国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

瀕危植物白桂木的遺傳多樣性研究

2010-07-24 01:30范繁榮
浙江農(nóng)林大學學報 2010年2期
關(guān)鍵詞:多態(tài)種群分化

范繁榮

(福建三明林業(yè)學校, 福建 三明365001)

白桂木Artocarpus hypargyreus 是??芃oraceae 波羅蜜屬Artocarpus 常綠喬木, 是一種經(jīng)濟價值很高的樹種。 種子含有豐富的白桂木凝集素, 正引起醫(yī)藥學界的廣泛注意。 白桂木樹干高大, 樹形優(yōu)美, 枝葉繁茂, 遮蔭面寬, 也是園林綠化的優(yōu)良樹種。 現(xiàn)主要零星分布于福建南部和西部、 江西南部、 湖南東南部和西南部、 廣東北部、 海南、 廣西、 云南東南部。 長期以來, 由于人們對白桂木天然林的破壞性經(jīng)營, 加上白桂木自身生物學特性及自然環(huán)境條件變化等方面的原因, 致使白桂木野生資源接近枯竭, 處于瀕危境地, 已被列為國家三級瀕危保護樹種[1]。 目前, 關(guān)于白桂木的研究很少, 僅局限于白桂木藥用化學成分的研究[2-6]和白桂木形態(tài)特征、 生態(tài)特性及地理分布方面的報道[7], 對白桂木瀕危的內(nèi)在機制及保育技術(shù)研究還是空白。 遺傳多樣性是生物種內(nèi)表現(xiàn)在從DNA 分子到形態(tài)特征各個層次上可遺傳所有變異的總稱, 是瀕危植物保護生物學研究的核心之一[8]。 對瀕危物種遺傳多樣性和群體遺傳結(jié)構(gòu)的研究是揭示其適應潛力的基礎(chǔ), 也為進一步探討瀕危物種的瀕危機制和制定相應的保護措施提供科學依據(jù)[9]。 隨機擴增多態(tài)性DNA(RAPD, random amplified polymorphic DNA)分析不受器官和組織種類、 發(fā)育階段和生境條件等因素的影響, 需要的DNA 模板量少, 質(zhì)量要求不高,多態(tài)性豐富, 具有簡便、 快速、 易行、 價廉等優(yōu)點, 為從分子水平研究生物遺傳多樣性中應用最廣和最具代表性的方法之一[10]。 RAPD 分子標記用于屬以下等級特別是種內(nèi)各居群或品種的研究具有很強的優(yōu)越性[11]。 本研究利用RAPD 分子標記技術(shù)對福建不同白桂木天然種群的遺傳多樣性進行分析, 為從遺傳多樣性角度揭示白桂木的瀕危機制和更好地保護白桂木種群提供科學依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料采集

實驗材料分別采自福建白桂木保存較好的三明市梅列區(qū)陳大、 三元區(qū)莘口, 泉州市永春縣牛姆林, 清流縣沙蕪, 永安市貢川的白桂木天然林。 由于各個種群的白桂木個體數(shù)量較少, 因此, 只能在各個采樣區(qū)隨機選取生長良好的3 株白桂木(株間間隔必須5 m 以上), 采集白桂木健康小枝, 并將它們迅速放入密封塑料袋中, 裝入冰壺帶回實驗室, 放在- 80 ℃超低溫冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2 DNA 提取

采用改進的十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法, 參照王關(guān)林等[12]的方法提取DNA。 稱取葉片0.3 g左右, 加液氮快速充分研磨至粉末狀, 加入0.1 g 聚乙烯吡咯烷酮(PVP), 將粉末移至1.5 mL 離心管中; 加入600 μL·管-1預熱至65 ℃的2 × CTAB 提取緩沖液, 同時加入7 μL 2-琉基乙醇, 充分混勻,65 ℃水浴30 min, 其間顛倒幾次; 取出離心管, 冷至室溫, 加等體積的氯仿/異戊醇(24 ∶1), 輕緩顛倒混勻, 靜置10 min, 室溫下1.2 萬r·min-1離心10 min; 取上清液至另一離心管, 加2/3 體積異丙醇, 輕緩顛倒混勻, 室溫放置15 min, 于4 ℃條件下1.2 萬r·min-1離心10 min; 用體積分數(shù)為70%乙醇洗滌DNA 2~3 次, 風干, 將DNA 溶于500 μL TE(tris-EDTA, 三羥甲基氨基甲烷-乙二胺四乙酸)溶液, 加入質(zhì)量濃度為50 g·L-1的RNase A, 并于37 ℃保溫1 h; 用等體積氯仿/異戊醇(24 ∶1)抽提1 ~3 次; 上清液中加入終濃度為0.2 ~ 0.4 mol·L-1的氯化鈉, 2 倍體積的無水乙醇, 放置1 h 左右, 1.2萬r·min-1離心10 min; 除去上清液; 用體積分數(shù)為70%乙醇洗滌沉淀2 ~ 3 次, 風干后溶于50 μL TE 中備用。

1.3 聚合酶鏈式反應(PCR)擴增與產(chǎn)物的檢測

擴增體系采用25.0 μL 體系: 25 ng 模板DNA, 0.40 μmol·L-1引物, 0.15 mmol·L-1三磷酸堿基脫氧核苷酸(dNTP), 16.67 nkat TaqDNA 聚合酶, 1.50 mmol·L-1氯化鎂, 2.5 μL 10 ×聚合酶鏈式反應(PCR)緩沖液, 加入滅菌的超純水至25.0 μL。

PCR 擴增條件為: 94 ℃預變性5 min, 94 ℃變性1 min, 36 ℃1 min, 72 ℃延伸2 min, 共40 個循環(huán), 72 ℃延伸10 min。 擴增完畢, 取經(jīng)15.0 g·L-1瓊脂糖凝膠電泳檢查。

1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計與分析

RAPD 是顯性標記, 同一引物擴增產(chǎn)物中電泳遷移率一致的條帶被認為具有同源性。 根據(jù)反應產(chǎn)物在凝膠對應位置上條帶的有無, 有帶記為1, 無帶記為0, 得到RAPD 分析的原始數(shù)據(jù)。 使用POPGEN 32 軟件計算多態(tài)位點百分率、 Shannon 指數(shù)、 Nei 指數(shù)和基因流(Nm); 運用Nei 指數(shù)法[13]計算遺傳距離 (D)和遺傳一致度 (F), 聚類分析運用DPS 軟件采用非加權(quán)配對算術(shù)平均法 (UPGMA, unweighted pai-group method using an arithmetic average)分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 引物篩選

隨機引物購自上海生工生物工程有限公司。 用5 個DNA 樣品(每個種群選1 個樣品)對隨機引物進行篩選, 從60 個引物中篩選出S237, S248,S249, S262, S263, S271 等6 個擴增條帶清晰、 重復性好的引物(表1), 對所有個體進行擴增。

表1 RAPD 分析的6 個隨機引物序列Table 1 Sequences of 6 random primers used in RAPD analysis

2.2 白桂木種群遺傳多樣性分析

2.2.1 多態(tài)位點百分率 利用6 個隨機引物對5 個白桂木種群15 個個體DNA 樣品進行RAPD 分析,共擴增出37 個條帶, 其中多態(tài)條帶30 個, 總的多態(tài)位點百分率為81.08%, 平均可獲得多態(tài)位點5個·引物-1。 引物S263, S269 和S271 對白桂木不同個體擴增的帶型見圖1 ~ 3。 各居群間多態(tài)位點百分率存在著較大差異, 其中永安種群最高, 為24.32%, 梅列種群最低, 為8.11%, 平均多態(tài)位點百分率為15.67%, 其大小排序為永安種群>三元種群>永春種群>清流種群>梅列種群。

圖1 引物S263 擴增的RAPD 帶型Figure 1 RAPD amplification products from primer S263

圖2 引物S269 擴增的RAPD 帶型Figure 2 RAPD amplification products from primer S269

圖3 引物S271 擴增的RAPD 帶型Figure 3 RAPD amplification products from primer S271

2.2.2 Shannon 多樣性和Nei 基因多樣性指數(shù) Shannon 指數(shù)是生態(tài)學中用于度量物種多樣性最常用的指標[14]。 從表2 的估算結(jié)果可看出, 白桂木總遺傳多樣性指數(shù)為0.231 9, 各種群平均多樣性指數(shù)為0.219 3, 其中最高的是永安種群, 為0.261 7, 其大小排序為清流種群>三元種群>梅列種群>永春種群, 最小的永春種群僅為0.181 9。 從表2 中可見, 由Nei 指數(shù)估算的白桂木總遺傳多樣性為0.166 0, 各種群平均

表2 不同白桂木種群的遺傳多樣性Table 2 Genetic diversity of Artocarpus hypargyreus

遺傳多樣性為0.152 6, 其中最高的是永安種群, 為0.182 0, 其他大小排序為清流種群>三元種群>梅列種群>永春種群, 最小的永春種群僅為0.120 2。 由該指數(shù)估算的遺傳多樣性較Shannon 指數(shù)估算的低, 但其大小排序與Shannon 多樣性指數(shù)基本一致。 與瀕危植物銀杉Cathaya argyrophylla 和珙桐Davidia involucrata 相比, 白桂木的遺傳多樣性高于銀杉[11], 低于珙桐[15]。

2.3 白桂木種群間的遺傳分化

由Nei 指數(shù)計算的白桂木種群間的遺傳分化系數(shù)結(jié)果見表3。 白桂木種群間的分化系數(shù)GST為0.737 8, 白桂木的遺傳變異有73.78%存在于種群之間, 只有26.22%的遺傳變異存在于種群內(nèi), 這與蘇何玲等[16]對瀕危植物冷杉Abies ziyuanensis 的研究結(jié)果相似。 可見白桂木種群間的分化程度較高, 種群內(nèi)的分化程度較低。

表3 Nei 指數(shù)估算的白桂木種群間遺傳分化Table 3 Genetic differentiations among 5 populations estimated by Nei’ index

基因流Nm的計算結(jié)果為0.125 1, 表明白桂木種群間的基因流動較小, 這與由Nei 指數(shù)計算的種群間的遺傳分化系數(shù)所得的大部分遺傳變異存在于種群間的結(jié)論相一致。 Wright 認為種群間基因流大于1, 則能發(fā)揮其均質(zhì)化作用; 反之若小于1, 則說明基因流成為遺傳分化的主要原因[17]。 白桂木種群在自然狀態(tài)下分布零散, 各種群呈“島嶼” 狀, 種群間的空間距離遠, 花粉的傳播受限, 同時其生殖生態(tài)學研究發(fā)現(xiàn)白桂木個體數(shù)量少、 雄雌花序的分布不利于授粉、 開花時期雨水多等原因造成結(jié)實量低, 加上動物的取食, 自然狀態(tài)下可供更新的有效種子數(shù)量少。 同時種子含水量高, 不易儲存, 種子有后熟現(xiàn)象, 在自然條件下發(fā)芽困難, 種子成苗率低, 自然更新能力差。 有效種子流的形成受到極大的限制, 使得白桂木種群間的基因流極低, 只有0.125 1, 遠小于1.000, 極低的基因流造成種群間很高的遺傳分化。

2.4 白桂木種群的遺傳距離與遺傳相似度

遺傳距離和遺傳相似度是衡量植物變異水平的重要指標。 白桂木種群間的遺傳距離和遺傳相似度計算結(jié)果見表4。 從表4 中可看出, 梅列種群與三元種群的相似度最大, 為0.747 7, 它們之間的地理距離最近, 永春種群與清流種群的的相似度最小, 為0.528 7, 它們之間的地理距離也是最大的。 遺傳距離則是永春種群與清流種群最大,為0.637 3, 梅列種群與三元種群的遺傳距離最小, 為0.290 7, 5 個不同種群的平均相似度和遺傳距離分別為0.6665 和0.411 8。

表4 不同白桂木種群的遺傳相似度與遺傳距離Table 4 Genetic distance and genetic identity of populations of Artocarpus hypargyreus

2.5 聚類分析

種群間的遺傳距離一般隨著地理距離的增大而增大[18]。 根據(jù)RAPD 基因表型矩陣, 通過UPGMA法進行不同白桂木種群的聚類分析, 得到白桂木個體間的樹狀圖(圖4), 進一步反映了白桂木種群間的親緣關(guān)系。 從聚類結(jié)果可看出, 聚類結(jié)果與該種群所處的地理緯度位置比較一致, 地理位置相對最近的梅列種群和三元種群先聚在一起, 然后是清流種群和永安種群, 最后是地理位置最遠的永春種群。

3 討論

通常認為, 瀕危物種因種群縮小而導致近親繁殖和等位基因的隨機固定, 從而降低了其種群生存能力, 遺傳多樣性水平較低, 如華木蓮Sinomanglietia glauca 和銀杉等[9,19], 而黃久香等[20]和惲銳等[21]對觀光木Tsoongiodendron odorum 和遼東櫟Quercus liaotungensis 的研究發(fā)現(xiàn)有些瀕危物種也保持持著較高的遺傳多樣性水平。 白桂木遺傳多樣性水平的分析結(jié)果表明: 白桂木種群具有較高的遺傳多樣性, 總的多態(tài)位點頻率為81.08%, 與觀光木(84.62%)和遼東櫟(79.00%)相當, 遠高于銀杉(32.00%)和華木蓮(53.22%)。 平均Shannon指數(shù)為0.231 9, Nei 指數(shù)為0.166 0, 白桂木的遺傳分化系數(shù) (GST)為0.737 8, 基因流 (Nm)為0.125 1。 說明白桂木種群間的基因流受限嚴重,其遺傳變異有73.78%存在于種群間, 只有26.22%發(fā)生于種群內(nèi), 可見白桂木種群間的分化程度較高, 種群內(nèi)的分化程度較低, 這與瀕危植物冷杉相似。

圖4 不同白桂木種群的UPGMA 聚類圖Figure 4 UPGMA dendrogram for populations of Artocarpus hypargyreus

通過UPGMA 聚類分析表明: 不同白桂木種群的聚類結(jié)果與其地理緯度位置基本一致。 地理位置最近的先聚一起, 其次相對較近的聚在一起, 最后是距離最遠的。 可見不同白桂木種群間的基因交流少, 小種群分化嚴重, 種群內(nèi)雜合度低,適應性弱, 是其種群衰退的重要原因。 同時, 白桂木的物種具有較高的遺傳多樣性, 因此在就地保護基礎(chǔ)上, 更要注意遷地保護。 由于其種群間基因流很小, 遺傳分化強烈, 應注意多種群采種, 進行人工繁殖, 尤其應在遺傳多樣性比較高的種群中采種, 采用扦插和組織培養(yǎng)等快繁途徑來擴大和更新現(xiàn)有種群。 同時通過打破白桂木種子休眠, 創(chuàng)造條件提高白桂木種子發(fā)芽率, 在較大的空間范圍進行播種, 增加該種群的幼苗數(shù)量, 創(chuàng)造基因交流和重組的條件, 進一步保護白桂木的遺傳多樣性。

[1] 傅立國. 中國植物紅皮書[M]. 北京: 北京科學技術(shù)出版社, 1992: 98.

[2] 甘茂羅, 歐陽勝, 謝平, 等. 白桂木的化學成分研究[J]. 中草藥, 2005, 36 (7): 988-989.GAN Maoluo, OUYANG Sheng, XIE Ping, et al. Study on chemical composition of Artocarpus hypargyreus [J].Chin Tradit Herbal Drugs, 2005, 36 (7): 988-989.

[3] 陳黎明, 謝平, 肖慶青, 等. 白桂木化學成分研究[J]. 中草藥, 2007, 38 (6): 815-818.CHEN liming, XIE Ping, XIAO Qingqing, et al.Study on chemical composition of Artocarpus hypargyreus [J]. Chin Tradit Herbal Drugs, 2007, 38 (6): 815-818.

[4] 周德義, 楊爾濱, 鄧勇, 等. 白桂木凝集素的純化與性質(zhì)的研究[J]. 生物化學與生物物理學報, 1995, 17 (1): 61- 66.ZHOU Deyi, YANG Erbin, DENG Yong, et al. Purification and characterization of lectin from the seeds of Artocarpus hypargyreus Hance [J]. Acta Biochem Biophys Sin, 1995, 17 (1): 61-66.

[5] 吳耀生, 張紅, 周素芳, 等. 酶標白桂木凝集素糖蛋白結(jié)合特性的分析[J]. 中國生物化學與分子生物學報, 2000,16 (2): 210-214.WU Yaosheng, ZHANG Hong, ZHOU Sufang, et al. Characterization of Artocarpus hypargyreus Hance lectin interacting with glycoproteins [J]. Chin J Biochem Mol Biol, 2000, 16 (2): 210-214.

[6] 鄧勇, 周德義, 關(guān)祺芳, 等.紅桂木、 白桂木、 木菠蘿種子凝集素生物學性質(zhì)的比較分析[J].廣西醫(yī)科大學學報, 1995,12 (2): 183-185.DENG Yong, ZHOU Deyi, GUAN Qifang, et al. Biology characteristic analysis of seed agglutinin between Artocarpus lignanensis Merr, Artocarpus hypargyreus Hance and Artocarpus heterophyllus Lam. [J]. J Guangxi Med Univ, 1995, 12(2): 183-185.

[7] 陳開團, 張宗華, 蔣延生.福建省25 種珍貴樹種的分布現(xiàn)狀與保護對策的初步研究[J]. 福建林業(yè)科技, 2003, 30 (2):70-73.CHEN Kaituan, ZHANG Zhonghua, JIANG Yansheng. Preliminary on the distribution status and protective countermeasures of rare tree species in Fujian Province [J]. J Fujian For Sci Technol, 2003, 30 (2): 70-73.

[8] 祖元剛, 張文輝, 閻秀峰, 等. 瀕危植物裂葉沙參保護生物學[M]. 北京: 科學出版社, 1999: 182-223.

[9] 葛頌, 王海群, 張大明. 八面山銀杉林的遺傳多樣性和群體分化[J]. 植物學報, 1997, 39 (3): 266-271.GE Song, WANG Haiqun, ZHANG Daming. Genetic diversity and population differentiation of Cathaya argyrophylla Chun et Kuang in Bamian Mountain [J]. Chin Bull Bot, 1997, 39 (3): 266-271.

[10] 蔣志剛, 馬克平, 韓興國. 保護生物學[M]. 杭州: 浙江科學技術(shù)出版社, 1997.

[11] 汪小全, 鄒喻蘋, 張大明, 等. RAPD 應用于遺傳多樣性和系統(tǒng)學研究中的問題[J]. 植物學報, 1996, 38 (12):954-962 WANG Xiaoquan, ZOU Yuping, ZHANG Daming, et al. Problems in the use of RAPD to the study of genetic diversity and systematics [J]. Chin Bull Bot, 1996, 38 (12): 954-962.

[12] 王關(guān)林, 方宏筠. 植物基因工程[M]. 北京: 科學出版社, 2002: 744.

[13] NEI M, LI W H. Mathematical model for studying genetic variation in terms of restriction endonucleases [J]. Proc Natl Acad Sci USA, 1979, 76: 5269-5273.

[14] 羅美娟, 葉功富, 盧昌義. 短枝木麻黃群體的遺傳分化和遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 福建林學院學報, 2007, 27 (4): 343-348.LUO Meijuan, YE Gongfu, LU Cangyi. Genetic differentiation and structure of Casuarina equisetifolia populations [J]. J Fujian Coll For, 2007, 27 (4): 343-348.

[15] 宋叢文, 包滿珠. 天然珙桐群體的RAPD 標記遺傳多樣性研究[J]. 林業(yè)科學, 2004, 40 (4): 75-79.SONG Congwen, BAO Manzhu. Study on genetic diversity of RAPD mark for natural Davidia involucrata population [J].Sci Silv Sin, 2004, 40 (4): 75-79.

[16] 蘇何玲, 唐紹清. 瀕危植物資源冷杉遺傳多樣性研究[J]. 廣西植物, 2004, 24 (5): 414-417.SU Heling, TANG Shaoqing. Genetic diversity of the endangered plant Abies ziyuanensis in two populations [J]. Guihaia, 2004, 24 (5): 414-417.

[17] WRIGHT S. Evolution in Mendelian population [J]. Genetics, 1931, 16: 97-159.

[18] NEBAUER S G, CASTILLO-AGUDO L, SEGURA J, et al. RAPD variation within and among natural populations of outcrossing willow-leaved foxglove (Digitalis obscurea L.)[J]. Thror Appl Genet, 1999, 98: 985-994.

[19] 林新春, 俞志雄, 裘利洪, 等. 瀕危植物華木蓮的遺傳多樣性研究[J]. 江西農(nóng)業(yè)大學學報: 自然科學版, 2003, 25(6): 805-810.LIN Xinchun, YU Zhixiong, QIU Lihong, et al. Studies on genetic diversity of endangered Sinomanglietia glauca(Magnoliaceae)[J]. Acta Agric Univ Jiangxi, 2003, 25 (6): 805-810.

[20] 黃久香, 莊雪影. 華南三地觀光木遺傳多樣性的RAPD 分析[J]. 華南農(nóng)業(yè)大學學報, 2002, 23 (2): 54-57.HUANG Jiuxiang, ZHUANG Xueying. Comparison of genetic diversity of Tsoongiodendron odorum in southern China by RAPD markers [J]. J South China Agric Univ, 2002, 23 (2): 54-57.

[21] 惲銳, 鐘敏, 王洪新, 等. 北京東靈山遼東櫟種群DNA 多樣性的研究[J]. 植物學報, 1998, 40 (2): 169-175.YUN Rui, ZHONG Ming, WANG Hongxin, et al. Study on DNA diversity of Quercus liaotungensis Koidz population[J]. Chin Bull Bot, 1998, 40 (2): 169-175.

猜你喜歡
多態(tài)種群分化
山西省發(fā)現(xiàn)刺五加種群分布
兩次中美貨幣政策分化的比較及啟示
基于雙種群CSO算法重構(gòu)的含DG配網(wǎng)故障恢復
分化型甲狀腺癌切除術(shù)后多發(fā)骨轉(zhuǎn)移一例
魯政委:房地產(chǎn)同城市場初現(xiàn)分化
參差多態(tài)而功不唐捐
中華蜂種群急劇萎縮的生態(tài)人類學探討
《C++面向?qū)ο蟪绦蛟O(shè)計》中引用類型的教學實踐
人多巴胺D2基因啟動子區(qū)—350A/G多態(tài)位點熒光素酶表達載體的構(gòu)建與鑒定及活性檢測
Cofilin與分化的研究進展