■劉鳳紅 崔金鐘 韓芳橋 劉國(guó)俊

中國(guó)科學(xué)院植物研究所文獻(xiàn)與信息管理中心，北京市海淀區(qū)香山南辛村20號(hào) 100093，E-mail：fenghong@ibcas.ac.cn

1 引言

信息技術(shù)的發(fā)展和普及催生了數(shù)據(jù)的爆炸式增長(zhǎng)，將人類社會(huì)帶入了大數(shù)據(jù)（big data）時(shí)代。對(duì)數(shù)據(jù)的識(shí)別、管理、計(jì)算和應(yīng)用正前所未有地改變著人類生產(chǎn)和生活的諸多方面，科學(xué)研究也概莫能外?！按髷?shù)據(jù)”引起了研究模式的革命性變化，促成了數(shù)據(jù)密集型科學(xué)發(fā)現(xiàn)即科學(xué)研究第四范式的誕生。在這種研究模式下，科學(xué)研究不再單純地依靠科學(xué)問題或假設(shè)驅(qū)動(dòng)，而是轉(zhuǎn)而探究科學(xué)數(shù)據(jù)本身［1］。大數(shù)據(jù)引發(fā)了對(duì)數(shù)據(jù)共享的廣泛關(guān)注和討論［2-7］，對(duì)數(shù)據(jù)共享的需求也日趨強(qiáng)烈，在這種背景下，數(shù)據(jù)論文（data paper）應(yīng)運(yùn)而生。數(shù)據(jù)論文采用規(guī)范的出版形式，但與常規(guī)學(xué)術(shù)論文有很大不同：數(shù)據(jù)不是支持學(xué)術(shù)觀點(diǎn)的輔助性材料，而是論文主體。自從20世紀(jì)末生態(tài)學(xué)領(lǐng)域經(jīng)典學(xué)術(shù)期刊Ecology首次刊發(fā)數(shù)據(jù)論文以來，伴隨“大數(shù)據(jù)”的浪潮，其已引起了科技期刊出版界和科研群體的廣泛關(guān)注，得到了長(zhǎng)足而迅速的發(fā)展。目前，國(guó)際上不僅有期刊開通了數(shù)據(jù)論文發(fā)表通道（如Ecology，BMC Research Notes和International Journal of Robotics Research等），數(shù)據(jù)期刊（data journal）業(yè)已正式出版發(fā)行（如自然出版集團(tuán)（Nature Publishing Group）的《科學(xué)數(shù)據(jù)》（Scientific Data），Pensoft出版社的《生物多樣性數(shù)據(jù)期刊》（Biodiversity Data Journal，BDJ）等。有關(guān)數(shù)據(jù)論文的概念探討也開始見諸于專業(yè)科技期刊。在出版實(shí)踐上，數(shù)據(jù)論文的出版流程也在不斷完善和規(guī)范?？梢哉f，數(shù)據(jù)論文的出現(xiàn)和發(fā)展，不僅有益于科學(xué)數(shù)據(jù)的共享和積累，也是對(duì)論文出版類型的一種全新的嘗試。然而，其在國(guó)內(nèi)卻未受到相應(yīng)重視，對(duì)絕大多數(shù)期刊和科研群體而言，數(shù)據(jù)論文仍然是一個(gè)相對(duì)陌生的概念。基于此，本文詳細(xì)介紹了數(shù)據(jù)論文產(chǎn)生的背景、概念以及國(guó)內(nèi)外出版實(shí)踐，以期為國(guó)內(nèi)同行了解相關(guān)信息提供翔實(shí)的參考資料，并提出了在我國(guó)開設(shè)數(shù)據(jù)論文發(fā)表通道的建議。

2 數(shù)據(jù)論文及其相關(guān)概念

要準(zhǔn)確地闡釋數(shù)據(jù)論文，首先需要將其與數(shù)據(jù)發(fā)表、論文數(shù)據(jù)資料等概念和形式區(qū)分開來。

2.1 數(shù)據(jù)發(fā)表（data publication）

數(shù)據(jù)發(fā)表是將數(shù)據(jù)發(fā)布在網(wǎng)絡(luò)或其它媒介上，在遵循版權(quán)協(xié)議的前提下，他人可以引用、下載、分析和重用。廣義上講，任何將數(shù)據(jù)上載到網(wǎng)絡(luò)或其它媒介并允許他人使用的行為都可以稱為“數(shù)據(jù)發(fā)表”［8］。目前國(guó)際上有很多存儲(chǔ)專業(yè)數(shù)據(jù)的平臺(tái)，這些平臺(tái)的數(shù)據(jù)格式遵循國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)，保了上載的數(shù)據(jù)能夠被清晰描述，并為數(shù)據(jù)共享和重用奠定了基礎(chǔ)。如，存儲(chǔ)生物多樣性、物種分類和描述數(shù)據(jù)的全球生物多樣性網(wǎng)絡(luò)（GBIF），存儲(chǔ)基因數(shù)據(jù)的Genbank和生命條碼數(shù)據(jù)系統(tǒng)（Barcode of Life Data Systems，BOLD），存儲(chǔ)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫（Gene Expression Omnibus，GEO），存儲(chǔ)系統(tǒng)發(fā)育數(shù)據(jù)的TreeBASE等?？蒲泄ぷ髡邔?shù)據(jù)上載到這些存儲(chǔ)平臺(tái)上，就屬于數(shù)據(jù)發(fā)表行為。

2.2 數(shù)據(jù)資料（data materials）

數(shù)據(jù)資料作為支撐論文學(xué)術(shù)思想的佐證，是論文本身需要展示的不可或缺的部分。目前主要有兩種形式，一種是限于版面和出版成本，數(shù)據(jù)不在正文中出現(xiàn)，而以附件形式存在。這種形式早已有之，較為普遍；另一種形式是期刊出版機(jī)構(gòu)和科研群體基于對(duì)科學(xué)數(shù)據(jù)公開、重用、共享以及對(duì)論文原始數(shù)據(jù)真實(shí)性和重復(fù)性［9-10］的考慮，鼓勵(lì)作者將論文涉及的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)在專業(yè)數(shù)據(jù)庫或出版機(jī)構(gòu)網(wǎng)站上，推行這一舉措的包括Nature、American Naturalist、Ecology、Evolution、Heredity、Biological Journal of the Linnaean Society等國(guó)際知名期刊。在上述兩種形式中，數(shù)據(jù)資料不是論文本身要描述的主體，而是起支撐論文學(xué)術(shù)思想的作用。

2.3 數(shù)據(jù)論文（data paper）

數(shù)據(jù)論文是正式的學(xué)術(shù)論文，遵從學(xué)術(shù)發(fā)表規(guī)范，要接受嚴(yán)格的同行評(píng)議（peer-review）。它與常規(guī)學(xué)術(shù)論文最大的不同之處在于，并不重點(diǎn)報(bào)道基于科學(xué)假設(shè)和科學(xué)問題的研究結(jié)果，而是重點(diǎn)描述科學(xué)數(shù)據(jù)本身。實(shí)際上，數(shù)據(jù)論文的概念早已有之。早在2000年，美國(guó)生態(tài)學(xué)會(huì)（Ecological Society of America，ESA）就在投稿須知中對(duì)其進(jìn)行了闡釋：數(shù)據(jù)論文是一種特殊類型的論文，用于展示大型或豐富的數(shù)據(jù)集，包括描述數(shù)據(jù)內(nèi)容、數(shù)據(jù)產(chǎn)生背景、數(shù)據(jù)質(zhì)量和結(jié)構(gòu)的元數(shù)據(jù)文件。ESA明確提出發(fā)表數(shù)據(jù)論文的目的是重用數(shù)據(jù)，讓數(shù)據(jù)發(fā)揮更多潛在的科研價(jià)值［11］。隨著數(shù)據(jù)共享理念的發(fā)展和在線共享方式的普及，Chavan和 Penev（2011）將其概念發(fā)展為：數(shù)據(jù)論文應(yīng)該總是與其描述的公開發(fā)布的數(shù)據(jù)集鏈接，這個(gè)鏈接（可以是URL，最好是數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫自動(dòng)分配的DOI）包含在文章內(nèi)部［12］。概言之，數(shù)據(jù)論文是對(duì)在線數(shù)據(jù)集（dataset）或一組數(shù)據(jù)集進(jìn)行描述的元數(shù)據(jù)文檔，遵循一定的數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)，計(jì) 算 機(jī) 可 讀、 可 檢 索［13-15］。Ecology、Phytokeys、Zookyes、BMC Research Notes和International Journal of Robotics Research等期刊都發(fā)表數(shù)據(jù)論文。

2.4 數(shù)據(jù)期刊（data journal）

除部分期刊開設(shè)數(shù)據(jù)論文欄目外，近來還涌現(xiàn)了專門發(fā)表數(shù)據(jù)論文的數(shù)據(jù)期刊（data journal）。這方面非常典型的例子是：自然出版集團(tuán)（Nature Publishing Group）出版的《科學(xué)數(shù)據(jù)》和Pensoft出版社的《生物多樣性數(shù)據(jù)期刊》?！犊茖W(xué)數(shù)據(jù)》重在描述實(shí)驗(yàn)和觀察數(shù)據(jù)，并有效整合傳統(tǒng)學(xué)術(shù)發(fā)表內(nèi)容和結(jié)構(gòu)信息，力求在最大程度上促進(jìn)數(shù)據(jù)重用，幫助用戶進(jìn)行檢索和信息挖掘［20］?！渡锒鄻有詳?shù)據(jù)期刊》則采用一套完整的在線平臺(tái)，集中整合了論文寫作、投稿、審稿和編輯，再到出版和傳播的全部流程，是具有開創(chuàng)性的新興期刊出版模式。

3 數(shù)據(jù)論文的出版實(shí)踐

3.1 出版流程

同概念一樣，數(shù)據(jù)論文的出版實(shí)踐可追溯至20世紀(jì)末，也產(chǎn)生于生態(tài)學(xué)領(lǐng)域。生態(tài)學(xué)的學(xué)科屬性決定了數(shù)據(jù)整合和協(xié)同研究的重要性，所以對(duì)開放數(shù)據(jù)的要求尤為突出［6-7］。過去十五年來，生態(tài)學(xué)領(lǐng)域國(guó)際頂級(jí)學(xué)術(shù)期刊Ecology上刊發(fā)的數(shù)據(jù)論文的數(shù)量不斷上升（圖1），一定程度上反映了科學(xué)數(shù)據(jù)越來越受到重視。

圖1 Ecology歷年發(fā)表數(shù)據(jù)論文的數(shù)量

美國(guó)生態(tài)學(xué)會(huì)對(duì)數(shù)據(jù)論文的要求非常嚴(yán)格，對(duì)內(nèi)容、數(shù)據(jù)格式、出版流程、數(shù)據(jù)存儲(chǔ)方式以及數(shù)據(jù)質(zhì)量和審稿規(guī)范都做了詳細(xì)規(guī)定，并明確要求作者不得對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行保護(hù)性處理，以確保讀者能無障礙獲取數(shù)據(jù)［11］。Ecology Archives平臺(tái)為每篇論文及數(shù)據(jù)提供長(zhǎng)期保存和維護(hù)服務(wù)。Ecology數(shù)據(jù)論文的格式非常工整，包含標(biāo)題、版權(quán)聲明、Ecology Archives賦予的ID號(hào)以及摘要、作者、數(shù)據(jù)文件（及其鏈接）和元數(shù)據(jù)［16］。每個(gè)元數(shù)據(jù)文件分別包含數(shù)據(jù)集（data set descriptor）、研究動(dòng)因（research origin descriptors）、數(shù)據(jù)狀態(tài)和獲取方式（data set status and accessibility）、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)（data structural descriptors）和附屬描述資料（supplemental descriptors）5 個(gè)部分。

依賴于日趨龐大的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫和不斷創(chuàng)新的軟件工具，數(shù)據(jù)論文的創(chuàng)作過程不斷規(guī)范。日前，世界最大的生物多樣性信息服務(wù)機(jī)構(gòu)——全球生物多樣性信息網(wǎng)絡(luò)（Global Biodiversity Information Facility，GBIF）聯(lián)合Pensoft出版社，啟動(dòng)了數(shù)據(jù)論文示范項(xiàng)目。這個(gè)項(xiàng)目探索了從數(shù)據(jù)存儲(chǔ)、論文創(chuàng)作、投稿、同行評(píng)議、論文修改、投遞修改稿再到最后正式發(fā)表的全套流程，并推出了GBIF整合發(fā)表工具（Integrated Publishing Toolkit，IPT）。 基于在GBIF中存儲(chǔ)的數(shù)據(jù)，IPT元數(shù)據(jù)編輯器可以幫助作者方便快捷地創(chuàng)作遵從 GBIF元數(shù)據(jù)規(guī)范（GBIF Metadata Profile，GMP）的數(shù)據(jù)論文（圖2）。 這些論文經(jīng)過同行評(píng)議后，最終可在 Pensoft出版社的Zookeys、Phytokeys、MycoKeys、BioRisk、NeoBiota、Nature Conservation等期刊發(fā)表。IPT工具的使用不僅為作者提供了極大便利，而且實(shí)現(xiàn)了數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)化，使數(shù)據(jù)符合特定標(biāo)準(zhǔn)和規(guī)范，便于數(shù)據(jù)擴(kuò)展和整合。具體出版流程如下［12］：

a）數(shù)據(jù)發(fā)布者（data publisher）使用IPT為數(shù)據(jù)集創(chuàng)建元數(shù)據(jù)，IPT自動(dòng)分配給元數(shù)據(jù)一個(gè)永久ID。

b）元數(shù)據(jù)完成后，數(shù)據(jù)論文自動(dòng)產(chǎn)生。

c）作者自查并將論文上傳到期刊在線投稿系統(tǒng)。

d）同行評(píng)議后，初稿連同審稿意見返回給作者。

e）作者根據(jù)審稿意見修改論文。

f）同 b），標(biāo)記的修改版再一次自動(dòng)轉(zhuǎn)換成論文。

g）論文被接受，進(jìn)入校樣（proof）階段，加上投稿日期、修改日期和接受日期，并獲得DOI號(hào)。

h）數(shù)據(jù)論文經(jīng)過校對(duì)最終確認(rèn)后，將以4種形式發(fā)表：打印版、與打印版一致的PDF格式、語義增強(qiáng)HTML格式和XML格式，多種格式并存有利于日后對(duì)文章進(jìn)行深度數(shù)據(jù)挖掘。

圖2 全球生物多樣性信息網(wǎng)絡(luò)（GBIF）與Pensoft出版社期刊數(shù)據(jù)論文出版流程示意圖［12］

i）數(shù)據(jù)論文發(fā)表后，論文DOI號(hào)與在GBIF注冊(cè)表（GBIF Registry）上注冊(cè)的元數(shù)據(jù)文檔ID相互鏈接。

j）數(shù)據(jù)論文收錄進(jìn)檢索系統(tǒng)，供讀者使用。

3.2 質(zhì)量控制

為有效控制數(shù)據(jù)論文的質(zhì)量，Pensoft對(duì)同行評(píng)審標(biāo)準(zhǔn)做了嚴(yán)格詳細(xì)的規(guī)定，審稿人要評(píng)估元數(shù)據(jù)的完整性、數(shù)據(jù)質(zhì)量以及發(fā)表價(jià)值（publication value of data），以及在數(shù)據(jù)采集、管理和審核過程中采用的方法是否有效和標(biāo)準(zhǔn)是否一致。具體而言，審稿人要審核稿件質(zhì)量、數(shù)據(jù)質(zhì)量和以及內(nèi)容和元數(shù)據(jù)一致性等三個(gè)方面的問題［8］。

Pensoft投稿指南對(duì)三者分別做了詳細(xì)說明。論文質(zhì)量審核包括：標(biāo)題、摘要和關(guān)鍵詞是否精確反映了內(nèi)容？論文組織得是否合理，語言是否正確標(biāo)準(zhǔn)？非文本（如圖、表、視頻、音頻文件等）使用是否得當(dāng)？縮寫和符號(hào)是否定義正確？是否涉及到版權(quán)沖突等。數(shù)據(jù)質(zhì)量審核包括：數(shù)據(jù)是否完整和統(tǒng)一？數(shù)據(jù)資源是否包含了重要的科學(xué)內(nèi)容，涵蓋范圍是否足夠大，時(shí)間段和（或）分類群是否值得單獨(dú)發(fā)表？數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)是否一致？是否完整記錄了原始數(shù)據(jù)分析和使用方法，是否可復(fù)用？數(shù)據(jù)是否合理？數(shù)據(jù)存儲(chǔ)庫是否合適？論文和數(shù)據(jù)一致性審核包括：是否對(duì)數(shù)據(jù)及數(shù)據(jù)獲取方法進(jìn)行了精確描述？數(shù)據(jù)產(chǎn)生方法是否描述得足夠詳細(xì)？數(shù)據(jù)是否足夠？使用案例是否與數(shù)據(jù)一致？是否明確指出了可能導(dǎo)致數(shù)據(jù)錯(cuò)誤的原因等［8］。美國(guó)生態(tài)學(xué)會(huì)也制定了專門的審稿標(biāo)準(zhǔn)，除了對(duì)保密、審稿時(shí)限、規(guī)避利益沖突等一般性規(guī)定外，還要求審稿人必須給出詳細(xì)的審稿意見：審稿人必需要明確告訴作者其論文的主要貢獻(xiàn)、優(yōu)缺點(diǎn)和是否適合發(fā)表的原因，包括一般性意見和具體意見［11］。這些規(guī)定都旨在通過制定合理而嚴(yán)格的標(biāo)準(zhǔn)提高數(shù)據(jù)論文的質(zhì)量，為數(shù)據(jù)重用提供保障。

3.3 權(quán)益管理

數(shù)據(jù)論文屬于開放知識(shí)（open knowledge）范疇，是開放理念（這里數(shù)據(jù)也被看作是知識(shí)體系的一部分）的產(chǎn)物。在遵循版權(quán)共享協(xié)議的前提下，可被重用、演繹和重新發(fā)布。政府、基金資助組織、科研機(jī)構(gòu)和期刊出版界近年來陸續(xù)研究和制定了科學(xué)數(shù)據(jù)的管理和共享政策，以促進(jìn)科學(xué)數(shù)據(jù)的保存和開放獲取［17］。目前，絕大多數(shù)出版社和期刊都鼓勵(lì)甚至強(qiáng)制規(guī)定作者采用知識(shí)共享-署名協(xié)議（CCBY）。

Pensoft出版社采用開放數(shù)據(jù)共享署名（Open Data Commons Attribution License，ODC-BY）作為數(shù)據(jù)發(fā)表的首要和默認(rèn)協(xié)議，這意味著只要以引用或致謝的方式給原作者署名，數(shù)據(jù)就可以被自由共享、演繹和使用。署名可給數(shù)據(jù)創(chuàng)作者帶來學(xué)術(shù)信譽(yù)（基于此，數(shù)據(jù)論文的推出被認(rèn)為是促進(jìn)數(shù)據(jù)開放和共享的有效機(jī)制，前文有述）［8］。此外，Pensoft期刊也強(qiáng)烈推薦作者采用知識(shí)共享豁免（Commons CC0，CC-Zero）和開放數(shù)據(jù)共享公有領(lǐng)域的貢獻(xiàn)與許可（Open Data Commons Public Domain Dedication and Licence，PDDL）協(xié)議，該協(xié)議可有效避免“署名堆積（attribution stacking）”。

因?yàn)橥瑫r(shí)涉及數(shù)據(jù)和論文引用，所以對(duì)數(shù)據(jù)論文的引用與傳統(tǒng)的文獻(xiàn)引用有所不同。通常情況下，被引數(shù)據(jù)和數(shù)據(jù)論文都需要在文中和文后參考文獻(xiàn)目錄中有所體現(xiàn)。根據(jù)數(shù)據(jù)引用元數(shù)據(jù)核心（DataCite Metadata Kernel）的規(guī)定，Pensoft期刊文中和文后數(shù)據(jù)和論文引用標(biāo)準(zhǔn)示例為［8］：

正文引用：“這篇文章使用了來自“數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)”的數(shù)據(jù)，網(wǎng)址是：http：//dx.doi.org/*****（Jones et al.2008a），該數(shù)據(jù)首次刊發(fā)于Jones etal.2008b一文 ”。

目錄引用格式為：數(shù)據(jù)引用：“Jones A，Bloggs B，Smith C（2008a）.數(shù)據(jù)標(biāo)題.數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)名稱.標(biāo)識(shí)符：*****.”。論文引用：“Jones A，Saul D，Smith C（2008b）.論文標(biāo)題.刊名.卷：頁碼.

.”。

4 推動(dòng)數(shù)據(jù)論文的意義

“數(shù)據(jù)洪流（data deluge）的時(shí)代已經(jīng)來臨”［15］。要真正有效利用龐大的科學(xué)數(shù)據(jù)支持科學(xué)研究，踐行數(shù)據(jù)共享理念是必然之路。實(shí)際上，數(shù)據(jù)共享并不是一個(gè)嶄新的話題［14］。近年來，很多基金資助組織、科研機(jī)構(gòu)和學(xué)者都在積極呼吁科學(xué)數(shù)據(jù)共享。美國(guó)國(guó)家自然科學(xué)基金委員會(huì)（NSF）建議受資助的科研人員共享數(shù)據(jù)和實(shí)驗(yàn)材料［18］，基金申請(qǐng)人員除了提交項(xiàng)目申請(qǐng)書外，還需要提交數(shù)據(jù)管理計(jì)劃，這份計(jì)劃作為申請(qǐng)書的一部分，也要接受同行評(píng)審。中國(guó)也在積極采取措施促進(jìn)數(shù)據(jù)資源的公開，近年來，國(guó)家也支持了相應(yīng)的大型項(xiàng)目，如科技部和財(cái)政部資助的中國(guó)科技資源共享平臺(tái)項(xiàng)目。

Borgman（2013）對(duì)數(shù)據(jù)共享的原因和由此帶來的益處做了總結(jié)：公開數(shù)據(jù)方便同行驗(yàn)證和開展重復(fù)實(shí)驗(yàn)；公共基金資助的研究結(jié)果理應(yīng)服務(wù)于公眾；數(shù)據(jù)被同行和不同行業(yè)的人使用后促使新科學(xué)問題的提出；提升科研總體創(chuàng)新水平［15］。然而，令人遺憾的是很多數(shù)據(jù)并沒有被合理共享［19-22］，反對(duì)數(shù)據(jù)共享的聲音也不絕于耳［23］。在有些科學(xué)家看來，數(shù)據(jù)公開可能導(dǎo)致研究成果被他人使用，且對(duì)數(shù)據(jù)貢獻(xiàn)者沒有顯著回饋，不能幫助科研人員或數(shù)據(jù)擁有者提高學(xué)術(shù)信譽(yù)。數(shù)據(jù)論文的出現(xiàn)恰好可以有效彌補(bǔ)這一不足。首先，其是正式出版的學(xué)術(shù)論文，可被引用，能為數(shù)據(jù)發(fā)布者帶來學(xué)術(shù)信譽(yù)；其次，其采用結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)，遵循通用數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)，便于整合和擴(kuò)展；再次，其經(jīng)過同行評(píng)議，在質(zhì)量上有嚴(yán)格保證［24］。數(shù)據(jù)論文還可以有效鼓勵(lì)數(shù)據(jù)擁有機(jī)構(gòu)和人員公開歷史久遠(yuǎn)的原始數(shù)據(jù)。比如，單就生物多樣性領(lǐng)域而言，在過去的250年時(shí)間里，世界范圍內(nèi)6500家自然歷史博物館大概記錄了3億條數(shù)據(jù)［25-26］，被發(fā)現(xiàn)和公開發(fā)布的僅僅是其中的很小一部分，黑色數(shù)據(jù)（沒被發(fā)現(xiàn)和公開的數(shù)據(jù)）仍然占據(jù)主體，它們的產(chǎn)生鮮有計(jì)劃，數(shù)據(jù)質(zhì)量缺乏審核，發(fā)現(xiàn)和獲取尤為困難，面臨極大的丟失風(fēng)險(xiǎn)，而這些數(shù)據(jù)可能擁有極其重要的價(jià)值［26］。數(shù)據(jù)論文的推出極有可能成為發(fā)現(xiàn)和保存這些數(shù)據(jù)的有效機(jī)制［12］。

5 推動(dòng)中文數(shù)據(jù)論文的一點(diǎn)思考

科技期刊在數(shù)據(jù)管理方面發(fā)揮的作用日益重要。如上文所述，國(guó)際上已有一些有影響力的大型出版社參與數(shù)據(jù)存儲(chǔ)和數(shù)據(jù)發(fā)表。反觀國(guó)內(nèi)科技期刊出版界，雖然有關(guān)開放獲取的探討很多，但到目前為止，還未針對(duì)科學(xué)數(shù)據(jù)公開發(fā)布真正采取切實(shí)有效的措施。近來，生物學(xué)類核心期刊《生物多樣性》開設(shè)了生物編目欄目，該欄目刊發(fā)生物多樣性熱點(diǎn)地區(qū)、調(diào)查空白地區(qū)的物種編目以及中國(guó)和世界重要生物類群的編目［27］。自2011年以來，該刊已刊發(fā)17篇生物編目類論文?！吨参锷鷳B(tài)學(xué)報(bào)》開辟了資料論文專欄，旨在刊發(fā)特定尺度上（如群落、景觀或區(qū)域）植物群落的樣方數(shù)據(jù)［28］。這兩類文章是國(guó)內(nèi)期刊對(duì)數(shù)據(jù)論文的開創(chuàng)性嘗試，它們具備數(shù)據(jù)論文的基本特點(diǎn)：是正式的學(xué)術(shù)論文，對(duì)文章的科學(xué)假設(shè)和科學(xué)問題不做必然要求，重點(diǎn)關(guān)注數(shù)據(jù)本身，論文和數(shù)據(jù)本身都經(jīng)過嚴(yán)格的同行評(píng)審。但相較于國(guó)際上比較成熟的數(shù)據(jù)論文，還存在非常明顯的差距。如，沒有專業(yè)的數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)，更沒有對(duì)數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的規(guī)定和說明，對(duì)數(shù)據(jù)的管理僅僅停留在論文附屬資料的簡(jiǎn)單層面；沒有對(duì)數(shù)據(jù)共享、傳播、重用、演繹等權(quán)益做明確說明，或者沒有開放這些權(quán)益；沒有對(duì)數(shù)據(jù)引用格式做詳細(xì)說明。究其根本，造成這些差距的主要原因在于國(guó)內(nèi)對(duì)科學(xué)數(shù)據(jù)的認(rèn)識(shí)不夠深入，重視程度不足。

在開放理念日益盛行的今天，作為激勵(lì)科研人員共享科學(xué)數(shù)據(jù)的有效機(jī)制，數(shù)據(jù)論文模式有必要在國(guó)內(nèi)科技期刊出版界推廣。當(dāng)然，這需要科研群體、數(shù)據(jù)保存機(jī)構(gòu)、科技期刊和基金資助組織共同推動(dòng)。數(shù)據(jù)論文的核心是數(shù)據(jù)，這首先牽涉到數(shù)據(jù)保存問題。目前國(guó)內(nèi)尚缺乏有廣泛影響的成熟的科學(xué)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)。因此，要建立成熟完善的中文數(shù)據(jù)論文發(fā)表通道，首先需要從數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)建設(shè)上做起。可以考慮以區(qū)域節(jié)點(diǎn)方式參與國(guó)際數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)建設(shè)，快速移植國(guó)外平臺(tái)的框架、體系規(guī)范、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)和管理模式。數(shù)據(jù)存儲(chǔ)也便于作者和期刊管理和重用數(shù)據(jù)。建議國(guó)內(nèi)科技期刊與數(shù)據(jù)存儲(chǔ)平臺(tái)通力合作，積極鼓勵(lì)作者采用國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)存儲(chǔ)數(shù)據(jù)。此外，國(guó)內(nèi)期刊對(duì)數(shù)據(jù)共享和傳播應(yīng)該采取更為開放的態(tài)度，限制數(shù)據(jù)重用有違數(shù)據(jù)論文的核心理念，也會(huì)阻礙數(shù)據(jù)論文的持續(xù)性發(fā)展，因此建議國(guó)內(nèi)期刊盡可能采用開放程度大的數(shù)據(jù)共享協(xié)議，如CC-BY（知識(shí)共享-署名）協(xié)議。

當(dāng)然，科技期刊的發(fā)表通道再順暢，出版流程再專業(yè)，如果沒有科研群體貢獻(xiàn)科學(xué)數(shù)據(jù)，都只能是無米之炊、無水之源。因此，筆者呼吁基金資助組織鼓勵(lì)科研群體將公益資金資助的數(shù)據(jù)共享，唯此方能從源頭上保障我國(guó)數(shù)據(jù)論文的發(fā)展。

參考文獻(xiàn)

1 鄧仲華，李志芳.科學(xué)研究范式的演化——大數(shù)據(jù)時(shí)代的科學(xué)研究第四范式.情報(bào)資料工作，2013，20（4）：19-23

2 Vision TJ.Open data and the social contract of scientific publishing.Bioscience， 2010， 60（5）： 330-331

3 Huang XL，Qiao G.Biodiversity databases should gain support from journals.Trends in Ecology&Evolution， 2011， 26（8）： 377-378

4 Molloy JC.The open knowledge foundation：Open datameansbetter science.Plos Biology， 2011， 9（12）： e1001195

5 Whitlock MC.Data archiving in ecology and evolution：best practices.Trends in Ecology&Evolution， 2011， 26（2）： 61-65

6 Reichman OJ， Jones MB， Schildhauer MP.Challenges and opportunities of open data in ecology.Science， 2011， 331（6018）：703-705

7 Hampton SE，Strasser CA，Tewksbury JJ et al.Big data and the future of ecology.Frontiers in Ecology and the Environment， 2013，11（3）： 156-162

8 Pensoft data publishing policies and guidelines for biodiversity data.［EB/OL］ ［2014-06-20］.http：//www.pensoft.net/J_FILES/Pensoft_Data_Publishing_Policies_and_Guidelines.pdf

9 Cassey P，Blackburn TM.Reproducibility and repeatability in ecology.Bioscience， 2006， 56（12）： 958-959

10 Giles J.The trouble with replication.Nature， 2006， 442（7101）：344-347

11 Instruction for data paper of ESA.［EB/OL］ ［2014-06-20］.http：//www.esapubs.org/archive/instruct_d.htm

12 Chavan V， Penev L.The data paper： a mechanism to incentivize data publishing in biodiversity science.BMC Bioinformatics， 2011，12：S2

13 Newman P，Corke P.Data papers-peer reviewed publication of high quality data sets.International Journal of Robotics Research， 2009，28（5）： 587-587

14 Huang XL， Hawkins BA， Qiao GX.Biodiversity data sharing： will peer-reviewed data paperswork？Bioscience， 2013， 63（1）： 5-6

15 Borgman CL.科研數(shù)據(jù)共享的挑戰(zhàn).現(xiàn)代圖書情報(bào)與技術(shù)，2013， 34（5）： 1-20

16 Exlore ecologcal archives.［EB/OL］ ［2014-06-20］.http：//esapubs.org/archive/search.php？journal=E&year=2014&firstAuthor=&isDP=1

17 黃永文，張建勇，黃金霞等.國(guó)外開放科學(xué)數(shù)據(jù)研究綜述.現(xiàn)代圖書情報(bào)技術(shù).2013，34（5）：21-27

18 Policy DS.National Science Foundation.［EB/OL］ ［2014-06-20］.http： //www.nsf.gov/pubs/policydocs/pappguide/nsf11001/aag_6.jsp

19 About scientifc data.［EB/OL］ ［2014-06-20］.http：//www.nature.com/scientificdata/about/

20 Yesson C，Brewer PW，Sutton T，et al.How global is the global biodiversity information facility？Plos One， 2007， 2（11）： e1124

21 Alsheikh-Ali AA， Qureshi W， Al-Mallah MH， et al.Public availability of published research data in high-impact journals.Plos One， 2011， 6（9）： e24357

22 Vines TH， Albert AYK， Andrew L， et al.The availability of research data declines rapidly with article age.Current Biology，2014， 24（1）： 94-97

23 Tenopir C， Allard S， Douglass K，et al.Data sharing by scientists：practices and perceptions.Plos One， 2011， 6（6）： e21101

24 Costello MJ， Michener WK， Gahegan M， et al.Biodiversity data should be published， cited，and peer reviewed.Trends in Ecology&Evolution， 2013， 28（8）： 454-461

25 Chavan VS，Ingwersen P.Towards a data publishing framework for primary biodiversity data：challenges and potentials for the biodiversity informatics community.BMC Bioinformatics， 2009， 10（Suppl 14）： S2

26 Heidorn P.Shedding light on the dark data in the long tail of science.Library Trends， 2008， 57（2）： 280-299

27 生物多樣性投稿簡(jiǎn)則.［EB/OL］ ［2014-09-20］.http：//www.biodiversity-science.net/CN/column/column16.shtml

28 植物生態(tài)學(xué)報(bào)投稿簡(jiǎn)則.［EB/OL］ ［2014-09-20］.http：//www.plant-ecology.com/CN/column/column106.shtml