孫麗娜, 芮昌輝, 袁會(huì)珠
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所,農(nóng)業(yè)部作物有害生物綜合治理綜合性重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100193)
魚尼丁受體(RyR)是目前所知最大的鈣離子通道,由4個(gè)相同的亞基組成,每個(gè)亞基的分子量約為560ku。在脊椎動(dòng)物中存在3種亞型RyRs,而在昆蟲中僅存在一種魚尼丁受體[1]。二酰胺類化合物氟蟲雙酰胺和氯蟲苯甲酰胺對(duì)鱗翅目害蟲具有較高的活性,其作用機(jī)制與其他類殺蟲劑不同,它們可以結(jié)合昆蟲體內(nèi)的魚尼丁受體,抑制昆蟲取食,引起蟲體收縮,使蟲體變粗變短,最終導(dǎo)致死亡[2-3]。自兩個(gè)化合物創(chuàng)制成功以來,不僅作用于魚尼丁受體化合物的合成備受關(guān)注,昆蟲魚尼丁受體的基因克隆及分子特性也因此成為焦點(diǎn)[4-5]。
小菜蛾[Plutella xylostella(L.)]是一種為害十字花科植物的世界性害蟲,也是對(duì)農(nóng)藥產(chǎn)生抗性的最嚴(yán)重害蟲之一。據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),小菜蛾已經(jīng)對(duì)70多種殺蟲劑產(chǎn)生了抗藥性,包括有機(jī)氯、有機(jī)磷、氨基甲酸酯、擬除蟲菊酯類,以及昆蟲生長調(diào)節(jié)劑和蘇云金桿菌(Bt)等殺蟲劑[6]。盡管二酰胺類化合物對(duì)小菜蛾具有較高的活性,但是有研究稱小菜蛾對(duì)其抗性產(chǎn)生較快。田間監(jiān)測(cè)表明,在我國華南地區(qū)田間小菜蛾對(duì)氯蟲苯甲酰胺的抗性與室內(nèi)敏感小菜蛾相比已達(dá)到100多倍[7];而在泰國,2008年至2011年間,小菜蛾對(duì)氟蟲酰胺的抗性從1.5倍增至4 817倍,對(duì)氯蟲苯甲酰胺的抗性從35.4倍增至152倍[8]。因此克隆小菜蛾魚尼丁受體基因可以為今后小菜蛾抗性機(jī)制研究提供一定的理論基礎(chǔ)。
小菜蛾于室內(nèi)采用無藥劑接觸甘藍(lán)苗連續(xù)飼養(yǎng)的技術(shù)飼養(yǎng)[9]。
取3齡小菜蛾幼蟲,用液氮研磨后,參照Trizol(Invitrogen)試劑說明書步驟提取總RNA。以反轉(zhuǎn)錄酶(PrimeScript?1st Strand cDNA Synthesis Kit,TaKaRa,大連,中國)合成cDNA第一鏈;利用TaKaRa 3′和5′RACE 試劑盒合成3′和5′RACE cDNA第一鏈。
如圖1所示,小菜蛾RyR序列可以由18個(gè)片段重疊組合得到。本試驗(yàn)引物設(shè)計(jì)根據(jù)美國國家生物工程信息中心(NCBI)數(shù)據(jù)庫中家蠶B.m.(Bombyx mori)、煙芽夜蛾 H.v.(Heliothis virescens)、黑腹果蠅D.m.(Drosophila melanogaster)、桃蚜 M.p.(Myzus persicae)、棉蚜A.g.(Aphis gossypii)、玉米飛虱P.m.(Peregrinus maidis)、埃及伊蚊A.a(Aedes aegypti)這個(gè)7個(gè)物種魚尼丁受體基因氨基酸中保守序列來設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物。根據(jù)簡(jiǎn)并引物的PCR測(cè)序結(jié)果,設(shè)計(jì)特異性引物,引物見表1。所有引物的合成由北京六合華大基因科技有限公司完成。
圖1 PCR擴(kuò)增和克隆小菜蛾魚尼丁受體(Px-RyR)cDNA片段示意圖
表1 克隆小菜蛾魚尼丁受體基因的引物1)
片段S1~S19的擴(kuò)增,按照TaKaRa Ex Taq試劑盒說明進(jìn)行,按照不同的引物及擴(kuò)增片段的長度設(shè)置不同的PCR反應(yīng)程序。
cDNA 3′末端快速擴(kuò)增(3′RACE),outer PCR和inner PCR的反應(yīng)條件均為:94℃3min;94℃30s,65℃→50℃(-0.5℃/循環(huán))30s,72℃1min,30個(gè)循環(huán);94℃30s,50℃30s,72℃1min,15個(gè)循環(huán),72℃10min。
cDNA 5′末端快速擴(kuò)增(5′RACE),outer PCR反應(yīng)條件為:94℃3min;94℃30s,55℃30s,72℃1min,25個(gè)循環(huán);72℃10min。Inner PCR反應(yīng)條件為:94℃3min;94℃30s,68℃1min,30個(gè)循環(huán);72℃10min。
將目的片段克隆于pMD?19-T Simple Vector載體內(nèi),選取陽性克隆測(cè)序。序列測(cè)定由北京六合華大基因科技股份有限公司完成。
利用DNAstar和Mega5.0等軟件進(jìn)行序列分析和比較。利用美國國家生物工程信息中心(NCBI,http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)的BLAST網(wǎng)絡(luò)工具與GenBank中的其他物種序列進(jìn)行比較,確定目標(biāo)產(chǎn)物的真實(shí)可靠性。分子量和等電點(diǎn)(molecular weight/isoelectric point)MW/pI在ExPaSy website(http:∥us.expasy.org/tools/pitool.htm)預(yù)測(cè)計(jì)算??缒^(qū)域預(yù)測(cè)可以于www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM 進(jìn)行分析,蛋白質(zhì)二級(jí) 結(jié) 構(gòu) 于 http:∥www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi和http:∥www.expasy.org/tools/scanprosite/分析。
根據(jù)NCBI中昆蟲魚尼丁受體基因序列設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并引物,通過RT-PCR擴(kuò)增得到了目標(biāo)片段,而后根據(jù)目的片段序列,再設(shè)計(jì)特異性引物,繼續(xù)進(jìn)行RT-PCR擴(kuò)增。進(jìn)一步進(jìn)行5′RACE和3′RACE擴(kuò)增,得到兩端序列后,通過小菜蛾所有片段的序列拼接得到小菜蛾魚尼丁受體基因cDNA序列全長。小菜蛾魚尼丁受體基因全長為15 748bp,其中5′端非閱讀區(qū)267bp,3′端非閱讀區(qū)109bp,開放閱讀區(qū)15 372bp。開放閱讀區(qū)編碼5 123個(gè)氨基酸殘基(GenBank登錄號(hào)為JF927788),預(yù)測(cè)其分子量約為579.39ku,等電點(diǎn)為5.45。
對(duì)預(yù)測(cè)的Px-RyR氨基酸序列與其他物種RyR基因氨基酸序列進(jìn)行多重比對(duì),結(jié)果表明Px-RyR與其他物種RyR存在很高的同源性如表2。與煙芽夜蛾(H.v.)、家蠶(B.m.)、桃蚜(M.p.)、棉蚜(A.g.)、玉米飛虱(P.m.)、果蠅(D.m.)、鼠(M.m.)骨骼肌RyR1、鼠心肌RyR2及鼠RyR3的相似性分別為92%、92%,77%、77%、80%、78%、45%、47%、46%。
表2 Px-RyR與其他物種RyRs序列相似性 %
通過MEGA 5.0利用鄰接法對(duì)22個(gè)物種RyR蛋白質(zhì)進(jìn)行進(jìn)化樹分析(Bootsrap為1 000個(gè)重復(fù)),從而通過RyR氨基酸多態(tài)性來揭示這些物種間RyR蛋白質(zhì)的進(jìn)化關(guān)系。由圖2看出,22個(gè)物種間的RyR基本分兩大類,即脊椎動(dòng)物中一類,無脊椎動(dòng)物中一類。圖2可以明顯看出,小菜蛾RyR與煙芽夜蛾和家蠶RyR關(guān)系最近。
圖2 Px-RyR與其他21個(gè)物種間RyR蛋白質(zhì)進(jìn)化樹分析
根據(jù)氨基酸二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)小菜蛾魚尼丁受體基因存在6個(gè)跨膜區(qū)域,位于第4 474~5 022氨基酸之間。這6個(gè)氨基酸序列分別為(如表3):Phe4474-Leu4496;Asp4655-Tyr4676;Val4734-Leu4756;Phe4875-Ala4897;Leu4923-Phe4945;Ile5003-Ile5022。除了跨膜區(qū)域外,小菜蛾魚尼丁受體蛋白還存在其他結(jié)構(gòu)域。如RyR結(jié)構(gòu)域(重復(fù)序列)、細(xì)胞內(nèi)鈣離子釋放通道結(jié)構(gòu)域、鈣離子結(jié)合的EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域、MIR結(jié)構(gòu)域(因該結(jié)構(gòu)域同時(shí)存在于甘露糖轉(zhuǎn)移酶、三磷酸肌醇受體和魚尼丁受體中而命名)、Spla/RYanodine receptor SPRY結(jié)構(gòu)域、離子通道結(jié)構(gòu)域、魚尼丁受體和三磷酸肌醇受體相似結(jié)構(gòu)域、似SPRY結(jié)構(gòu)域及一些未命名的結(jié)構(gòu)域[10]。
表3 小菜蛾RyR跨膜區(qū)域序列
魚尼丁受體是最大的鈣離子釋放通道之一,在肌肉興奮收縮偶聯(lián)中具有重要作用,在很多細(xì)胞中具有第二信使的作用。魚尼丁受體因其所具有的特性,近30年來在醫(yī)學(xué)界備受關(guān)注,而近10年來在殺蟲劑研究領(lǐng)域也深受廣大研究者關(guān)注[1]。因此克隆昆蟲魚尼丁受體基因?qū)ψ饔糜隰~尼丁受體新化合物的設(shè)計(jì)及害蟲抗藥性研究至關(guān)重要。在本研究中,筆者克隆了小菜蛾魚尼丁受體。但其具有較大分子量,不易表達(dá)。
Puente等[11]克隆了編碼煙芽夜蛾RyR C-末端1 172個(gè)氨基酸,通過比對(duì)發(fā)現(xiàn)其與哺乳動(dòng)物3種亞型的RyRs具有45%~47%的同源性,與桃蚜(M.p.)、棉蚜(A.g.)、玉米飛虱(P.m.)、果蠅(D.m.)的同源性分別為76.8%、77.5%、79.6%、78.2%。而本文中小菜蛾RyR基因與其他物種同源性關(guān)系分析表明,小菜蛾RyR與煙芽夜蛾RyR和蠶相似性高達(dá)92%,這與3種昆蟲同屬鱗翅目有關(guān)。
根據(jù)預(yù)測(cè)的氨基酸二級(jí)結(jié)構(gòu)分析,小菜蛾魚尼丁受體基因C端存在6個(gè)跨膜區(qū)域,這也是魚尼丁受體基因的特性之一。有研究認(rèn)為魚尼丁受體基因存在6~8個(gè)跨膜區(qū)域,也有研究認(rèn)為存在4~12個(gè)跨膜區(qū)域[12-14],然而魚尼丁受體基因跨膜區(qū)域的特定結(jié)構(gòu)尚未明確。Puente等[11]研究表明煙芽夜蛾C-末端存在5個(gè)較高的疏水性區(qū)域,這5個(gè)區(qū)域在氨基酸序列的位置為:516~532(M′)、704~720(M1)、782~798(M2)、972~988(M3)和1 054~1 070(M4),即為5個(gè)跨膜區(qū)域。煙芽夜蛾RyR與小菜蛾RyR跨膜區(qū)域的不同,可能是由于計(jì)算方式不同引起的。小菜蛾RyR基因6個(gè)跨膜區(qū)的親水性指數(shù)為1.5~2.6,然而TM4的親水性指數(shù)僅0.6,這與Zorzato等[14]推測(cè)的12個(gè)跨膜區(qū)域的親水性指數(shù)在0.8~2.9之間基本一致。
Puente等[11]研究還表明在煙芽夜蛾RyR跨膜區(qū)M3和M4之間存在一個(gè)鈣離子釋放通道的成孔結(jié)構(gòu)域GVRAGGGIGD,同樣的結(jié)構(gòu)域也存在于小菜蛾RyR基因C-末端的TM5和TM6之間。然而在兔心肌RyR中也存在這個(gè)結(jié)構(gòu),但是GXRXGGG-XGD第8個(gè)氨基酸殘基I在兔心肌RyR中為第4897個(gè)氨基酸 T[15]。
此外,一個(gè)重復(fù)序列出現(xiàn)4次不僅體現(xiàn)在小菜蛾魚尼丁受體基因中,也存在于脊椎動(dòng)物的骨骼肌和心肌魚尼丁受體中[14-15]。第一個(gè)重復(fù)區(qū)域有94個(gè)殘基,位于859~952氨基酸之間;第二和第三個(gè)重復(fù)區(qū)域均有95個(gè)氨基酸殘基,位于972~1 066和2 838~2 932氨基酸之間;第四個(gè)重復(fù)區(qū)域有89個(gè)氨基酸,位于2 964~3 052氨基酸之間。比對(duì)重復(fù)序列(如圖3),根據(jù)二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),小菜蛾魚尼丁受體基因的重復(fù)序列是α-α型,而在RyR1和RyR2的重復(fù)序列呈現(xiàn)的是β-α-β-α型。在小菜蛾魚尼丁受體基因中4個(gè)重復(fù)序列的相似性有33%,在哺乳動(dòng)物RyR1和RyR2中重復(fù)序列的相似性為28%,然而這一區(qū)域的功能尚未得到驗(yàn)證。
微摩爾濃度的細(xì)胞質(zhì)Ca2+可以激活RyRs,毫摩爾的Ca2+可以抑制RyRs。這些雙向作用可能是由不同親和性的Ca2+結(jié)合位點(diǎn)的相互作用引起。在鱗翅目昆蟲的RyRs中存在PPPEPTEEE氨基酸束,而在兔RyR1這也存在一個(gè)脯氨酸和谷氨酸豐富的氨基酸束PEPEPEPEPEPE(4 488~4 499)[16]。45Ca2+的平衡結(jié)合試驗(yàn)表明龍蝦 RyR與哺乳動(dòng)物RyR1和RyR2的相應(yīng)此結(jié)構(gòu)域包含了Ca2+鈍化RyR的結(jié)合位點(diǎn)即位于EF-h(huán)and結(jié)構(gòu)域鈣離子結(jié)合位點(diǎn)[17]。
圖3 重復(fù)序列比對(duì)結(jié)果圖
ATP與RyR1存在3個(gè)可能的結(jié)合位點(diǎn),結(jié)合位點(diǎn)的氨基酸序列為GXGXXG[18]。在煙芽夜蛾的RyR中3個(gè)位點(diǎn)分別為GVGLEG、GEGGEG、GSGESG。而小菜蛾中僅有1個(gè)相似位點(diǎn)位于RyR的4 005~4 010(GVGLEG)。此外與煙芽夜蛾其余兩個(gè)位點(diǎn)的位置,小菜蛾的氨基酸序列分別為4 683~4 688(AEPGEG),4 710~4 715(GSGEE-)。在后兩個(gè)位點(diǎn)區(qū)域出現(xiàn)了一個(gè)突變位點(diǎn),一個(gè)缺失位點(diǎn),可能是由于物種間的差異造成,或者是ATP與小菜蛾RyR就存在一個(gè)結(jié)合位點(diǎn)。
另一個(gè)對(duì)哺乳動(dòng)物RyRs具有重要調(diào)節(jié)作用的是具有雙向功能的鈣調(diào)蛋白。脫鈣鈣調(diào)蛋白(Ca2+游離鈣調(diào)蛋白)激活的同時(shí),鈣調(diào)蛋白(Ca2+結(jié)合鈣調(diào)蛋白)抑制RyR鈣離子通道[19]。根據(jù)有關(guān)研究推斷4124HS RLWDAVGGFLFLFSHMQDKLSKH4148可能是鈣調(diào)蛋白與RyR的結(jié)合位點(diǎn)[11]。
Ulich等[20]認(rèn)為氟蟲雙酰胺與RyR的結(jié)合不受魚尼丁的影響,Kenta等[21]研究表明,氟蟲雙酰胺與鱗翅目昆蟲RyR的結(jié)合位點(diǎn)在C-末端4 111~5 084氨基酸之間,因此推測(cè)氟蟲雙酰胺與RyR的結(jié)合位點(diǎn)不同于魚尼丁的結(jié)合位點(diǎn)??梢姡嘘P(guān)二酰胺類殺蟲劑的作用位點(diǎn)仍需進(jìn)一步研究。因此小菜蛾魚尼丁受體基因的克隆為此提供了有利的研究基礎(chǔ),也為今后小菜蛾對(duì)二酰胺類化合物產(chǎn)生的抗性研究提供理論支持。
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