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植物PPDK基因在基因工程中的應(yīng)用

2010-09-10 09:05:06王原媛白云鳳張定宇
山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2010年8期
關(guān)鍵詞:丙酮酸葉綠體激酶

王原媛,白云鳳,張定宇

(1.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)研究生學(xué)院,山西太谷030801;2.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物遺傳研究所,山西太原030031;3.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,山西太谷030801)

1 PPDK基因的結(jié)構(gòu)及其功能

在植物的C4代謝途徑和景天酸代謝途徑(Crassulacean acid metabolism,CAM)中存在一種叫作丙酮酸磷酸雙激酶(Pyruvateorthophosphate dikinase,PPDK)的限速酶。PPDK基因大部分位于植物的葉肉細(xì)胞中催化丙酮酸(Pyruvate)生成磷酸烯醇式丙酮酸(Phosphoenolpyruvate,PEP)。在細(xì)菌、原生動物等生物體中也均發(fā)現(xiàn)有PPDK酶存在,在這些生物體中PPDK起丙酮酸激酶的作用,催化丙酮酸和ATP生成的反應(yīng)。原生動物、細(xì)菌與植物的一級結(jié)構(gòu)十分相似,這種一級結(jié)構(gòu)上的高度同源性說明在原核生物及真核生物分化之前,原始的PPDK基因就已經(jīng)出現(xiàn)了(表 1)。

表1 原生動物、細(xì)菌與植物中PPDK基因的區(qū)別

在植物體內(nèi),丙酮酸磷酸二激酶首先以一個 大的前體蛋白形式在細(xì)胞質(zhì)中被合成,并在葉綠體中加工為成熟的酶。PPDK基因的cDNA序列最先是由Matsuoka等人從玉米中克隆出來的,然后根據(jù)cDNA序列預(yù)測其氨基酸序列,這也是完整的PPDK蛋白一級結(jié)構(gòu)的最早研究。玉米cDNA序列中包含有一個長2 844 bp的開放讀碼框,其分子量是編碼為947個氨基酸的多肽。

Matsuoka等人通過確定純化酶的N端氨基酸序列,結(jié)果表明,成熟的酶含有876個氨基酸殘基,轉(zhuǎn)運(yùn)肽含有71個氨基酸殘基,從而確定了轉(zhuǎn)運(yùn)肽的剪切。將PPDK酶的轉(zhuǎn)運(yùn)肽與其他核基因編碼的葉綠體蛋白進(jìn)行比較,結(jié)果顯示,PPDK轉(zhuǎn)運(yùn)肽與1,5-二磷酸核酮糖酶小亞基及捕光復(fù)合體AB的轉(zhuǎn)運(yùn)肽有3個區(qū)域較為相似,N端的氨基酸序列MAASV類似N端同源區(qū)MAXSX,中間序列TSFARRSV與小麥同源區(qū)II SSFAGKAV類似,第三段序列SGAGRGQHC與玉米1,5-二磷酸核酮糖小亞基轉(zhuǎn)運(yùn)肽剪切位點(diǎn)附近序列SNGGRIRC類似。這些序列都位于各自肽鏈的相同位置,不過,PPDK轉(zhuǎn)運(yùn)肽的長度比其他酶的轉(zhuǎn)運(yùn)肽要長得多。

2 PPDK基因在C4循環(huán)和C3植物中的研究

2.1 C4循環(huán)中的PPDK基因

在植物體內(nèi)的C4代謝途徑,植物以及PPDK的具體作用是催化一個可逆的三步反應(yīng),將ATP,Pi和丙酮酸生成磷酸烯醇式丙酮酸。反應(yīng)的第一步是將ATP的γ-磷酸及β-磷酸轉(zhuǎn)移到酶活性位點(diǎn)的組氨酸殘基上,第二步是將γ-磷酸轉(zhuǎn)移至磷酸,第三步將剩余的β-磷酸轉(zhuǎn)移到丙酮酸??偡磻?yīng)式如下:

丙酮酸+腺嘌呤 -P-Pβ-Pγ+Pi→PEPβ+AMP+PPiγ+2H+

從PPDK蛋白的晶體結(jié)構(gòu)中可以看出,其催化反應(yīng)可能是在一個蛋白結(jié)構(gòu)域中(包含通過核苷酸及丙酮酸結(jié)合結(jié)構(gòu)域間的鉸鏈區(qū)盤曲折疊而成的活性位點(diǎn))進(jìn)行的。

C4循環(huán)途徑較C3途徑具有更大的優(yōu)勢,其能在外界CO2濃度較低的情況下,通過它的酶系統(tǒng)(磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPCase)、NADP-蘋果酸脫氫酶(NADP-MDH)、NADP-蘋果酸酶(NADP-ME)和丙酮酸磷酸雙激酶(PPDK)等[2])保持高效的CO2同化率。其中,PPDK是C4植物光合反應(yīng)中的一個葉綠體酶,同時(shí)是C4途徑的專一性酶,該酶催化CO2初級受體——磷酸烯醇式丙酮酸(PEP)的生成。該催化反應(yīng)主要受到光的調(diào)控,是C4光合作用途徑的限速步驟之一。在C4植物的葉片中,丙酮酸磷酸雙激酶(PPDK)主要位于葉綠體的葉肉細(xì)胞氣孔中,C4植物在高光強(qiáng)和高溫的條件下,比C3植物具有更強(qiáng)的光合效率,在C4途徑中,由于CO2在維管束鞘細(xì)胞中濃縮,氧化(oxylase)受到抑制或者停止,以至于光呼吸可以忽略。

2.2 PPDK基因在C4途徑的酶分子生物學(xué)中的研究

隨著C3植物中C4途徑存在的證實(shí)及分子生物學(xué)手段的運(yùn)用,人們更深刻地了解C4途徑酶類的分子機(jī)理及它們在C3植物體內(nèi)的表達(dá)。Agarie等認(rèn)為,PPDK在一種兩棲類植物荸薺(Eleocharis)體內(nèi)表達(dá)的研究是近年來研究最為成功的例子。在陸生環(huán)境下,荸薺進(jìn)行C4循環(huán)途徑,但在水生環(huán)境下,荸薺進(jìn)行C3方式的循環(huán)途徑。通過研究丙酮酸磷酸雙激酶(PPDK)的同源(分別為陸生和水生環(huán)境下)基因PPDK 1和PPDK2,證明了盡管基因PPDK1和PPDK2同源性很高,但卻不完全相同。PPDK1和PPDK2分別編碼一個葉綠體PPDK和一個細(xì)胞質(zhì)PPDK。原因在于PPDK1蛋白是由cDNA的核序列編碼,且包含一個特殊的N端區(qū)域,可能作為葉綠體的轉(zhuǎn)移肽,然而PPDK2缺乏這個特殊區(qū)域。核DNA編碼的PPDK基因,其細(xì)胞專一性表達(dá)是在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控的,PPDK1和PPDK2從2個不同的起始點(diǎn)轉(zhuǎn)錄。在2個不同的起動子的控制下,大的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物是葉綠體PPDK,包括轉(zhuǎn)運(yùn)肽;小的產(chǎn)物是細(xì)胞質(zhì)PPDK?;蚪M的Southern印跡結(jié)果表明,在荸薺的基因組中存在小的PPDK基因家族。基因組的Northern印跡結(jié)果表明,荸薺的葉綠體PPDK1和細(xì)胞質(zhì)PPDK2都是在其空心稈(荸薺的光合器官)中表達(dá),但是這些基因的表達(dá)隨著荸薺處于生態(tài)環(huán)境條件的不同而不同。當(dāng)荸薺在陸生環(huán)境中時(shí),其空心稈具有Kranz結(jié)構(gòu)并以C4循環(huán)途徑進(jìn)行光合作用;當(dāng)荸薺在水生環(huán)境中時(shí),其空心稈以C3循環(huán)途徑進(jìn)行光合作用。

2.3 C3植物中的PPDK基因

C3植物中是否存在C4光合途徑一直受到很多科研人員的關(guān)注,在C4植物葉片中有特殊的Kranz結(jié)構(gòu)。有研究顯示,C4植物是從C3植物中分化出來的,而且這種轉(zhuǎn)變在進(jìn)化上是多源的。Sheen認(rèn)為,C4型PPDK基因在C3植物中可能有一個祖先,含有一個類似于C4型基因的結(jié)構(gòu),通過引入第一外顯子——一個編碼非常重要的轉(zhuǎn)入葉綠體的轉(zhuǎn)運(yùn)肽而成為C4基因。但是目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn),在水稻等C3植物中的PPDK基因與C4型的PPDK基因一樣,也具有2個不同的啟動子轉(zhuǎn)錄的不同起始位點(diǎn)。在水生植物Hydrilla verticilata[3]和 Egeria densa[4]中沒有 Kranz 結(jié)構(gòu),但是卻存在C4光合途徑的運(yùn)行,說明在植物葉片的單一光合細(xì)胞中可以進(jìn)行C4光合微循環(huán)。早有報(bào)道,在 C3作物大豆[5]、小麥[6]、水稻[7]葉片中有 C4光合酶系統(tǒng),由于酶活性較低,因此提出C3植物葉片中可能具有有限的C4光合途徑。Chen等[8]研究指出,向C3植物菠菜中外加C4光合原初產(chǎn)物OAA或MA,可提高葉片的光合能力,這為在C3植物中建立C4微循環(huán)系統(tǒng)以提高光合效率的可能性提供了依據(jù)[9]。

Aoyagi等證實(shí),在C3植物中存在著與C4植物同樣的丙酮酸磷酸雙激酶(PPDK)。已有報(bào)道,C3植物中的PPDK與C4植物中的PPDK具有相同的酶學(xué)特征,如被光激活、對冷脅迫的敏感,催化性質(zhì)等。Hata以及Aoyagi等證明,PPDK不但存在于葉綠體中,而且還存在于小麥種子的細(xì)胞質(zhì)中,Imaizumi通過Northern blot分析發(fā)現(xiàn),在水稻種子的細(xì)胞質(zhì)中有PPDK的存在。PPDK大部分位于葉肉細(xì)胞,它的活性已在C3植物的光合組織中被測定。Hata等發(fā)現(xiàn),C3植物水稻幼苗體內(nèi)的PPDK與C4植物玉米的PPDK無論在蛋白分子量,還是抗原決定簇和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)等方面都相同。

3 PPDK基因在植物基因工程領(lǐng)域的應(yīng)用

3.1 轉(zhuǎn)基因煙草植株中PPDK基因與鋁脅迫的關(guān)系

將C3植物冰葉日中花(M crystallinum)的PPDK基因轉(zhuǎn)入煙草的基因組中,轉(zhuǎn)基因的煙草就能通過根部有機(jī)酸的分泌來抵抗鋁的脅迫。在高等植物的細(xì)胞質(zhì)和葉綠體中,PPDK基因的表達(dá)水平受干旱和鹽脅迫的影響。通過在轉(zhuǎn)錄水平對patatin基因家族B33啟動子的調(diào)控,生產(chǎn)出表達(dá)冰葉日中花PPDK或者ΔPPDK的轉(zhuǎn)基因煙草植物并發(fā)現(xiàn)它們可以改善鋁的脅迫。在轉(zhuǎn)基因植株中,當(dāng)受到鋁脅迫時(shí)根的生長加強(qiáng);然而在野生的植株中根的生長卻被強(qiáng)烈地抑制。通過ECR染色和原子吸收光譜測定,在轉(zhuǎn)基因植株根尖鋁的含量要比野生植株含量低。此外,轉(zhuǎn)基因植株所產(chǎn)生的三羧酸循環(huán)中間產(chǎn)物(檸檬酸和蘋果酸)要比野生植株高。通過對ECR根染色、有機(jī)酸分泌和鋁積累的研究發(fā)現(xiàn),2種轉(zhuǎn)基因植物相比,含有PPDK基因的植株比表達(dá)ΔPPDK基因的植株對鋁脅迫有更強(qiáng)的耐受力[10]。

3.2 PPDK轉(zhuǎn)基因水稻的研究進(jìn)展

隨著科學(xué)技術(shù)特別是分子生物學(xué)方面的發(fā)展,目前已成功將磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)、丙酮酸磷酸雙激酶(PPDK)、NADP-蘋果酸酶(NADP-ME)轉(zhuǎn)到水稻中獲得了5種轉(zhuǎn)基因水稻。Schreiber等[11]將已導(dǎo)入玉米C4光合關(guān)鍵酶磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)、丙酮酸磷酸 二 激 酶 (PPDK)、NADP- 蘋 果 酸 酶(NADP-ME)和PEPC+PPDK的轉(zhuǎn)基因水稻為材料,以其受體品種Kitaake(WT)為對照,對C4轉(zhuǎn)基因水稻秧苗葉片氣孔與葉鞘維管束的結(jié)構(gòu)特征進(jìn)行研究,結(jié)果表明,品系葉片上的氣孔密度最高,其氣孔總面積(是對照的1.47倍)在轉(zhuǎn)基因品系中也是最高,轉(zhuǎn)基因PPDK品系水稻秧苗干質(zhì)量明顯高于對照品種,其葉片的類囊體結(jié)構(gòu)也比對照品種更完整、有序,有利于光能轉(zhuǎn)換,但是其葉鞘維管束組織卻不如對照發(fā)達(dá)。綜合以上結(jié)論,PPDK仍然具有轉(zhuǎn)基因水稻高光效表達(dá)的結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)。季本華等[9]利用亞硫酸氫鈉對轉(zhuǎn)PEPC基因水稻葉片進(jìn)行噴施,發(fā)現(xiàn)其凈光合速率的增加幅度較大。

3.3 PPDK轉(zhuǎn)基因秈稻IR64的研究進(jìn)展

在具有增加20倍光合作用酶活性的轉(zhuǎn)基因水稻中,C4基因?qū)3植物水稻的生理沖擊是很小的,沒有觀察到水稻光合作用特征的改變。張建福等研究的玉米高光效基因PPDK在秈稻IR64中的整合及其與光合作用相關(guān)的特性分析表明,丙酮酸磷酸雙激酶(PPDK)的反應(yīng)是逆向的,依賴于底物、活化劑和非活化劑的濃度。這可能是丙酮酸磷酸雙激酶(PPDK)的過量表達(dá)不能導(dǎo)致轉(zhuǎn)基因水稻葉片碳代謝顯著效應(yīng)的原因。盡管是初步的結(jié)論,但丙酮酸磷酸雙激酶(PPDK)的過量表達(dá)可以增加每叢轉(zhuǎn)基因水稻植株的粒數(shù)和千粒質(zhì)量。對轉(zhuǎn)基因IR64植株的分析結(jié)果表明,轉(zhuǎn)基因IR64植株劍葉的全氮含量比非轉(zhuǎn)基因IR64植株高,說明玉米丙酮酸磷酸雙激酶(PPDK)基因能夠促進(jìn)轉(zhuǎn)基因IR64植株對土壤中氮的吸收和同化,而且在溫室條件下,大部分轉(zhuǎn)基因IR64植株的結(jié)實(shí)率和收獲指數(shù)高于非轉(zhuǎn)基因植株[12]。

3.4 大豆中PPDK基因的研究進(jìn)展

Li等[5]研究大豆葉片C4循環(huán)途徑酶表明,不同發(fā)育時(shí)期大豆葉片內(nèi)均存在PPDK酶作為C4途徑的再生磷酸烯醇式丙酮酸的特定酶PPDK,其變化趨勢是從苗期到初莢期酶活性逐漸升高,然后降低。在初莢期,PPDK酶活性均達(dá)到最高值。

4 展望

目前,已經(jīng)明確了植物PPDK基因是C4植物的限速酶之一,對植物光合效率的提高有至關(guān)重要的作用,而且已經(jīng)成功運(yùn)用植物基因工程將C4植物的PPDK基因?qū)隒3植物中,但PPDK基因的許多優(yōu)勢作用目前尚未明確,所以,運(yùn)用包括分子生物學(xué)在內(nèi)的各種方法,研究PPDK對光合作用、植物抗性等的具體影響方式,并將其優(yōu)勢功能運(yùn)用于其他農(nóng)作物,將會成為今后一個重要的研究方向。

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