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與腎小管上皮轉(zhuǎn)分化相關(guān)的miRNA的初步篩選

2014-04-13 10:13邵駕宇章慧娣潘嘉林尤小寒薛向陽黃朝興
浙江醫(yī)學(xué) 2014年17期
關(guān)鍵詞:依賴性腎小管纖維細(xì)胞

邵駕宇 章慧娣 潘嘉林 尤小寒 薛向陽 黃朝興

●論 著

與腎小管上皮轉(zhuǎn)分化相關(guān)的miRNA的初步篩選

邵駕宇 章慧娣 潘嘉林 尤小寒 薛向陽 黃朝興

目的 觀察miRNA在大鼠腎小管上皮細(xì)胞(NRK-52E)發(fā)生上皮-肌成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)分化(EMT)過程中的變化,篩選與腎小管上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)分化相關(guān)的miRNA。方法體外培養(yǎng)NRK-52E,用5 ng/ml轉(zhuǎn)化生長因子-β1(TGF-β1)分別作用0、3、6、12、24、48 h,以0 h為空白組(BC組),余為TGF-β1組。倒置相差顯微鏡觀察細(xì)胞形態(tài)學(xué)變化;real-time PCR法檢測細(xì)胞內(nèi)α-平滑肌肌動(dòng)蛋白(α-SMA)、E鈣蛋白(E-cad)、1型膠原(ColⅠ)和纖連蛋白(FN)的mRNA表達(dá)水平;Western blot法檢測細(xì)胞內(nèi)α-SMA的表達(dá)水平;ELISA法檢測上清液中FN的含量;莖環(huán)實(shí)時(shí)熒光定量PCR法檢測6條miRNA在細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)水平。結(jié)果與BC組比較,TGF-β1組部分細(xì)胞失去原有的鵝卵石形態(tài),轉(zhuǎn)變成成纖維細(xì)胞特有的梭形;細(xì)胞內(nèi)α-SMA、ColⅠ和FN的mRNA表達(dá)上調(diào),E-cad的mRNA表達(dá)下調(diào),細(xì)胞內(nèi)α-SMA表達(dá)量增多,細(xì)胞上清液中FN含量升高(均P<0.05);miR-30d、miR-132和miR-21的表達(dá)上調(diào),miR-200b、miR-192和miR-10b的表達(dá)下調(diào)(均P<0.05)。結(jié)論TGF-β1可誘導(dǎo)NRK-52E發(fā)生EMT。miR-30d、miR-132、miR-21、miR-200b、miR-192和miR-10b可能參與大鼠腎小管上皮細(xì)胞EMT,值得進(jìn)一步研究。

大鼠腎小管上皮細(xì)胞 腎小管上皮轉(zhuǎn)分化 轉(zhuǎn)化生長因子-β1 microRNA

腎間質(zhì)纖維化(renal interstitial fibrosis,RIF)的基本病理特征是細(xì)胞外基質(zhì)(extracellular matrix,ECM)在腎間質(zhì)大量堆積。腎小管上皮細(xì)胞-肌成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)分化(epithelial-myofibroblast transdifferentiation,EMT)是造成ECM堆積的主要原因之一。目前已有一些動(dòng)物實(shí)驗(yàn)顯示部分miRNA參與腎小管上皮細(xì)胞EMT。我們在前期的動(dòng)物體內(nèi)實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)上,以體外培養(yǎng)的大鼠腎小管上皮細(xì)胞(NRK-52E)為研究對象,在轉(zhuǎn)化生長因子-β1(transforming growth factor-β1,TGF-β1)作用下,觀察miR-132、miR-21、miR-10b、miR-200b、miR-192和miR-30d這6條miRNA在NRK-52E發(fā)生EMT過程中的改變,以期認(rèn)識這些miRNA是否參與調(diào)控腎小管上皮細(xì)胞分泌ECM的過程。

1 材料和方法

1.1 材料和試劑 NRK-52E(購自中科院上海細(xì)胞庫),DMEM高糖培養(yǎng)液、0.25%胰蛋白酶-EDTA和胎牛血清(均購自美國GIBCO公司),人類重組TGF-β1(購自美國R&D公司),Trizol提取液(購自美國Invitrogen公司),逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(購自加拿大MBI Fermentas公司),SYBR GreenⅠMix(購自美國Roche公司),Real time PCR引物(購自上海Invitrogen公司),α-SMA抗體及GAPDH抗體(購自美國Abcam公司),大鼠纖連蛋白ELISA試劑盒(購自上海西塘生物科技公司)。

1.2 NRK-52E的培養(yǎng) 用含8%胎牛血清的DMEM高糖培養(yǎng)液在37℃,5%CO2的孵育箱中培養(yǎng),0.25%胰蛋白酶消化,隔天換液,2~3 d傳代。

1.3 TGF-β1誘導(dǎo)轉(zhuǎn)分化 細(xì)胞接種于培養(yǎng)皿后,生長至50%~60%融合狀態(tài)時(shí),換成無血清DMEM高糖培養(yǎng)液同步化處理16h,用含5ng/ml TGF-β1的DMEM高糖培養(yǎng)液分別培養(yǎng)0、3、6、12、24、48h,將TGF-β1作用0h的細(xì)胞設(shè)為空白對照組(BC組),將TGF-β1作用3、6、12、24、48h的細(xì)胞設(shè)為TGF-β1組。

1.4 real-time PCR檢測α-SMA、E-cad、Col I、FN的miRNA表達(dá)水平 分別于TGF-β1作用細(xì)胞0、3、6、12、24h時(shí)在培養(yǎng)皿中加入1 ml Trizol裂解細(xì)胞,氯仿萃取,異丙醇濃縮過夜,得總RNA,分光光度計(jì)測RNA純度,甲醛變性凝膠電泳質(zhì)檢RNA質(zhì)量。取1μg總RNA,按照Fermentas Reverse Transcription Kit逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,再用Roche LightCycler 480實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)條件:95℃5min預(yù)變性,95℃10s變性,58℃10s退火,72℃10s延伸,45個(gè)循環(huán)。技術(shù)重復(fù)3次,生物學(xué)重復(fù)6次。以GAPDH為內(nèi)參進(jìn)行歸一化。樣品目的基因的相對表達(dá)率采用△△Ct方法計(jì)算,目的基因的相對量=

1.5 Western blot法檢測細(xì)胞內(nèi)α-SMA表達(dá)水平 分別于TGF-β1作用細(xì)胞0、12、24、48h時(shí)裂解細(xì)胞提取蛋白,BCA法測蛋白濃度,各組上樣30μg行10%SDSPAGE電泳,轉(zhuǎn)膜,5%脫脂牛奶封閉2h,一抗(α-SMA抗體1∶500)4℃孵育過夜,TBS-T溶液洗膜3次,每次10min。室溫下加入IgG抗體(1∶4 000)孵育1.5h,洗膜3次,用Odyseyy近紅外雙色激光成像系統(tǒng)選擇800通道進(jìn)行掃描條帶,以GAPDH為內(nèi)參標(biāo)化α-SMA表達(dá),生物學(xué)重復(fù)6次,技術(shù)重復(fù)3次,用AlphaEaseFC凝膠成像分析軟件進(jìn)行半定量分析。

1.6 ELISA法檢測上清液中FN的含量 分別于TGF-β1作用細(xì)胞0、12、24、48h時(shí)收集細(xì)胞上清液,4℃,4 000g×5min離心,吸取上清液,用大鼠FN ELISA試劑盒檢測各濃度點(diǎn)的蛋白分泌量。生物學(xué)重復(fù)6次,技術(shù)重復(fù)3次。

1.7 莖環(huán)Real-time PCR檢測miRNA的表達(dá)水平 取1μg總RNA,按照Fermentas Reverse Transcription Kit加入逆轉(zhuǎn)錄莖環(huán)引物逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,再用Roche LightCycler 480實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)條件:95℃5min預(yù)變性,95℃10s變性,58℃10s退火,72℃10s延伸,45個(gè)循環(huán),技術(shù)重復(fù)3次,生物學(xué)重復(fù)6次。以U6 RNA為內(nèi)參進(jìn)行歸一化。樣品目的基因的相對表達(dá)率采用△△Ct方法計(jì)算,方法同上。

1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS16.0統(tǒng)計(jì)軟件,計(jì)量數(shù)據(jù)以表示,組間比較采用t檢驗(yàn)。

2 結(jié)果

2.1 NRK-52E形態(tài)學(xué)改變 TGF-β1作用0、3、6、12h,細(xì)胞呈腎小管上皮細(xì)胞原有的卵圓形“鋪路石”形狀;TGF-β1作用24h,部分細(xì)胞拉長呈梭形改變;TGF-β1作用48h,更多細(xì)胞呈梭形改變,部分細(xì)胞凋亡,見圖1。

2.2 α-SMA、E-cad、Col I和FN的mRNA表達(dá)水平的變化 與BC組比較,TGF-β1組各時(shí)點(diǎn)細(xì)胞內(nèi)肌成纖維細(xì)胞標(biāo)志物α-SMA的mRNA表達(dá)上調(diào)而上皮細(xì)胞標(biāo)志物E-cad的mRNA表達(dá)均下調(diào)(均P<0.05);細(xì)胞內(nèi)Col I和FN的mRNA的表達(dá)均上調(diào)(均P<0.05),且呈時(shí)間依賴性,見表1。

表1 TGF-β1作用不同時(shí)間NRK-52E細(xì)胞內(nèi)α-SMA、E-cad、Col I和FN的mRNA的表達(dá)水平變化

2.3 細(xì)胞內(nèi)α-SMA表達(dá)水平的變化 與BC組比較,TGF-β1組各時(shí)點(diǎn)細(xì)胞內(nèi)α-SMA的表達(dá)量均明顯升高(均P<0.05),在TGF-β1作用24 h時(shí)達(dá)峰值2.24±0.55,見圖2。

圖1 TGF-β1作用不同時(shí)間NRK-52E的形態(tài)改變

圖2 TGF-β1作用不同時(shí)間NRK-52E內(nèi)α-SMA的表達(dá)水平變化

2.4 上清液FN含量的變化 上清液FN含量0h為1.0±0,12、24、48h分別為1.11±0.03、1.32±0.20、1.55±0.15。與BC組比較,TGF-β1組上清液FN的含量均明顯升高(均P<0.05),且呈時(shí)間依賴性。

2.5 miRNA的表達(dá)水平變化 與BC組比較,TGF-β1組6條miRNA的表達(dá)均存在差異。TGF-β1作用3、6、12、24h后,miR-30d、miR-132和miR-21的表達(dá)上調(diào),其中miR-30d和miR-132表達(dá)上調(diào)呈時(shí)間依賴性(P<0.05);miR-200b、miR-192和miR-10b的表達(dá)均下調(diào),其中miR-192在TGF-β1作用12h達(dá)最低值(P<0.05),見表2。

3 討論

我們在前期工作中通過大鼠單側(cè)輸尿管梗阻(UUO)及5/6腎切除兩種RIF模型,采用real-time PCR法篩選了與RIF相關(guān)的部分miRNA,其中比較一致的6條miRNA(miR-30d、miR-132、miR-21、miR-200b、miR-192和miR-10b)被選為本研究篩選對象[1]。

表2 TGF-β1作用不同時(shí)間miRNA在NRK-52E細(xì)胞內(nèi)表達(dá)水平的比較

本研究中TGF-β1組部分細(xì)胞肥大,拉長,失去原有的鵝卵石形態(tài),向成纖維細(xì)胞特有的梭形發(fā)展,細(xì)胞內(nèi)上皮細(xì)胞黏附分子E-cad的mRNA表達(dá)明顯下降,肌成纖維細(xì)胞標(biāo)志物α-SMA的mRNA表達(dá)明顯上調(diào),以及纖維化指標(biāo)ColⅠ和FN的mRNA表達(dá)均上調(diào)且呈時(shí)間依賴性,細(xì)胞內(nèi)α-SMA表達(dá)水平升高和上清液中FN含量升高,以上各點(diǎn)提示本實(shí)驗(yàn)造模成功,證實(shí)TGF-β1可誘導(dǎo)體外培養(yǎng)的NRK-52E發(fā)生轉(zhuǎn)分化,促進(jìn)合成和分泌ECM。

本研究TGF-β1組有3條miRNA(miR-30d、miR-132、miR-21)表達(dá)上調(diào),3條miRNA(miR-200b,miR-192、miR-10b)表達(dá)下調(diào),其中miR-30d和miR-132的表達(dá)變化,與ColⅠ和FN的mRNA的表達(dá)一樣,都具有TGF-β1作用的時(shí)間依賴性。提示這些miRNA參與TGF-β1誘導(dǎo)體外培養(yǎng)的NRK-52E轉(zhuǎn)分化發(fā)生過程,促進(jìn)ECM的合成和分泌。

miR-132表達(dá)受cAMP反應(yīng)元件結(jié)合蛋白(CREB)調(diào)控[2]。Kriegel等[3]研究發(fā)現(xiàn)人腎小管上皮細(xì)胞經(jīng)TGF-β1刺激后miR-132表達(dá)上調(diào);Stachurska等[4]研究顯示在赭曲霉素A作用下,豬腎近曲小管細(xì)胞(LLC-PK1)內(nèi)TGF-β1和TGF-β2的miRNA和miR-132表達(dá)均上調(diào),而抑制miR-132表達(dá)可抑制TGF-β2 miRNA表達(dá),均提示miR-132促纖維化。我們前期的研究結(jié)果顯示,在大鼠UUO和5/6腎切除模型腎組織中miR-132均呈高表達(dá)[1],用TGF-β1作用大鼠腎間質(zhì)成纖維細(xì)胞(NRK-49F)后,miR-132及ColⅠmRNA表達(dá)上調(diào),轉(zhuǎn)染miR-132類似物至NRK-49F可上調(diào)ColⅠmRNA的表達(dá),提示miR-132促進(jìn)RIF[5]。本研究中TGF-β1組miR-132呈高表達(dá),且與ColⅠ和FN的mRNA表達(dá)上調(diào)一樣,具有TGF-β1作用的時(shí)間依賴性,推測miR-132通過作用EMT相關(guān)的靶基因參與EMT的調(diào)控,其中miR-132與ColⅠ和FN的相關(guān)性值得進(jìn)一步研究。

關(guān)于miR-30d的研究則集中于腫瘤領(lǐng)域[6-9]。EMT作為腫瘤細(xì)胞發(fā)生和轉(zhuǎn)移的重要分子機(jī)制,在腫瘤細(xì)胞的形態(tài)改變、遷移、侵襲等生物學(xué)行為中起關(guān)鍵作用。Yao等[8]研究發(fā)現(xiàn)miR-30d通過靶向抑制腫瘤抑制基因GNAI2促進(jìn)肝癌細(xì)胞的遷移和侵襲。另有研究發(fā)現(xiàn)發(fā)生淋巴轉(zhuǎn)移的聲門上型喉鱗癌患者腫瘤組織中miR-30d表達(dá)高于無淋巴轉(zhuǎn)移的同類患者[9]。上述發(fā)現(xiàn)均提示miR-30d可能在腫瘤轉(zhuǎn)分化中起正向調(diào)節(jié)作用。本研究中miR-30d在TGF-β1組呈高表達(dá)且與ColⅠ和FN的miRNA表達(dá)一樣具有TGF-β1作用的時(shí)間依賴性,亦提示miR-30d正向調(diào)節(jié)上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)分化。通過Targetscan、miRbase和pictar預(yù)測miR-30d相關(guān)靶基因,提示膠原蛋白可能為其候選靶基因,miR-30d與ColⅠ的關(guān)系有待進(jìn)一步探索。

Xiong等[10]用TGF-β1誘導(dǎo)NRK-52E轉(zhuǎn)分化的研究顯示TGF-β1通過Smad信號傳導(dǎo)通路上調(diào)miR-21的表達(dá);將miR-21類似物轉(zhuǎn)染至NRK-52E可誘導(dǎo)轉(zhuǎn)分化,而用miR-21抑制物能夠阻斷TGF-β1誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)分化。而miR-200家族(包括miR-200a、miR-200b、miR-200c、miR-141、miR-429)在TGF-β1作用下表達(dá)均下調(diào)。轉(zhuǎn)染miR-200類似物至NRK-52E能抑制TGF-β1誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)分化;相反,用miR-200抑制劑降低miR-200的表達(dá)能誘導(dǎo)NRK-52E轉(zhuǎn)分化。本研究中TGF-β1組miR-21呈高表達(dá),而miR-200b呈低表達(dá),與Xiong等的研究結(jié)果一致,提示miR-21促進(jìn)EMT,而miR-200b抑制EMT。

miR-192是腎臟特異表達(dá)的miRNA,其與EMT的關(guān)系尚存爭議。既往研究顯示,miR-192通過作用ZEB1和Smad-作用蛋白1(SIP1,又稱ZEB2)的miRNA調(diào)控膠原的產(chǎn)生,促進(jìn)TGF-β1誘導(dǎo)的EMT[11];而近年有研究發(fā)現(xiàn),TGF-β1使人腎小管上皮細(xì)胞miR-192表達(dá)下調(diào),而過表達(dá)miR-192可拮抗TGF-β1的促轉(zhuǎn)分化作用[12]。我們在大鼠UUO模型組發(fā)現(xiàn)miR-192呈低表達(dá)且與腎小管間質(zhì)病變負(fù)相關(guān)[1],且本研究中miR-192在TGF-β1作用下表達(dá)下調(diào),均支持miR-192抑制轉(zhuǎn)分化的觀點(diǎn)。關(guān)于miR-10b的研究主要涉及腫瘤領(lǐng)域[13-16],其與纖維化的關(guān)系未見報(bào)道。既往研究顯示miR-10b促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)分化[13-14],提示miR-10b參與腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)分化且起正向調(diào)節(jié)作用。但在我們前期大鼠UUO體內(nèi)模型中,腎組織miR-10b在術(shù)后3 d表達(dá)下調(diào)[1],且在本研究體外模型中TGF-β1作用下miR-10b表達(dá)下調(diào),均提示miR-10b抑制腎小管上皮轉(zhuǎn)分化,與其在腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)分化中的作用相反,可能為miR-10b在不同類型的EMT中作用機(jī)制不同,其與EMT的關(guān)系有待進(jìn)一步研究與明確。

綜上所述,在TGF-β1誘導(dǎo)的NRK-52E轉(zhuǎn)分化的模型中,大鼠腎小管上皮細(xì)胞內(nèi)miR-30d、miR-132、miR-21、miR-200b、miR-192和miR-10b存在較為明顯的差異表達(dá),而且伴隨纖連蛋白在細(xì)胞內(nèi)外表達(dá)量增加,提示以上microRNA參與大鼠EMT的發(fā)生、發(fā)展過程,影響大鼠腎小管上皮細(xì)胞合成和分泌ECM,其具體的作用機(jī)制有待進(jìn)一步探討。

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Screening of microRNA related to epithelial-myofibroblast transdifferentiation of renal tubular cells

Objective To screen microRNA(miRNA)related to epithelial-myofibroblast transdifferentiation(EMT)of renal tubular epithelial cells.MethodsNormal rat kidney tubular epithelial NRK-52E cells were cultured and stimulated with 5 ng/ml TGF-β1 for 0,3,6,12,24 and 48h.Morphological changes of NRK-52E cells were observed with inverted phase contrast microscope at different time points after stimulation.The expression of α-smooth muscle actin(α-SMA)mRNA,E-cadherin (E-cad)mRNA,collagen I(Col I)mRNA and fibronectin(FN)mRNA was detected with real time qPCR.Western blot was performed to analyze the expression of α-SMA and ELISA was used to quantitatively detect the FN in the supernatant.Six selected miRNAs were examined by stem-loop real-time qPCR.ResultsSome NRK-52E cells underwent morphological changes after stimulation of TGF-β1,changed from typical cobblestone shape to spindle-like in appearance.Compared with BC group,the expression of α-SMA mRNA,Col I mRNA and FN mRNA was enhanced after stimulation of TGF-β1(P<0.05),while the expression of E-cadherin mRNA was decreased(P<0.05).The α-SMA content in cells and FN content in supernatant was significantly increased(P<0.05)after the stimulation of TGF-β1.Compared with BC group,miR-30d,miR-132 and miR-21 were up-regulated(P<0.05),while miR-200b,miR-192 and miR-10b were down-regulated(P<0.05).ConclusionEMT of NRK-52E cells can be induced by TGF-β1 stimulation.miR-30d,miR-132,miR-21,miR-200b,miR-192 and miR-10b may be related to EMT in renal tubular cells.

NRK-52E Epithelial-myofibroblast transdifferentiation Transforming growth factor-β1 miRNA

2014-01-06)

(本文編輯:沈叔洪)

溫州市科技計(jì)劃項(xiàng)目(Y20080116);浙江省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(Y12H050017);浙江省醫(yī)藥衛(wèi)生科技計(jì)劃項(xiàng)目(NO.2010KYA135)

325000 溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院腎內(nèi)科(邵駕宇、章慧娣、尤小寒、黃朝興);溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院心血管內(nèi)科(潘嘉林);溫州醫(yī)科大學(xué)微生物免疫學(xué)教研室(薛向陽)

黃朝興,E-mail:huangzhaoxing@medmail.com.cn

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