馬金友,余 燕,劉俊偉,徐之勇,朱巖昆,陳金山
(河南科技學(xué)院動(dòng)物科學(xué)學(xué)院,河南 新鄉(xiāng)453003)
豬病毒病的暴發(fā)是長(zhǎng)期制約生豬養(yǎng)殖和豬肉產(chǎn)品加工迅速發(fā)展的重要因素之一,尤其是2006年以來豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)變異株引起的高熱病的暴發(fā)使養(yǎng)豬業(yè)遭受了重大經(jīng)濟(jì)損失,因此,通過“預(yù)防為主”,提高豬只的自身免疫能力以增強(qiáng)其抗病力,是解決豬病及抗生素等藥物濫用問題的一條非常有效的途徑。目前,對(duì)于PRRSV免疫預(yù)防研究工作已經(jīng)取得了一些進(jìn)展[1-2],但對(duì)病毒入侵宿主細(xì)胞后,一些相關(guān)免疫因子對(duì)病毒感染過程中的囊泡運(yùn)輸系統(tǒng)是如何調(diào)控的還知之甚少,尤其在病毒的復(fù)制或參與病毒防御等方面。
Centaurin-α1是Centaurin蛋白家族中第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的成員,該基因于1996年首先在大鼠腦中被克隆得到,其可以特異性地通過PH結(jié)構(gòu)域與3,4,5-三磷酸磷脂酰肌醇(phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate,PtdIns(3,4,5)P(3))相結(jié)合,使 Centaurin-α1蛋白向細(xì)胞膜上遷移,通過 Ras-Raf-MEK-ERK1/2途徑調(diào)控細(xì)胞功能,從而參與到信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路中[3-4],對(duì)Centaurin-α1的研究主要是其作為ARF6的GAP(GTPase-activating protein)所行使的調(diào)控功能[5]。作為ARF的GAP,Centaurin-α1通過對(duì)ARF的調(diào)控而間接地參與到了病毒和抗病毒感染過程中[6],同時(shí),作為細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)PI3-K途徑下游的重要成員[4,7],我們?nèi)钥梢灶A(yù)見,Centaurin-α1可能與豬只抗病毒免疫密切相關(guān)。
由于Centaurin-α1在PRRSV感染中的免疫防御作用和調(diào)節(jié)機(jī)制缺乏了解,本文擬通過豬只Centaurin-α1基因的克隆與分析,構(gòu)建該基因的原核表達(dá)載體以獲得抗血清,為進(jìn)一步研究豬Centaurin-α1在PRRSV感染過程中的調(diào)控作用提供理論基礎(chǔ)。
1.1 試劑與設(shè)備
1.1.1 常用試劑 限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ與HindⅢ、反轉(zhuǎn)錄酶 M-MLV、Taq DNA 聚合酶,pMD18-T載體、質(zhì)粒提取試劑盒、DNA回收試劑盒、PrimeSTARTMHS DNA Polymerase,均購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司;瓊脂糖、蛋白胨和酵母浸出膏等,購(gòu)自上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司;槍頭和離心管(Axygen),購(gòu)自北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司;其他常用試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純?cè)噭?;pET-His載體和大腸桿菌(Escherichia coli Top10)由本實(shí)驗(yàn)室保藏。
1.1.2 主要設(shè)備 PCR儀,凝膠成像系統(tǒng),水平電泳槽,電泳儀,超凈工作臺(tái),臺(tái)式冷凍離心機(jī),隔水式恒溫培養(yǎng)箱,恒溫?fù)u床,電子精密天平,高壓滅菌鍋,制冰機(jī)等。
1.2 材料 從動(dòng)物科學(xué)學(xué)院獸醫(yī)院取疑似PRRSV感染的杜洛克豬肺、腦、淋巴結(jié)、心臟等少量組織,液氮凍存帶回實(shí)驗(yàn)室處理。
1.3 引物設(shè)計(jì) 根據(jù)NCBI(National Center for Biotechnology Information)豬 Centaurin-α1(M _214226)序列設(shè)計(jì)擴(kuò)增Centaurin-α1全長(zhǎng)ORF引物(CentF:5′-ATGGCCAA-GGAGCGGCGG-3′ 和CentR:5′-CGCTAGGGTTTATGC-TTGAAGTG-3′,上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成)和原核表達(dá)引物(Sus-CenF1:5′-GCGAATTCATCTGCCTGAGCTGCTTG-3′ 和 SusCenR1: 5′-CGAAGCTTCGCTAGGGTTTATG-CTTGAAG-3′,上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司法合成,下劃線為酶切位點(diǎn))。
1.4 方法
1.4.1 豬Centaurin-α1基因擴(kuò)增
1.4.1.1 組織總RNA提取 取適當(dāng)組織(200mg以下)于研缽(180℃烘烤3h)中加入液氮充分研磨,然后加入1 000μL Trizol(Invitrogen)混勻,分裝為2管,再分別加入Trizol補(bǔ)充至每管1 000μL,混勻(1管凍存,1管用于試驗(yàn)),室溫放置10min;12 000r/min(4℃)離心10min;上清轉(zhuǎn)移至一新管,加入0.2mL氯仿/每1 000μL Trizol,劇烈搖動(dòng)15s左右,室溫放置8min左右;12 000r/min(4℃)離心15min;上層水相轉(zhuǎn)移至一新管中,加入0.5 mL異丙醇混勻,室溫放置8min;12 000r/min(4℃)離心8min;棄上清,1mL 75%乙醇洗1min,7 500r/min(4℃)離心5min,重復(fù)洗1次;棄上清,空氣干燥3min,加入60μL DEPC水溶解沉淀。
1.4.1.2 cDNA合成 首先配制以下成分:1μL 6 mer隨機(jī)引物,4μg 總 RNA,1μL 10mmol/L dNTP混合物,DEPC水補(bǔ)充到14μL;PCR儀中65℃加熱5min,然后冰浴至少1min;輕微離心一下,然后加入以下成分:4μL 5×first-strand Buffer,1μL Rnase inhibitor,1μL反轉(zhuǎn)錄酶 M-MLV;PCR儀中25℃溫浴5min,42℃溫浴60min,70℃加熱15min以失活成分,4℃后保存冰箱中備用。
1.4.1.3 Centaurin-α1基因擴(kuò)增 PCR 反應(yīng)管中分別加入以下成分:5×Prime-STARTMBuffer 5 μL,2.5mmol/L dNTP混合物2μL,上下游引物各1.0μL,10倍稀釋的反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物2.0μL,PrimeSTARTMHS DNA Polymerase 0.25μL,補(bǔ)充滅菌三蒸水至25μL。PCR反應(yīng)程序如下:95℃,3min;98℃10s,55℃15s,72℃70s,30個(gè)循環(huán);72℃再延伸5 min,4℃終止。
1.4.2 基因擴(kuò)增產(chǎn)物的回收、連接和測(cè)序 檢測(cè)擴(kuò)增的目的片段,根據(jù)DNA回收試劑盒說明回收目的片段;0.5mL離心管中依次加入:載體(pMD18-T)0.5L,目的片段6.0L,10×Liga-tion Buffer 1.0L,T4Ligase 0.6L,滅菌三蒸水補(bǔ)充至10.0 L,16℃連接6h;連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化Top 10細(xì)菌和轉(zhuǎn)化細(xì)菌的檢測(cè)及測(cè)序,正確測(cè)序產(chǎn)物質(zhì)粒的提取、保存。
1.4.3 序列分析 分別運(yùn)用 Clustal X[8]和 Blast程序 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/)及Signal P 4.0 (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)分析核酸序列和預(yù)測(cè)蛋白的保守結(jié)構(gòu)域及信號(hào)肽。通過 MEGA 4.0[9]程序的鄰接法(Neighbor-Joining,NJ,bootstrap1000)構(gòu)建了相關(guān)物種Centaurin-α1的系統(tǒng)發(fā)生樹。
1.4.4 豬 Centaurin-α1融合蛋白原核表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建
1.4.4.1 Centaurin-α1基因表達(dá)序列的擴(kuò)增 除擴(kuò)增引物為SusCenF1和SusCenR1及模板為提取含Centaurin-α1序列質(zhì)粒外,其他成分和程序參照1.4.1.3的成分和步驟。
1.4.4.2 擴(kuò)增的 Centaurin-α1序列和連接載體酶切及回收 1.5mL Eppendorf管中分別依次加入:內(nèi)切酶緩沖液(10xK)5.0L;DNA片段和pET-His分別為43.0L;EcoRⅠ1.0L,HindⅢ1.0L,37℃酶切2.5h。酶切后的片段回收按照DNA回收試劑盒說明進(jìn)行。
1.4.4.3 載體和目的片段連接、轉(zhuǎn)化及檢測(cè) 0.5 mL離心管中依次加入:酶切載體(pET-His)1.5 L,待連接的酶切 Centaurin-α1片段6.5L,10×Ligation Buffer 1.0L,T4Ligase 1.0μL,總體積10.0L,16℃連接6h。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化Top 10細(xì)菌,轉(zhuǎn)化細(xì)菌的菌落檢測(cè)和質(zhì)粒雙酶切檢測(cè)驗(yàn)證,符合要求的菌落測(cè)序,正確測(cè)序產(chǎn)物質(zhì)粒的提取、保存。
2.1 豬Centaurin-α1基因ORF的克隆與分析
2.1.1 豬Centaurin-α1基因ORF的克隆 通過豬腦和肺臟組織總RNA的提取、反轉(zhuǎn)錄和基因的擴(kuò)增,得到了和目的基因一致的條帶(圖1),測(cè)序后確認(rèn)為豬Centaurin-α1基因,大小為1 100bp左右。
圖1 克隆的豬Centaurin-α1電泳圖
圖2 豬Centaurin-α1基因全長(zhǎng)序列和蛋白序列中的保守結(jié)構(gòu)域
2.1.2 豬Centaurin-α1基因ORF及結(jié)構(gòu)特征 豬Centaurin-α1基因包含一個(gè)長(zhǎng)度為1 122bp開放閱讀框,預(yù)測(cè)編碼374個(gè)氨基酸,理論分子質(zhì)量約為43.50kDa,pI為8.95(圖2,A)。
通過NCBI Blast尋找其序列中的保守結(jié)構(gòu)域,我們發(fā)現(xiàn),豬Centaurin-α1蛋白包含一個(gè)Arf GAP和兩個(gè)PH結(jié)構(gòu)域(圖2,B)。信號(hào)肽預(yù)測(cè)該蛋白前22個(gè)氨基酸為信號(hào)肽序列。
2.1.3 豬Centaurin-α1分子系統(tǒng)分析 根據(jù) Centaurin-α1氨基酸序列構(gòu)建的 NJ樹(Neighbor-Joining tree)顯示:該蛋白首先與牛 Centaurin-α1聚為一類,說明其與牛Centaurin-α1親緣關(guān)系較近,這從它們同為偶蹄目動(dòng)物能夠得到進(jìn)一步的證實(shí),與哺乳動(dòng)物中人和嚙齒目動(dòng)物也有較高的同源性,而和魚綱中的斑馬魚和兩棲類的非洲爪蛙親緣關(guān)系稍遠(yuǎn)(圖3)。
圖3 構(gòu)建的豬Centaurin-α1NJ樹
2.2 豬Centaurin-α1融合蛋白原核表達(dá)載體構(gòu)建由于Centaurin-α1是細(xì)胞中調(diào)控囊泡運(yùn)輸?shù)鞍椎闹匾蜃樱瑢?duì)病毒的入侵起著重要的調(diào)控作用,為了獲得抗血清進(jìn)一步研究它的功能,對(duì)其原核表達(dá)載體進(jìn)行構(gòu)建。通過設(shè)計(jì)的原核表達(dá)引物經(jīng)PCR從質(zhì)粒pMD18-T-Centaurin-α1中克隆表達(dá)序列,雙酶切后連接到pET-His載體上,通過菌落PCR獲得了和目的片段大小一致的條帶,挑選的菌落培養(yǎng)后提取的質(zhì)粒雙酶切圖譜(圖4)進(jìn)一步證實(shí)構(gòu)建融合蛋白表達(dá)載體的正確性。根據(jù)克隆的Centaurin-α1基因,我們成功構(gòu)建了豬Centaurin-α1原核表達(dá)載體用于融合蛋白的表達(dá)。
圖4 構(gòu)建的豬Centaurin-α1融合蛋白表達(dá)載體雙酶切
PRRSV是影響世界豬產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要流行性傳染病之一,具有導(dǎo)致懷孕母豬發(fā)生流產(chǎn)、早產(chǎn)和死胎等嚴(yán)重病癥特點(diǎn),尤其2006年后該病的暴發(fā)使養(yǎng)豬業(yè)遭受了重大損失。在研究中發(fā)現(xiàn)PRRSV感染早期豬Centaurin-α1基因表達(dá)明顯上調(diào),說明豬Centaurin-α1因子可能參與了早期病毒感染的防御作用。目前,國(guó)內(nèi)外關(guān)于Centaurin蛋白家族的報(bào)道還非常少,作為這個(gè)家族中最早被發(fā)現(xiàn)的成員,Centaurin-α1在人們的研究中大多數(shù)都還僅限于它與ARF6的關(guān)系。然而,從Centaurin-α1蛋白所具有的保守結(jié)構(gòu)域上,我們不難看到該蛋白可能具有的功能和作用是不容忽視的。因?yàn)镃entaurin-α1不僅可以作為ARF6的GAP,從而間接參與到細(xì)胞吞噬、細(xì)胞運(yùn)動(dòng)和物質(zhì)運(yùn)輸?shù)然顒?dòng)中,它擁有的兩個(gè)PH結(jié)構(gòu)域及可與第二信使3,4,5-三磷酸磷脂酰肌醇特異性結(jié)合的能力也暗示了它可能在細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中具有重要地位。而且,根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,Centaurin-α1可能是重要細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑PI3-K途徑下游的成員[7],盡管目前在這方面還沒有具體的研究,但是我們?nèi)允强梢灶A(yù)見Centaurin-α1可能與豬的相關(guān)病毒入侵有著密切的相關(guān)性。
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