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突變型人PRKAG2基因的克隆及其真核表達載體構(gòu)建

2013-08-18 09:35張必利
海軍醫(yī)學雜志 2013年2期
關鍵詞:瓊脂糖變性克隆

陳 挺,張必利,何 平,程 平,鄭 興

家族性心室預激、傳導系統(tǒng)病變及心肌肥厚在2002年首次被歸結(jié)為分子遺傳學疾病,并被統(tǒng)稱為PRKAG2心臟綜合征。這是一種少見的常染色體顯性遺傳性疾病,主要由于編碼腺苷-磷酸激活的蛋白激酶γ2調(diào)節(jié)亞單位基因的PRKAG2發(fā)生錯義突變,例如,有人認為該基因R302Q位點突變與預激有關[1-2]。患者會出現(xiàn)陣發(fā)性室上性心動過速,需安裝永久起搏器,同時有可能伴有心肌肥厚、左室功能障礙等臨床表型[3-4]。本研究擬通過構(gòu)建含有突變位點R302Q的PRKAG2的真核表達載體,為進一步研究基因PRKAG2 R302Q突變的功能以及PRKAG2心臟綜合征的發(fā)病機制奠定基礎。

1 材料與方法

1.1 試劑

大腸桿菌感受態(tài)細胞Top10,由筆者所在實驗室制備;真核表達載體 pIRES2-EGFP(Clontech公司);KOD高保真DNA聚合酶(TOYOBO公司);限制性內(nèi)切酶Nhe I、BamH I(Fermantas公司);T4DNA連接酶(NEB公司);普通質(zhì)粒小抽試劑盒、瓊脂糖凝膠DNA回收試劑盒和PCR清潔試劑盒(Axygen公司);Trizol試劑(Invitrogen公司);逆轉(zhuǎn)錄酶(Promega公司)。

1.2 方法

1.2.1 引物設計與合成 設計用于PCR擴增人野生型PRKAG2基因(NCBI基因ID號51422)CDS區(qū)的引物,ATG起始位點前增加Kozak序列GCCACC,引物名稱及序列:F1,5'-GTCAGCTAGCGCCACCATGGGAAGCGCGGTTATGG-3';R1,5'-TGTAGGATCCTCACTCCGTTTCTGTCTCCTTTTGT-3';設計R302Q定點突變引物,突變位點位于引物中間位置,引物名稱及序列:RQ1,5'-GCCAACGGTGTCCGAGCAGCGCCACTGT-3';RQ2,5'-ACAGTGGCGCTGCTCGGACACCGTTGGC-3',以上引物由上海生工生物工程有限公司合成。

1.2.2 人野生型基因 PRKAG2的克隆 用 Trizol法抽提健康人全血mRNA,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA第1條鏈,采用F1/R1特異引物PCR擴增目標序列,PCR 體系:cDNA 0.5 μl,F(xiàn)1 引物 0.5 μl,R1 引物0.5 μl,KOD DNA 聚合酶 0.5 μl,濃度 2 mmol/L 的dNTP 2 μl,濃度 25 mmol/L 的 MgSO41 μl,10 × KOD Buffer 2.5 μl,無菌雙蒸水加至 25 μl。反應體系在冰上配制,混勻,瞬時離心后置于PCR儀,95℃預變性 5 min 后;95℃變性30 s,55℃退火30 s,68℃延伸90 s,進行35個循環(huán);最后68℃延伸5 min。目標片段回收,經(jīng)Nhe I、BamH I雙酶切連接至pIRES2-EGFP載體中,篩選陽性克隆測序驗證。

1.2.3 人突變型基因 PRKAG2 R302Q的克隆(1)PCR分段擴增引入突變序列。以人野生型PRKAG2基因為模板,分別采用F1/RQ2、RQ1/R2 2對引物進行PCR擴增,擴增產(chǎn)物分別命名為RSa、RSb。擴增結(jié)束后將PCR擴增產(chǎn)物全部上樣,用1%瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下切割目的片段,膠回收試劑盒純化。PCR體系及反應條件:模板pPRKAG2-IRES2-EGFP質(zhì)粒 0.1 μl,F(xiàn)1/RQ1 0.5 μl,RQ22/R1 0.5 μl,KOD DNA 聚合酶 0.5 μl,濃度 2 mmol/L 的 dNTP 2 μl,濃度 25 mmol/L 的 MgSO41 μl,10 × KOD Buffer 2.5 μl,無菌雙蒸水加至25 μl。反應體系在冰上配制,混勻,瞬時離心后置于PCR儀,95℃預變性5 min后;95℃變性30 s,56℃退火30 s,68℃延伸60 s,進行30 個循環(huán);最后68℃延伸5 min。(2)PCR拼接獲得PRKAG2 R302Q全長。將上述純化得到的2個分段PCR產(chǎn)物RSa、RSb作為模板,采用F1/R1引物PCR擴增,得到PRKAG2 R302Q基因片段,PCR擴增產(chǎn)物全部上樣,用1%瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下切割目的片段,膠回收試劑盒純化。PCR體系及反應條件:模板RSa 0.5 μl,模板 RSb 0.5 μl,F(xiàn)1 0.5 μl,R1 0.5 μl,KOD DNA 聚合酶1 μl,濃度 2 mmol/L 的 dNTP 4 μl,濃度25 mmol/L 的 MgSO42 μl,10 × KOD Buffer 5 μl,無菌雙蒸水加至50 μl。反應體系在冰上配制,混勻,瞬時離心后置于PCR儀,95℃預變性5 min后;95℃變性30 s,56℃退火30 s,68℃延伸2 min,進行30 個循環(huán);最后68℃延伸5 min。

1.2.4 重組載體 pR302Q-IRES2-EGFP的構(gòu)建(1)酶切、連接、轉(zhuǎn)化。用Nhe I、BamH I雙酶切回收產(chǎn)物R302Q片段和pIRES2-EGFP載體,37℃水浴酶切2 h。酶切體系:10 × TangoTMBuffer 5 μl,Nhe I 2 μl,BamH I 2 μl,R302Q/pIRES2-EGFP 25 μl,無菌雙蒸水加至50 μl。PCR清潔試劑盒回收酶切基因及載體產(chǎn)物,T4DNA連接酶4℃連接過夜,得到的質(zhì)粒為pR302Q-IRES2-EGFP。將重組質(zhì)粒42℃熱擊轉(zhuǎn)化Top10感受態(tài)細胞,37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)過夜。(2)陽性克隆鑒定。挑取轉(zhuǎn)化板的單克隆,置于20 μl無菌水中溶解,取1 μl菌液作模板,特異引物F1/R1進行PCR擴增,取5 μl擴增產(chǎn)物,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。反應體系:10×Taq Buffer 2 μl,F(xiàn)1 0.3 μl,R1 0.3 μl,菌液 0.5 μl,Taq 0.3 μl,濃度 2 mmol/L 的 dNTP 2 μl,無菌雙蒸水加至 20 μl。反應體系在冰上配制,混勻,瞬時離心后置于PCR儀,94℃預變性5 min后;94℃變性30 s,61℃退火30 s,72℃延伸2 min,進行30個循環(huán);最后72℃延伸10 min。挑取PCR鑒定正確的陽性克隆進一步采用Nhe I、BamH I雙酶切驗證后,挑取2個克隆送Invitrogen公司采用通用引物測序。Axygen質(zhì)粒小抽試劑盒抽提測序正確的克隆質(zhì)粒。

2 結(jié)果

2.1 人野生型PRKAG2基因的克隆

Trizol法提取人細胞mRNA,經(jīng)RT-PCR合成cDNA第1條鏈,特異性引物PCR擴增得到PRKAG2基因片段,目的片段條帶在1710 bp左右,酶切連接至pIRES2-EGFP載體中測序驗證,與NCBI公布序列完全一致,表明正確擴增出PRKAG2基因片段見圖1。

圖1 人野生型PRKAG2的RT-PCR電泳圖

2.2 人突變型基因PRKAG2R302Q的克隆

以人野生型基因PRKAG2為模板,通過PCR拼接的方法,分段擴增得到PRKAG2R302Q基因2段,大小分別為900 bp與800 bp左右,均與預期一致。見圖2。膠回收純化克隆得到的基因片段,再分別以以上2個片段為模板,通過PCR拼接得到了約1700 bp的目標片段,與預期一致。見圖3。

圖2 PRKAG2的RSa、RSb片段擴增結(jié)果

2.3 重組載體pR302Q-IRES2-EGFP的構(gòu)建

以Nhe I、BamH I分別雙酶切 pIRES2-EGFP和上述膠回收片段,1%瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下切割陽性片段,膠回收試劑盒回收酶切片段。經(jīng)T4DNA連接酶連接雙酶切產(chǎn)物,構(gòu)建pR302Q-IRES2-EGFP重組載體。轉(zhuǎn)化Top10感受態(tài)細胞,菌落PCR篩選陽性克隆。見圖4。篩選得到的陽性克隆進一步采用酶切驗證。見圖5。挑取2個陽性克隆送Invitrogen公司測序,結(jié)果與設計完全一致。

圖3 PRKAG2 R302Q的RSa、RSb片段拼接電泳圖

圖4 pR302Q-IRES2-EGFP重組載體菌落PCR鑒定結(jié)果

圖5 pR302Q-IRES2-EGFP重組載體酶切鑒定結(jié)果

3 討論

PRKAG2是AMPK γ2調(diào)節(jié)亞基的編碼基因,在心肌和骨骼肌高度表達[5]。AMPK是一種絲氨酸/蘇氨酸激酶,由α、β、γ亞基組成異質(zhì)三聯(lián)體,在細胞中作為代謝感受器,監(jiān)測細胞內(nèi)AMP/ATP比值,通過調(diào)節(jié)ATP的消耗和產(chǎn)生,在心肌代謝過程中發(fā)揮關鍵作用。在低氧、缺血、肌肉運動等應激情況下,細胞內(nèi)AMP/ATP的比值升高,AMP與AMPK的γ亞基結(jié)合,使α亞基的蘇氨酸暴露,通過上游激酶-AMP激活蛋白激酶激酶(AMP-activated protein kinase kinase,AMPKK)使蘇氨酸磷酸化,AMPK 被激活[6]。AMPK激活后通過減少維持生命并非必要的ATP消耗,以及通過促進細胞內(nèi)葡萄糖的攝取和加強氧化分解代謝刺激ATP的產(chǎn)生,調(diào)節(jié)體內(nèi)代謝平衡[7]。

關于PRKAG2突變對AMPK功能的影響,在細胞水平的研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染突變型PPKAG2基因的人CCL13 細胞株的 AMPK 活性降低[8];而 Arad 等[9]的研究表明,AMPK基礎活性反而增高。Hamilton[10]和Barnes[11]等的研究結(jié)果與Arad的研究結(jié)果一致,并且發(fā)現(xiàn)AMPK對AMP的敏感性降低。Burwinkel等[12]認為,由于不同實驗所用的細胞株不一樣,因此研究結(jié)果不同。CCL13細胞株中的腫瘤抑制蛋白LKB1是AMPK的主要上游底物,含量與其他細胞有顯著差異,而突變的AMPK結(jié)構(gòu)基因只有在足量LKB1存在的條件下才能增加AMPK的基礎活性,并降低AMPK對AMP的敏感性。

研究表明,PRKAG2心臟綜合征患者均有PRKAG2基因突變。所以,對該基因突變進行研究,進而闡述其發(fā)病機制尤為重要。為闡明這種缺陷機制,Sidhu等制備了表達人類突變PRKAG2基因的轉(zhuǎn)基因小鼠[13],轉(zhuǎn)基因小鼠出現(xiàn)的變化表型與人的家系性預激患者相似。

本研究克隆了突變型人PRKAG2 R302Q基因并構(gòu)建了其真核表達載體pR302QvIRES-EGFP,后續(xù)可通過轉(zhuǎn)染心肌細胞進行相關檢測,為進一步研究PRKAG2 R302Q突變功能奠定了基礎。

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