劉 琳,郝曉明,董 會,歐 元,趙興春,葉 健
(1.中國人民公安大學,北京100038;2.重慶市公安局巴南區(qū)分局,重慶401320;3.法庭科學生物芯片工程實驗室,北京 100038;4.公安部物證鑒定中心,北京 100038)
自20世紀90年代以來,以PCR-STR技術(shù)為代表的第二代法醫(yī)DNA分型技術(shù)在司法實踐中的應(yīng)用日益廣泛,整個DNA分型過程包括DNA提取、定量、PCR擴增和電泳檢測與分析,其中DNA提取與PCR擴增是兩個重要的限速步驟,常規(guī)方法難以滿足DNA數(shù)據(jù)庫規(guī)模不斷擴大和緊急案件檢驗的需求。本文選用AmpF?STRIdentifilerPlus試劑盒與TaKaRa公司的快速PCR試劑盒聯(lián)合建立快速直接PCR(Rapid Direct PCR[1])反應(yīng)體系,采用免提取的方式,以FTA血卡為模板,采用經(jīng)優(yōu)化的熱循環(huán)參數(shù)在快速PCR儀上完成擴增,對如何縮短DNA分型檢測的時間進行了初步探討。
FTA血卡樣本(公安部物證鑒定中心提供)
1.3.1 快速直接PCR擴增
實驗分為四組,第一組:10 μL反應(yīng)體系,直徑0.5 mm FTA血卡為模板;第二組:10 μL反應(yīng)體系,直徑1.0mm FTA血卡為模板;第三組:20 μL反應(yīng)體系,直徑0.5 mm FTA血卡為模板;第四組:20 μL反應(yīng)體系,直徑1.0mm FTA血卡為模板。
四組所用熱循環(huán)參數(shù):95℃ 3 min;95℃ 10 s,59℃ 15 s,72℃ 20 s,29 個循環(huán);72℃ 3 min;25℃保存。擴增總用時55min。
1.3.2 常規(guī)直接PCR擴增
取上述各PCR擴增產(chǎn)物1μL分別與10μL上樣混合物(20μL GeneScan LIZ500內(nèi)標 +1000μL去離子甲酰胺)混合,用3130XL遺傳分析儀,按標準流程進行電泳分離,采用GeneMapper ID V 3.2軟件進行基因分型。
圖1 10μL反應(yīng)體系,直徑0.5mm FTA血卡為模板
如何縮短DNA分型檢測時間一直是法醫(yī)界學者們研究的焦點之一,例如,Verheij[2]等在 2012年將Thermo快速PCR試劑盒與AmpF?STRSGM PlusTM、AmpF?STRIdentifiler、AmpF?STRSEfilerPlusTM、AmpF?STRNGMTM分別組合,探索快速直接PCR擴增在法庭科學領(lǐng)域的應(yīng)用。
圖2 10μL反應(yīng)體系,直徑1.0mm FTA血卡為模板
圖3 20μL反應(yīng)體系,直徑0.5mm FTA血卡為模板
參考文獻:
[1]Aboud M,Oh HH,McCord B.Rapid Direct PCR for Forensic genotyping in under 25 minutes[J].Electrophoresis,2013,34(11):1539-1547.
[2]Verheij S, Harteveld J, Sijen T.A protocol for direct and rapid multiplex PCR amplification on forensically relevant samples[J].Forensic Science International: Genetics, 2012,6(2):167-75.