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結(jié)核分枝桿菌利福平依賴性的初步研究

2012-01-24 11:14:18金海霞付雷王彬鄭梅琴陸宇
中國防癆雜志 2012年10期
關(guān)鍵詞:結(jié)核結(jié)核病位點

金海霞 付雷 王彬 鄭梅琴 陸宇

20世紀(jì)60年代,國外文獻報道了鏈霉素依賴的Mtb菌株,即菌株在含鏈霉素的培養(yǎng)基上生長較在不含藥培養(yǎng)基上旺盛[1-2]。之后,又發(fā)現(xiàn)了“依賴RFP的 Mtb菌株”[3-4]。目前,除 RFP依賴 Mtb菌株外,還報道了 Mtb的INH、S、EMB依賴現(xiàn)象[5-8]。RFP自1971年發(fā)明以來,一直是治療結(jié)核病的首選藥物。資料顯示,Mtb對RFP的依賴率最高。現(xiàn)階段,無論在臨床還是在實驗室研究層面,Mtb藥物依賴現(xiàn)象都還沒有引起足夠的重視。國內(nèi)關(guān)于Mtb藥物依賴現(xiàn)象的研究,大多數(shù)還僅停留于菌株的體外篩選,以及對該現(xiàn)象的簡單描述。國外自20世紀(jì)50年代報道了鏈霉素的依賴現(xiàn)象后,尚未見新的報道。一些研究者利用豚鼠模型在體內(nèi)觀察RFP依賴菌株的依賴現(xiàn)象,但未觀察到依賴菌株與非依賴菌株的差異[9]。有學(xué)者認(rèn)為,依賴是在耐藥基礎(chǔ)上產(chǎn)生的,是量變到質(zhì)變的過程,可能是耐藥菌耐藥基因進一步變異的結(jié)果[10]。目前研究表明,大多數(shù)RFP耐藥是由于其靶分子RNA聚合酶β亞基(RpoB)的編碼基因(rpoB)發(fā)生突變,阻止 mRNA合成所致[11-12]。目前,國內(nèi)外已報道有 70 多個rpoB 基因突變位點[11-14],95%以上集 中 在 一個被稱為RFP耐藥決定區(qū)的高度保守區(qū)內(nèi)(507~533位),其中又以531、526和516位3個位點的突變最常見,約占所有耐 RFP Mtb基因突變位點的86%[11-12]。本研究以RFP依賴現(xiàn)象為例,擬從體內(nèi)外同時驗證RFP依賴菌株的依賴現(xiàn)象。并通過rpoB基因突變位點分析,比較RFP依賴與耐藥菌株的差異,從而探討依賴菌株的產(chǎn)生原因,為RFP依賴結(jié)核病的診斷和防治提供依據(jù)。

材料和方法

一、材料

1.菌株:Mtb H37Rv(ATCC27294)為本室保存,46例臨床分離菌株均來自國家結(jié)核病參比實驗室,并在本室保存。

2.實驗動物:6~8周齡雄性 SPF(specific pathogen free)級BALB/c小鼠,體質(zhì)量為16~18 g,購自首都醫(yī)科大學(xué)實驗動物中心。經(jīng)本所動物倫理委員會批準(zhǔn),開展動物實驗。

3.試劑和培養(yǎng)基:7H9培養(yǎng)基(美國Difico公司)4.7 g溶于900 ml蒸餾水中,加入2.0 ml甘油,121℃高壓10 min,待使用前加入0.1體積分?jǐn)?shù)的營養(yǎng)添加劑白蛋白-葡萄糖-過氧化氫酶(ADC);7H11培養(yǎng)基(美國Difco公司)21 g,溶于900 ml蒸餾水中,加入5 ml甘油,121℃高壓10 min,加入100 ml OADC(oleate-albumin-dextrose-catalase),冷卻至50~55℃后分裝。含RFP(終濃度為1μg/ml和10μg/ml)的7H11培養(yǎng)基:稱取7H11培養(yǎng)基21 g,溶于850 ml蒸餾水中,加入5 ml甘油,121℃高壓10 min,加入100 ml OADC,同時加入50 ml 20μg/ml或200μg/ml的無菌 RFP溶液,冷卻至50~55℃后分裝。RFP,Rfb均購自Sigma公司。

二、方法

1.菌株的耐藥情況:46例菌株在改良羅氏培養(yǎng)基上通過絕對濃度法測定其對INH、RFP、EMB、S、Km、卷曲霉素(capreomycin,Cm)、Ofx、左氧氟沙星(levofloxacin,Lfx)(以上藥品均購自Sigma公司)的耐藥情況。具體操作過程參見《結(jié)核病診斷實驗室檢驗規(guī)程》[15]。耐多藥結(jié)核?。╩ultidrug resistant tuberculosis,MDR-TB)為結(jié)核病患者感染的Mtb在體外被證實至少同時對INH和RFP耐藥;廣泛耐藥結(jié)核?。╡xtensively drug-resistant tuberculosis,XDR-TB)為結(jié)核病患者感染的Mtb在體外被證實除對INH和RFP耐藥外,還對任意一種氟喹諾酮類藥物及對三種二線抗結(jié)核藥物注射劑(Km和 Am、Cm)中的至少一種耐藥[16]。

2.依賴菌株的篩選:46例菌株以1×104CFU/平皿的菌量分別接種于含0、1和10μg/ml RFP的7H11培養(yǎng)基上,37℃培養(yǎng),3周后觀察菌株在含藥培養(yǎng)基上的生長是否較不含藥培養(yǎng)基旺盛。根據(jù)《結(jié)核病診斷實驗室檢驗規(guī)程》,菌落生長占接種面積的1/4、1/2、3/4或布滿接種面積時,分別記為+、++、+++、++++。菌株在含1μg/ml RFP的培養(yǎng)基上的生長多于在不含藥培養(yǎng)基和含10μg/ml RFP的培養(yǎng)基上的生長,且多出+以上時,判斷為低濃度依賴;菌株在含10μg/ml RFP的培養(yǎng)基上的生長多于在不含藥培養(yǎng)基和含1μg/ml RFP的培養(yǎng)基上的生長,且多出+以上時,判斷為高濃度依賴;若菌株在含1μg/ml和10μg/ml RFP的培養(yǎng)基上的生長類似,但多于在不含藥培養(yǎng)基上的生長,且多出+以上時,亦判斷為高濃度依賴;其余情況,判斷為非依賴。

3.小鼠體內(nèi)實驗:選取在體外具有典型的RFP依賴現(xiàn)象的05116菌株,在7 H9液體培養(yǎng)基(含0.05%吐溫80)中生長至對數(shù)生長期后,用PBS(含0.05%吐溫80)制成5×107CFU/ml的菌液。取10 ml置于霧化器中,用氣溶膠感染暴露裝置感染小鼠。同時取0.1 ml的感染菌液用PBS進行10倍系列稀釋后,取0.1 ml接種于7 H11培養(yǎng)基上進行活菌計數(shù)。感染2周后開始灌胃給藥,每周給藥5次,每只小鼠給予0.2 ml。每周記錄體質(zhì)量,并根據(jù)體質(zhì)量調(diào)整給藥劑量。小鼠按照給藥的種類和給藥單位劑量分成對照組0.5%羧甲基纖維素鈉(carboxymethyl cellulose sodium,CMC)、10 mg/kg Rfb(Rfb10)組、10 mg/kg RFP(RFP10)組、20 mg/kg RFP(RFP20)組,每組各10只。在感染后第2天、治療開始時分別解剖3只小鼠,取肺進行活菌計數(shù),作為基線值。在給藥后4周、給藥后8周,每組各解剖5只小鼠,對肺進行攝影、活菌計數(shù),同時分別接種于不含RFP、含1、10μg/ml RFP的7 H11培養(yǎng)基上,觀察菌株的生長情況。

4.檢測rpoB基因突變位點:選取利福平依賴與非依賴菌株中MDR及XDR菌株共19株,應(yīng)用煮沸法提取基因組DNA。挑取少量菌落置于EP(eppendorf)管中,加入100μl TE緩沖液,混勻,煮沸15 min,立即置于冰上5 min,12 000轉(zhuǎn)/min(離心半徑8 cm)離心3 min,取上清液,-20℃冰箱保存?zhèn)溆?。PCR擴增:上游引物序列5′-TCAGACCACGATGACCGTTCC-3′,下 游 引 物 序 列 5′-GTCCATGTAGTCCACCTCAGACG-3′。PCR 反應(yīng)采用50μl反應(yīng)體系:10×PCR緩沖液5μl,MgCl23 μl,d NTPs(10 mmol/L)1 μl,引 物(10μmol/L)各1μl,DNA模板2μl,TaqDNA 多聚酶(5 U/L)1μl,用高壓滅菌后的雙蒸水補至50μl。94℃預(yù)變性5 min,94℃變性15 s,62℃退火30 s,72℃延伸1 min,共30個循環(huán),最后72℃延伸10 min。PCR反應(yīng)后,取5μl產(chǎn)物進行2%瓊脂糖凝膠電泳,在紫外線下鑒定有無擴增產(chǎn)物。擴增產(chǎn)物片段長688 bp,送華大基因測序以檢測突變位點。

結(jié) 果

1.體外篩選RFP依賴的Mtb菌株:本研究從46例RFP耐藥的Mtb臨床分離株中篩選到18例RFP耐藥伴依賴的菌株(39.1%)和28例RFP耐藥非依賴的菌株(60.9%)(表1)。18例RFP耐藥依賴的菌株中,2例為低濃度依賴菌株,16例高濃度依賴菌株。藥敏結(jié)果顯示,46例菌株具有不同的耐藥組合(表1),MDR、XDR分別占14.3%,67.9%;而RFP耐藥伴依賴株中,MDR、XDR分別占38.89%,55.56%。

圖1 057、05116菌株在體外具有典型的RFP依賴現(xiàn)象:菌株在含10μg/ml RFP的培養(yǎng)基上的生長比在不含藥培養(yǎng)基和含1μg/ml RFP的培養(yǎng)基上的生長至少多出+。1:不含RFP培養(yǎng)基;2:含1μg/ml RFP培養(yǎng)基;3:含10μg/ml RFP培養(yǎng)基

2.體內(nèi)驗證RFP依賴現(xiàn)象:057、05116菌株在體外具有典型的RFP依賴現(xiàn)象(圖1)。菌株與含10μg/ml RFP的培養(yǎng)基上的生長比在不含藥培養(yǎng)基和含1μg/ml RFP的培養(yǎng)基上的生長至少多出+。體外藥敏實驗表明05116菌株為INH低度耐藥,RFP高度耐藥,對其他所有受試藥物均敏感。體外依賴實驗表明05116菌株為RFP高濃度依賴。選取05116菌株在小鼠體內(nèi)驗證其RFP依賴現(xiàn)象。給藥期間,各組小鼠體質(zhì)量差異不大(圖2)。給藥后4周、給藥后8周,各組小鼠全肺發(fā)生肉芽腫樣病理改變(圖3,4),但從病理改變和給藥后4周的活菌計數(shù)結(jié)果中未觀察到明顯的藥物依賴現(xiàn)象(表2)。繼續(xù)給藥至8周,各組小鼠的活菌計數(shù)結(jié)果(lgCFU 為6.20~6.60)接近于最初感染的菌量(lgCFU為5.93),并且各組小鼠的活菌計數(shù)結(jié)果從高到低依次為:RFP20組、RFP10組、Rfb10組、對照組,說明,RFP及Rfb對小鼠持續(xù)給藥達8周時,藥物對體外RFP依賴的菌株具有一定的促生長作用,并具有濃度依賴性,但差異無統(tǒng)計學(xué)意義(與對照組相比,各組P值均大于0.05)。同時,在給藥后8周,各組小鼠全肺勻漿液在含1μg/ml和10μg/ml RFP的7H11培養(yǎng)基上的培養(yǎng)結(jié)果也顯示,菌株仍保持明顯的RFP依賴現(xiàn)象(圖5)。

表1 RFP耐藥株中依賴菌株和非依賴菌株數(shù)(株)

表2 給藥后各組小鼠肺CFU計數(shù)

A列:0μg/mlRFP7H11培養(yǎng)基;B列:1μg/ml7H11培養(yǎng)基;C列:10μg/mlRFP 7H11;在給藥后8周,各組小鼠全肺勻漿液在含1μg/ml和10μg/ml RFP的7H11培養(yǎng)基上菌株仍保持明顯的RFP依賴現(xiàn)象,對照組菌落較少,而其他組則菌落生長相對旺盛圖5 給藥后8周,對照組、Rfb10組、RFP10組、RFP20組小鼠肺部活菌在含0μg/ml、1μg/ml和10μg/ml RFP的7H11培養(yǎng)基上的生長情況

3.rpoB基因突變位點:RFP依賴與非依賴菌株中MDR及XDR菌株共19株,對其rpoB基因進行測序,結(jié)果顯示,8例RFP耐藥非依賴的菌株中,rpoB基因526位發(fā)生突變的菌株占3/8,531位發(fā)生突變的菌株占2/8,533位、522位發(fā)生突變以及561位和672位同時發(fā)生突變的菌株各占1/8;11例RFP耐藥伴依賴的菌株中,rpoB基因526位發(fā)生突變的菌株占4/11,531位發(fā)生突變的菌株占6/11,511位和518位同時發(fā)生突變的菌株占1/11。

討 論

目前國際尚沒有藥物依賴菌的判斷標(biāo)準(zhǔn)。Mtb依賴菌100%為耐藥菌?,F(xiàn)有資料顯示,在我國耐藥結(jié)核患者中,RFP依賴菌的檢出率為14.13%~17.7%,鏈霉素依賴菌的檢出率為7.8%~11.41%,異煙肼依賴菌的檢出率為1.0%~6.52%[4,7]。這說明,在耐藥結(jié)核患者中,藥物依賴菌患者占了很大的比例。本研究中,RFP依賴菌的檢出率為39.1%,高于文獻報道的值,其原因一方面與樣本量有關(guān),另一方面可能與本單位為三級甲等結(jié)核病專科醫(yī)院,接收的多為病情重、耐多藥、治療效果差的重癥患者有關(guān)。

如圖1所示,臨床分離菌株在體外具有典型的RFP依賴現(xiàn)象。在本研究中,筆者在小鼠氣溶膠感染模型中也觀察到給藥8周時體外RFP依賴菌株05116對RFP及Rfb的依賴現(xiàn)象:給予RFP及利福類藥物治療依賴性菌株感染的小鼠時,小鼠的肺活菌計數(shù)不僅沒有降低,反而呈現(xiàn)濃度依賴性增加。同時,將體內(nèi)傳代后的05116菌株重新接種于含不同RFP濃度的7 H11培養(yǎng)基上,菌株仍表現(xiàn)出明顯的RFP依賴現(xiàn)象。這些結(jié)果間接說明,患者感染藥物依賴性Mtb后,繼續(xù)使用該藥不但治療無效,而且在一定條件下可能促進病原菌生長繁殖,使病情加重。Mtb耐藥造成臨床用藥無效,Mtb藥物依賴無疑將導(dǎo)致臨床有害用藥。這一現(xiàn)象也得到了多位臨床醫(yī)生的觀察證實:部分結(jié)核患者在用藥后,病情惡化;停止用藥,病情反而有所緩解。同時,已經(jīng)有文獻報道表明結(jié)核患者中存在明顯的RFP依賴現(xiàn)象[17],該患者停用RFP而其他治療藥物不變后,病情明顯好轉(zhuǎn)并治愈。RFP依賴菌株05116在小鼠體內(nèi)也表現(xiàn)出對Rfb的依賴性,這也間接證明Rfb和RFP存在交叉耐藥,從而提醒臨床醫(yī)生為RFP耐藥的患者選擇利福類藥物時需慎重考慮。從小鼠給藥4周、8周的肺部病理改變中未觀察到明顯的藥物依賴現(xiàn)象,筆者推測其原因之一可能是本研究在氣溶膠感染小鼠的過程中,感染菌量偏大,從而無法通過肉眼觀察分辨出RFP或Rfb的促生長作用(圖3,4)。

有人認(rèn)為,依賴是在耐藥基礎(chǔ)上產(chǎn)生的,是量變到質(zhì)變的過程,可能是耐藥菌耐藥基因進一步變異的結(jié)果[10]。本研究結(jié)果表明,RFP依賴株和耐藥株在rpoB基因突變位點上略有不同,但因檢測的樣本量有限,僅檢測了19例,不足以說明兩者之間是否差異有統(tǒng)計學(xué)意義,因此,需要進一步擴大樣本量,以鑒定RFP依賴株和耐藥株的差異。其他研究也表明,結(jié)核分枝桿菌RFP依賴株和耐藥株的rpoB基因突變位點基本相同,DNA指紋類型及分布亦無明顯特殊性,表明前者的變異主要為表型變異[18]。因此,依賴現(xiàn)象的獨特表現(xiàn)可能源于基因表達差異。

綜上所述,RFP依賴菌在臨床RFP耐藥株中的檢出率高,并在小鼠體內(nèi)初步觀察到體外RFP依賴菌株的RFP依賴現(xiàn)象。但由于本研究主要以肉眼觀察指標(biāo)來判斷藥物依賴,沒有量化指標(biāo),所以研究結(jié)果也存在一定的局限性。同時,通過對利福平依賴與非依賴菌株中MDR及XDR菌株進行測序分析,檢測突變位點,發(fā)現(xiàn)RFP耐藥株和依賴株的rpoB基因突變位點基本相同,因此RFP依賴的原因是表型變異還是其他因素尚有待進一步的實驗證實。

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