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小菜蛾GluCl受體α亞基cDNA基因克隆和序列分析

2010-06-12 02:43梁延坡吳青君劉長(zhǎng)仲張友軍王少麗徐寶云
植物保護(hù) 2010年4期
關(guān)鍵詞:小菜蛾亞基阿維菌素

梁延坡, 吳青君, 劉長(zhǎng)仲, 張友軍, 王少麗, 徐寶云

(1.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)學(xué)院,蘭州 730070; 2.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所,北京 100081)

谷氨酸是脊椎動(dòng)物和無脊椎動(dòng)物神經(jīng)系統(tǒng)內(nèi)重要的神經(jīng)遞質(zhì),在脊椎動(dòng)物體內(nèi)主要通過門控陽離子通道介導(dǎo)興奮性的神經(jīng)傳遞,而在無脊椎動(dòng)物體內(nèi)谷氨酸既是興奮性的神經(jīng)遞質(zhì)[1-3]又是抑制性的神經(jīng)遞質(zhì)[4]。作為抑制性的神經(jīng)傳遞介質(zhì),谷氨酸與突觸后受體結(jié)合后,開啟氯離子通道,稱為谷氨酸門控的氯離子通道(glutamate-gated chloride channel,GluCl)[5]。GluCl屬于半胱氨酸環(huán)門控離子通道基因超家族,目前僅在無脊椎動(dòng)物的神經(jīng)和肌肉細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)[4],在脊椎動(dòng)物中尚未發(fā)現(xiàn),因此是較為理想的殺蟲劑作用靶標(biāo)。作用于GluCl的殺蟲劑包括阿維菌素/美倍霉素類、苯基吡唑類殺蟲劑氟蟲腈以及吲哚二萜類化合物nodulisporic acid等[6-8]。人們對(duì)于GluCl受體的分子結(jié)構(gòu)和功能的了解大多數(shù)來自于對(duì)線蟲和模式昆蟲的研究[5],而對(duì)農(nóng)業(yè)昆蟲的研究較少。

小菜蛾[Plutellaxylostella(L.)]屬鱗翅目菜蛾科,是世界性的十字花科蔬菜重要害蟲,對(duì)多種殺蟲劑都產(chǎn)生了抗藥性[9]。近年來對(duì)特效生物制劑阿維菌素類也產(chǎn)生了不同程度抗性[10]。早期的研究認(rèn)為,阿維菌素作用于γ-氨基丁酸(GABA)受體達(dá)到殺蟲效果[11]。但是后來的研究發(fā)現(xiàn),在較低濃度時(shí),阿維菌素可引起與GABA系統(tǒng)無關(guān)的Cl-通道的開放,即谷氨酸控制的Cl-的開放,從而導(dǎo)致膜對(duì)Cl-通透性增加,帶負(fù)電荷的Cl-引起神經(jīng)元休止電位的超極化,使正常的動(dòng)作電位不能釋放,神經(jīng)傳導(dǎo)受阻,最終引起蟲體麻痹死亡[12]。而且研究發(fā)現(xiàn),線蟲對(duì)伊維菌素(阿維菌素的衍生物)的主要抗性機(jī)理是GluCl受體α亞基(GluClα)的堿基突變導(dǎo)致與藥物的親和力下降[13]??梢奊luCl受體是阿維菌素類殺蟲劑的更為主要的作用靶標(biāo)。目前小菜蛾對(duì)阿維菌素的抗性機(jī)理尚未明確,小菜蛾GluCl受體國(guó)內(nèi)外也未見研究報(bào)道。本研究利用反轉(zhuǎn)錄-多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)的方法首先對(duì)小菜蛾的GluCl受體α亞基cDNA片斷進(jìn)行克隆和序列分析,然后采用RACE技術(shù)獲取小菜蛾GluCl受體α亞基的全長(zhǎng)序列,為深入研究小菜蛾GluCl受體的分子特性和揭示阿維菌素類殺蟲劑的抗性機(jī)理奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 供試?yán)ハx

供試小菜蛾為于室內(nèi)用甘藍(lán)苗連續(xù)飼養(yǎng)多年的敏感種群,室內(nèi)飼養(yǎng)溫度為(25±2)℃,RH為50%~70%,光周期L∥D=16h∥8h。

1.2 主要試劑和儀器

Trizol Reagent RNA kit和cDNA synthesis kit(SuperScript III)購(gòu) 自 Invitrogen (USA)公 司;dNTP Mix、DNA Marker,100bp DNA Ladder均購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司;TaqDNA聚合酶購(gòu)自Promega公司;克隆載體pEASY-T1vector、Mach1-T1感受態(tài)細(xì)胞:購(gòu)自全式金公司;PCR產(chǎn)物回收與純化試劑盒購(gòu)自北京百泰克公司;TaKaRa LA Taq?:TaKaRa寶生物工程(大連)有限公司,TaKaRa 3′-Full RACE coreset試劑盒:購(gòu)自 TaKa-Ra公司;SMARTTMRACE cDNA Amplification Kit:Clontech公司產(chǎn)品,PCR引物由上海生工合成;測(cè)序由北京諾賽基因組研究中心有限公司完成;PCR擴(kuò)增儀為PTC-200,MJR。

1.3 試驗(yàn)方法

1.3.1 總 RNA的提取

參照Trizol Reagent RNA提取試劑盒說明書進(jìn)行總RNA抽提。

1.3.2 cDNA第1鏈合成

按Invitrogen公司的cDNA kit說明書進(jìn)行。cDNA合成步驟參照Invitrogen in SuperScript III First-strand synthesis systeMfor RT-PCR 使 用 程序進(jìn)行。

1.3.3 GluCl受體α基因cDNA片段的克隆

根據(jù)GenBank中已收錄的果蠅(Drosophila melanogaster)和秀麗隱桿線蟲(Caenorhabditiselegans)GluCl受體α亞基氨基酸序列的保守性區(qū)域,設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并性上下游引物(表1),進(jìn)行同源克隆。

以cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,50μL反應(yīng)體系中含:第1鏈cDNA產(chǎn)物2μL,5μL 10×TaqDNA Buffer,2mmol/L dNTP,2mmol/L MgCl2,2μL dNTP(10mmol/L),2μL(10μmol/L)DEGF/DEG-R和0.5μL(5U/μL)TaqDNA polymerase。PCR反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性3min,94℃變性1min,50℃退火1min,72℃延伸1min,循環(huán)35次,72℃延伸10min。

1.3.4 GluCl受體α亞基全長(zhǎng)基因的克隆

1.3.4.1 GluCl受體α亞基3′-末端cDNA的克隆

根據(jù) TaKaRa 3′-Full RACE coreset Kit說明書合成3′端cDNA,并根據(jù)片段測(cè)序結(jié)果,設(shè)計(jì)了3條特異性上游引物(表1),用于小菜蛾GluClα3′端cDNA序列的擴(kuò)增,以3′GSP1和3′RACE Outer Primer為第1輪擴(kuò)增引物,以3′GSP2或3′GSP3和3′RACE Inner Primer為第2輪擴(kuò)增引物。

第1輪PCR在50μL反應(yīng)體系中3′cDNA 4μL,1×cDNA Dilution BufferⅡ (Mg2+Plus)6μL,3′GSP1(10μmol/L)2μL,3′Outer Primer(20μmol/L)2 μL,TaKaRa LATaq(5U/μL)0.25μL,10×LA PCR BufferⅡ(Mg2+Plus)4μL,去離子水31.75μL;擴(kuò)增程序?yàn)椋?5℃3min,94℃30s,55 ℃ 30s,72 ℃ 1.5min,35個(gè)循環(huán);72℃10min。將第1輪PCR產(chǎn)物稀釋50倍作Nest-PCR 模 板,以 (3′NGSP2/3′RACE Innerprimer)和(3′NGSP3/3′RACE Inner-primer)為引物,進(jìn)行第2輪PCR,擴(kuò)增程序?yàn)椋?5℃3min;94℃30s,58 ℃ 30s,72 ℃ 1.5min,35個(gè)循環(huán);72℃10min。

1.3.4.2 GluCl受體α亞基5′-末端cDNA的克隆

參照SMARTTMRACE cDNA Amplification Kit(Clontech)使用說明進(jìn)行5′cDNA的合成,根據(jù)片段和3′RACE結(jié)果設(shè)計(jì)5′RACE特異性引物(表1)用于獲取5′端cDNA序列。

以5′GSP1和UPM為第1輪引物,94℃30s,72℃3min,5個(gè)循環(huán);94℃30s,70℃ 30s,72 ℃3min,5 個(gè) 循 環(huán);94 ℃ 30s,68 ℃ 30s,72 ℃3min,30個(gè)循環(huán);72℃10min。將第1輪PCR產(chǎn)物稀釋50倍用5μL做Nest-PCR模板,以5′NGSP1和NUP為第2輪引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃30s,68℃30s,72℃3min,30個(gè)循環(huán);72℃10min。

表1 試驗(yàn)中設(shè)計(jì)的引物序列

1.3.5 cDNA 全長(zhǎng)的驗(yàn)證

根據(jù)擴(kuò)增得到的5′和3′端片段的序列分別設(shè)計(jì)擴(kuò)增全長(zhǎng)cDNA的引物 QC-F/QC-R(表1)以驗(yàn)證基因的完整性。擴(kuò)增程序?yàn)椋?5℃3min,94℃30s,55 ℃ 30s,72 ℃ 2min,35 個(gè) 循 環(huán);72 ℃10min。

1.3.6 PCR產(chǎn)物的克隆與測(cè)序

將PCR產(chǎn)物經(jīng)DNA純化回收試劑盒回收純化后,克隆于PEASY-T1載體中,挑取陽性克隆經(jīng)酶切和PCR鑒定后,送北京諾賽基因組研究中心有限公司進(jìn)行測(cè)序。

1.3.7 在線序列比對(duì)和分析程序

蛋白質(zhì)序列分析采用ExPASy在線ScanProsite程序;蛋白質(zhì)分子量和等電點(diǎn)分析采用http∥:www.expasy.org/tools/pi-tool.html在線工具;序列比對(duì)使用ClustalW程序;序列和數(shù)據(jù)搜索使用NCBI上的Blast在線程序;信號(hào)肽序列預(yù)測(cè)采用http:∥www.cbs.dtu.dk/services/SignalP 在線程序進(jìn)行;進(jìn)化分析采用 MEGA4.0軟件[14]。

2 結(jié)果與分析

2.1 小菜蛾GluCl受體α亞基cDNA全長(zhǎng)的克隆及序列分析

通過簡(jiǎn)并性上下游引物進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增,結(jié)果見圖1a,擴(kuò)增所得的片段大小約為192bp,與預(yù)期的目的擴(kuò)增片段大小相符。將PCR產(chǎn)物克隆測(cè)序,所得cDNA片段總長(zhǎng)度為192bp,與已知昆蟲的GluCl受體α亞基氨基酸序列進(jìn)行相似性分析,與果蠅和飛蝗(Locustamigratoria)的氨基酸序列相似性為80%,表明克隆的cDNA片段是小菜蛾GluClα亞基基因的部分序列。根據(jù)已獲得的基因序列,分別設(shè)計(jì)5′-和3′-特異性引物,通過 RACE策略,成功的獲得含有5′-及3′-非編碼區(qū)的序列,其中3′端長(zhǎng)度為1 014bp(圖1b),測(cè)序結(jié)果分析后發(fā)現(xiàn),在這個(gè)片段包含一個(gè)TGA終止子以及多個(gè)TAA,在終止子的下游包含一個(gè)長(zhǎng)603bp的非編碼區(qū)(UTR)。末端具有真核生物mRNA典型特征:一個(gè)含15個(gè)腺嘌呤的poly(A),在前面出現(xiàn)了加尾信號(hào) AATAAA;5′-端序列長(zhǎng)為1 090bp(圖1c),在這個(gè)片段中包含一個(gè)起始密碼子(ATG),在起始密碼子前有197bp的非編碼區(qū)(圖2)。序列分析結(jié)果可以證實(shí)得到了小菜蛾GluClαcDNA的完整序列。

圖1 PCR擴(kuò)增電泳圖譜

將5′-和3′-端序列拼接,得到了基因的全序列。為了進(jìn)一步驗(yàn)證拼接序列的正確性,通過已獲得的序列設(shè)計(jì)了基因編碼區(qū)的特異性引物以擴(kuò)增全長(zhǎng)cDNA片段。PCR擴(kuò)增獲得了與預(yù)期大小相符的條帶,克隆結(jié)果同拼接序列比較,氨基酸序列并無差異,進(jìn)一步驗(yàn)證了獲得的基因序列的準(zhǔn)確性和完整性。

2.2 序列分析

GluClα亞基cDNA全長(zhǎng)2 144bp,用DNAMAN軟件進(jìn)行分析,其開放閱讀框(ORF)長(zhǎng)為1 344bp,編碼447個(gè)氨基酸殘基,根據(jù)在線軟件SignalP 3.0(http:∥www.cbs.dtu.dk/servi-ces/SignalP/)分析GluClα亞基氨基酸序列信號(hào)肽剪切位點(diǎn),其信號(hào)肽最有可能的切割位點(diǎn)在第24位與第25位之間,預(yù)測(cè)出GluClα亞基蛋白信號(hào)肽序列含25個(gè)氨基酸,其序列為:MDVLRPSCALFVLFLLYCAHLTECV(圖2);蛋白質(zhì)切割信號(hào)肽后經(jīng)過簡(jiǎn)單的加工過程而成為成熟肽;預(yù)測(cè)其蛋白分子量為51348.7u,其蛋白序列的理論等電點(diǎn)為8.46;相似性分析表明:它與埃及伊蚊的相似性為75%,與果蠅的相似性為73%,與赤擬谷盜的相似性為73%,與東亞飛蝗的相似性為79%。用在線軟件TMHMM2.0預(yù)測(cè)跨膜結(jié)構(gòu)其包含有4個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,TM1-4(圖2)具有 GluClα亞基的典型特征:有一個(gè)長(zhǎng)的N-末端半胱氨酸的胞外區(qū)和4個(gè)跨膜區(qū)和C-端胞外區(qū),在其親水的胞外區(qū)由2對(duì)十分保守的半胱氨酸二硫鍵形成氨基酸殘基的橋環(huán),其中第1對(duì)包含13個(gè)氨基酸殘基,第2個(gè)包含10個(gè)氨基酸殘基(圖2),這些特征表明該基因編碼受體α亞基。

圖2 編碼小菜蛾的GluClα亞基核酸序列及推導(dǎo)的氨基酸序列

2.3 進(jìn)化分析

在GenBank中搜索果蠅、赤擬谷盜(TriboliuMcastaneum)、蝗蟲、蜜蜂(Apismellifera)和秀麗隱桿線蟲、犬心絲線蟲(Cylicocyclusnassatus)、腫孔古柏線蟲(Cooperiaoncophora)等物種的GluCl基因的α、β亞基的氨基酸序列,應(yīng)用MEGA4.0軟件通過鄰位法(neighbor-joining)進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析,以1 000次回抽的置信度作置信分析,結(jié)果如圖3所示,分別標(biāo)注在分支節(jié)點(diǎn)上,每個(gè)分支末端依次為不同物種的GluCl的蛋白基因登錄號(hào)和物種名。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明:GluCl基因分為Ⅰ、Ⅱ兩個(gè)組,分別代表GluClα基因和GluClβ基因,Ⅰ組又可分兩亞族:昆蟲組Ⅰa和線蟲組Ⅰb;小菜蛾的GluCl屬于Ⅰa,昆蟲α亞基;由此證明了克隆的基因?yàn)镚luCl受體的α亞基。

3 討論

谷氨酸是一種重要的神經(jīng)遞質(zhì),在無脊椎動(dòng)物中GluCl作為抑制性配體起作用,在昆蟲和甲殼類動(dòng)物中,谷氨酸被公認(rèn)為是作用于H受體而導(dǎo)致其去極化的這一假說。目前,在一些線蟲和果蠅屬中,GluCl已被克隆,并在爪蟾卵母細(xì)胞中表達(dá),通過已克隆的通道顯示,無脊椎動(dòng)物的GluCl受體上具有阿維菌素類藥劑的作用位點(diǎn)[15]。相對(duì)于線蟲,人們對(duì)昆蟲GluCl受體研究較少,其通道特性與線蟲的亦有所不同。目前GluCl受體在其他昆蟲如非洲鈍緣蜱、扁虱、草地貪夜蛾、谷實(shí)夜蛾[16]、美洲大蠊[7]、家蠅[17]和東亞飛蝗[18]等體內(nèi)也有發(fā)現(xiàn),但目前對(duì)任何生物的GluCl亞基的構(gòu)成都不明確。

圖3 不同物種間GluCl蛋白的系統(tǒng)進(jìn)化分析

靶標(biāo)不敏感性是害蟲對(duì)殺蟲劑產(chǎn)生抗性極為重要的一種機(jī)制,尤其與高水平抗性有關(guān)。遺傳學(xué)研究表明,小菜蛾對(duì)阿維菌素的抗性是常染色體、不完全隱性遺傳,而且可能是有多基因控制的抗性遺傳[19]。吳青君[20]的研究認(rèn)為,GABA 受 體 結(jié)合 數(shù)目的降低是小菜蛾對(duì)阿維菌素產(chǎn)生抗性的重要機(jī)制之一,放射性配體結(jié)合分析表明,敏感和抗性種群的受體親和力均無顯著差異,但抗性種群受體最大的結(jié)合數(shù)目比敏感種群降低了63.6%,說明是受體數(shù)目的減少,而不是結(jié)構(gòu)上的改變導(dǎo)致了小菜蛾對(duì)阿維菌素的抗性。目前,還沒有GluCl受體不敏感性與昆蟲抗藥性關(guān)系的報(bào)道。本研究首次利用簡(jiǎn)并引物通過RT-PCR和RACE技術(shù)成功地克隆了小菜蛾GluClα亞基的全長(zhǎng)序列,根據(jù)這段序列可設(shè)計(jì)特異性引物進(jìn)行抗性小菜蛾cDNA全長(zhǎng)克隆和功能表達(dá),比較其抗性和敏感種群的氨基酸差異,從分子水平明確小菜蛾GluCl功能亞基的分子性質(zhì),為研究小菜蛾對(duì)阿維菌素類殺蟲劑抗性靶標(biāo)不敏感的分子機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

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