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福建省嗜肺軍團菌血清1型及血清6型菌株P(guān)FGE分型研究*

2012-01-24 02:12陳愛平楊勁松林震宇
中國人獸共患病學(xué)報 2012年5期
關(guān)鍵詞:軍團菌凝膠電泳冷卻塔

原 靈,陳愛平,楊勁松,林震宇

軍團病是近20年以來新發(fā)現(xiàn)傳染病之一,并且該病已成為世界各國及我國普遍關(guān)注的公共衛(wèi)生問題。

為進一步了解福建省嗜肺軍團菌分子特征,作者采用脈沖場凝膠電泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分型技術(shù)對福建省2008-2010年公共場所中央空調(diào)冷卻塔水及冷凝水中分離到的嗜肺軍團菌主要血清型別血清Ⅰ型(LP1)及Ⅵ型(LP6)菌株進行基因分型研究,現(xiàn)將結(jié)果報告如下。

1 材料與方法

1.1 菌株 57株LP1及15株LP6嗜肺軍團菌均為我省2008-2010年公共場所中央空調(diào)冷卻塔水及冷凝水污染狀況調(diào)查中分離菌株,并經(jīng)形態(tài)染色、生化鑒定、血清學(xué)凝集試驗鑒定為LP1型及LP6型及經(jīng)PCR確認的嗜肺軍團菌。菌株來源于我省7個設(shè)區(qū)市;PFGE實驗分子量標準對照沙門菌(Braenderup)H9812菌株,由中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所提供。

1.2 主要試劑 乳膠凝集試劑購自英國OXOID公司;軍團菌診斷血清購自日本生研會社,均在有效期內(nèi)使用。GVPC平板、BCYE-α平板購自廣州環(huán)凱在有效期內(nèi)。Seakem Gold Agarose PFGE級瓊脂糖購自法國Lonza公司,AscⅠ限制性內(nèi)切酶(10U/μL)、XbaI限制性內(nèi)切酶(20U/μL)以及蛋白酶 K購自美國 NEB公司,Tris、EDTA、硼酸等試劑購自上海生工公司。

1.3 主要儀器 TGL-16B臺式高速離心機、水平電泳槽、生物安全柜、CO2培養(yǎng)箱、三聯(lián)抽濾裝置(濾膜 Millipore,0.45μm);美國 Bio-Rad公司的 CHEF MAPPER脈沖場凝膠電泳儀和Gel Doc XR+ 凝膠成像系統(tǒng),法國BioMérieux Vitek公司的DENSIMAT細菌濁度儀。分析軟件為BioNumerics(version 6.0,Applied Maths,Inc)軟件包。

1.4 方法

1.4.1 脈沖場凝膠電泳 方法由中國CDC傳染病預(yù)防控制所呼吸道傳染病室提供。軍團菌用AscI酶切,每樣品用量為20U。H9812用XbaI酶切,每樣品用量為40U。電泳條件:6.8s~54.2s,18h。膠塊經(jīng)染色、脫色后置于 Gel Doc XR+ 凝膠成像系統(tǒng)成像。

1.4.2 聚類分析 PFGE圖像導(dǎo)入BioNumerics(version 6.0,Applied Maths,Inc)軟件包進行處理,選擇Dice相關(guān)系數(shù)和UPGMA方法,tolerance設(shè)置為1.5%。

根據(jù)每兩個圖像之間的相似性系數(shù),構(gòu)建聚類樹。

2 結(jié) 果

2.1 嗜肺軍團菌菌株P(guān)FGE電泳 57株嗜肺軍團菌LP1血清型菌株及15株嗜肺軍團菌LP6血清型菌株用Asc I限制性內(nèi)切酶酶切后進行脈沖場凝膠電泳,部分Lp1型嗜肺軍團菌PFGE酶切指紋圖譜,見圖1。

圖1 LP1型嗜肺軍團菌PFGE酶切電泳圖譜(AscⅠ內(nèi)切酶)M:H9812沙門菌標準株,2-9:軍團菌Fig.1 PFGE profile of serotype I Legionella pneumophilaisolates digested with Asc IM:Salmonellareference strain H9812,lane 2-9 Legionella pneumophilaisolates

2.2 嗜肺軍團菌菌株P(guān)FGE電泳圖譜的聚類分析

2.2.1 57株LP1型嗜肺軍團菌菌株聚類分析 57株LP1型嗜肺軍團菌菌株用AscI酶切電泳后,得到大小從20~1 200kb的電泳片段,不同的菌株條帶數(shù)從6~15不等,按照100%的相似度,57株菌株可分為40個不同的PFGE型別,命名為A0001~A0040。大部分帶型只包含1個菌株數(shù),其它少部分帶型包含菌株數(shù)為2~4株,不同菌株的相似系數(shù)在24.107%~100%之間,見圖2。

圖2 57株LP1型嗜肺軍團菌PFGE聚類分析Fig.2 Cluster analysis for 57strains of serotype I Legionella pneumophila

2.2.2 15株LP6型嗜肺軍團菌PFGE聚類分析對15株LP6型嗜肺軍團菌用AscI酶切電泳后,可得到大小從20~1 300kb的電泳片段。不同的菌株條帶數(shù)從5~15條不等,見圖3。按照100%的相似度,15株菌株可分為12個不同的PFGE型別,命名為B0001~B0012。大部分帶型包含1個菌株數(shù),少部分帶型包含2個菌株數(shù),不同菌株的相似系數(shù)在27.87%~100%之間。

圖3 15株LP6型嗜肺軍團菌PFGE聚類分析Fig.3 Cluster analysis for 15strains of serotype VI Legionella pneumophila

2.3 57株LP1嗜肺軍團菌不同地區(qū)的菌株相似性系數(shù) 從公共場所中央空調(diào)冷卻塔水中分離出的57株LP1型嗜肺軍團菌,分別來自福州市、廈門市、泉州市、漳州市、龍巖市、三明市(1株)、莆田市(1株)。菌株全染色體DNA酶切圖譜采用BioNumerics軟件進行聚類分析,福州、廈門、泉州、漳州和龍巖的菌株數(shù)分別為7、11、10、8、19株;而相似性系數(shù)分別為:79.9%~100%、42.31%~100%、56.23%~100%、36.48% ~95.24%和 22.04%~100%。

3 討 論

近年來,多種分子分型的方法被應(yīng)用于軍團菌的流行病學(xué)調(diào)查研究,如隨機擴增多態(tài)性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)、脈沖 場 凝 膠 電 泳 (pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)、擴增片段長度多態(tài)性(amplified fragment length polymorphism,AFLP)、核酸測序分型(sequence based typing,SBT)等方法的研究均有報道[1-3],但大部分方法沒有標準化,PFGE由于具有高分辨力和高穩(wěn)定性的特點,已被應(yīng)用到對醫(yī)源性軍團菌感染的調(diào)查中[4]。

在PFGE分型試驗中,限制性內(nèi)切酶的選擇十分關(guān)鍵,目前實驗一般采用SfiI或Not I這兩種在軍團菌基因組中酶切位點較少的限制性內(nèi)切酶酶切基因組DNA[1],秦天等以AscⅠ為內(nèi)切酶的PFGE分型方法對所有血清型的嗜肺軍團菌和17個非嗜肺軍團菌血清群進行分型能夠獲得高質(zhì)量的電泳圖譜,并且可以用于嗜肺軍團菌的流行病學(xué)調(diào)查[5],提示AscⅠ應(yīng)成為軍團菌PFGE分型的首選酶。本實驗采用PFGE分型技術(shù),以AscⅠ為內(nèi)切酶對福建省公共場所中央空調(diào)冷卻塔水及冷凝水中分離到的LP1及LP6軍團菌菌株進行分型,按相似性系數(shù)100%分型,結(jié)果顯示57株LP1型嗜肺軍團菌可分為40種不同的PFGE型別;15株LP6菌株可分為12種PFGE型別,大部分菌株間相似性系數(shù)差異較明顯,可見菌株間親緣關(guān)系較遠,屬于多個克隆系,即沒有優(yōu)勢基因型;福建省公共場所中央空調(diào)冷卻塔水及冷凝水中分離到嗜肺軍團菌血清Ⅰ型和 Ⅵ型基因存在多樣性,未形成相對優(yōu)勢的基因型別,基因型別散在分布的外環(huán)境軍團菌株一般不易于引起人群的暴發(fā)流行,可能是目前福建省極少發(fā)現(xiàn)軍團菌病人的原因之一。另外,不同地區(qū)分離的Ⅰ型嗜肺軍團菌既有差異較大的帶型,也存在相同和相似的帶型。在同一時間點從相同場所分離的菌株存在多種型別,表明同一水系中可以多個克隆系的嗜肺軍團菌共存。福州、龍巖、廈門、漳州均有2~4株不等的菌株,其PFGE條帶100%相同,提示它們在遺傳上可能有緊密的相關(guān)性。從表1顯示,同一地區(qū),菌株間相似性系數(shù)從22.04%~100%不等,各菌株間親緣關(guān)系較遠,沒有優(yōu)勢PFGE型菌株。

本研究也發(fā)現(xiàn)同一PFGE型在某個地區(qū)內(nèi)可在不同年份連續(xù)出現(xiàn),如廈門某酒店2008、2009年均出現(xiàn)A24型,龍巖某賓館2008-2010年均出現(xiàn)A27型等,表明在分離菌株的水系中有個特定克隆系的菌株持續(xù)存在,與任宏宇等人的研究結(jié)果相似[6]。而同一PFGE型別也可以在不同地區(qū)的不同時間出現(xiàn),如A11型就分別出現(xiàn)在2008年的福州、2009年的莆田和2010年的龍巖,軍團菌是如何遷徙傳播到較遠地區(qū),傳播方式除了外環(huán)境水系的載體作用,是否還存在軍團菌隱性感染者的中介傳播還需要進一步的研究。

根據(jù)有關(guān)文獻[7]報告,福建省近年公共場所外環(huán)境水中(即中央空調(diào)冷卻塔水)軍團菌的監(jiān)測調(diào)查,2008年福建省5設(shè)區(qū)市均有分離到LP1型或LP6型軍團菌,公共場所中央空調(diào)冷卻塔水受嗜肺軍團菌污染程度比較嚴重,且以LP1型為優(yōu)勢血清型,提示公共場所存在潛在的危害,必須加以關(guān)注。本實驗研究首次采用PFGE分型技術(shù)應(yīng)用于福建省環(huán)境水源分離軍團菌菌株的基因分子分型,為今后在分子水平對環(huán)境軍團菌進行監(jiān)測提供我省基因分型基礎(chǔ)資料,同時為分子流行病學(xué)調(diào)查提供科學(xué)依據(jù)。

[1]劉元力,胡朝暉,朱慶義.軍團菌分子分型及其流行病學(xué)調(diào)查中應(yīng)用[J].微生物學(xué)雜志,2007,27(4):83-86.

[2]Ratcliff RM.Sequence 2based classification scheme for the genus Legionella targeting the MIP gene[J].Journal of Clinical Microbiology,1998,36(6):1560-1567.

[3]楊夢,程慧鍵,熊長輝.嗜肺軍團菌血清1型基因檢測及分子分型研究[J].中國人獸共患病學(xué)報,2010,26(12):1151-1156.

[4]陳敏、陳明亮、王剛毅,等.2007年上海部分嗜肺軍團菌血清Ⅰ型菌株 PFGE 分 型 研 究 [J].環(huán) 境 與 職 業(yè) 醫(yī) 學(xué),2010,27(6):356-359.

[5]秦天,任紅宇,周海健,等.脈沖場凝膠電泳用于軍團菌分型能力的評價[J].疾病監(jiān)測,2011,26(3):182-186.

[6]任紅宇,朱兵清,周海健,等.環(huán)境水系分離嗜肺軍團菌脈沖場凝膠電泳[J].疾病監(jiān)測,2009,24(12):970-973.

[7]原靈,陳愛平,詹鑾峰,等.福建省2008年公共場所中央空調(diào)冷卻塔水軍團菌污染狀況調(diào)查 [J].中國人獸共患病學(xué)報,2010,26(11):1080-1081.

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