馮玉潔,宋柯晟,顧鳳龍
(華南師范大學(xué)化學(xué)與環(huán)境學(xué)院,環(huán)境理論化學(xué)省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東廣州510006)
近年來(lái),每當(dāng)新型抗生素投入臨床使用不久,細(xì)菌即可對(duì)它產(chǎn)生耐藥性,往往存在交叉耐藥和多重耐藥現(xiàn)象.抗生素結(jié)構(gòu)較復(fù)雜,屬于難生物降解的化學(xué)物質(zhì),一旦造成污染,容易在環(huán)境中富集,給環(huán)境中各種生物造成嚴(yán)重的影響,而甲硝唑(Metronidazole,圖1)作為一種重要的抗生素,有很好的抗菌性,應(yīng)用于臨床,其在抗滴蟲(chóng)和抗阿米巴原蟲(chóng)上有很好的效果,還具有強(qiáng)大的抗厭氧菌活性[1-2],但由其造成的環(huán)境污染也不容忽視.
圖1 甲硝唑化學(xué)結(jié)構(gòu)示意圖Figure 1 Molecular structure ofmetronidazole
處理甲硝唑的方法有多種,如用活性炭吸附[3-4],零價(jià)的鐵顆粒酸性條件下催化降解甲硝唑[5-6],利用 UV 等過(guò)程來(lái)降解甲硝唑[7-8],微生物降解[9-10]等.有些方法雖然降解得較為徹底,但耗時(shí)很長(zhǎng),有一些則只是將污染物與環(huán)境分離,污染物并沒(méi)有降解,有些則對(duì)降解條件要求高,所以尋找更好的降解方法依舊很迫切.FANG[6]等發(fā)現(xiàn)零價(jià)納米鐵在催化降解甲硝唑的反應(yīng)中極大地提高了反應(yīng)速率.
納米零價(jià)鐵近年來(lái)被廣泛應(yīng)用于處理各類(lèi)污染物,例如用于處理硝酸鹽的污染物[11-12],以及含氯的有機(jī)化合物[13],最近有研究者發(fā)現(xiàn),分解氯化烷烴方面,納米零價(jià)鐵參與反應(yīng),分解速率很快[14-15].納米零價(jià)鐵有很高的比表面積和高的表面活性,所以具有很好的還原性.
硝基化合物結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,不易分解轉(zhuǎn)化,是難生物降解的化合物,AGRAWAL和 TRATNYEK[11]曾嘗試用零價(jià)鐵來(lái)還原硝基苯,并最終確定還原產(chǎn)物主要是苯胺,后來(lái)ZILBERBERG等[16]從電子轉(zhuǎn)移角度分析零價(jià)鐵還原硝基苯的過(guò)程,陳少瑾等[17]通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了在零價(jià)鐵還原硝基苯的過(guò)程中,有微量的亞硝基甲苯等中間產(chǎn)物生成,并提出了相應(yīng)的反應(yīng)機(jī)理(圖2).
圖2 對(duì)硝基甲苯的可能還原步驟Figure 2 The possiblemajor steps in the reduction of p-nitrotoluenes
FANG等發(fā)現(xiàn)用納米級(jí)的零價(jià)鐵在酸性條件下降解甲硝唑效果很好,甲硝唑可以有效地被降解,但是中間產(chǎn)物和生成物均不能確定[5];并提出甲硝唑的可能降解機(jī)理[6](圖3).
圖3 甲硝唑可能的降解路徑Figure 3 Possible pathways ofmetronidazole degradation
根據(jù)文獻(xiàn)[18-19]提出的一些零價(jià)鐵的還原性質(zhì),分析3種可能的降解路徑,斷鍵和去硝基的可能性較小(圖3).本文通過(guò)理論化學(xué)計(jì)算提出了零價(jià)鐵還原降解甲硝唑的機(jī)理(圖4).
考慮到溶液中的氫離子及水分子,甲硝唑還原降解模型中的羥基用氫離子絡(luò)合,增加其穩(wěn)定性,而用于催化作用的鐵原子用2個(gè)水分子絡(luò)合,使其在與氫離子作用的時(shí)候能夠滿足八電子穩(wěn)定結(jié)構(gòu),反應(yīng)物的計(jì)算模型如圖5所示.整個(gè)計(jì)算過(guò)程在高斯09[20]計(jì)算軟件下完成,采用 DFT/B3LYP 方法,非金屬原子C、H、O、N在6-31g*的基組下計(jì)算,金屬原子Fe采用贗勢(shì)基組(lanl2dz).通過(guò)振動(dòng)頻率計(jì)算來(lái)確認(rèn)優(yōu)化結(jié)構(gòu)為穩(wěn)定結(jié)構(gòu)(無(wú)虛頻)或過(guò)渡態(tài)(有且僅有1個(gè)虛頻),并獲得零點(diǎn)能修正.通過(guò)內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)(IRC)計(jì)算來(lái)確認(rèn)連接過(guò)渡態(tài)的2個(gè)穩(wěn)定結(jié)構(gòu).溶劑化效應(yīng)的計(jì)算采用極化連續(xù)介質(zhì)模型(PCM).
圖4 零價(jià)鐵還原降解甲硝唑的機(jī)理(電子由鐵原子提供)Figure 4 Mechanism on degradation ofmetronidazole by zero-valent iron(electrons are provided by irons)
圖5 反應(yīng)物的計(jì)算模型Figure 5 The calculation model of the reactant
甲硝唑降解過(guò)程反應(yīng)路徑勢(shì)能面上各駐點(diǎn)(反應(yīng)物、過(guò)渡態(tài)、中間體和產(chǎn)物)的幾何構(gòu)型通過(guò)計(jì)算優(yōu)化得出.過(guò)渡態(tài)振動(dòng)頻率分析的結(jié)果表明,各步反應(yīng)的過(guò)渡態(tài) TS1、TS2、TS3、TS4、TS5、TS6 中各有多種振動(dòng)模式,其中只有1種振動(dòng)模式對(duì)應(yīng)的頻率為虛頻,振動(dòng)頻率分別為 1 088.90 i·cm-1、830.46 i·cm-1、1 224.78 i·cm-1、1 003.36 i·cm-1、1 171.49 i·cm-1、121.25 i·cm-1.圖6顯示,虛振動(dòng)位移分別指向反應(yīng)物和產(chǎn)物,反方向指向中間體,而各步中間產(chǎn)物的振動(dòng)頻率均為正值,說(shuō)明其確為反應(yīng)勢(shì)能面上的穩(wěn)定點(diǎn),內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)(IRC)計(jì)算確認(rèn)了各步反應(yīng)的反應(yīng)物、中間體、過(guò)渡態(tài)和產(chǎn)物的相關(guān)性,說(shuō)明中間體和過(guò)渡態(tài)均位于正確的反應(yīng)路徑上.
圖6 過(guò)渡態(tài)TS1和TS6的虛振動(dòng)模式Figure 6 Imaginary vibrationalmode of transition states for TS1 and TS6
圖7 甲硝唑降解過(guò)程的分子模擬Figure 7 Molecular simulation on metronidazole degradation process
從計(jì)算結(jié)果看出,本文假設(shè)的甲硝唑在酸性條件下,被零價(jià)鐵原子還原的機(jī)理可以通過(guò)模擬得到驗(yàn)證(圖7).在反應(yīng)的第1步,甲硝唑中硝基上的N原子從零價(jià)鐵得到電子,共軛體系被破壞,氮氧雙鍵斷開(kāi),帶負(fù)電的氧原子與氫離子結(jié)合,生成羥基化合物Int1,該過(guò)程氫氧之間的距離逐漸減小,從反應(yīng)物React中0.209 nm 到過(guò)渡態(tài) TS1中0.138 nm,再到Int1中為0.099 nm,基本接近水分子中氫氧鍵鍵長(zhǎng).而氮氧鍵鍵長(zhǎng)逐漸增大,由反應(yīng)物React中的0.129 nm增長(zhǎng)到過(guò)渡態(tài)TS1中的0.134 nm,再到中間產(chǎn)物Int1中的0.139 nm.反應(yīng)第2步,Int1中硝基上的N原子得到電子,羥基與氫離子結(jié)合,生成水分子,氮氧之間的距離繼續(xù)增大,直到該步反應(yīng)結(jié)束,由0.139 nm到0.274 nm,氮氧鍵斷裂,硝基上1個(gè)氧原子以水分子形式脫去,生成亞硝基.第3步,亞硝基上的N原子從零價(jià)鐵原子得電子,氮氧雙鍵斷開(kāi),因氧原子電負(fù)性大,奪電子能力強(qiáng),帶負(fù)電,與帶正電的氫離子結(jié)合,生成羥基化合物,即中間產(chǎn)物Int3.反應(yīng)第4步,Int3中與羥基相連的N原子得到電子,使N原子上此時(shí)有2對(duì)孤對(duì)電子,強(qiáng)烈吸引氫離子與其結(jié)合,生成羥基胺化合物Int4.反應(yīng)第5步,Int4中羥基胺上N原子繼續(xù)得電子,分子中羥基與氫離子結(jié)合,生成水分子,脫去另一個(gè)氧原子,生成中間產(chǎn)物Int5.反應(yīng)第6步,Int5中亞氨基上的N原子繼續(xù)得電子,此時(shí)該N上有2對(duì)孤對(duì)電子,與氫離子結(jié)合,生成胺基,甲硝唑降解完成.
為了獲得反應(yīng)路徑的能量變化曲線,內(nèi)稟反應(yīng)坐標(biāo)(IRC)的計(jì)算分別從過(guò)渡態(tài) TS1、TS2、TS3、TS4、TS5、TS6開(kāi)始,并對(duì)計(jì)算結(jié)果進(jìn)行優(yōu)化.圖8是各駐點(diǎn)沿反應(yīng)路徑的能量變化.圖8A顯示出甲硝唑中硝基還原為亞硝基過(guò)程能量的變化,反應(yīng)物在鐵的催化作用下,經(jīng)過(guò)一個(gè)6.8 kcal/mol的能壘,生成中間產(chǎn)物Int1,該步反應(yīng)能壘較小,容易發(fā)生.第二步反應(yīng)需要足夠的能量來(lái)活化—O N鍵,使其發(fā)生斷裂,同時(shí)O1(圖7第2步)帶電量稍微增大,H2所帶電量與H1相比,明顯降低,O1與H2兩者之間的電荷引力減小,使反應(yīng)難度增加,需要克服27.0 kcal/mol的高能壘才能發(fā)生.圖8B中TS4生成反應(yīng)需要較大的能壘,因?yàn)榇藭r(shí)N上有2對(duì)孤對(duì)電子,盡管N原子的電負(fù)性很大,與帶正電的氫離子成鍵能力很強(qiáng),但需要與O2(圖7第4步)競(jìng)爭(zhēng),克服O2與H4之間的電荷引力,反應(yīng)才能夠發(fā)生,故使反應(yīng)體系勢(shì)能增加,致使該步反應(yīng)具有較高的能壘.表1列出了各原子上Milliken電荷的分布.表2分別列出了溶劑效應(yīng)和非溶劑效應(yīng)下,反應(yīng)物、過(guò)渡態(tài)、中間體和產(chǎn)物的相對(duì)能量.圖8C、8D分別列舉了硝基上剩下的1個(gè)氧原子O2脫去及氨基生成過(guò)程中能量的變化,TS5、TS6活化能都不高,羥基胺生成之后即可繼續(xù)反應(yīng)得到最終還原產(chǎn)物胺基,與上面各步反應(yīng)過(guò)程類(lèi)似.計(jì)算結(jié)果表明,第2步亞硝基生成過(guò)程和第4步羥基胺的生成過(guò)程都需要較高的能量,其中一步很有可能為反應(yīng)的速控步.整個(gè)反應(yīng)過(guò)程中,含亞硝基的中間體Int2相對(duì)能量最低,為 -104.3 kcal/mol,相對(duì)穩(wěn)定,F(xiàn)ANG 等[6]在降解甲硝唑的實(shí)驗(yàn)中觀測(cè)到的中間產(chǎn)物很可能就是該步生成的含亞硝基的中間體Int2.由表2中數(shù)據(jù)可得,各步反應(yīng)產(chǎn)物的能量均低于反應(yīng)物的能量,故可得出該反應(yīng)在還原過(guò)程不斷釋放能量.溶劑效應(yīng)有利于降解反應(yīng)的發(fā)生.
表1 Mulliken電荷分布Table 1 Mulliken charge distributions
表2 反應(yīng)物、過(guò)渡態(tài)、中間體和產(chǎn)物的相對(duì)能量Table 2 Relative energies for the reactant,transition states,intermediates and product kcal/mol
圖8 計(jì)算得到的鐵催化降解的反應(yīng)能壘(單位:kcal/mol)Figure 8 Calculated potential energy barriers catalyzed by Fe(kcal/mol)
本文的理論化學(xué)計(jì)算為甲硝唑的降解提供了一個(gè)合理的降解路徑,通過(guò)還原性零價(jià)鐵的催化作用使硝基逐步還原,經(jīng)過(guò)中間產(chǎn)物亞硝基、羥基胺、最后還原成胺基.
本文嘗試研究了降解機(jī)理,對(duì)反應(yīng)的過(guò)程給出詳細(xì)且合理的解釋?zhuān)⑶夷M了每一步的中間產(chǎn)物,使整個(gè)降解過(guò)程清晰明了.通過(guò)模擬計(jì)算發(fā)現(xiàn)鐵不但作為催化劑存在,同時(shí)也提供電子給反應(yīng)系統(tǒng);亞硝基和羥基胺生成的2步有可能為該反應(yīng)的速控步驟;亞硝基的相對(duì)能量較低,能夠穩(wěn)定存在;溶劑效應(yīng)有利于降解反應(yīng).但是該機(jī)理仍需要進(jìn)一步的理論和實(shí)驗(yàn)來(lái)驗(yàn)證,確保精確性和可靠性,并提出更加有效的降解方法.
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