麥國(guó)琴,許曉萍,余翠媚,張立國(guó),王娟
(深圳大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,廣東 深圳 518060)
纖維素是地球上分布最廣、蘊(yùn)藏量最豐富的生物質(zhì),也是最廉價(jià)的可再生資源。纖維素酶是一類能夠?qū)⒗w維素降解為葡萄糖的多組分酶系的總稱,它們協(xié)同作用,分解纖維素產(chǎn)生寡糖和纖維二糖,最終水解為葡萄糖[1]。纖維素酶可廣泛用于食品、紡織、飼料、釀酒、石油勘探、中藥成分提取等眾多領(lǐng)域,特別是在紡織、洗滌、造紙和生物能源等工業(yè)應(yīng)用上具有重要地位[2]。木聚糖是植物半纖維素的主要成分,是一種多聚五碳糖,且多以異質(zhì)多糖形式存在,與纖維素分子之間存在氫鍵連接和物理混合。木聚糖酶是一類降解木聚糖分子的復(fù)雜酶系,包括內(nèi)切β-1,4-木聚糖酶、β-D-木糖苷酶、α-L-呋喃型阿拉伯糖苷酶、乙酰木聚糖酯酶、酚酸酯酶等[3]。
南海沿岸紅樹(shù)林資源豐富,紅樹(shù)林(mangrove)是熱帶、亞熱帶海岸潮間帶的木本植物群落[4]。其生態(tài)系統(tǒng)是一個(gè)特殊復(fù)雜的生境,植物凋落物極其豐富,其中含有大量的纖維素、半纖維素等,紅樹(shù)林區(qū)絕大多數(shù)真菌都能產(chǎn)生降解纖維素和其他植物成分的酶[5]。目前,研究人員對(duì)陸地環(huán)境中的真菌研究較多[6-8],而與紅樹(shù)林環(huán)境中真菌的分離鑒定、酶活及酶學(xué)性質(zhì)分析等的相關(guān)研究相對(duì)較少。本研究從深圳福田紅樹(shù)林土壤環(huán)境中篩選高產(chǎn)纖維素酶、木聚糖酶的真菌菌株,并對(duì)其進(jìn)行分子鑒定及酶學(xué)性質(zhì)的研究。
樣品采自于深圳福田紅樹(shù)林表層0~15 cm的土壤,選擇10個(gè)采集點(diǎn),每點(diǎn)采集樣品約10 g。
1)馬丁氏瓊脂培養(yǎng)基[9]:葡萄糖10 g,蛋白胨5 g,K2HPO41 g,MgSO4·H2O 0.5 g,瓊脂20 g,海水750 mL,加去離子水至1 L,121℃滅菌30 min,溫度降到50℃左右,加入青霉素、鏈霉素(其終濃度均為50μg/mL)。
2)液體種子培養(yǎng)基:mandels營(yíng)養(yǎng)鹽濃縮液100mL/L,mandels微量元素濃縮液1.0 mL/L,葡萄糖10 g/L,蛋白胨1 g/L,1 mol/L的檸檬酸緩沖液(pH 4.5)50 mL/L,吐溫801.5 mL/L。
3)纖維素酶產(chǎn)酶培養(yǎng)基:微晶纖維素粉30 g/L,mandels營(yíng)養(yǎng)鹽濃縮液200 mL/L,mandels微量元素濃縮液1.0 mL/L,葡萄糖3 g/L,蛋白胨1 g/L,1 mol/L的檸檬酸緩沖液(pH 4.5)50 mL/L,吐溫801.5 mL/L。
4)木聚糖酶產(chǎn)酶培養(yǎng)基:玉米芯粉30 g/L,mandels營(yíng)養(yǎng)鹽濃縮液200 mL/L,mandels微量元素濃縮液1.0 mL/L,葡萄糖3 g/L,蛋白胨1 g/L,1 mol/L的檸檬酸緩沖液(pH4.5)50 mL/L,吐溫801.5 mL/L。
1.3.1 紅樹(shù)林土壤真菌的分離與篩選
將采集的樣品分別用無(wú)菌水適當(dāng)稀釋,涂布于馬丁氏瓊脂培養(yǎng)基平板,37℃培養(yǎng)2d,挑取單菌落在馬丁氏瓊脂培養(yǎng)基平板上劃線純化分離3次,得到純種的真菌。
將純化菌株(無(wú)菌水洗孢子3mL)接種于含有30mL液體種子培養(yǎng)基的三角搖瓶中,于28℃,250 r/min條件下振蕩培養(yǎng)2d后,再取3 mL的液體種子接種于含有30 mL產(chǎn)酶培養(yǎng)基的三角搖瓶中于28℃,250 r/min條件下振蕩培養(yǎng)4 d后分別檢測(cè)其木聚糖酶及纖維素酶酶活。
1.3.2 木聚糖酶酶活測(cè)定
首先在試管中加入0.9 mL 0.5%的木聚糖溶液(由0.05 mol/L pH4.8的醋酸緩沖液配制)和0.1 mL適當(dāng)稀釋的酶液,50℃恒溫水浴20 min后加入2 mL 3,5-二硝基水楊酸(DNS)試劑終止反應(yīng),煮沸5 min,冷卻后測(cè)定其540 nm下的吸光值,以木糖作標(biāo)準(zhǔn)。酶活定義:1 mL酶液在50℃和pH 4.8條件下,每分鐘水解木聚糖生成1 μmol木糖的量為1個(gè)酶活力單位,以IU表示。
1.3.3 纖維素酶活測(cè)定
在試管中加入0.9 mL 1%的微晶纖維素溶液(由0.05 mol/L pH4.8的檸檬酸緩沖液配制)和0.1 mL適當(dāng)稀釋的酶液,50℃恒溫水浴20 min后加入2 mL DNS試劑終止反應(yīng),煮沸5 min,冷卻后測(cè)定其540 nm下的吸光值,以葡萄糖作標(biāo)準(zhǔn)。酶活定義:1 mL酶液在50℃和pH4.8條件下,每分鐘水解纖維素生成1 μmol葡萄糖的量為1個(gè)酶活力單位,以IU表示。
1.3.4 最適pH和最適溫度的測(cè)定
最適pH測(cè)定:配制pH1~pH12的緩沖液,分別在pH1~pH12條件下按照1.3.2及1.3.3方法測(cè)定木聚糖酶和纖維素酶活性。
最適溫度測(cè)定:用pH 4.8緩沖液配制底物,分別在10℃~80℃條件下按照1.3.2及1.3.3方法測(cè)定木聚糖酶和纖維素酶活性。
1.3.5 菌株的鑒定
形態(tài)觀察方法參考乳酸石碳酸棉藍(lán)染色液染色法[10]。
分子鑒定:提取真菌的基因組DNA,采用真菌5.8S rDNA通用引物ITS1及ITS4[11]擴(kuò)增菌株的5.8S rDNAITS(內(nèi)部轉(zhuǎn)錄間隔區(qū),internal transcriber spacer)序列,對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行切膠回收、測(cè)序,將所得序列與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中序列進(jìn)行tblastx分析比對(duì)。
深圳福田紅樹(shù)林土壤樣品經(jīng)分離純化,在含抗生素的馬丁氏瓊脂培養(yǎng)基上涂布、劃線、純化,共分離得到80株真菌。把這80株真菌分別接到液體種子培養(yǎng)基、產(chǎn)酶培養(yǎng)基上復(fù)篩,得到2株(菌株1和菌株2)同時(shí)具有較高木聚糖酶和纖維素酶活的真菌。經(jīng)測(cè)定,菌株1的木聚糖酶和纖維素酶活分別為42.16 IU和3.05 IU,菌株2的木聚糖酶和纖維素酶活分別為39.01 IU和0.87 IU。
菌株1和菌株2在馬丁氏培養(yǎng)基上的菌落特征和分生孢子結(jié)構(gòu)見(jiàn)圖1。
圖1a顯示,菌株1在馬丁氏培養(yǎng)基上28℃培養(yǎng)7 d,直徑約60 mm,中間有臍狀突起而其他部分平坦;質(zhì)地絨狀;分生孢子大量產(chǎn)生;分生孢子面先是粉紅色,后來(lái)變成暗綠色,菌落反面為黃褐色。圖1b顯示,菌株2在馬丁氏培養(yǎng)基上28℃培養(yǎng)7 d,直徑約65 mm,平坦并具有輻射狀溝紋;質(zhì)地絲絨狀,分生孢子大量產(chǎn)生,主要聚集在菌落的中部,為灰褐色,菌落反面呈淡黃色。
圖1 菌株的菌落特征及分生孢子結(jié)構(gòu)Fig.1 Characteristics of colony and conidia structure of two strains
經(jīng)乳酸石碳酸棉藍(lán)染色液染色后,在40 X光學(xué)顯微鏡下觀察結(jié)果如下:圖1c顯示,菌株1其分生孢子梗莖壁平;帚狀枝通常二輪生,偶有三輪生;?;枯?~4個(gè),彼此較緊貼;分生孢子近似于橢圓形,分生孢子鏈近于圓柱狀。圖1d顯示,菌株2其分生孢子囊為球形;分生孢子梗老時(shí)黃色或黃褐色,壁平滑;頂囊球形;分生孢子近似于球形。
利用真菌5.8S rDNA通用引物ITS1及ITS4,分別從菌株1和菌株2的基因組DNA中擴(kuò)增出一條特異性片段,序列大約600 bp。菌株1、2的基因組DNA及5.8S ITS PRC產(chǎn)物電泳圖分別見(jiàn)圖2、圖3。
圖2 兩菌株的基因組DNAFig.2 Genome DNA of two strains
圖3 兩菌株的ITS序列Fig.3 ITS sequence of two strains
將擴(kuò)增的ITS序列PCR產(chǎn)物進(jìn)行切膠回收、測(cè)序,并把測(cè)序結(jié)果與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中序列進(jìn)行tblastx比對(duì)分析,菌株1的ITS序列與Penicillium oxalicum strain XWSFJJ3(FJ977097)的相似性達(dá)到99.5%,同時(shí)結(jié)合形態(tài)觀察,可確定菌株1為草酸青霉(Penicillium oxalicum);菌株2的ITS序列與Aspergillus piperis strain CBS 112811(FJ629352)的相似性達(dá)到99.6%,結(jié)合形態(tài)觀察,可確定菌株2為曲霉屬的Aspergillus piperis。
在不同的溫度條件下測(cè)定菌株1和菌株2的木聚糖酶活見(jiàn)圖4。
圖4 木聚糖酶的最適溫度Fig.4 Optimum temperature of xylanase
由圖4可知,2種真菌的木聚糖酶活的最適溫度均為50℃,酶活分別為42.16 IU和39.01 IU;并且在40℃~60℃范圍內(nèi)都能保持67.1%以上的酶活,尤其菌株1在70℃下仍保持64.3%的酶活,說(shuō)明該菌產(chǎn)生的木聚糖酶具有一定的耐熱性,有較好的應(yīng)用潛能。
在不同的溫度條件下測(cè)定菌株1和菌株2的纖維素酶活見(jiàn)圖5。
圖5 纖維素酶的最適溫度Fig.5 Optimum temperature of cellulase
同圖5可以看出,菌株1的纖維素酶的最適溫度是60℃,酶活為3.18 IU;菌株2的纖維素酶活的最適溫度是70℃,酶活為1.22 IU,盡管菌株2的纖維素酶活較低,但其具有一定的耐熱性,而且在30℃~80℃范圍內(nèi)酶活活性變化不明顯,說(shuō)明溫度適用范圍較廣。
在不同的pH條件下測(cè)定菌株1和菌株2的木聚糖酶酶活,見(jiàn)圖6。
圖6 木聚糖酶的最適pHFig.6 Optimum pH value of xylanase
由圖6可知,菌株1木聚糖酶的最適pH為5.0,但在pH 4和pH 6時(shí)仍分別保持85.6%和84.1%以上的酶活;菌株2木聚糖酶的最適pH為4.0,在pH 4~8范圍內(nèi)酶活變化不明顯,說(shuō)明該木聚糖酶的pH適用范圍較廣,有利于酶在工業(yè)中的應(yīng)用。但當(dāng)pH大于9時(shí),兩菌的木聚糖酶活明顯下降,在pH 12時(shí)幾乎沒(méi)有酶活。不同pH條件下菌株1和菌株2的纖維素酶酶活見(jiàn)圖7。
圖7顯示菌株1和菌株2纖維素酶的最適pH均為3.0。菌株1和菌株2在pH 2~5范圍內(nèi)纖維素酶酶活變化不明顯,說(shuō)明兩菌株均產(chǎn)生酸性纖維素酶。
圖7 纖維素酶的最適pHFig.7 Optimum pH value of cellulase
南海紅樹(shù)林產(chǎn)纖維素酶或木聚糖酶的土壤微生物廈門(mén)大學(xué)和海南大學(xué)已有報(bào)道[12-13],但對(duì)分離菌株的分子鑒定及最適溫度、pH等特性并未有詳細(xì)數(shù)據(jù)。我們應(yīng)用分子生物學(xué)手段,對(duì)菌株進(jìn)行了分子鑒定,并對(duì)相關(guān)酶學(xué)性質(zhì)進(jìn)行了研究。
rDNA上的5.8、18和28 S rDNA基因有極大的保守性,同時(shí)絕大多數(shù)的真核生物都有極為廣泛的序列多態(tài)性,即親緣關(guān)系非常接近的2個(gè)種都能在ITS序列上表現(xiàn)出差異,顯示最近的進(jìn)化特征,這就是ITS序列在微生物種類鑒定的理論基礎(chǔ)[14]。從深圳福田紅樹(shù)林土壤環(huán)境中篩選的產(chǎn)纖維素酶、木聚糖酶的真菌菌株,根據(jù)ITS序列特征,本研究鑒定的2個(gè)菌株,其ITS序列與數(shù)據(jù)庫(kù)中已知菌株的序列相似性均高于99.5%,結(jié)合形態(tài)觀察的結(jié)果,最終確定菌株1為草酸青霉(Penicillium oxalicum),菌株2為曲霉屬的Aspergillus piperis。
本實(shí)驗(yàn)中菌株2纖維素酶的最適溫度是70℃,屬于嗜熱纖維素酶[15],可應(yīng)用于農(nóng)業(yè),使纖維素降解為糖,再由糖轉(zhuǎn)化為乙醇,產(chǎn)嗜熱纖維素酶的工程菌可在高溫條件下大量生產(chǎn)酒精,為能源建設(shè)開(kāi)辟新途徑。本實(shí)驗(yàn)分離的兩菌株纖維素酶最適pH均為3.0,說(shuō)明均具有較強(qiáng)的耐酸性,酸性纖維素酶可廣泛應(yīng)用于釀酒、釀醋、果汁等食品工業(yè)中[16]。
由于酸性木聚糖酶在pH 4.0以下時(shí)仍然保持較高酶活性,可廣泛應(yīng)用于飼料加工、釀酒工業(yè)、果汁加工等領(lǐng)域[17]。本研究所篩選的Penicillium oxalicum和Aspergillus piperis均具有較高的木聚糖酶酶活。今后將進(jìn)一步優(yōu)化培養(yǎng)條件和培養(yǎng)基組分,提高酶活性??寺∠嚓P(guān)的功能基因,深入研究其酶學(xué)性質(zhì),為開(kāi)發(fā)新型纖維素酶和木聚糖酶制劑奠定基礎(chǔ)。
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