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偽威氏按蚊mtDNA-Cytb基因群體遺傳學(xué)研究*

2011-08-21 06:51湯林華周水森潘嘉云王學(xué)忠楊曼尼卓瑪央金
關(guān)鍵詞:復(fù)合體瘧疾云南省

劉 茜,武 松,湯林華,周水森,黃 芳,潘嘉云,王學(xué)忠,楊曼尼,卓瑪央金

2.中國(guó)疾病控制中心寄生蟲病預(yù)防控制所,世界衛(wèi)生組織瘧疾、血吸蟲病和絲蟲病合作中心,上海 200025;

3.云南省寄生蟲病研究所,普洱 665000;

4.西藏自治區(qū)林芝地區(qū)疾病預(yù)防控制中心,林芝 860100

課題組于2007與2010年在西藏瘧疾流行區(qū)墨脫縣進(jìn)行媒介調(diào)查發(fā)現(xiàn),該縣的按蚊主要包括多斑按蚊復(fù)合體和帶足按蚊,對(duì)多斑按蚊復(fù)合體進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室種型鑒定發(fā)現(xiàn)包括偽威氏按蚊和威氏按蚊[1],其中偽威氏按蚊為絕對(duì)優(yōu)勢(shì)蚊種,在偽威氏按蚊中采用巢氏PCR方法檢測(cè)出間日瘧原蟲SSU r DNA基因特異序列[2],從而從分子角度判定偽威氏按蚊為該瘧疾流行區(qū)的傳瘧媒介。云南省與西藏瘧疾流行區(qū)相鄰,偽威氏按蚊在該省分布廣泛。課題組擬采用線粒體細(xì)胞色素B基因?qū)ξ鞑?、云南和緬甸拉咱市的偽威氏按蚊進(jìn)行群體遺傳分析,以期為云南省偽威氏按蚊在瘧疾傳播作用方面提供研究思路。

1 材料與方法

1.1 樣本采集 所有按蚊成蚊標(biāo)本課題組采集于2007年西藏與云南及緬甸現(xiàn)場(chǎng)。采集到的按蚊經(jīng)過形態(tài)學(xué)鑒定至多斑按蚊復(fù)合體,帶回實(shí)驗(yàn)室采用分子方法進(jìn)行具體種型鑒定。5個(gè)群體共獲偽威氏按蚊共44份樣本用于mt DNA-Cytb基因群體遺傳分析,見表1。

表1 偽威氏按蚊采集地點(diǎn)與編號(hào)Tab.1 Anopheles pseudowillimori collection spot and ID

1.2 mt DNA-Cytb基因擴(kuò)增

1.2.1 基因提取 采用簡(jiǎn)易快速DNA提取法[3],即將1~2個(gè)蚊腿置于1.5 m L離心管,加入35μL裂解液(10 mmol/L p H8.0 Tirs HCL,1 mmol/L EDTA,1%Nonidet P-40 100μg/m L蛋白酶 K),勻漿;再加入35μL消毒雙蒸水,煮沸5 min;10 000 r/min離心2 min,取上清液置-30℃?zhèn)溆谩?/p>

1.2.2 擴(kuò)增體系與條件 采用文獻(xiàn)報(bào)道的擴(kuò)增方案[4],正 向 引 物:5′-GGA CAA ATA TCA TTT TGA GGA GCA ACA G-3′;反向引物為:5′-ATT ACT CCT CCT AGC TTA TTA GGA ATT G-3′。擴(kuò)增體系為50μL,體系包括10×PCR緩沖液5.0 μL,4.5μL MgCl2(25 mmol/L),1.0μL d NTPs(10 mmol/L),正、反向引物0.8μL(20 mmol/L),2.5 μL redTaq聚合酶(1U/μL),1.5μL DNA 模板,33.9μL dd H2O。反映條件94℃預(yù)變性2 min,94℃變性30 s,45℃退火30 s,72℃延伸30 s,共35個(gè)循環(huán),72℃孵育8 min。擴(kuò)增產(chǎn)物送基因公司進(jìn)行測(cè)序。

1.3 數(shù)據(jù)分析 測(cè)序結(jié)果以Chromas(Version 2.13)進(jìn)行核對(duì),必要時(shí)手工調(diào)整,序列比對(duì)采用Clustal X進(jìn)行,MEGA軟件包統(tǒng)計(jì)序列特征,包括堿基含量、轉(zhuǎn)換和顛換的數(shù)目等,并計(jì)算序列的差異性(p距離),依據(jù)差異性構(gòu)建鄰接樹(Neighbor Joining Tree,NJ)。將序列數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為ARLEQUIN(Version 3.0)可識(shí)別的文件后,統(tǒng)計(jì)和計(jì)算各群體的基因序列堿基分化參數(shù),置換位點(diǎn)數(shù)目、單倍型的類型和在群體中的分布等。單倍型之間的系譜關(guān)系由TCS 1.21[5])軟件包構(gòu)建。群體遺傳結(jié)構(gòu)由ARLEQUIN的AMOVA模塊計(jì)算,包括群體間的分化參數(shù)Fst(F-statistics)、基因流水平Nm(Nm=1-Fst/4Fst)和群體內(nèi)和群體間的變異成分。

2 結(jié) 果

2.1 擴(kuò)增情況 受檢偽威氏按蚊DNA標(biāo)本均擴(kuò)增出mt DNA-Cytb基因目標(biāo)片段,擴(kuò)增片段約為445 bp,所有的擴(kuò)增產(chǎn)物在瓊脂糖凝膠中觀察,均為單一、清晰的條帶,長(zhǎng)度與預(yù)期一致。

2.2 偽威氏按蚊mt DNA-Cytb序列特征 測(cè)序獲得偽威氏按蚊Cytb基因共44條,比對(duì)序列,發(fā)現(xiàn)差異極小,經(jīng)GenBank的BLAST比對(duì),確認(rèn)該序列片段為特異擴(kuò)增的Cytb基因。在序列比對(duì)后,取其中的420 bp部分片段進(jìn)行后續(xù)分析,結(jié)果顯示,堿基置換的位點(diǎn)為26個(gè),其中23處轉(zhuǎn)換(50.0%),2處顛換(7.69%),1個(gè)超變位點(diǎn)(3.85%),共27個(gè)單倍型(61.36%),其中有6個(gè)單倍型在群體中共享,見表2。該片段的平均AT含量為75.6%,GC含量為24.4%。

2.3 單倍型之間的關(guān)系 將本研究得到的偽威氏按蚊Cytb基因的33個(gè)單倍型應(yīng)用TCS1.21軟件包建立95%簡(jiǎn)約家系網(wǎng)絡(luò)圖(圖1),網(wǎng)絡(luò)圖中每個(gè)圈代表其中一個(gè)單倍型,空白部分是未檢測(cè)到的單倍型,在家系網(wǎng)絡(luò)圖中各單倍型呈高水平的平行演化,COI_DX02(18)、COI_DX01(12)和 COI_M(jìn)N16(5)在群體中的分布豐度較高,分別占27.69%、18.46%和7.69%,COI_DX02作為外群的最大可能值0.2125,Cytb_cy15作為外群的最大可能性為0.1925。應(yīng)用Mega軟件包計(jì)算本研究偽威氏按蚊mt DNA-Cytb基因單倍型之間的遺傳距離,并依據(jù)遺傳距離構(gòu)建聚類關(guān)系樹(圖2),樹的拓?fù)潢P(guān)系顯示各單倍型之間的聚類關(guān)系沒有明顯的與地理分布呈相關(guān)性。

圖1 偽威氏按蚊mtDNA-Cytb基因單倍型的家系網(wǎng)絡(luò)圖Fig.1 Family constellation network map of mtDNA-Cytb haplotypes of Anopheles pseudowillimori

2.4 群體遺傳結(jié)構(gòu) 分步AMOVA計(jì)算結(jié)果顯示,群體內(nèi)變異絕對(duì)大于群體間變異,群體內(nèi)差異占總差異的98.30%,群體間占1.70%,見表2,所有群體的Fst值為0.016 96,見表3,Nm為4.168,大于1,提示基因流水平可以完全抵御遺傳漂變?cè)斐傻娜后w分化,群體間幾乎沒有發(fā)生遺傳分化。本研究結(jié)果顯示西藏墨脫縣與云南景洪群體間Fst值最大(0.086 50),云南勐臘與緬甸拉咱市、察隅和墨脫群體間的Fst值依次為-0.081 12、-0.003 81和-0.103 03;墨脫與緬甸拉咱市群體間的Fst值為-0.005 12,提示上述群體相互間基因流水平非常高,群體遺傳分化程度很小。

圖2 偽威氏按蚊mtDNA-Cytb基因單倍型之間的聚類關(guān)系Fig.2 Cluster relation of mtDNA-Cytb haplotypes of Anopheles pseudowillimori

表2 偽威氏按蚊群體mtDNA-Cytb序列基本數(shù)據(jù)摘要Tab.2 mtDNA-Cytb gene data of Anopheles pseudowillmori population

表3 偽威氏按蚊群體mtDNA-Cytb基因AMOVA分析Tab.3 mtDNA-Cytb AMOVA analysis of Anopheles pseudowillmori population

3 討 論

多斑按蚊(Anophelesmaculatus)由Theobald于1901年定名,模式產(chǎn)地為香港,隸屬按蚊屬,塞蚊亞屬,新塞蚊系,主要分布于東洋區(qū)(Oriental region),從印度次大陸,經(jīng)東南亞至中國(guó)臺(tái)灣。多斑按蚊過去一直被認(rèn)為是單一蚊種,后經(jīng)科學(xué)家多年研究證實(shí),發(fā)現(xiàn)多斑按蚊是由多個(gè)形態(tài)相似的蚊種組成的復(fù)合體,多斑按蚊復(fù)合體在我國(guó)主要分布于北緯34°以南地區(qū),是山區(qū)、半山區(qū)及河谷地區(qū)的主要蚊種。目前該復(fù)合體已經(jīng)包括9種,Harbach[6-7]最終確立多斑按蚊復(fù)合體有9成員種,即多斑按蚊(An.maculatus)、威氏按蚊(An.willmori)、偽威氏按 蚊 (An.pseudowillmori)、塞 沃 按 蚊 (An.sawadwongporni)、達(dá)羅毗按蚊(An.dravidicus)、異形按蚊(An.dispar)、諾他按蚊(An.notanandai)、格林按蚊(An.greeni)和多斑按蚊核型 K,其中前5種在我國(guó)有分布。姬淑紅[8]和陸寶麟[9]對(duì)我國(guó)5種多斑按蚊復(fù)合體的形態(tài)鑒別特征進(jìn)行系統(tǒng)闡述。多斑按蚊復(fù)合體成員種形態(tài)非常相似,其部分成員種是馬來西亞、泰國(guó)、老撾等國(guó)主要傳瘧媒介之一[10-12]。

課題組前期研究在西藏瘧疾流行區(qū)墨脫縣發(fā)現(xiàn),偽威氏按蚊為該地的主要傳瘧媒介,云南省與西藏自治區(qū)相鄰,董學(xué)書[13]發(fā)現(xiàn)多斑按蚊復(fù)合體中的偽威氏按蚊、威氏按蚊和多斑按蚊在云南省為全省分布,占云南山區(qū)、半山區(qū)和河谷區(qū)按蚊總數(shù)的42.68%,其中偽威 氏占 22.44%,多斑 按蚊占9.35%,甚至在云南省某些地區(qū)多斑按蚊復(fù)合體占捕獲按蚊的比例高達(dá)94.6%,為絕對(duì)優(yōu)勢(shì)蚊種[14]。并經(jīng)流行病學(xué)調(diào)查發(fā)現(xiàn),多斑按蚊與偽威氏按蚊和瘧疾發(fā)病關(guān)系密切,推測(cè)可能為傳瘧媒介;但都因未能發(fā)現(xiàn)子孢子感染的直接證據(jù),未能確定其為傳瘧媒介。本研究從群體遺傳學(xué)的角度,探討了西藏瘧疾流行區(qū)墨脫縣、察隅縣與云南省勐臘、景洪和緬甸拉咱市偽威氏按蚊的群體遺傳分化關(guān)系,發(fā)現(xiàn)各群體間基因交流頻繁,尚未發(fā)生群體間的分化。另群體內(nèi)變異(98.30%)遠(yuǎn)大于群體間變異(1.70%),提示偽威氏按蚊可能曾經(jīng)歷過近期群體擴(kuò)張事件,且目前仍處于群體擴(kuò)張階段,故mt DNA-cytb基因序列的核苷酸變異主要發(fā)生在于群體內(nèi)個(gè)體間研究,結(jié)果也暗示了云南省的偽威氏按蚊理論上也應(yīng)具備瘧疾的傳播能力,應(yīng)該加強(qiáng)云南省偽威氏按蚊傳瘧能力的研究。

[1]武松,潘嘉云,王學(xué)忠,等.西藏墨脫縣瘧疾流行區(qū)多斑按蚊復(fù)合體種型鑒定[J].中國(guó)寄生蟲學(xué)與寄生蟲病雜志,2008,26(4):286-289.

[2]武松,黃芳,張國(guó)慶,等.巢氏PCR判定西藏瘧疾流行區(qū)傳瘧媒介[J].中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào),2010,26(7):648-650,653.

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[14]和春桐.云南貢山縣獨(dú)龍河谷地帶傳瘧媒介的調(diào)查研究[J].現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué),2008,35(23):4670-4671.

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