李 娜, 戴美學(xué)
(山東師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,濟(jì)南 250014)
植物內(nèi)生細(xì)菌在植物體內(nèi)有穩(wěn)定的生存空間,一旦進(jìn)入植物體內(nèi),即可獨(dú)立繁殖和傳遞,并占據(jù)有利的生態(tài)位點(diǎn)來防止病原菌的入侵[1]。因此有益的內(nèi)生細(xì)菌有可能成為生物防治中很有發(fā)展?jié)摿Φ纳酪蜃印?/p>
草莓灰霉病是導(dǎo)致草莓產(chǎn)量和質(zhì)量降低的主要限制因素之一[2]。目前,對草莓灰霉病的防治以化學(xué)手段為主,但研究表明隨著灰霉抗性菌株的增加,化學(xué)防治的優(yōu)勢正在下降[3-4],且存在農(nóng)藥殘留問題[5]。因此安全、低毒的生物防治已成為研究的熱點(diǎn),作為生物制劑的木霉和酵母菌已在灰霉病的防治中發(fā)揮重大作用[6-7]。研究證明生物制劑如能阻止或減少灰霉菌對于草莓花朵的侵染,就能有效地控制灰霉病害[8],而內(nèi)生細(xì)菌能發(fā)揮該項(xiàng)作用。
草莓內(nèi)生細(xì)菌具有通過產(chǎn)生吲哚乙酸和溶解有機(jī)磷來促進(jìn)植株生長的作用[9],但對其生防作用的研究國內(nèi)外尚未有報道。本文對防治草莓灰霉病菌的內(nèi)生細(xì)菌進(jìn)行篩選,并對一株高效菌株SL6進(jìn)行了鑒定。
1.1.1 樣品
董家草莓基地3個大棚中生長旺盛的草莓,在不同層次,不同區(qū)域以五點(diǎn)取樣法取草莓根、莖、葉。
1.1.2 培養(yǎng)基
PDA:馬鈴薯200g,葡萄糖20g,瓊脂20g,水1 000mL,pH 自然;NA:牛肉膏3.5g,蛋白胨10g,NaCl 5g,瓊脂20g、水1 000mL,pH7.0~7.2。
1.1.3 靶標(biāo)病原菌
草莓灰霉病菌(BotrytiscinereaPers.ex Fr.),本試驗(yàn)室保存菌種。
1.1.4 引物
16SR1(AGAAAGGAGGTGATCCAGCC);16SF1(AGAGTTTGATCC TGGCTCAG)由上海生工生物技術(shù)有限公司合成。
1.2.1 草莓內(nèi)生菌的分離
1.2.1.1 表面消毒時間的選擇
為了既能保證植物組織的青翠,以獲得較多的內(nèi)生菌,又能保證表面消毒徹底,需要通過一系列試驗(yàn)尋找恰當(dāng)?shù)腍gCl2消毒時間。將草莓根、莖、葉用0.1%HgCl2處 理1、1.5、2、2.5、3、3.5、4min。然后將處理后的根、莖、葉在NA培養(yǎng)基,28℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3~5d,觀察是否有菌的生長。
1.2.1.2 表面消毒
將植物組織用清水沖洗干凈,無菌水沖洗10次,在75%乙醇中消毒5min,無菌水沖洗3次,最佳0.1%HgCl2時間消毒后,無菌水沖洗3次。
1.2.1.3 內(nèi)生細(xì)菌的分離
將檢出的消毒徹底的組織采用五點(diǎn)取樣法剪成0.5cm×0.5cm左右的小塊,組織勻漿器研磨充分,依次稀釋,取原液、10-1、10-2、10-3稀釋度的組織液0.1mL涂布于NA平板,每種樣品3個重復(fù),37℃培養(yǎng)箱中倒置培養(yǎng)2~5d。
1.2.1.4 內(nèi)生細(xì)菌的純化
培養(yǎng)3~5d后,挑取不同形態(tài)的菌落于NA平板上畫線純化。
1.2.2 拮抗細(xì)菌的篩選與拮抗性能測定
1.2.2.1 草莓灰霉菌拮抗菌的篩選
采用對峙培養(yǎng)法,取直徑8mm的靶標(biāo)菌菌餅置于PDA平板(d=90mm)中央,用接種環(huán)挑取純化好的菌種點(diǎn)接在距平板中央3cm處的4個角點(diǎn)上,25℃培養(yǎng)7d后測量抑菌帶寬。每處理設(shè)3個重復(fù)。選出對病原菌生長有抑制作用,且被抑病原菌絲邊緣平齊、拮抗作用持久的菌株。
1.2.2.2 拮抗菌株的拮抗性能測定
進(jìn)入復(fù)篩的菌株,按上述方法做對峙試驗(yàn),以接種靶標(biāo)菌餅的平板做對照,每處理設(shè)3個重復(fù),25℃培養(yǎng)3~5d,直到對照平板布滿灰霉菌,測量抑菌圈半徑(細(xì)菌菌落中心至病原菌菌絲邊緣)。
1.2.2.3 SL6發(fā)酵濾液的抑菌作用測定
抑菌效果最佳的SL6菌株在37℃振蕩培養(yǎng)3d后,發(fā)酵液離心(12 000r/min,20min),取上清液用細(xì)菌過濾器(0.25μm)除菌,得無菌發(fā)酵液,取1mL發(fā)酵濾液加入到熔化的25mL PDA培養(yǎng)基中,混勻后制平板,以不加發(fā)酵濾液的PDA培養(yǎng)基為對照。同步接種草莓灰霉病菌菌絲塊,每個處理重復(fù)3次,于25℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng),待對照板菌絲觸及平板邊緣開始測量,計(jì)算加入濾液的平板菌絲生長直徑的平均值,利用公式可得出其抑菌率。對無菌發(fā)酵濾液進(jìn)行梯度稀釋后,同樣方式,測其稀釋后的抑菌率。挑取經(jīng)過濾液處理及對照平板上的邊緣菌絲,在掃描電鏡下觀察菌絲形態(tài)。
抑菌率=(對照板菌絲直徑一處理板菌絲直徑)/(對照板菌絲直徑一霉菌菌塊初始直徑)×100%。
1.2.3 拮抗細(xì)菌的初步鑒定
根據(jù)拮抗細(xì)菌菌株的形態(tài)、培養(yǎng)性狀和生理生化特性的測定結(jié)果,參考《伯杰細(xì)菌鑒定手冊》和《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊》對菌株進(jìn)行鑒定[10-11]。
1.2.4 拮抗細(xì)菌的分子鑒定
抽提拮抗菌總DNA,利用16SrDNA細(xì)菌通用引物R1和F1進(jìn)行PCR擴(kuò)增。擴(kuò)增產(chǎn)物回收,送至上海生工生物科技公司測序。測序結(jié)果用Blast軟件在GenBank中進(jìn)行同源性比較。
1.2.5 菌株系統(tǒng)發(fā)育分析和系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
從GenBank中查找已經(jīng)測序的同屬菌的16S rDNA序列用ClustalX進(jìn)行多序列比對分析,再用MEGA4軟件中Neighbor-Joining法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,并進(jìn)行1 000次Bootstraps檢驗(yàn)。
由表1可以看出,草莓根、莖、葉所需的0.1%HgCl2最佳消毒時間不同,根部所需處理時間最長,需3.5min。葉所需時間為3min,莖部需要2.5min,這可能與植物各個器官的生理結(jié)構(gòu)相關(guān)。
由表2可知,草莓的各個組織結(jié)構(gòu)中均有內(nèi)生細(xì)菌定殖,但不同組織中內(nèi)生細(xì)菌分布的密度不同,草莓莖部內(nèi)生細(xì)菌的含量為2.29×104~3.95×104cfu/g鮮重,葉中為3.22×103~9.66×103cfu/g鮮重,草莓根部的內(nèi)生細(xì)菌的含量最少,為2.8×101~5.3×101cfu/g。根據(jù)菌落形態(tài)、顏色及分離部位的不同,共純化得內(nèi)生細(xì)菌54株。且不同組織結(jié)構(gòu)中內(nèi)生菌的種類也不相同,莖中分得形態(tài)顏色不同的菌株27株,葉中15株,根中12株??梢姡瑑?nèi)生細(xì)菌的分布密度及種類均與所在植物的部位相關(guān)。
表2 草莓不同組織中內(nèi)生細(xì)菌的含量
2.3.1 拮抗內(nèi)生細(xì)菌的拮抗能力測定
平板對峙試驗(yàn)測定結(jié)果表明,5株內(nèi)生細(xì)菌具有較為明顯的拮抗作用,抑菌半徑最低為7mm,最高的SL6可達(dá)15mm(表3、圖1)。
表3 5株內(nèi)生拮抗菌株的抑菌能力1)
2.3.2 SL6發(fā)酵濾液的拮抗作用
通過對于生長直徑的測量,運(yùn)用公式得出,SL6的發(fā)酵濾液對草莓灰霉病菌菌絲的抑制率達(dá)97.6%(圖2)。稀釋100倍后,抑菌率為53.7%,有較好的抑菌效果(圖3)。掃描電鏡下對混有發(fā)酵液及空白對照平板上菌絲的形態(tài)觀察顯示,對照菌絲光滑、修長,濾液處理組菌絲部分膨大變形甚至斷裂,原生質(zhì)體溢出(圖4)。與平板對峙試驗(yàn)中,對菌絲的作用一致。推測是活性物質(zhì)的溶菌作用所致。具體的活性物質(zhì)成分還有待于進(jìn)一步的研究。
圖1 SL6抑菌效果
圖2 SL6無菌發(fā)酵液的拮抗活性檢測
圖3 SL6無菌發(fā)酵液稀釋后的抑菌效果
2.3.2 拮抗內(nèi)生菌的形態(tài)學(xué)和生理生化測定結(jié)果
通過形態(tài)學(xué)觀察和生理生化特征的測定,對草莓灰霉病菌有抗菌作用的5株內(nèi)生細(xì)菌進(jìn)行了初步鑒定,結(jié)果見表4、5。
表4 5株內(nèi)生拮抗菌形態(tài)及染色特征
表5 5株內(nèi)生拮抗菌生理生化測定結(jié)果1)
圖4 SL6無菌發(fā)酵液對菌絲的抑制作用
5株菌株幼齡培養(yǎng)物均成桿狀,革蘭氏陽性,芽胞為卵圓球形,以周生鞭毛運(yùn)動,好氧或兼性厭氧,革蘭氏陽性,接觸酶反應(yīng)呈陽性,不產(chǎn)生吲哚,確定其均歸屬于芽胞桿菌屬(Bacillussp.)[10-11]。
2.3.3 菌株SL6系統(tǒng)發(fā)育分析
菌株SL6的16SrDNA PCR產(chǎn)物長度為1 487bp,此序列在GenBank數(shù)據(jù)庫中的注冊序列號為FJ948786.1。由構(gòu)建出的系統(tǒng)發(fā)育樹可知,SL6與芽胞桿菌屬的菌株同源性高,與枯草芽胞桿菌(Bacillussubtilis)DCC1106(EU276080)在同一分支上,結(jié)合生理生化鑒定結(jié)果,可鑒定菌株SL6為枯草芽胞桿菌。系統(tǒng)發(fā)育樹見圖5。
內(nèi)生細(xì)菌定殖在植物的內(nèi)部[12],通常能夠促進(jìn)植物的生長,且不會對植物的組織器官造成傷害[13],是植物組織內(nèi)的正常菌群,可以通過組織學(xué)方法或從表面嚴(yán)格消毒的植物組織和汁液中分離獲得[14]。本研究表明,草莓根、莖、葉組織中均存在大量內(nèi)生細(xì)菌,各組織內(nèi)生細(xì)菌的密度不同,范圍在2.8×101~3.95×104cfu/g鮮重之間。
圖5 菌株SL6的系統(tǒng)發(fā)育樹
本研究通過設(shè)計(jì)不同的梯度來確定升汞的最佳消毒時間,以達(dá)到使分離的內(nèi)生細(xì)菌盡可能真實(shí)地反映植物內(nèi)的微生物群落的效果。過長的消毒時間導(dǎo)致內(nèi)生細(xì)菌種群密度減少;消毒時間較短,附生細(xì)菌會干擾內(nèi)生細(xì)菌密度的計(jì)算;且不同組織器官,因其構(gòu)造的不同,需要的消毒時間也會有差異。
內(nèi)生菌種有很多抗性菌株,具有提取各種抗菌物質(zhì)的潛力[15-16],是生物防治中起重要作用的生防因子。目前,從植物內(nèi)部分離得到的生防細(xì)菌已有多種,如:王書同從番茄植株中分離得到一株內(nèi)生枯草芽胞桿菌對番茄灰霉病菌的抑制率達(dá)71.1%[17],但對草莓內(nèi)生細(xì)菌生防作用的研究,目前國內(nèi)外尚未報道,本研究從草莓中篩選得到內(nèi)生枯草芽胞桿菌SL6,其無菌發(fā)酵液對草莓灰霉病菌的抑制率可達(dá)97.6%,具有生防菌的潛能。對其發(fā)酵濾液進(jìn)行分析可知是抗菌蛋白在起作用,但分離純化的方法有待進(jìn)一步研究,以期得到在病害生物防治中能起作用的抗菌蛋白。
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