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布氏田鼠種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究

2014-03-28 12:58葛永斌
滁州學(xué)院學(xué)報(bào) 2014年2期
關(guān)鍵詞:布氏多態(tài)田鼠

葛永斌,魏 磊

鼠類是哺乳動(dòng)物中種類最多、數(shù)量最大、分布最廣的一個(gè)類群,在生態(tài)系統(tǒng)中起著主導(dǎo)作用[1-3]。其種群的大小、種群密度、種群的遷徙以及種群數(shù)量的周期性變化等都會(huì)對(duì)棲息地生態(tài)環(huán)境和疫病傳播產(chǎn)生重要影響。布氏田鼠(Microtus brandti)隸屬于嚙齒目(Rodentia)倉鼠科(Cricetidae)田鼠亞科(Microtinae)是半干旱型草原的主要嚙齒類動(dòng)物,分布范圍在我國內(nèi)蒙古中、東部,蒙古利亞共和國南部、東方艾瑪格省東部以及俄羅斯。布氏田鼠是中國內(nèi)蒙古中、東部草原主要屬種,在呼倫貝爾盟、錫林郭勒盟地區(qū)呈間斷性的分布[4,5]。由于布氏田鼠既是危害草原的重要害獸,又是多種病毒性、細(xì)菌性、立克次氏體、螺旋體、寄生蟲病等病原體的攜帶和傳播者而被加以防控[6]。然而,近年來,人類活動(dòng),包括過度放牧,土地復(fù)墾和草藥的挖掘等導(dǎo)致草原生態(tài)系統(tǒng)的逆向演替[7-9];氣候變化,特別是高溫和干旱,加速了草地退化過程[10,11],一些被隔離的布氏田鼠棲息地已被永久破壞,導(dǎo)致布氏田鼠不同地理種群大小受到嚴(yán)重的影響。理論和實(shí)際研究表明棲息地的片段化會(huì)引起小獸種群的遺傳分化[12-14]。進(jìn)化生物學(xué)和種群遺傳學(xué)理論已證明小型和孤立的種群將遭受擴(kuò)散限制并導(dǎo)致遺傳多樣性減少,甚至因隨機(jī)漂移和近親繁殖的綜合影響而導(dǎo)致遺傳變異的喪失[15]。在擴(kuò)散能力減弱或者擴(kuò)散能力被限制的情況下,血緣關(guān)系的累加可能促進(jìn)了近親繁殖而引起種群衰退[16]。研究者一直關(guān)注片段化棲息地瀕危物種、珍稀物種種群的遺傳結(jié)構(gòu)的研究,而作為草原鼠害的布氏田鼠種群的遺傳異質(zhì)性沒有給予適當(dāng)?shù)脑u(píng)估[17]。另外,與其他北方嚙齒類動(dòng)物反饋調(diào)節(jié)類似,在分布區(qū)的一些地方布氏田鼠受高循環(huán)動(dòng)態(tài)制約包括偶然的種群數(shù)量增長[18],物種在短時(shí)間內(nèi)經(jīng)歷了數(shù)量的漲落波動(dòng),極端的數(shù)量的波動(dòng)會(huì)導(dǎo)致種群遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性的改變。對(duì)于布氏田鼠這種分布區(qū)域廣、具有短距離擴(kuò)散能力、繁殖力強(qiáng),壽命短的嚙齒類動(dòng)物來說,由于長期受特定的地理環(huán)境條件脅迫和棲息地片段化的雙重作用,不同的地理種群遺傳結(jié)構(gòu)和生物多樣性可能發(fā)生變化并產(chǎn)生遺傳分化,進(jìn)而分化為不同的適應(yīng)性種群,將會(huì)對(duì)草原保護(hù)和防止疫病的傳播產(chǎn)生重要影響。目前,研究者對(duì)布氏田鼠的研究主要集中在行為學(xué)和生態(tài)學(xué),對(duì)其種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究還很少,而了解布氏田鼠的遺傳結(jié)構(gòu)將對(duì)深入理解種群結(jié)構(gòu)的季節(jié)變動(dòng)的內(nèi)在原因、制定群體的控制策略等都具有重要意義。因此,本文就布氏田鼠種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究進(jìn)行簡要綜述。

1微衛(wèi)星多態(tài)性種群遺傳結(jié)構(gòu)分析

Wang等[19]分析52個(gè)布氏田鼠樣本,分離鑒定了10個(gè)微衛(wèi)星多態(tài)性位點(diǎn),每個(gè)位點(diǎn)共檢測到2-11個(gè)等位基因;期望雜合度為0.406-0.840。多數(shù)位點(diǎn)的觀察雜合度相似或大于期望雜合度。微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)研究該物種的遺傳多樣性、種群結(jié)構(gòu)以相關(guān)聯(lián)的研究提供了可能。王登等[20]用7個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)對(duì)內(nèi)蒙古呼倫貝爾分布區(qū),錫林郭勒北部分布區(qū),渾善達(dá)克沙地南部分布區(qū)等3個(gè)分布區(qū)的4個(gè)樣地158個(gè)樣本布氏田鼠遺傳差異檢測顯示:不同種群間等位基因平均數(shù)、有效等位基因平均數(shù)、信息指數(shù)、有效等位基因數(shù)和平均期望雜合度之間無顯著差異;各種群內(nèi)平均觀測雜合度小于平均期望雜合度,經(jīng)Bonferroni方法校正后的哈-溫平衡檢測顯示4個(gè)種群28個(gè)位點(diǎn)中共14個(gè)位點(diǎn)背離哈溫平衡。表明各種群在微衛(wèi)星水平上遺傳差異顯著,各種群總體實(shí)際等位基因頻率均偏離哈-溫平衡,推測其繁殖系統(tǒng),交配方式存在近交或者其生存環(huán)境存在某種瓶頸。Fst檢測結(jié)果顯示不同分布區(qū)種群遺傳分化顯著。地理距離和遺傳距離Mantel檢測表明,各種群間遺傳距離和地理距離無顯著相關(guān)性(r=0.0499,p=0.669>>0.05)。Fst/(l-Fst)與In(d)間無相關(guān)性(F=0.045,df=4,p=0.842),推測4個(gè)種群的基因流模式為海島模式。岳凌粉[21]通過基因掃描法對(duì)采自不同季節(jié)的458個(gè)布氏田鼠樣本的19個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記位點(diǎn)進(jìn)行基因型判定,結(jié)果表明:19個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)均具有高多態(tài)性,其中17個(gè)位點(diǎn)為高度多態(tài)位點(diǎn)(PIC>0.5),其它2個(gè)為中度多態(tài)位點(diǎn),平均多態(tài)信息含量為0.710(0.370-0.890);平均等位基因數(shù)和有效等位基因數(shù)分別為10.842和4.679;平均期望雜合度和觀測雜合度為0.744和0.686。對(duì)不同洞群的UPGMA聚類分析表明,當(dāng)洞群間物理距離較近時(shí),物理距離同遺傳距離之間并不存在相關(guān)關(guān)系;而當(dāng)物理距離較遠(yuǎn)時(shí),二者具有正相關(guān)關(guān)系。分別對(duì)春秋季不同個(gè)體的聚類結(jié)果分析表明,無論春季洞群還是秋季洞群,同一洞群內(nèi)的大部分個(gè)體具有較近的遺傳距離而被聚類在一起,親緣關(guān)系較近,結(jié)果說明親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近可能是決定洞群組成的主要因素。對(duì)不同季節(jié)布氏田鼠的遺傳結(jié)構(gòu)分析顯示,兩個(gè)群體中共存在57個(gè)特有等位基因,(春季群體34個(gè)、秋季群體23個(gè)),其中5個(gè)(春季3個(gè)、秋季2個(gè))具有較高頻率(P>0.03),說明遺傳結(jié)構(gòu)在季節(jié)間存在差異。Wang等[17]基于7個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)內(nèi)蒙古東烏珠穆沁旗、阿巴嘎旗、新巴爾虎左旗和正鑲白旗4個(gè)布氏田鼠地理隔離種群分析表明,除阿巴嘎旗種群外,所有種群7個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)呈現(xiàn)多態(tài)性。每個(gè)位點(diǎn)平均檢測到5.61等位基因檢測,每個(gè)座位上有效等位基因數(shù)為3.29。除正鑲白旗種群外,布氏田鼠種群平均觀察雜合度(P=0.744)、期望雜合度(P=0.904)和等位基因豐度(P=0.783)沒有顯著差異。正鑲白旗種群的期望雜合度和等位基因豐度顯著低于其他種群。而且不同的地理種群分化非常顯著(Fst=0.124),尤其是正鑲白旗種群與其他的種群隔離開來,成為封閉種群,種群分化較為明顯。并且發(fā)現(xiàn)不同分布區(qū)種群內(nèi)近交水平較高(Fis=0.205~0.290),此現(xiàn)象可導(dǎo)致布氏田鼠個(gè)體的生存能力減弱并有可能導(dǎo)致物種滅絕的危險(xiǎn)。

2 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)種群遺傳結(jié)構(gòu)分析

施海霞等[22]使用40條隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)(randomly amplified polymorphic DNA,PRAD)引物對(duì)布氏田鼠封閉群進(jìn)行PCR擴(kuò)增,瓊脂糖電泳分離條帶,參考標(biāo)準(zhǔn)分子量標(biāo)記計(jì)算條帶大小,并使用多態(tài)位點(diǎn)數(shù)、單態(tài)位點(diǎn)數(shù)以及多態(tài)位點(diǎn)比率評(píng)價(jià)種群的遺傳多樣性。結(jié)果篩選出8對(duì)能獲得清晰穩(wěn)定擴(kuò)增條帶的RAPD標(biāo)記。這8對(duì)RAPD標(biāo)記檢測到的多態(tài)位點(diǎn)數(shù)存在明顯差異。8對(duì)引物得到的遺傳多態(tài)位點(diǎn)的數(shù)據(jù)之和能揭示種群的遺傳結(jié)構(gòu),從而構(gòu)建了檢測布氏田鼠封閉群遺傳結(jié)構(gòu)的RAPD標(biāo)記的方法。

3 MHC多態(tài)種群遺傳分析

魏磊等[23]以 MHC classⅡgeneβ基因?yàn)榉肿訕?biāo)記,分別對(duì)在內(nèi)蒙的錫林浩特市、二連浩特市捕獲的473只布氏田鼠(2個(gè)種群)和青海省的青海玉樹州稱多縣、四川省孜州石渠縣捕獲的486只青海田鼠(2個(gè)種群)進(jìn)行種群遺傳分析。261 bp的MHC classⅡgeneβ基因RsaⅠ酶切結(jié)果出現(xiàn)了 AA、BB、CC、DD、EE、FF、AB、AC、AD、AE、AF、BC、BD、BE、BF、CD、CE、CF、DE、DF和 EF共21種基因型,其中布氏田鼠由A、B、C、D、E和F共6個(gè)等位基因控制;而青海田鼠由A、B、C、D和F共5等位基因控制。選取純合型RsaⅠAA作為對(duì)比序列,共發(fā)現(xiàn)68個(gè)變異位點(diǎn),占26.1%,其中布氏田鼠占39個(gè),青海田鼠占27個(gè),二者存在12堿基的差異。布氏田鼠MHC classⅡgene β基因在第27、53、63、70、91、126、127、128、129、160、213、214、215位堿基上存在多態(tài)性;青海田鼠在第27、53、63、126、127、128、129、160、213、214、215位堿基上存在多態(tài)性。

4 結(jié) 論

綜上所述,布氏田鼠種群遺傳結(jié)構(gòu)的研究工作已經(jīng)取得了一定進(jìn)展,尤其是基于微衛(wèi)星位點(diǎn)對(duì)不同地理種群的研究,此外有關(guān)布氏田鼠種群MHC基因多態(tài)性與鼠疫抗性的相關(guān)研究也取得了一定的進(jìn)展。目前還需要對(duì)布氏田鼠不同的地理種群遺傳結(jié)構(gòu)和生物多樣性可能發(fā)生變化并產(chǎn)生遺傳分化作進(jìn)一步的研究,以期探討物種適應(yīng)性和區(qū)域性成災(zāi)性,為鼠害治理以及預(yù)防控制田鼠型鼠疫提供理論數(shù)據(jù)。

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