嚴(yán)石林,沈宏春,2,王浩中,魯法庭,于宏波,陳 為,陶 怡
(1.成都中醫(yī)藥大學(xué),四川成都 610075;2.瀘州醫(yī)學(xué)院,四川瀘州 646000;3.云南中醫(yī)學(xué)院,云南昆明 650500)
病例資料來源于成都中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院、瀘州醫(yī)學(xué)院附屬中醫(yī)院。從2009年3月至2010年7月期間符合診斷標(biāo)準(zhǔn)及納入標(biāo)準(zhǔn)者,共收集慢性腎炎、糖尿病腎病、陽痿病3個病種典型腎陽虛證患者9例,分別抽取血樣標(biāo)本。
抽取實驗者空腹靜脈血10mL,裂解紅細胞,分離獲得白細胞,Trizol法提取總RNA。將總RNA進行IVT體外擴增,采用cy-3標(biāo)記擴增后的cDNA,單標(biāo)法與agilent4*44k人類全表達譜芯片進行雜交,洗脫、干燥、數(shù)據(jù)提取、歸一化處理。
1.2.1 分組
共分為4組,分別為慢性腎炎、糖尿病腎病、陽痿病3個實驗組共9例,健康對照組共3例。
使用SAM軟件進行統(tǒng)計分析。
數(shù)據(jù)全部錄入SAS系統(tǒng),數(shù)據(jù)采用DiffGene方法,分別將慢性腎炎腎陽虛組與正常組比較得到1435條差異表達基因,將糖尿病腎病腎陽虛組與正常組比較得到2306條差異表達基因,將陽痿腎陽虛組與正常組比較得到2060條差異表達基因。為了找到3種不同疾病腎陽虛組在腎陽虛證方面的共同生物學(xué)特征,我們把3組數(shù)據(jù)錄入EXCEL工作表,采用高級篩選功能進行兩兩篩選,最后找出332條共同差異表達基因,其中有注釋的基因為181條。
采用Pathway分析,發(fā)現(xiàn)3組間差異表達顯著的信號通路有37條。分別是腎細胞癌,氨酰-tRNA生物合成,Notch信號通路,纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸的生物合成,在癌細胞中協(xié)調(diào)促進啟動轉(zhuǎn)錄的核染質(zhì)重塑的復(fù)合物與共激動劑的活性,Pitx2基因轉(zhuǎn)錄的多步校正,MEF2D在T細胞凋亡的作用,胰島素信號通路,神經(jīng)營養(yǎng)蛋白信號通路,丙酮酸代謝,賴氨酸降解,阻止肉毒菌毒素引起的神經(jīng)遞質(zhì)釋放,非小細胞肺癌,前列腺癌,ps1簇淀粉樣的b-縮氨酸,mTOR(哺乳動物雷帕霉素靶蛋白)信號通路,半胱氨酸和蛋氨酸代謝,丙酸代謝,腫瘤通路,基本轉(zhuǎn)錄因子,代謝途徑,心血管系統(tǒng)中低氧可誘導(dǎo)因子,TGF-β信號通路,Wnt信號通路,g-分泌素介導(dǎo)的ErbB4信號通路,阿爾茨海默病,PPAR信號通路,黑色素細胞及色素沉著通路,Pelp1雌激素受體活性調(diào)節(jié),精子生成的肌酸酐調(diào)控,新型冠狀病毒的生命周期,磷脂酰肌醇信號系統(tǒng),DREAM轉(zhuǎn)錄調(diào)控鎮(zhèn)痛,PPAR-gamma復(fù)合激動劑在肥胖和產(chǎn)熱過程中的作用,SODD/TNFR1信號通路,CARM1甲基轉(zhuǎn)移酶基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控,甘油磷酸酯代謝。
通過篩選功能,我們還得到每組樣本所特有的差異表達基因。從這些差異表達基因中,找尋出同為腎陽虛證這一生物學(xué)意義下的不同點。數(shù)據(jù)處理示意圖見圖1。
圖1 數(shù)據(jù)篩選示意圖
3組病例都包含腎陽虛證,經(jīng)統(tǒng)計處理后找出了腎陽虛證的共同差異表達基因。但是,3組樣本來至不同疾病,所以存在不同的生物學(xué)意義。通過對各病所特有的基因進行分析后,除發(fā)現(xiàn)大部分基因與本身的疾病有關(guān)外,卻又驚奇發(fā)現(xiàn)有一小部分基因參與了共同差異表達基因里面的3條信號通路,具體結(jié)果如下:
3.2.1 mTOR(哺乳動物雷帕霉素靶蛋白)信號通路
是一種非典型絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶,可整合細胞外信號,磷酸化下游靶蛋白核糖體p70S6激酶,如S6K1及4E-BP1,影響基因轉(zhuǎn)錄與蛋白質(zhì)翻譯,從而參與調(diào)控細胞生長、增殖等過程。該通路與糖尿病腎病的發(fā)生密切相關(guān),研究發(fā)現(xiàn)TSC-mTOR通路之一,即PI3K-Akt-TSCI/2-mTOR信號通路可能參與系膜肥大增殖。如PI3K-Akt-TSCI/2-mTOR在生長停滯特異性基因6(Growtharrest.specificgene6)誘導(dǎo)系膜和腎小球肥大過程中起重要作用,雷帕霉素可阻斷PI3K-Akt-TSCI/2-mTOR通路活化和系膜肥大[1]。Komers等報告,PI3K-Akt-TSCI/2-mTOR路還可通過調(diào)節(jié)mTOR主要的下游分子p70S6K和elF-4E的表達,引起DN的腎臟肥大[2]。我們的實驗結(jié)果表明,在3組腎陽虛的共同特征是PDK1調(diào)控PI3KAkt-TSCI/2-mTOR通路,通過PP2A調(diào)控磷酸化下游靶蛋白核糖體p70S6激酶,如S6K1及4EBP1。糖尿病腎病組在該通路中還存在差異基因FKBP12,直接通過雷帕霉素調(diào)控mTOR信號通路(見圖2)。也就是說在糖尿病腎病腎陽虛證在mTOR信號通路上與健康組有3個位點存在差異表達,而在3組腎陽虛證共有的特征中僅有2個位點有差異,這就決定了在治療上有所不同。
3.2.2 Notch信號通路
廣泛存在于多種動物體內(nèi),在進化過程中高度保守,主要介導(dǎo)細胞的分化抑制信號,在胚胎發(fā)育、血細胞發(fā)育、腫瘤形成等生理病理過程中起重要作用。
3組病例在notch信號通路中共同的差異表達基因有:MAML1(mastermind-like1)、EP300(E1Abindingproteinp300),見圖3。
MAML1:有證據(jù)表明人類在體外homolog形成一個復(fù)雜的人類細胞內(nèi)的部分缺口受體和可以增加表達Notch-induced基因。此證據(jù)支持這個提議的功能相當(dāng)于一個co-activator切口轉(zhuǎn)錄在信號傳導(dǎo)途徑。有證據(jù)表明它是該通路的一個催化劑。
EP300(E1Abindingproteinp300)它的功能是通過組蛋白乙酰轉(zhuǎn)移酶調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄核染質(zhì)的再塑造和重要過程中細胞的增生和分化??梢哉{(diào)節(jié)cAMP-gene結(jié)合具體的調(diào)節(jié)蛋白磷酸化CREB。這個基因也被認定為缺氧因子1a的催化劑復(fù)合物,因此就在如血管內(nèi)皮生長因子等缺氧誘導(dǎo)基因中扮演了一個重要角色。
上述表明,腎陽虛證在notch信號通路中通過在基因MAML1、EP300表達下調(diào),降低了對細胞增殖和分化的催化作用,使與該通路相關(guān)的胚胎發(fā)育、血細胞發(fā)育降低,骨髓細胞生成減少。這種作用與中醫(yī)描述的腎藏精、主骨生髓的生理功能非常相似。腎藏先天之精,靠后天滋養(yǎng),人體的生長發(fā)育與之密切相關(guān);腎主骨,骨生髓、髓能生血;當(dāng)人體出現(xiàn)在腎陽虛的病理狀態(tài)下時,就可能導(dǎo)致小兒生長發(fā)育遲緩,髓不能生血出現(xiàn)血液虧虛,腎的這一生物學(xué)機制可能與notch信號通路調(diào)控有關(guān)。
然而在陽痿腎陽虛組中我們發(fā)現(xiàn)在Notch通路中還存在CIR1(corepressor interacting with RBPJ1)和DVL3表達有差異,二者均是起負反饋作用。所以對陽痿腎陽虛證的治療不同于其他疾病腎陽虛證的治療,可能是在于對CIR1和DVL3基因表達的調(diào)節(jié)上。
3.2.3 Wnt信號通路
Wnt是一類分泌型糖蛋白,通過自分泌或旁分泌發(fā)揮作用。Wnt信號途徑能引起胞內(nèi)β-連鎖蛋白 (β-catenin)積累。β-catenin是一種多功能的蛋白質(zhì),在細胞連接處它與鈣黏素相互作用,參與形成黏合帶。而游離的β-catenin可進入細胞核,調(diào)節(jié)基因表達。正常機體腎臟中Wnt信號是“沉默”的,胞質(zhì)中僅有少量游離態(tài)的β-catenin,體內(nèi)絕大多數(shù)β-catenin在胞膜處與E-cadherin形成復(fù)合體,對維持同型細胞的黏附、防止細胞的遷移發(fā)揮作用。Surendran等[3]利用單側(cè)輸尿管結(jié)扎方法造成大鼠腎小管間質(zhì)性腎纖維化模型,發(fā)現(xiàn)wnt4在集合管中有表達伴隨集合管周圍纖維化形成,間質(zhì)成纖維細胞wnt4高水平表達與I型膠原mRNA及a-sMA的高表達一致;體外實驗表明Wnt4可以誘導(dǎo)培養(yǎng)的成纖維細胞β-catenin進入細胞核內(nèi)。提示W(wǎng)nt信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路可能在腎臟纖維化中發(fā)揮著重要作用。慢性腎炎腎陽虛證組與腎陽虛證共同特征的差異在于,前者通過CAMK2G還參與了Wnt蛋白介導(dǎo)的Wnt5/Ca2+通路 (如圖4)。CAMK2G是屬于絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族4種亞基之一,在Ca2+通路中發(fā)揮關(guān)鍵作用。
圖4 Wnt信號通路示意圖
本次研究通過基因篩選,發(fā)現(xiàn)慢性腎炎、糖尿病腎病、陽痿等3種疾病的腎陽虛證除各有不同的差異表達基因外,還有共同的差異表達基因332條,其中有注釋的基因為181條。并通過轉(zhuǎn)錄組特征分析,發(fā)現(xiàn)與腎陽虛證相關(guān)的共同信號通路37個。說明不同疾病除具備各自特征的信號通路調(diào)控基因外,還具有共同的信號通路調(diào)控,為中醫(yī)“異病同證”、“異病同治”的經(jīng)典論述從分子生物學(xué)的角度找到理論依據(jù)。
本次研究從每組樣本特有的差異表達基因中發(fā)現(xiàn)有mTOR、notch、Wnt等3條信號通路與腎陽虛證共有的信號通路一致,只是在通路的調(diào)控上有基因表達差異。
其中糖尿病腎病腎陽虛組在mTOR信號通路中存在差異基因FKBP12,直接通過雷帕霉素調(diào)控該信號通路;陽痿腎陽虛組中發(fā)現(xiàn)在Notch通路中存在CIR1(corepressor interacting with RBPJ1)和DVL3表達有差異;慢性腎炎腎陽虛組通過CAMK2G的差異表達調(diào)控Wnt信號通路。以上說明,3種不同疾病,同有腎陽虛證,雖然有共同的信號通路,即反應(yīng)于外的大證相同,但因受不同疾病的影響,同一信號通路的調(diào)控基因有所差異,其細證的表現(xiàn)和病機也有所差異,這些表達差異基因有可能決定了治療上的差異。這一研究結(jié)果,為我們提出“同證異治”的創(chuàng)新治法觀點提供了分子生物學(xué)依據(jù)。由此可以認為,中醫(yī)在辨證論治的時候,應(yīng)高度重視疾病對證候的影響,必須“從病辨證”。不僅要嚴(yán)格遵循“異病同證”, “同證同治”的傳統(tǒng)經(jīng)典論述。還要重視疾病對證候的影響,參照“異病同證”,“同證異治”這一對傳統(tǒng)治法的補充和完善的創(chuàng)新理念,才能提高辨證論治的水平。
[1] NagaiK,MatsubaraT,MimaA,eta1.Gas6 induces Akt/mTOR-mediated mesangial hypertrophy in diabetic nephropathy[J].KidneyInt,2005,68(2):552-561.
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