF的定義,可計(jì)算出一系列[LF]和[LB]值,結(jié)果見(jiàn)表1。

表1 含4.00×10-5 mol·L-1 BSA的BR溶液的馳豫速率觀測(cè)值

將1/[LB]對(duì)1/[LF]作圖(圖3),用式(7)擬合所得直線,得到BR-BSA絡(luò)合物的表觀絡(luò)合常數(shù)K=36.0 L·mol-1,BSA分子上的最大結(jié)合中心數(shù)目n=98。

圖中直線為L(zhǎng)angmuir吸附等溫方程(式7)的擬合結(jié)果

2.3 討論

本實(shí)驗(yàn)所用的模型適用于游離態(tài)和結(jié)合態(tài)配體快速交換的體系。對(duì)于慢交換體系,式(8)不再有效,因?yàn)榇藭r(shí)NMR信號(hào)非常寬,無(wú)法測(cè)得YB,因而也就無(wú)法計(jì)算Yobs。血清白蛋白的X-射線研究和很多光譜研究結(jié)果表明,在BSA分子上與配體結(jié)合的高親合力結(jié)合中心數(shù)目一般為1或2[8,9]。由于洞穴可以很緊密地結(jié)合配體小分子,因此很容易理解這類BSA-配體絡(luò)合物的絡(luò)合常數(shù)K非常大[10~12]。這類絡(luò)合物的絡(luò)合常數(shù)K通常在1×105~1×106L·mol-1范圍,可以肯定屬于慢交換類型。然而,正與作者前面所提到的那樣,本實(shí)驗(yàn)觀測(cè)不到這種類型的相互作用。本實(shí)驗(yàn)中采用很高的配體-蛋白濃度比,從而確保了BSA分子上的高親合力結(jié)合中心完全飽和。雖然實(shí)驗(yàn)體系中高親合力相互作用和低親合力相互作用同時(shí)存在,但本實(shí)驗(yàn)僅能獲得低親合力相互作用的信息。

作為生物大分子,不僅牛血清白蛋白可以和小分子配體發(fā)生作用,DNA、RNA或者酶都可以發(fā)生這種作用??梢灶A(yù)料,Langmuir吸附等溫方程在配體-生物大分子研究中的應(yīng)用有著非常廣闊的前景。

3 結(jié)論

采用核磁共振馳豫測(cè)量研究了膽紅素和牛血清白蛋白間的低親合力相互作用。得到BR-BSA絡(luò)合物的表觀絡(luò)合常數(shù)K=36.0 L·mol-1,BSA分子上的最大結(jié)合中心數(shù)目n=98。顯然,研究配體-蛋白絡(luò)合物的結(jié)合等溫線是理解該類絡(luò)合物形成過(guò)程的關(guān)鍵。作為描述小分子在固體表面吸附和脫附動(dòng)力學(xué)平衡的一種手段,Langmuir吸附等溫方程能夠很好地解釋生物大分子對(duì)小分子配體的低親合性結(jié)合能力。

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