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一種結(jié)腸的自動(dòng)分段虛擬外翻技術(shù)研究

2010-06-08 12:42:46張丹楓趙俊李雷王志中
中國(guó)醫(yī)療器械雜志 2010年2期
關(guān)鍵詞:彎角外壁內(nèi)壁

張丹楓,趙俊*,李雷,王志中

上海交通大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程系,上海市,200240

CT、MR等成像技術(shù)的發(fā)展為人體的非侵入式檢測(cè)提供了完善的數(shù)據(jù)基礎(chǔ),相應(yīng)地各種人體虛擬可視化技術(shù)也隨之出現(xiàn)。1994年,Vining率先提出了虛擬內(nèi)窺鏡技術(shù)來(lái)模擬傳統(tǒng)光學(xué)內(nèi)窺鏡,用于觀察人體結(jié)腸內(nèi)壁結(jié)構(gòu)。虛擬內(nèi)窺鏡技術(shù)免除了病人在傳統(tǒng)內(nèi)窺鏡檢查中所受的痛苦,但同時(shí)也存在與傳統(tǒng)內(nèi)窺鏡同樣的檢查耗時(shí)長(zhǎng)、存在視角盲區(qū)等問(wèn)題。虛擬展平技術(shù)的提出,較好地解決的這些問(wèn)題。但其也帶來(lái)了其他的問(wèn)題,如丟失了結(jié)腸空間結(jié)構(gòu)信息,無(wú)法直觀地看到息肉所處的解剖位置[1]。

虛擬外翻技術(shù)[1-2]是一項(xiàng)新近提出的可視化技術(shù),可用于人體結(jié)腸、胃、血管等管道或腔體的檢查,也可應(yīng)用到工業(yè)領(lǐng)域的管道無(wú)損探傷。虛擬外翻提供了寬闊的視野,可避免內(nèi)窺鏡方法造成的狹小視角以及耗時(shí)漫游,同時(shí)也保持了數(shù)據(jù)的整體解剖形態(tài),解決了虛擬展平而發(fā)生的問(wèn)題。

1 虛擬外翻技術(shù)概述

雖然虛擬外翻克服了虛擬內(nèi)窺鏡和虛擬展平方法存在的種種問(wèn)題,但這項(xiàng)技術(shù)還剛起步,很多相應(yīng)的技術(shù)手段還有待完善。林洲等[3]提出了結(jié)合橫截面和局部電場(chǎng)的快速算法,以提高外翻效率。黃翊玲等[4]利用FFT實(shí)現(xiàn)了高效的基于全局面電場(chǎng)的外翻。Zhang等[5]在計(jì)算了結(jié)腸外壁的基礎(chǔ)上,證實(shí)利用外壁中心路徑外翻可以得到更準(zhǔn)確的外翻結(jié)果。這一系列方法為虛擬外翻技術(shù)的發(fā)展打下了良好的基礎(chǔ)。

通過(guò)虛擬外翻技術(shù),結(jié)腸的內(nèi)壁信息被表示在外面,從外面可以一目了然地看到內(nèi)壁表面結(jié)構(gòu)。人體結(jié)腸是彎曲的,大體上可分為升結(jié)腸、橫結(jié)腸、降結(jié)腸、乙狀結(jié)腸和直腸幾部分,但是它們之間的個(gè)體差異性相當(dāng)大。自盲腸到肛門(mén)會(huì)存在肝曲、脾曲等十至二十多個(gè)大小不一的彎角,特別在彎曲嚴(yán)重處時(shí),彎角兩側(cè)被外翻出來(lái)的數(shù)據(jù)會(huì)靠得很近,甚至粘連起來(lái)。在這樣的情況下,內(nèi)壁表面的信息將難以看清,非常不利于臨床檢查診斷。如何將外翻后腸道彎角內(nèi)信息更清晰直觀地顯示出來(lái),是一個(gè)亟待解決的技術(shù)問(wèn)題。

本文通過(guò)計(jì)算結(jié)腸外壁中心路徑的平均曲率,設(shè)計(jì)了將結(jié)腸自動(dòng)分段后外翻表示的方法。經(jīng)過(guò)分段外翻后,可以將彎角的兩側(cè)分別繪制,原先相互遮擋、粘連的內(nèi)壁信息就能清晰地表現(xiàn)出來(lái)。

2 自動(dòng)分段方法研究

2.1 分段后外翻的優(yōu)勢(shì)

如前文所述,結(jié)腸有很多彎曲區(qū)域,這些區(qū)域的外翻數(shù)據(jù)會(huì)相互遮擋甚至交疊粘連,難以觀察。若是能在外翻前估計(jì)出哪些區(qū)域?qū)?huì)發(fā)生這樣的情況,并在外翻時(shí)將彎角兩側(cè)的外翻數(shù)據(jù)分別保存,在進(jìn)行檢查時(shí)按需顯示,就能避免上述問(wèn)題。總的來(lái)說(shuō),分段后的外翻有兩方面優(yōu)勢(shì)。

① 可視區(qū)域更完全。在彎曲大的地方,兩側(cè)的數(shù)據(jù)可以分別顯示,以提高臨床檢查的準(zhǔn)確性。

② 有助于提高檢查效率。一個(gè)完整結(jié)腸數(shù)據(jù)一般被分為10-20段,觀察每一小段時(shí)可以繞被檢數(shù)據(jù)段旋轉(zhuǎn)相機(jī)位置,或是從2-3個(gè)不同視角同步觀察。這樣檢查一小段的時(shí)間可控制在10多秒內(nèi),完整檢查一個(gè)結(jié)腸數(shù)據(jù)只需5-6分鐘。

要對(duì)整個(gè)彎曲的結(jié)腸進(jìn)行分段,最直觀的方法就是找到每一個(gè)彎角的中間作為間斷點(diǎn),將彎角一分為二。如何找到間斷點(diǎn)是研究的關(guān)鍵。下面介紹根據(jù)平均曲率確定間斷點(diǎn)的方法。

2.2 局部平均曲率的計(jì)算

中心路徑被廣泛應(yīng)用于虛擬內(nèi)窺鏡、虛擬展平等技術(shù)中,作為觀察視角的導(dǎo)航路線或者數(shù)據(jù)采樣的坐標(biāo)基準(zhǔn)。但是傳統(tǒng)方法往往基于結(jié)腸內(nèi)壁計(jì)算中心路徑[1],由于結(jié)腸內(nèi)壁上存在眾多的褶皺凸起,導(dǎo)致內(nèi)壁中心路徑存在很多曲折,這些曲折的內(nèi)壁中心路徑難以代表結(jié)腸的整體趨勢(shì)。而簡(jiǎn)單地對(duì)內(nèi)壁中心路徑進(jìn)行濾波平滑處理,又難以做到剔除褶皺帶來(lái)的曲折的同時(shí)又保留結(jié)腸本身的彎曲信息。因此,我們提出了根據(jù)結(jié)腸外壁計(jì)算中心路徑的方法,很好地解決了這一問(wèn)題[5]。

對(duì)于光滑曲線,通過(guò)計(jì)算曲率,可以找到其彎曲區(qū)域并且確定彎曲程度。我們得到的外壁中心路徑是一系列3維坐標(biāo)點(diǎn),通過(guò)樣條插值的方法可以獲得等間距間隔的中心路徑點(diǎn),以便計(jì)算曲率。對(duì)于已獲得的等間距間隔的外壁中心路徑S={p1,p2, ...,pn},其中n為中心路徑點(diǎn)數(shù),各中心路徑點(diǎn)之間距離相等,即‖pi+1-p‖=d,i∈{1,...,n-1}。

曲率是描述曲線彎曲程度的量,曲線S上pi點(diǎn)處的曲率Ki定義為pi點(diǎn)處切線旋轉(zhuǎn)速度。

圖1 中心路徑上點(diǎn)曲率計(jì)算Fig.1 Curvature computing of centerline

若要求由離散點(diǎn)序列組成的中心路徑S上pi點(diǎn)處的曲率,如圖1所示,可增加pi與pi-1的中點(diǎn)以及pi與pi+1的中點(diǎn)則S在處的切線平行于pi-1pi,在pi處的切線平行于pi-1pi+1,在處的切線平行于pi pi-1,pi-1pi與pi pi+1的夾角為α。如前文所述,經(jīng)過(guò)插值重采樣后,中心路徑點(diǎn)之間等距,間距為d,則pi-1、pi、pi+1三點(diǎn)組成等角三角形,故pi-1pi與pi-1pi+1的夾角為計(jì)算pi左右側(cè)的近似切線旋轉(zhuǎn)速度,有

因此,pi處的點(diǎn)曲率近似為但是實(shí)際中心路徑并非光滑曲線,如上方法利用相鄰3點(diǎn)求出的點(diǎn)曲率序列是雜亂的,存在相當(dāng)多的噪聲。為了得到反映結(jié)腸真實(shí)彎曲情況的信息,需要計(jì)算一個(gè)加窗范圍內(nèi)的平均曲率。

類(lèi)似前面計(jì)算點(diǎn)曲率的方法,設(shè)窗寬為2m+1,取中心路S徑上pi-m、pi、pi+m3點(diǎn)計(jì)算pi處的平均曲率,有:

取合適的m后獲得的平均曲率,能正確反映結(jié)腸真實(shí)的彎曲情況。

2.3 中心路徑上分段及外翻

根據(jù)中心路徑上每一點(diǎn)的平均曲率變化,可容易地找到每一個(gè)曲率峰值點(diǎn)。但并不是每一個(gè)峰值點(diǎn)處都需要分段的,原因有兩點(diǎn):一是即便是計(jì)算了加窗后的平均曲率,該序列仍有少量噪聲峰值點(diǎn);二是有些峰值點(diǎn)對(duì)應(yīng)的曲率值并不是很大,也就是處于一段較平直結(jié)腸的微小彎曲中間。以上這兩種情況的峰值點(diǎn)是不應(yīng)該分段的,因此我們對(duì)所有峰值點(diǎn)求平均值之后取所有大于均值的峰值點(diǎn)作為間斷點(diǎn)。

以這些峰值點(diǎn)為間斷點(diǎn),將中心路徑分為若干段,分別進(jìn)行虛擬外翻。為了保持相鄰兩段數(shù)據(jù)在外翻后鄰接面相匹配,外翻方法中所用的電場(chǎng)線是基于完整的外壁中心路徑計(jì)算而得。根據(jù)基于中心路徑的外翻方法,我們將每一段外翻好的數(shù)據(jù)分別保存。這樣需要觀察某一段或幾段外翻數(shù)據(jù)時(shí),就可以方便地切換顯示。

3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析

用于分段及外翻的數(shù)據(jù)來(lái)自美國(guó)生物醫(yī)學(xué)圖像中心(National Biomedical Imaging Archive, NBIA)[6]采集的真實(shí)病人下腹部螺旋CT數(shù)據(jù),體素量為512×512×451至512×512×535,采樣間隔0.625×0.625×1.25 mm3。通過(guò)區(qū)域生長(zhǎng)分割算法以及測(cè)地線活動(dòng)輪廓方法[5],獲得結(jié)腸的內(nèi)壁、外壁信息,并計(jì)算外壁中心路徑。分段及外翻程序在PC機(jī)(處理器Intel Pentium E2160 1.8 GHz,內(nèi)存3GB)上通過(guò)C++實(shí)現(xiàn)??梢暬@示利用Visualization Toolkit (VTK)實(shí)現(xiàn)。由于計(jì)算一處平均曲率僅需計(jì)算兩個(gè)向量的夾角,計(jì)算量極小,故分段外翻的時(shí)間消耗和原先完整外翻的耗時(shí)是幾乎相當(dāng)。

圖2 不同窗寬對(duì)應(yīng)的平均曲率曲線Fig.2 Average curvatures by different window width

圖3 自動(dòng)分段外翻顯示的效果: (a)未分段的外翻結(jié)果;(b)-(d)為三段分別顯示的外翻數(shù)據(jù)。Fig.3 Automatic sectioned eversion results: (a) is the everted result without section; (b)-(d) are three segments of the sectioned eversion result.

實(shí)驗(yàn)測(cè)試了窗寬m的不同取值對(duì)于平均曲率K的影響。圖2所示為中心路徑各點(diǎn)間距d為0.2像素,m分別取10、100、400、600、1000時(shí)的得到的平均曲率??梢钥吹?,m取值過(guò)小時(shí)平均曲率序列噪聲過(guò)多,難以提取出有效的分段點(diǎn);而若m取值過(guò)大,則會(huì)丟分段點(diǎn),而且對(duì)中心路徑頭尾處的分段不利。經(jīng)過(guò)對(duì)10組結(jié)腸數(shù)據(jù)進(jìn)行測(cè)試,對(duì)于點(diǎn)間距為0.2像素的中心路徑,m取400-500能得到良好的分段結(jié)果。

經(jīng)過(guò)分段后的外翻如圖3所示。為便于比較,對(duì)圖3(b)-(d)中完整外翻數(shù)據(jù)做了半透明處理。未作分段的外翻結(jié)果圖3(a)中無(wú)法看到拐角內(nèi)信息,而在圖3(b)-(d)中由于進(jìn)行了分段外翻,可以清楚地觀察到彎角內(nèi)信息。

4 結(jié)論

本文提出了一種分段外翻的數(shù)據(jù)可視化方法,分段后的外翻可清楚地表現(xiàn)出彎角內(nèi)信息,避免了原先整體外翻后造成的大彎角處數(shù)據(jù)相互遮擋,甚至相粘連的情況。分段外翻的方法使結(jié)腸外翻檢查的可視區(qū)域完整化,同時(shí)又提高了檢查的效率。自動(dòng)分段的判斷依據(jù)是曲率大小。但是結(jié)腸中心路徑的點(diǎn)曲率序列過(guò)于雜亂,難以自動(dòng)化提取分段點(diǎn)。本文提出利用加窗的平均曲率來(lái)確定分段點(diǎn),經(jīng)驗(yàn)證,方法穩(wěn)定、有效,能夠自動(dòng)識(shí)別出合適分段位置,而且對(duì)運(yùn)算消耗的增加量極小。

[1]J Zhao, L Cao, T Zhuang.Digital Eversion of a Hollow Structurean Application in Virtual Colonography [J].International Journal of Biomedical Engineering (S1673-4181), 2008, vol 2008: Article ID 763028, 6 pages.

[2]趙俊, 曹立基, 莊天戈.空腔性臟器內(nèi)壁虛擬外翻式三維可視化方法[P].中國(guó)專(zhuān)利: ZL200610026664.0, 2006-5-18, 2009

[3]林洲, 趙俊, 曹立基.結(jié)腸的快速虛擬外翻方法[J].中國(guó)醫(yī)療器械雜志, 2008, 32(6): 394-397.

[4]黃翊玲, 趙俊, 曹立基.基于基準(zhǔn)面全局電場(chǎng)的外翻快速算法 [J].系統(tǒng)仿真學(xué)報(bào), 2009, 21(23): 7515-7517.

[5]D Zhang, J Zhao, L Lu, et al.A Virtual Eversion of Colon Based Outer-Surface Centerline.[C].Yangtze River 2009 International Conference on Medical Imaging Physics, Nanjing, 2009, 194-201.

[6]"National Biomedical Imaging Archive, USA.https: //imaging.nci.nih.gov/ncia.

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