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實(shí)時(shí)熒光定量法檢測(cè)晚期NSCLC惡性胸腔積液及血液腫瘤細(xì)胞EGFR基因突變的研究

2013-05-23 04:01:12
山東醫(yī)藥 2013年1期
關(guān)鍵詞:外顯子基因突變胸腔

(江西省腫瘤醫(yī)院,南昌330029)

吉非替尼和厄洛替尼是目前已批準(zhǔn)用于一線治療非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)的酪氨酸激酶抑制劑(TKI)靶向藥物,但這兩種藥物均依賴于患者表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)突變的存在與否,ASCO于2011年4月11日發(fā)布臨時(shí)性臨床指導(dǎo)意見,要求患者在使用TKI藥物前需進(jìn)行EGFR檢測(cè)。目前,檢測(cè)EGFR突變的金標(biāo)準(zhǔn)為直接測(cè)序法,其敏感度較低,為10% ~20%,且僅用于組織標(biāo)本的檢測(cè)。本研究旨在探討晚期NSCLC患者在難以取得手術(shù)組織的情況下,應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR擴(kuò)增胸腔積液及血液中腫瘤細(xì)胞EGFR基因是否可準(zhǔn)確判斷其突變的存在與否,進(jìn)而指導(dǎo)患者是否采取TKI治療。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 選擇2010年1月~2011年12月江西省腫瘤醫(yī)院內(nèi)二科NSCLC腺癌患者76例,男27例、女49例,年齡52~77歲。均經(jīng)病理確診,根據(jù)2011年NCCN指南肺癌TNM分期標(biāo)準(zhǔn),均為Ⅳ期患者,均合并惡性胸腔積液,未接受過TKI類藥物治療。

1.2 方法

1.2.1 標(biāo)本的收集 同時(shí)收集入選患者的3種標(biāo)本,即組織石蠟切片、外周血、胸腔積液。A:收集活檢的腫瘤組織石蠟切片置于4℃冰箱保存待測(cè),組織切片來(lái)源包括支氣管鏡下活檢組織及CT引導(dǎo)性經(jīng)皮肺穿刺活檢組織,均經(jīng)我院病理科診斷為肺腺癌。B:組織經(jīng)病理確診后,清晨空腹抽取患者外周靜脈血4 mL,置于潔凈的乙二胺四乙酸抗凝管中,后按照血液RNA抽提標(biāo)準(zhǔn)操作提取RNA。C:組織經(jīng)病理確診后,收集100 mL以上胸腔積液,以8 000 r/min離心5min,取沉淀;按照組織RNA抽提標(biāo)準(zhǔn)操作規(guī)程抽提。

1.2.2 基因組 DNA提取 提取組織 DNA采用TakaRa DEXPAT試劑盒。將3~5片10μm厚的石蠟切片放于Eppendorf管中,加入DNA抽提液10滴,充分混勻,100℃加熱10 min,13 000 r/min離心10 min,吸取其上清直接用于實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)。胸腔積液樣本離心后收集細(xì)胞團(tuán),經(jīng)研磨,Trizol-氯仿分層,取上清,異丙醇沉淀,以75%乙醇洗滌,再次離心,干燥,DEPC水溶解沉淀后獲取組織RNA,RNA經(jīng)紫外分光光度計(jì)質(zhì)控后方可使用。采用ABI9700 PCR儀逆轉(zhuǎn)錄后獲得cDNA,用于實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)。外周血樣本加入3倍體積紅細(xì)胞裂解液后離心,Trizol-氯仿分層后處理同胸腔積液,提取RNA用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

1.2.3 熒光定量PCR法分析NSCLC患者組織中EGFR 19~21突變情況 反應(yīng)體系包括:模板50 ng、正反向引物各 25 pmol、Master Mix及 Taqman標(biāo)記探針。每次試驗(yàn)均設(shè)定各突變的陰、陽(yáng)性對(duì)照孔及空白對(duì)照孔。反應(yīng)循環(huán)參數(shù)為:50℃ 2 min,95℃10 min;95℃ 15 s,62℃ 34 s,循環(huán)40次。引物均由上海英駿生物技術(shù)有限公司合成純化。引物序列:18外顯子:上游:5'-GGCGTGGAAACAGACATAGAA-3';下游:5'-TGGAGTTCCCAAACACTCAG-3'。19外顯子:上游:5'-ATTCGTAGGAGCCCAACAG-3';下游:5'-GCCAGTAATTGCCTGTTTCC-3'。20外顯子:上游:5'-CTCTCCCACTGCATCTGTCA-3';下游:5'-GATGGGACAGGCACTGATT-3'。21 外顯子:上游:5'-GTCAGCAGCGGGTTACATCT-3';下游:5'-AAGCAGCTCTGGCTCACACT-3'。

1.2.4 結(jié)果判定 以無(wú)模板對(duì)照擴(kuò)增曲線的最高點(diǎn)為準(zhǔn)設(shè)定閾值。沒有出現(xiàn)擴(kuò)增曲線或Ct=0的樣本為陰性樣本;出現(xiàn)擴(kuò)增曲線且Ct≤34.0的樣本為陽(yáng)性樣本;34.0≤Ct≤38.0的樣本為可疑陽(yáng)性,需重復(fù);Ct>38.0為陽(yáng)性。另外,每次PCR結(jié)束后,將PCR產(chǎn)物于2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),排除假陰性。18號(hào)外顯子:2155堿基G→A;19號(hào)外顯子:2235-2249堿基,堿基缺失;20號(hào)外顯子:2369堿基C→T;21號(hào)外顯子:2573堿基T→G。標(biāo)本出現(xiàn)任一突變陽(yáng)性均記為該標(biāo)本陽(yáng)性。

1.2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用 SPSS13.0統(tǒng)計(jì)軟件,采用χ2檢驗(yàn)進(jìn)行組間的兩兩比較,小樣本量采用Fisher確切概率法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。P≤0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 熒光定量PCR結(jié)果 76例NSCLC的EGFR外顯子18~21中,共檢測(cè)出27例有反應(yīng)峰,其中外顯子19缺失突變陽(yáng)性的樣本17例,外顯子21為7例,突變率分別為22.3%和9.21%(圖1),而外顯子20突變未檢測(cè)到。

圖1 陽(yáng)性組織的擴(kuò)增曲線

2.2 3種組織EGFR突變檢測(cè)結(jié)果 見表1。外周血、胸腔積液與腫瘤組織的符合率達(dá)到80%(24/27、25/27)以上,檢驗(yàn)結(jié)果表明這3種標(biāo)本來(lái)源對(duì)EGFR檢測(cè)的突變差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P均>0.05),其中有2例呈現(xiàn)穿刺組織檢測(cè)陽(yáng)性而胸腔積液未檢出,3例穿刺組織陽(yáng)性而外周血陰性,1例呈現(xiàn)胸腔積液檢測(cè)陽(yáng)性而穿刺組織及外周血未檢出,2例標(biāo)本在穿刺組織中同時(shí)存在外顯子19、21突變。

表1 3種不同標(biāo)本EGFR突變檢測(cè)結(jié)果(例)

3 討論

目前,EGFR-TKI藥物已廣泛應(yīng)用于肺癌的治療,但其靶點(diǎn)突變檢測(cè)卻仍處于較低水平。IPASS研究表明,吉非替尼一線治療EGFR突變陽(yáng)性患者的有效率明顯高于無(wú)突變的患者[1],但是如不先進(jìn)行EGFR檢測(cè)而直接使用TKI藥物,則死亡風(fēng)險(xiǎn)提高約185%[2]。因此,使用TKI藥物前快速準(zhǔn)確進(jìn)行EGFR檢測(cè)至關(guān)重要。

EGFR是erbB酪氨酸激酶受體家族的成員之一,作用機(jī)制為通過與配體如EGF、TGF-α結(jié)合,形成同源或異源二聚體,隨后發(fā)生自身磷酸化,激活其下游的信號(hào)通路。EGFR基因位于人類7號(hào)染色體短臂7p12-14,由28個(gè)外顯子組成,其酪氨酸激酶功能區(qū)由外顯子18~24編碼[3];我國(guó) NSCLC患者EGFR基因突變率約為34%,主要發(fā)生在外顯子19~21,占所有突變的 90%以上[4]。因此,準(zhǔn)確檢測(cè)這4個(gè)突變基因即可基本了解是否存在EGFR基因突變。

70%~80%的NSCLC患者在確診時(shí)即已處于ⅢB~Ⅳ期,喪失手術(shù)機(jī)會(huì),無(wú)法獲得手術(shù)標(biāo)本,限制了TKI藥物在臨床的使用。本研究結(jié)果顯示,3種來(lái)源的標(biāo)本進(jìn)行EGFR突變檢測(cè)均可有效反映患者機(jī)體狀態(tài);提示在難以獲取患者病理切片時(shí),可采用外周血及胸腔積液進(jìn)行EGFR基因突變檢測(cè)以協(xié)助診斷;但需要指出的是,本研究在樣本量不大的情況下,仍出現(xiàn)2例胸腔積液標(biāo)本出現(xiàn)假陰性。因此,我們認(rèn)為在能取得病理組織的情況下,組織切片標(biāo)本仍為評(píng)估原發(fā)腫瘤突變性的最佳方案,以排除假陰性的可能。

本研究發(fā)現(xiàn),EGFR基因存在19/21外顯子雙突變的可能,雙突變的存在必然引起整個(gè)基因空間結(jié)構(gòu)的變化,使得下游信號(hào)通路激活變化,這一類患者在應(yīng)用TKI藥物時(shí)療效如何,對(duì)總生存期及無(wú)進(jìn)展生存期影響如何,尚需進(jìn)一步研究。

本研究中,1例患者胸腔積液存在21號(hào)外顯子突變,但外周血及穿刺組織未見突變,提示腫瘤突變存在部位異質(zhì)性。國(guó)內(nèi)外資料證實(shí),EGFR基因突變存在異質(zhì)性主要表現(xiàn)為兩種,一是轉(zhuǎn)移部位與原發(fā)部位的不一致,二是治療(主要指化療)干預(yù)后腫瘤病灶EGFR檢測(cè)的變換。突變異質(zhì)性的發(fā)現(xiàn)解釋了某些多處轉(zhuǎn)移患者在接受TKI治療后原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶對(duì)藥物應(yīng)答的不一致性,也解釋了某些化療前檢測(cè)EGFR基因突變陰性的患者在接受規(guī)范化化療后突變檢測(cè)陽(yáng)性的現(xiàn)象,為臨床用藥提供了有益的指導(dǎo)。

綜上所述,應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法檢測(cè)胸腔積液及外周血中腫瘤細(xì)胞的EGFR基因突變,可以較準(zhǔn)確地反映NSCLC患者的EGFR突變情況,耗時(shí)短,損傷小,標(biāo)本易得且經(jīng)濟(jì)實(shí)惠,值得臨床推廣。但是由于存在假陰性的可能以及腫瘤異質(zhì)性的存在,仍建議在送檢時(shí)多種標(biāo)本兼顧。

[1]Fukuoka M,Wu YL,Thongprasert S,etal.Biomarker analyses and final overall survival results from a phaseⅢ,randomized,open-label,first-line study ofgefitinib versus carboplatin/paclitaxel in clinically selected patients with advanced non-small-cell lung cancer in Asia(IPASS)[J].JClin oncol,2011,29(21):2866-2874.

[2]Suzumura T,Kimura T,Kudoh S,etal.Reduced CYP2D6 function is associated with gefitinib-induced rash in patients with non-small cell lung cancer[J].BMC Cancer,2012,12(1):568.

[3]Lynch TJ,Bell DW,Sordella R,et al.Activatingmutations in the epidermal growth factor receptor underlying responsiveness of nonsmall-cell lung cancer to gefitinib[J].N Engl JMed,2004,350(21):2129-2139.

[4]Dong Q,Huang JS,Huang J,etal.Advance in targeted therapy for lung cancer and EGFR genemutations in China[J].Tumor,2005,25(6):625-628.

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