李咪咪 劉洪梅 張帆 梁衛(wèi)紅
摘要:以日本晴(Wt)和光敏色素A、B的突變體(phyA,phyB)3個水稻(Oryza stiva L.)粳稻品種為試材,檢測其在生長發(fā)育過程中葉片組織的葉綠素含量,并采用半定量RT-PCR和實時定量PCR技術,檢測水稻MAPK基因OsMPK14在葉片中的表達特性。結果表明,在水稻生長發(fā)育過程中,光敏色素A和B的突變葉片葉綠素含量呈下降趨勢;表達模式分析顯示,OsMPK14基因在3個水稻品種的葉片中具有不同水平的表達,在Wt和phyA植株葉片中的表達呈現(xiàn)出波動性,而在phyB中隨著生長進程的延續(xù)呈上升趨勢。
關鍵詞:水稻(Oryza stiva L.);光敏色素突變體;OsMPK14基因;葉綠素含量;表達特性
中圖分類號:S511;Q75 文獻標識碼:A 文章編號:0439-8114(2014)05-1178-04
對高等植物來說,光不僅能決定植物的光合作用,而且是調控植物生長發(fā)育和代謝活動的重要環(huán)境信號分子[1]。對于生長環(huán)境中光條件的變化,高等植物主要是利用光敏色素(Phytochromes,phy)、隱花色素(Cryptochromes)和向光素(Phototropins)這三種光受體,通過一系列復雜的信號轉導反應來調節(jié)自身的生長發(fā)育,最終適應周圍環(huán)境的變化[1-4]。
光敏色素主要感受紅光和遠紅光信號[3,5]。水稻(Oryza stiva L.)中一共有3個編碼光敏色素的基因,即PHYA、PHYB和PHYC,它們都是單拷貝且均位于水稻的第3號染色體上[1,4]。利用反轉座子和γ射線誘變的方法,Takano等[5]研究獲得了水稻光敏色素A和B的突變體。已有研究表明,水稻光敏色素在水稻幼苗去黃化[3,6,7]、根的伸長[8]和向地性[7]、植株形態(tài)[9]等發(fā)育過程中起重要作用。
MAPK是一類存在于所有真核生物中、高度保守的絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶。MAPK和其上游的MAPKK(MAPK激酶)、MAPKKK(MAPKK激酶)共同組成一條重要的信號傳遞途徑。研究顯示,MAPK 級聯(lián)反應參與植物的生長發(fā)育[10]、生物及非生物脅迫反應[11,12]、激素應答[13]、細胞分化和發(fā)育調控[10,14]等生命過程。但是,有關光敏色素光信號在調節(jié)MAPK基因表達方面的研究尚未見報道。
全基因組序列預測分析表明,水稻中有17種MAPK基因,分別被命名為OsMPK1~OsMPK17,并將其劃分為A~F 6組[15]。研究表明,MAPK參與水稻生物和非生物脅迫應答以及水稻生長發(fā)育過程[16],如OsMKK4-OsMPK3/OsMPK6可通過調節(jié)生物合成基因的表達,從而產生雙萜類植物抗毒素[17]。在水稻生長發(fā)育后期,OsMPK4基因的表達量在葉、根和幼穗中都有所增加[18,19]。Jeong等[20]研究發(fā)現(xiàn)OsMPK7基因在水稻根中有很強的組成型表達。
河南師范大學植物生長發(fā)育調控實驗室采用序列拼接和RT-PCR技術,克隆了水稻OsMPK14基因完整的cDNA編碼區(qū),表達模式分析顯示,該基因在水稻不同組織中廣泛且差異表達,且在地上部分的表達可能受光照的負調控[21]。為了深入研究該基因在水稻整個生長發(fā)育過程中的表達特性,以及與光敏色素光信號通路之間的關系,本研究以水稻粳稻品種日本晴(Oryza sativa L.,Japonica cv. Nipponbare)和光敏色素A、B的突變體為材料,分別采用半定量RT-PCR和實時定量PCR技術,分析了OsMPK14基因在葉片中的表達特性,旨在了解在水稻發(fā)育過程中光敏色素光信號通路對OsMPK14基因表達的影響。
1 材料和方法
1.1 供試材料
粳稻品種日本晴野生型(簡稱Wt)、具有日本晴遺傳背景的光敏色素A突變體(phyA)和光敏色素B突變體(phyB),由山東省農業(yè)科學院高新技術研究中心謝先芝研究員饋贈。
1.2 供試試劑
PCR相關試劑和總RNA提取試劑TRNzol[天根生化科技(北京)有限公司]、M-MLV反轉錄酶(Promega生物技術有限公司)、DNaseⅠ酶(Fermentas 生物技術有限公司)、PrimeScript?誖 RT Enzyme Mix Ⅰ和SYBR?誖 Premix Ex TaqTM[寶生物工程(大連)有限公司]。
1.3 方法
用75%乙醇將水稻種子完全消毒后,于2012年5月3日點種于河南師范大學生物試驗園地,30、60、90 d時取植株頂部完全伸展且無任何損傷的葉片,用于葉綠素含量的測定和總RNA的提取。
1.3.1 葉綠素含量的測定 利用乙醇法[22]萃取葉綠素,并于722N型可見光分光光度計上測定萃取液在波長645 nm和663 nm下的吸光度,分別按照以下公式計算。
葉綠素A濃度(Ca,mg/L)=13.95A663 nm-6.88A645 nm
葉綠素B濃度(Ca,mg/L)=24.96A645 nm-7.32A663 nm
總葉綠素濃度(Ca,mg/L)=葉綠素A濃度+葉綠素B濃度
葉綠素含量(mg/g)=(葉綠素濃度×提取液體積×稀釋倍數(shù))/樣品鮮重
1.3.2 總RNA的提取 按TRNzol試劑說明書,提取水稻葉片總RNA,并通過DNA快速電泳檢測總RNA質量,并根據A260 nm/A280 nm比值確定其純度及濃度。
1.3.3 半定量RT-PCR檢測 按M-MLV反轉錄酶說明書進行cDNA的合成。采用25 μL反轉錄體系,反應體系:1 μL Oligo(dT)15(0.5 μg/μL)、0.63 μL RNA酶抑制劑(40 U/μL )、5 μL dNTP Mix(10 mmol/L)和 M-MLV RT Buffer(5×)、1 μL M-MLV RT(200 U/μL)、總RNA取1 μg,補加RNase-free 水至25 μL。
以水稻肌動蛋白基因OsAct1作為內參進行半定量RT-PCR,所用引物為P1/P2(表1)。PCR擴增條件:94 ℃預變性 1 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,24個循環(huán);72 ℃終延伸5 min。OsMPK14擴增引物為P3/P4(表1)。PCR擴增條件:94 ℃預變性 1 min;94 ℃變性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸45 s,24個循環(huán);72 ℃終延伸5 min。以1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR擴增產物。
1.3.4 qRT-PCR檢測 采用40 μL反轉錄體系合成cDNA,反應體系2 μL Oligo(dT)15(50 μmol/L)和隨機6聚引物(100 μmol/L)、8 μL PrimeScript?誖 Buffer(5×)、2 μL PrimeScript?誖RT Enzyme Mix Ⅰ、總RNA不超過2 μg,補加RNase-free 水至40 μL。
以水稻肌動蛋白基因OsAct1作為內參,所用引物為P5/P6,OsMPK14基因擴增引物為P7/P8(表1)。采用20 μL的反應體系:10 μL SYBR?誖Premix Ex TaqTM(2×)、0.4 μL PCR引物(10 μmol/L)、
0.4 μL ROX Reference Dye Ⅱ(50×)、2 μL cDNA模板、6.8 μL滅菌雙蒸水。采用兩步法PCR擴增標準程序:95 ℃預變性30 s;95 ℃變性5 s,60 ℃退火34 s,進行40個循環(huán)。每個樣品做3次平行反應。
1.3.5 數(shù)據分析 數(shù)據統(tǒng)計和顯著性分析采用SPASS V13軟件。qRT-PCR數(shù)據分析采用SDS Software v 1.4軟件,以2-△△Ct法分析OsMPK14基因表達水平。
2 結果與分析
2.1 3個水稻品種生長發(fā)育過程中葉綠素含量
隨著水稻的生長發(fā)育,野生型Wt和光敏色素突變體phyA、phyB水稻葉片中的葉綠素含量均呈現(xiàn)不同的下降,但是在同一時期3個品種葉片中葉綠素含量有一定的差異。其中突變體phyA的葉綠素含量在30 d時低于野生型Wt,但在60 d和90 d時則高于野生型Wt。突變體phyB水稻葉片中的葉綠素含量在3個時期均高于野生型Wt和突變體phyA。
2.2 OsMPK14基因在3個水稻品種葉片中的表達特性
以組成型表達的水稻肌動蛋白基因OsAct1為內參,通過半定量RT-PCR檢測OsMPK14基因在日本晴Wt、phyA和phyB 3個水稻品種30、60、90 d時地上部分的時空表達特性(圖2)。結果表明,OsMPK14基因在Wt、phyA和phyB水稻葉片中都有表達,但表達水平存在差異。其中30 d時該基因在phyA中的表達量明顯高于其他2個品種。
進一步采用qRT-PCR定量檢測OsMPK14基因的表達差異(圖3)。從圖3可以看出,OsMPK14基因在3個水稻品種葉片中廣泛表達,且整體變化趨勢與半定量RT-PCR的檢測結果基本一致。OsMPK14基因在Wt發(fā)育的不同時期表達量沒有明顯的變化,在phyA發(fā)育的不同時期呈現(xiàn)出先降低后升高的趨勢,其中在30 d的水稻葉片中,OsMPK14基因在phyA中的表達量是在另外2個品種中表達量的2.7倍、4.2倍。而該基因在phyB發(fā)育的不同時期表達量則呈持續(xù)升高的趨勢。
3 小結與討論
光敏色素信號轉導途徑中的第二信使有G蛋白、Ca2+、cGMP、二脂酰甘油和IP3等,可誘導葉綠素和花青素生物合成酶基因的表達[23]。有研究表明,擬南芥中的光敏色素B可參與調節(jié)葉綠素的合
成[24]。在水稻中光敏色素B感受紅光正調控葉綠素的合成,且光敏色素A和B存在功能上的冗余[25]。本研究通過比較3個水稻品種在3個典型時期葉綠素的含量,發(fā)現(xiàn)phyA基因在水稻發(fā)育早期正調控葉綠素含量,在發(fā)育中、后期則負調控葉綠素含量,但是從整體來看phyA突變使水稻葉綠素含量的下降幅度沒有野生型下降幅度大。突變體phyB的葉綠素含量在3個時期均高于野生型和突變體phyA,這表明phyB基因在整個發(fā)育過程中負調控葉綠素的含量。葉綠素的含量受葉綠素分解代謝和合成代謝的雙重調控,葉綠素含量的變化與葉綠素代謝的哪個途徑有關,有待進一步研究。
MAPK作為MAPK級聯(lián)反應的重要組成部分,在應答多種信號中起重要作用。研究表明,MAPK可能參與水稻多種不同生長發(fā)育過程[18, 19, 26]。例如,OsMPK2基因在水稻幼苗所有組織中均有表達,但成熟期僅在花器官中表達[27],OsMPK8基因則在葉中表達水平較高[19]。本研究結果表明,日本晴水稻中OsMPK14基因在葉片中廣泛表達,且表達水平維持相對穩(wěn)定的狀態(tài),說明該基因與葉片生長發(fā)育密切相關。
光照和OsMPK14基因表達之間有一定的關
聯(lián)[21],但是紅光和遠紅光信號對該基因表達的影響尚不清楚,而且水稻光敏色素信號通路與MAPK級聯(lián)反應之間的聯(lián)系鮮見報道。本研究采用具有日本晴遺傳背景的光敏色素A和B突變體,比較了OsMPK14基因在突變體中的表達特性。結果表明,這2種光敏色素的突變對該基因在葉片中的表達有不同的影響。突變體phyA中,OsMPK14基因在幼苗期(30 d)表達量顯著高于對照日本晴,是其2.7倍,說明phyA的突變對該基因的表達在發(fā)育早期是促進效應,這一特點也體現(xiàn)在成熟期(90 d,1.7倍);但在營養(yǎng)生長向生殖生長轉換期,phyA突變對該基因的影響不顯著。而光敏色素B的突變體phyB在水稻幼苗期時表現(xiàn)為對OsMPK14基因表達的抑制效應,表達量是對照日本晴的60%,當水稻由營養(yǎng)生長向生殖生長轉換并且逐漸成熟時,phyB的突變對該基因的表達則為促進效應,分別是其1.2倍和1.6倍。說明由紅光/遠紅光通過光敏色素受體介導的信號通路對OsMPK14基因表達的調控具有發(fā)育時期的特異性,且phyA和phyB的作用機制不同,而光對OsMPK14基因表達的調控機制十分復雜,其內在機制尚需深入研究。
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