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一步法電泳分析肌聯(lián)蛋白亞型和肌球蛋白重鏈

2014-01-17 12:21董睿敏鄭振達(dá)謝旭晶朱潔明趙長(zhǎng)林
關(guān)鍵詞:瓊脂糖電泳分子量

董睿敏 鄭振達(dá) 謝旭晶 朱潔明 趙長(zhǎng)林 陳 璘

(中山大學(xué)附屬第三醫(yī)院心內(nèi)科,廣州510630)

肌聯(lián)蛋白(titin)是一個(gè)肌小節(jié)蛋白,發(fā)現(xiàn)相對(duì)較晚,但功能重要[1,2]。Titin是哺乳動(dòng)物體內(nèi)分子量最大的蛋白,隨亞型結(jié)構(gòu)不同分子量達(dá)2970-3700kDa[3]。Titin的 N-C末端跨越半個(gè)肌小節(jié),N末端與肌動(dòng)蛋白相互作用固定于Z線,C末端附著在M線的肌球蛋白上。Titin的發(fā)現(xiàn)是對(duì)滑行肌絲模型理論(sliding filament model)的重要補(bǔ)充,是肌原纖維中的“第三肌絲”。其結(jié)構(gòu)特點(diǎn)有利于維持肌原纖維的完整性和穩(wěn)定性,為粗肌絲裝配的模版蛋白[4,5]。并且,titin的I帶部分具有高度折疊的彈簧樣分子結(jié)構(gòu),是心肌細(xì)胞執(zhí)行舒張功能的重要結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)[1,2]。Titin在心肌細(xì)胞中同時(shí)表達(dá) N2B 和N2BA兩種亞型,N2B更短更僵硬,N2BA更長(zhǎng)更有彈性,在不同的種屬、不同的發(fā)育階段和病理狀態(tài)下,N2B/N2BA比值變化,可導(dǎo)致心臟僵硬度發(fā)生明顯的改變[6]。為研究titin的生理病理功能,需對(duì)titin及其亞型進(jìn)行有效的電泳分離。SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)是分離鑒別蛋白的重要實(shí)驗(yàn)方法,但該方法不能有效地分離大于500KDa的大分子量蛋白,對(duì)于超大分子量的titin而言需要特殊的電泳技術(shù)[7]。本試驗(yàn)為能同時(shí)有效地分離肌小節(jié)內(nèi)的超大分子量蛋白titin各亞型和中分子量的肌球蛋白重鏈(Myosin heavy chain,MHC),增強(qiáng)titin研究的可行性和科學(xué)性,對(duì)其電泳方法進(jìn)行了改良。采用大面積垂直電泳,在電泳板上層以SDS-瓊脂糖膠(SDS-agarose gel electrophoresis,SDS-VAGE)方法分離titin各亞型,下層以SDS-PAGE電泳分離MHC,建立了能夠同時(shí)分離、檢測(cè)分子量跨越范圍大的多個(gè)蛋白的一步法電泳。

材料和方法

1.材料

1.1儀器與試劑

DYY-60型電泳儀;16cm×18cm垂直凝膠電泳槽(Bio-rad,美國(guó));凝膠成像系統(tǒng)(KODAK,美國(guó));瓊脂糖(SeaKem Gold AGAROSE,Sigma,美國(guó));四甲基乙二銨(Sigma,美國(guó));丙烯酰胺、硝酸銀、硅鎢酸、冰醋酸、甲醛、甘油、甘氨酸、十二烷基苯磺酸鈉(SDS)、三羥甲基氨酸甲烷(Tris)、過(guò)硫酸銨(Aps)等。

1.2實(shí)驗(yàn)材料

實(shí)驗(yàn)兔和小鼠,均于麻醉后迅速摘取心臟,用冰生理鹽水沖洗,沿房室環(huán)剪去左右心房及右室游離壁,然后切取左心,心尖至心底連線中點(diǎn)處游離壁心肌組織,置液氮保存后轉(zhuǎn)移至-80℃低溫冰箱以備做。同樣方法留取兔腓腸肌組織。

2.方法

2.1總蛋白提取

取少量的上述的兔心肌組織、小鼠心肌組織,兔腓腸肌組織。將各組標(biāo)本分別置于預(yù)冷的研缽中,在液氮浸泡下將組織塊研磨成粉狀。將粉狀組織分裝入EP管中,并按1∶40移入裂解液。60℃加熱10min。渦旋后,在13 200r/min離心5min,取上清即行電泳。

2.2垂直凝膠板的制備

將兩塊16cm×18cm的垂直電泳玻板和齒梳洗凈后,再用酒精擦拭,晾干,安裝在配膠架上。

2.2.1配制PAGE膠

先配制15ml 6%的PAGE膠,配方如下:30%丙烯酰胺溶液3ml、2mol/L Tis(pH 8.8)5.7 ml、甘油0.15ml、Aps 0.15ml、去離子水6ml、TEMED 0.012ml、SDS 0.15ml。配置后立即混勻,迅速將配置好的PAGE膠灌注到兩塊玻璃板中間的間隙中,小心地用雙蒸水覆蓋,室溫垂直放置1h使之凝固。PAGE膠高度約占整片垂直電泳膠的1/3,主要起到分離中分子蛋白 MHC的作用,同時(shí)可防止在垂直電泳中上層VAGE膠從底部脫落。待PAGE膠聚合完成后,倒掉覆蓋層,盡可能排去凝膠上的液體,用吸水紙吸干。并將帶有PAGE膠的垂直電泳槽置于60℃烤箱中預(yù)熱約15min。

2.2.2配制 VAGE膠

VAGE膠灌注在PAGE膠上方,約占整片垂直電泳膠的2/3,主要起到分離巨大分子titin亞型的作用。按照下述方法配制50ml 1%的VAGE膠:100%甘油15ml,5#buffer(0.25mol/L Tris,1.92mol/L甘氨酸,0.5%SDS)10ml,去離子水定容至50ml。秤取瓊脂糖0.5g,將上述50ml溶液溶解瓊脂糖。反復(fù)煮沸,使瓊脂糖充分溶解。其后將瓊脂糖液置入60℃烤箱10min,以排除液體中的氣泡。將1%VAGE膠直接灌注到已預(yù)熱的垂直電泳槽中,灌注后再次放入60℃烤箱5-10min,使液狀膠體中的氣泡能上升至液面。取出已灌注的垂直電泳槽,排除氣泡后,立即在其中插入一塊干凈的齒梳。室溫冷卻后置于4℃冰箱制冷,至少放置30 min后方能行電泳。也可于4℃冰箱中放置不超過(guò)2d。

2.3點(diǎn)樣

待VAGE膠聚合冷卻后,小心移去齒梳。將凝膠固定在電泳裝置上,分別在上下電泳槽加入蛋白質(zhì)電泳緩沖液,緩沖液配方:50mmol/L Tris,0.384 mol/L甘氨酸,0.1%SDS,上槽中需添加0.08%2-巰基乙醇。排除氣泡后按照預(yù)定順序每個(gè)樣品上樣10μl,不用上樣的空孔加入等體積的2×SDS凝膠上樣緩沖液。

2.4電泳

在恒溫4℃下進(jìn)行電泳。接通電源,設(shè)定電壓為200-250v,恒定電流15mA。當(dāng)溴酚藍(lán)到達(dá)下層PAGE膠體底部時(shí),可停止電泳,約需持續(xù)電泳5h。卸下玻板,在緩和的流水中輕輕撬開(kāi),取出凝膠。小心分離出下層的PAGE膠和上層的VAGE膠。

2.5染色

PAGE膠使用考馬斯亮藍(lán)染色法:用至少5倍體積的考馬斯亮藍(lán)R250染色液浸泡PAGE膠,室溫下置于搖床上平緩搖動(dòng)1h。將凝膠移入脫色液中,室溫平緩搖動(dòng)4-8h,其間更換脫色液2-3次;VAGE膠使用銀染法:使用100ml固定液浸泡VAGE膠,室溫下置于搖床上平緩搖動(dòng)1h。棄除固定液后,置膠片于37℃溫箱中18-20h,使膠片中水分減少,膠片變薄可降低銀染時(shí)背景對(duì)結(jié)果觀察的影響。蒸餾水搖晃洗滌20min×3次。2%亞鐵氰化鉀浸泡5min后,蒸餾水搖晃洗滌5min×3次。100ml新鮮配制的銀染液染色,待蛋白條帶出現(xiàn)即倒掉銀染液,予1%冰乙酸液洗膠,中和停止銀染反應(yīng)。

2.6上述凝膠均于染色后即掃描記錄,使用Bandscan分析軟件對(duì)目標(biāo)條帶行蛋白定量。

結(jié) 果

Titin為動(dòng)物體內(nèi)分子量最大的蛋白,使用SDS-VAGE電泳并銀染可見(jiàn)titin的蛋白條帶處于膠片的最頂端。Titin具有數(shù)個(gè)亞型,亞型的數(shù)量比例在不同的物種中差別甚遠(yuǎn)。因?yàn)橥秒枘c肌titin基本為N2A亞型,鼠心肌titin 99%為N2B亞型,所以可使用這兩種組織的titin電泳條帶作為titinN2A和N2B亞型的標(biāo)記[7]。蛋白電泳結(jié)果顯示:采用改良后的電泳方法,上層SDS-VAGE膠能成功分離titin,銀染后可清晰顯示titin各亞型及其分解產(chǎn)物T2。使用兔腓腸肌作為titin N2A標(biāo)記,鼠心肌作為titin N2B標(biāo)記,可確定兔心肌細(xì)胞分離出N2B和N2BA亞型,titin各亞型相應(yīng)條帶所處位置與其分子量大小一一對(duì)應(yīng)(圖1)。

圖1 SDS-VAGE電泳并銀染分離titin各亞型Fig.1SDS-agarose (SDS-VAGE)gel electrophoresis.RB SO,rabbit soleus.RT LV,rat left ventricle.RB LV1-4,rabbit left ventricle.The rabbit cardiac samples contain N2BA and N2Bisoforms whereas the rabbit skeletal samples contain onlyN2Aypef.

上層SDS-VAGE膠經(jīng)銀染處理后明顯變薄并收縮,可減少銀染時(shí)背景染色過(guò)深導(dǎo)致條帶分析困難。上層的VAGE膠與下層的PAGE膠連接良好(圖2)。與標(biāo)記蛋白對(duì)照,可見(jiàn)下層SDS-PAGE膠能清晰地分離出MHC。根據(jù)以往文獻(xiàn)報(bào)道,使用銀染法能提高titin蛋白條帶的檢出率。本實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)如同時(shí)使用銀染法標(biāo)記MHC其條帶染色彌散,背景較深,影響電泳圖像分析。故對(duì)SDS-PAGE膠使用考馬斯藍(lán)染色,結(jié)果顯示MHC條帶顯示清晰(圖2)。

圖2 SDS-VAGE結(jié)合SDS-PAGE的16cm×18cm垂直電泳。Fig.2 16cm×18cm vertical gel electrophoresis combining SDS-VAGE and SDS-PAGE.RB SO,rabbit soleus.RT LV,rat left ventricle.RB LV,rabbit left ventricle.MHC,myosin heavy chain.The top SDS-VAGE gel help to resolve titin isoforms and the bottom SDS-PAGE gel can separate MHC.This design allows to resolve titin isoforms and MHC in one step and one gel.

討 論

SDS-PAGE是分析生物體蛋白常用的方法,其基本原理在于:使用化學(xué)物消除蛋白的電荷差,由蛋白分子量的大小決定電泳遷移率,實(shí)現(xiàn)蛋白分離。不同濃度的聚丙烯酰胺凝膠形成不同凝膠孔徑,與相應(yīng)的蛋白質(zhì)分子大小接近,可提高對(duì)蛋白的分辨能力。大部分的生物體蛋白可通過(guò)SDS-PAGE被分離、鑒定和純化,但對(duì)于大分子量的蛋白,使用常規(guī)的電泳分離效果差。大分子量蛋白,需要低濃度的聚丙烯酰胺凝膠,低濃度的凝膠接近液態(tài)狀,機(jī)械強(qiáng)度低,不利于實(shí)驗(yàn)操作,同時(shí)在固定與染色階段容易出現(xiàn)膠體的斷裂和破碎,影響實(shí)驗(yàn)效果。

Titin分子量巨大,其蛋白電泳方法是研究的難點(diǎn),同時(shí)也導(dǎo)致了titin研究受到限制。既往使用的分離titin的電泳方法是用低濃度或2%-9.5% 濃度漸變SDS-PAGE膠進(jìn)行電泳[6]。但這些方法均不能克服低濃度的PAGE膠帶來(lái)的實(shí)驗(yàn)困難,如:膠片制作困難;實(shí)驗(yàn)操作中膠片容易破損;titin亞型的分離效果欠佳;轉(zhuǎn)膜效率低而難以行下一步的western blot檢測(cè)。至2003年Warren等使用1%SDS-瓊脂 糖 膠 (SDS-agarose gel electrophoresis,SDS-VAGE)垂直電泳可清晰地分離titin的各種亞型,并證實(shí)該電泳系統(tǒng)可應(yīng)用于大分子量蛋白(≥220kDa)的分離[7]。

根據(jù)上述方法進(jìn)行改良的垂直電泳方法,電泳膠片分為兩大部分:上2/3使用SDS-VAGE膠對(duì)titin進(jìn)行分離及銀染;下1/3采用SDS-PAGE膠對(duì)MHC進(jìn)行分離并予考馬斯藍(lán)染色。在上部的VAGE膠中因?yàn)榄傊切纬傻目讖酱?,?duì)于超大分子量的titin蛋白而言是良好的電泳介質(zhì)。Titin在SDS-VAGE膠中緩慢移動(dòng),電泳約5小時(shí)可實(shí)現(xiàn)亞型的分離。對(duì)中小分子量的蛋白而言,上層的VAGE膠相當(dāng)于不連續(xù)電泳系統(tǒng)中的低濃度的濃縮膠。中小分子量的蛋白在SDS-VAGE膠中電遷移速度快,有利于這些蛋白從最初的樣品溶液中濃縮出來(lái),進(jìn)而在下部的SDS-PAGE膠中實(shí)現(xiàn)電泳分離。一步法的垂直電泳方法有助于在實(shí)驗(yàn)中實(shí)現(xiàn)一次電泳同時(shí)分離多個(gè)分子量差距大的蛋白,提高實(shí)驗(yàn)效率。此方法也有利于titin的研究,因?yàn)閠itin極易出現(xiàn)降解,無(wú)法制備相關(guān)的獨(dú)立標(biāo)記蛋白,故使用內(nèi)參的方法對(duì)titin進(jìn)行定量檢測(cè)更為準(zhǔn)確[8]。在本實(shí)驗(yàn)中可以 MHC作為內(nèi)參,總titin=N2B+N2BA+T2,titin總量可表達(dá)為總titin/MHC。

此外,使用上述兩種膠體結(jié)合的大面積垂直電泳也有助于提高蛋白含量測(cè)定的精確性。因?yàn)榈鞍纂娪咀鳛橐环N操作技術(shù),在試驗(yàn)過(guò)程中有多方面的因素可能影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果,如:標(biāo)本的準(zhǔn)備方法;凝膠的組成和濃度;電泳分離參數(shù)和染色條件等。總體而言,蛋白定量檢測(cè)過(guò)程中應(yīng)注意使用同等條件準(zhǔn)備標(biāo)本、進(jìn)行電泳及分析。本實(shí)驗(yàn)采用的垂直電泳板面積為16cm×18cm,共有21個(gè)點(diǎn)樣孔,允許多個(gè)標(biāo)本同時(shí)電泳。并可根據(jù)實(shí)驗(yàn)?zāi)康倪x擇相應(yīng)膠體進(jìn)行組合,一次電泳即可檢測(cè)出標(biāo)本中的多個(gè)目標(biāo)蛋白,減少分次電泳中存在的不可控誤差,提高了結(jié)果比較和分析的可靠性。

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