国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

SIESTA程序在物理化學(xué)教學(xué)中的應(yīng)用

2013-02-13 09:25方亞輝李會英鄭丹袁聯(lián)群
大學(xué)化學(xué) 2013年2期
關(guān)鍵詞:微觀活化原子

方亞輝 李會英 鄭丹 袁聯(lián)群

(上海應(yīng)用技術(shù)學(xué)院化學(xué)與環(huán)境工程學(xué)院 上海201418)

分子反應(yīng)動力學(xué)和表面化學(xué)問題是化學(xué)動力學(xué)中的兩個前沿領(lǐng)域,都是從分子水平上研究基元反應(yīng)的速率,使人們對化學(xué)反應(yīng)過程有比較細(xì)致的了解。這類研究對深入理解化學(xué)反應(yīng)的微觀機(jī)理,進(jìn)而更好地控制化學(xué)反應(yīng)和化學(xué)途徑,可起重要的作用。在物理化學(xué)課程相應(yīng)章節(jié)的學(xué)習(xí)過程中涉及到的微觀結(jié)構(gòu)和基礎(chǔ)概念(如表面結(jié)構(gòu)、活化能、過渡態(tài)理論及構(gòu)型及基元反應(yīng)速率等)需要學(xué)生有很強(qiáng)的想象力,但由于學(xué)生在初學(xué)時缺乏對化學(xué)反應(yīng)在分子水平上的認(rèn)識,難于理解微觀上的動力學(xué)知識。隨著計算技術(shù)的發(fā)展,我們能從分子水平模擬化學(xué)反應(yīng),研究微觀動力學(xué),并可將相應(yīng)的計算結(jié)果引入到物理化學(xué)教學(xué)中,加深學(xué)生對微觀反應(yīng)動力學(xué)的理解。

SIESTA(Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousands of Atoms)是常用于分子和固體的電子計算和分子動力學(xué)模擬程序,可以研究體系的能量和結(jié)構(gòu)、反應(yīng)路徑、電偶極矩、原子、軌道和鍵分析等[1-3]。該程序可以在一般的工作站模擬幾百個原子的體系,深受化學(xué)工作者的青睞。我們在物理化學(xué)課程教學(xué)中應(yīng)用了SIESTA軟件,使教學(xué)內(nèi)容從抽象到直觀,從復(fù)雜到簡單,對學(xué)生從微觀水平理解化學(xué)反應(yīng)很有幫助。下面結(jié)合物理化學(xué)分子反應(yīng)動力學(xué)和表面化學(xué)課程的教學(xué),介紹SIESTA軟件在輔助教學(xué)方面的應(yīng)用。重點(diǎn)介紹O2在Pt金屬表面的吸附解離過程,該過程結(jié)合了分子動力學(xué)和表面化學(xué)微觀知識,能夠使學(xué)生更好地了解微觀化學(xué)反應(yīng)和表面化學(xué)。

1 O2在常見催化劑Pt表面吸附過程的模擬

O2在Pt表面上的吸附還原是現(xiàn)代催化化學(xué)燃料電池陰極常見的化學(xué)反應(yīng),也是在實(shí)際工作中經(jīng)常會碰到的一類反應(yīng)。微觀上,一塊理想的Pt固體原子排布具有完整的三維周期性,而表面則是這種三維周期性在某一方向上的中斷。因此,理想表面的原子具有完整的二維周期。我們使用這類理想表面來模擬金屬Pt的平臺面(圖1(a))。對于Pt表面的不同位置,標(biāo)記為頂位(top)、橋位(bridge)等。當(dāng)這類金屬表面置于O2氛圍中時,O2會吸附于該金屬表面,并且發(fā)生解離生成O原子。

在模擬過程中,我們首先研究了O2在Pt金屬表面的不同吸附位置,分別計算了O2吸附于單個Pt原子的頂位(圖1(b)),兩個O分別吸附于表面兩個Pt原子的頂位(圖1(c))以及O2中的一個O吸附于橋位而另一個O吸附于頂位(圖1(d))的情況,詳細(xì)的計算結(jié)果列于表1。從表1可以看出,O2在Pt表面不同位置吸附的能量不盡相同,即在分子水平上,O2對于同一表面的不同位置的選擇性不同。從計算結(jié)果可知,O2吸附于橋位-頂位時吸附能最大,即該位置為O2最佳吸附位點(diǎn)。在該吸附位置時,頂位Pt—O之間鍵長為2.05?,O—O之間的鍵長為1.39?。O2另外一個穩(wěn)定吸附位置為O—O鍵分別吸附于Pt原子的頂部,吸附能為0.72eV。而O2以一個O與表面Pt原子吸附的結(jié)構(gòu)最不穩(wěn)定。

圖1 表面及O2吸附結(jié)構(gòu)

表1 O2在不同位置時的吸附能及鍵長

2 O2在常見催化劑Pt表面解離過程的模擬

對于O2解離的化學(xué)反應(yīng)(O2→O+O),在反應(yīng)過程中發(fā)生了共價鍵的斷裂。在此情況下,體系的能量隨著O—O之間的距離而發(fā)生變化。在此變化過程中,O2先活化為處于過渡態(tài)的活化絡(luò)合物(TS),然后再分解為兩個O原子。我們可使用SIESTA程序計算出該活化絡(luò)合物和反應(yīng)勢壘,并畫出該反應(yīng)的勢能面,這樣就可以更加直觀地理解勢能面和活化絡(luò)合物。圖2顯示了O2解離的活化絡(luò)合物結(jié)構(gòu),過渡態(tài)O2解離為吸附在橋位的O和頂位的O,此時兩個O之間的距離為2.05?,經(jīng)過該活化過程后,O2進(jìn)一步解離為吸附在表面的O原子。

圖2 O2在Pt表面吸附解離的自由能圖

我們可以計算出O2在發(fā)生解離過程的勢能面隨著O—O鍵長的變化。如圖2所示,以Pt金屬表面和氣相O原子作為該過程的起點(diǎn),隨著O2在表面的吸附,整個系統(tǒng)的能量降低。然后吸附在表面的O2發(fā)生解離,系統(tǒng)能量逐漸升高?;罨j(luò)合物所需要的能量就是整個反應(yīng)過程的能壘(0.25eV),系統(tǒng)越過該活化絡(luò)合物后,便解離生成兩個O原子,系統(tǒng)達(dá)到最穩(wěn)定狀態(tài)。

3 結(jié)束語

在物理化學(xué)教學(xué)中充分利用計算機(jī)化學(xué)的最新成果,可使學(xué)生更加深入地了解化學(xué)反應(yīng)的基本原理,提高對化學(xué)反應(yīng)的認(rèn)識;對培養(yǎng)學(xué)生的興趣有重要意義。通過對O2在Pt金屬表面吸附解離過程的研究,學(xué)生可以從直觀上了解表面的原子構(gòu)型,以及分子在表面的吸附解離過程,從而更好地理解勢能面和過渡態(tài)理論。

[1]Soler J M,Artacho E,Gale J D,et al.J Phys Condes Matter,2002,14(11):2745

[2]Andreoni W,Curioni A.Parallel Computing,2000,26(7-8):819

[3]Fattebert J L,Gygi F.J Comput Chem,2002,23(6):662

[4]Tian N,Zhou Z Y,Sun S G,et al.Science,2007,316(5825):732

[5]Zhang J,Sasaki K,Sutter E,et al.Science,2007,315(5809):220

[6]Stamenkovic V R,Mun B S,Mayrhofer K J J,et al.J Am Chem Soc,2006,128(27):8813

[7]Lim B,Jiang M J,Camargo P H C,et al.Science,2009,324(5932):1302

猜你喜歡
微觀活化原子
無Sn-Pd活化法制備PANI/Cu導(dǎo)電織物
原子究竟有多小?
原子可以結(jié)合嗎?
帶你認(rèn)識原子
生姜對亞硝胺合成及體內(nèi)代謝活化的抑制作用
小學(xué)生活化寫作教學(xué)思考
一種新的結(jié)合面微觀接觸模型
微觀的山水
微觀中國
微觀中國