戰(zhàn)大偉,李 靖,劉伯華,顏克松,戶 義,姜 濤,祝慶余
(1.解放軍總醫(yī)院第一附屬醫(yī)院,北京 100037;2.軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所,北京 100071)
禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)屬正黏病毒科(Orthomyxoviridae)流感病毒屬A型流感病毒,是分節(jié)段的負鏈單股RNA病毒。高致病性禽流感(high pathogenic avian influenza virus,HPAIV)是由以H5N1、H7N7為代表的H5和H7兩個亞型引發(fā)的疾病,對養(yǎng)禽業(yè)危害巨大,而且影響禽類產(chǎn)品的安全[1,2]。1997年香港首次發(fā)生H5N1禽流感病毒跨越種屬屏障感染人類并致死的事件,至今在全球范圍內(nèi),高致病性H5N1亞型禽流感頻繁發(fā)生并造成人類感染,具有很高的致死率[3,4],H5N1亞型禽流感作為人畜共患病的公共衛(wèi)生地位更加突出[5-7]。
H5N1禽流感病原學(xué)檢測的臨床與預(yù)防意義是早期診斷、確診,及時識別傳染源,盡早隔離與控制,因此應(yīng)用靈敏、特異和快速的檢測方法就顯得尤為重要。對于送檢的樣本及病料,目前實驗室常用檢測方法主要有傳統(tǒng)的細胞接種觀察 CPE法(cytopathic effect)、血凝實驗 (hemagglutination,HA)以及分子生物學(xué) RT-PCR、Real-time RT-PCR等[8-12]。本研究應(yīng)用 A/Beijing/01/03 H5N1病毒,雞胚擴增,蝕斑(plaque form ing unit,PFU)技術(shù)定量病毒滴度,應(yīng)用以上4種常用方法檢測稀釋的病毒懸液,比較檢測的最低稀釋度,比對檢測方法的靈敏性等特點。
1.1 實驗材料
1.1.1 病毒與細胞
A/BeiJing/01/03為實驗室分離保存的高致病性H5N1禽流感毒株[13];MDCK細胞株為本所細胞庫保存。實驗中具有感染性病毒粒子的操作均在在本所BSL-3實驗室內(nèi)進行。
1.1.2 試劑
RNA提取應(yīng)用 Rneasy Mini Kit,購自 QIAGEN公司;RT-PCR應(yīng)用 One-Step RT-PCR Kit,購自QIAGEN公司;Real-time RT-PCR應(yīng)用One-Step RTPCR Master M ix,購自 ABI公司;低溶點瓊脂糖,購自Invitrogen公司;雞血紅細胞及9日齡SPF雞胚,購自維通利華公司。
1.1.3 引物
RT-PCR及Real-time RT-PCR檢測H5N1病毒的HA基因保守區(qū)域[14]。RT-PCR檢測引物:上游引物:5’-CTCCCCTGCTCATTGCTATG-3’,下游引物:5’-GCCATTCCACAACATCCACCC-3’,擴增片斷長度為219 bp,引物由北京三博遠志生物技術(shù)公司合成。Real-time PCR檢測引物:上游引物:5’-ACATGCCCAAGACATACTGGAA-3’,下游引物:5’-GAATTCGTCACACATTGGGTTTC-3’,探針:FAMCACACAACGGGAAGCTCTGCGATCT-TAMRA,擴增片段長度為130 bp,探針5’端標(biāo)記的熒光報告基團是 FAM,3’端標(biāo)記熒光淬滅基團 Non-fluorescent quencher和minor groove binder(MGB),由Invitrogen公司合成。
1.2 方法
1.2.1 病毒增殖:將 H5N1病毒應(yīng)用 2%FBS DMEM 1∶100倍稀釋,經(jīng)絨毛尿囊腔接種法感染9日齡SPF雞胚,200μL/枚,石蠟溶化封口,37℃溫箱培養(yǎng)。每日照檢雞胚一次。挑出死亡雞胚,放置4℃冰箱過夜后收獲雞胚尿囊液,1000 r/min離心5 m in,上清分裝在細胞凍存管中,-70℃凍存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 病毒 PFU定量:采用雙層瓊脂糖法:應(yīng)用2%FBS DMEM維持液將病毒液10倍依次稀釋,每梯度吸取0.8 m L病毒液進行病毒蝕斑定量。應(yīng)用生長良好MDCK細胞(2×106個/mL)鋪6孔板,過夜培養(yǎng)。吸棄10%FBS DMEM培養(yǎng)液,換為 earle液,浸泡1 h后吸棄。將病毒稀釋液加入6孔板中,吸附1 h,加入第一層0.5%乳白蛋白水解物-犢牛血清營養(yǎng)低溶點瓊脂糖,1 m L/孔,待瓊脂糖充分凝固后放入37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中。48 h后加入含0.1%中性紅的第二層瓊脂糖染色,1 m L/孔,過夜培養(yǎng),蝕斑觀察計數(shù)。
1.2.3 RNA提取:病毒核酸提取應(yīng)用 QIAGEN公司Rneasy Mini Kit,按試劑盒操作說明書進行。
1.2.4 病毒血凝實驗:向96孔血凝板各孔中加生理鹽水 0.25 m L,吸取0.25 m L病毒,加入第一孔中,與生理鹽水充分稀釋后吸0.25 m L加入第二孔中,依次2倍稀釋。每孔中加入1%雞紅細胞懸液0.25 m L,將血凝板放入濕盒中,室溫放置45 m in,觀察記錄實驗結(jié)果。
1.2.5 細胞接種:應(yīng)用生長良好的 MDCK細胞鋪96孔板,過夜培養(yǎng)。吸棄 10%FBS DMEM,根據(jù)PFU計數(shù),首先用2%FBS DMEM稀釋病毒為10整數(shù)倍,然后10倍倍比稀釋的病毒液,每個梯度接種4孔,100 m L/孔,37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),逐日顯微鏡下觀察記錄細胞病變。
1.2.6 RT-PCR:50μL反應(yīng)體系:10μL 5×RTPCR緩沖液,2μL dNTP m ix,10μL 5×Q溶液,6 μL 5μmol/L上游引物,6μL 5μmol/L下游引物,2 μL酶混合液,0.5μL 20U/μl RNase抑制劑,9μL H2O,5μL模板 RNA。PCR參數(shù):反轉(zhuǎn)錄50℃ 30 m in,起始 PCR反應(yīng)95℃ 15 min,三步循環(huán):變性94℃ 30 s,退火55℃ 30 s,延伸72℃ 30 s,循環(huán)數(shù)40;延伸72℃2 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)0.8%瓊脂糖凝膠電泳,80 V,40 min,凝膠成像。
1.2.7 Real-time RT-PCR:25μL反應(yīng)體系:5μL RNA,15μL 2×Taqman one-step RT-PCR混合液,0.75μL RNase抑制劑,終濃度為0.25μmol/L的上游引物、下游引物及終濃度為0.125μmol/L探針。反應(yīng)參數(shù):逆轉(zhuǎn)錄48℃ 30 m in,起始反應(yīng)95℃ 10 m in,預(yù)變性,95℃ 15 s,60℃ 1 m in擴增40個循環(huán)。在60℃進行單點熒光檢測。
2.1 待檢病毒定量
收獲得到含有大量感染性H5N1病毒粒子的雞胚尿囊液。A/BeiJing/01/03 H5N1病毒稀釋液在六孔板形成清晰的白色、大小不均一的混合病毒蝕斑,病毒滴度為2.25×107PFU/m L(彩插2圖1)。
2.2 靈敏性實驗結(jié)果
2.2.1 CPE觀察:高濃度病毒接種的MDCK細胞自48 h在顯微鏡能觀察到明顯病變,細胞發(fā)生融合,后期細胞變圓、崩解。至第5天,10-6病毒稀釋液接種的MDCK細胞病毒死亡,107稀釋的病毒接種細胞及對照細胞生長良好(彩插2圖2)。細胞接種方法檢出靈敏度至10 PFU/m L。
2.2.2 血凝實驗:2-1~2-6血凝結(jié)果為“4+”,2-7血凝結(jié)果為“3+”。雞血紅細胞血凝實驗?zāi)軌驒z出2-7病毒稀釋液,檢出靈敏度至3.52×105PFU/m L (彩插2圖3)。
2.2.3 RT-PCR檢測結(jié)果:10-1~10-4病毒稀釋樣本能夠清晰檢出特異性219 bp條帶,檢出靈敏度至103PFU/m L(圖4)。
圖4 RT-PCR檢測結(jié)果Fig.4 The Results of detection with one step RT-PCR
2.2.4 Real-time RT-PCR檢測結(jié)果:根據(jù)實驗室對熒光定量RT-PCR反應(yīng)體系與反應(yīng)條件的標(biāo)準(zhǔn)選擇與優(yōu)化,10-4,10-5為陽性,10-6為弱陽性結(jié)果,所以該方法能夠檢出10-6病毒稀釋液,檢出靈敏度至10 PFU/m L(圖5)。
幾種檢測方法靈敏度比較:細胞接種與 Realtime RT-PCR病毒檢測靈敏度最高,能夠檢出 10 PFU/m L病毒粒子;RT-PCR能夠檢出103PFU/m L病毒粒子,檢測靈敏度比細胞CPE及Real-time RTPCR低 100倍;血凝實驗靈敏度最低,僅能檢出3.52×105PFU/m L病毒粒子。對于病毒含量較低的待檢樣本,細胞接種與Real-time RT-PCR是首選的檢測方法。
圖5 Real-time RT-PCR檢測結(jié)果Fig.5 The Results of detection with Real-time RT-PCR
幾種檢測方法檢測用時比較:細胞接種方法用時最長,高濃度病毒接種的敏感MDCK細胞也需要2 d才能夠觀察到顯著病變,低濃度病毒接種的細胞需要5 d出現(xiàn)病變,實驗前期細胞培養(yǎng)、材料處理等工作也需要一定時間;血凝實驗費時最短,能夠在2~3 h完成檢測;RT-PCR及 Real-time RT-PCR需要樣本處理、RNA提取等前期工作,但能夠在6~7 h得到結(jié)果。
不同的送檢樣本、采集方法、送檢條件及方式影響感染性H5N1病毒的存活,從而會直接細胞接種方法的檢出靈敏度。此外,傳統(tǒng)的細胞接種實驗及血凝實驗條件要求高,只能在BSL-3實驗室內(nèi)進行,實驗結(jié)果也需要尚需要如電鏡觀察或分子生物學(xué)方法進一步驗證。但是細胞接種檢測方法能夠同時分離獲得病原體,有利于病原學(xué)的進一步研究。
RT-PCR及Real-time RT-PCR等分子生物學(xué)方法應(yīng)用世界衛(wèi)生組織推薦的針對H5亞型HA基因保守序列檢測引物,實驗證明均具有高保真性[14],用于檢測病毒核酸,對病原體要求低,只要有達到檢測下限的未降解AIV核酸即可,具有特異性,高度靈敏性,又檢測快速,而且簡便易操作,不需要高級別生物安全實驗室條件等保障條件,所以更適合于H5亞型禽流感病毒的快速診斷,因而分子生物學(xué)方法在H5N1禽流感的檢測中得以廣泛的應(yīng)用。RT-PCR產(chǎn)物能夠進行擴增片段的序列測定及序列比對分析,為流行病學(xué)調(diào)查研究提供重要數(shù)據(jù)。Real-time RT-PCR檢測技術(shù),閉管式操作能夠最大程度避免污染與假陽性結(jié)果的出現(xiàn),還可以實現(xiàn)實時定量,適合用于病原體的早期快速診斷[15-17]。
綜上所述,將傳統(tǒng)的檢測手段與分子生物學(xué)方法結(jié)合,檢測中相互印證,能夠準(zhǔn)確、快速完成H5N1禽流感病原學(xué)檢測工作,為禽流感的快速診斷和分子流行病學(xué)調(diào)查提供技術(shù)支持。
[1]Kilbourne ED.Influenza pandemics of the 20th century[J].Emerg Infect Dis,2006,12(1):9-14.
[2]Ligon BL.Avian influenza virus H5N1:A review of its history and information regarding its potential to cause the next pandemic[J].Semin Pediatr Infect Dis,2005,16(4):326-335.
[3]Kuiken T,Holmes EC,McCauley J,et al.Host species barriers to influenza virus infections[J].Science,2006,312(3):94 -97.
[4]Dybing JK,Shultz-Cherry S,etal.Distinct pathogenesis of Hong Kong-origin H5N1 viruses in mice compared to that of other highly pathogenic H5 avian influenza viruses[J].JVirol,2000,74:1443-1450.
[5]Maines TR,Lu XH,Erb SM,et al.Avian influenza(H5N1) viruses isolated from humans in asia in 2004 exhibit increased Virulence in mammals[J].J Virol,2005,79(18):11788 -11800.
[6]Liu J,Xiao H,Lei F,et al.Highly pathogenic H5N1 influenza virus infection in migratory birds[J]. Science,2005,309:1206.
[7]Wang GH,Zhan DW,Li LX,et al.Reemergence of H5N1 Avian Influenza in Qinghai in 2006:Implications for the Potential Role of Migratory Birds in Its Global Circulation.J Gen Virol,2008,89:697-702.
[8]黃禎祥,洪濤,劉崇柏,等.醫(yī)學(xué)病毒學(xué)基礎(chǔ)及實驗技術(shù)[M].北京:科學(xué)技術(shù)出版社,1990:149-156.
[9]殷震,劉景華.動物病毒學(xué)(第2版)[M].北京:科學(xué)出版社,1997:84-86,93-98.
[10]Lee MS,Chang PC,Shien JH,et al.Identification and subtyping of avian influenza viruses by reverse transcription-PCR[J].JVirol Methods,2001,97(1-2):13-22.
[11]Starick E,Romer-Oberdorfer A,Werner O.Type-and sutypespecific RT-PCR assays for avian influenza A viruses(AIV)[J].JVet Med B Infect Dis Vet Public Health,2000,47(4):295-301.
[12]Chen WJ,He B,Li CG.Real-time RT-PCR for H5N1 avian influenza A virus detection[J].J Med Microbiol,2007,56:603-607.
[13]Zhu QY,Qin ED,Wang W,et al.Fatal infection with influenza A(H5N1)virus in China[J].N Engl J Med,2006,354 (25):2731-2.
[14]Wang W,Ren PJ,Sek Mardi,et al.Design of multiplexed detection assays for identification of avian influenza Avirus subtypes pathogenic to humans by smartcycler Real-time reverse transcription-PCR[J].J Clin Microbiol,2009,47(1):86 -92.
[15]包紅梅,王秀榮,劉麗玲,等.H5亞型禽流感病毒一步法RT-PCR檢測方法的建立[J].中國生物工程雜志,2007,27 (5):65-69.
[16]曾顯營,耿士忠,潘志明,等.紅細胞富集與多重RT-PCR聯(lián)合檢測禽流感病毒[J].中國人獸共患病學(xué)報,2007,23 (2):153-155.
[17]盧亦愚,嚴(yán)菊英,馮 燕,等.TaqMan-MGB熒光定量RT-PCR技術(shù)快速檢測H5亞型禽流感病毒[J].中國病毒學(xué),2006,472-476.