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巢式-PCR檢測(cè)蜱體中土拉弗氏菌的fopA基因及血清學(xué)調(diào)查*

2014-11-10 06:40李志清劉增加上官改珍瑩巨李旭光胡良煜
關(guān)鍵詞:亞種氏菌陜西省

李志清 劉增加 上官改珍 何 瑩巨 敏 李旭光 胡良煜 徐 燕

(1.解放軍第323醫(yī)院,西安 710054; 2.蘭州軍區(qū)疾病預(yù)防控制中心,蘭州 730020)

土拉菌病又稱“野兔熱”,是由土拉弗氏菌Francisellatularensis經(jīng)患病野生動(dòng)物、吸血節(jié)肢動(dòng)物或遭受污染的水或食物傳播的一種自然疫源性疾病,呈世界性分布(Dennisetal., 2001; T?rnviketal., 2003)。土拉弗氏菌在自然界的宿主主要包括節(jié)肢類和哺乳類動(dòng)物,如:蜱類、野兔類、鼠類等(Fulopetal., 1996)。在中國(guó),土拉弗氏菌最早在1957年從黃鼠體內(nèi)就分離得到。1959年黑龍江省報(bào)道了第一起人間感染野兔熱(康成貴,1980)。隨后證實(shí)西藏、新疆、甘肅等地存在土拉弗氏菌病的自然疫源地(郭從厚等,1981;孔昭敏等,1984;劉增加等,1995)。陜西省地處西北地區(qū)中部,與甘肅省毗鄰,生態(tài)環(huán)境、自然資源與甘肅省十分相像,然而,陜西省并未開展此方面的研究,目前尚不清楚該病是否在陜西省存在。為此,2012年4月至2013年8月我們對(duì)陜西省部分地區(qū)土拉弗氏菌的自然感染作了調(diào)查研究,首先應(yīng)用巢式PCR技術(shù)對(duì)蜱體內(nèi)攜帶土拉弗氏菌進(jìn)行檢測(cè),以了解陜西省蜱體中自然感染土拉弗氏菌的狀況,同時(shí)收集調(diào)查地區(qū)人群的血清標(biāo)本進(jìn)行血清學(xué)檢測(cè),以明確人群血清土拉弗氏菌的抗體狀況。此外,我們應(yīng)用短串聯(lián)重復(fù)序列(Short sequence tandem repeat, SSTR)多態(tài)性對(duì)檢測(cè)陽(yáng)性的標(biāo)本進(jìn)行基因分型,結(jié)合流行病學(xué)資料研究基因型與地理分布、媒介蜱種等方面的關(guān)系,為陜西省土拉弗氏菌病的分子流行病學(xué)研究奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 病原分子生物學(xué)檢測(cè)

1.1.1標(biāo)本采集:調(diào)查地點(diǎn):陜西省調(diào)查點(diǎn)包括富縣、隴縣,屬于子午嶺山區(qū)。蜱標(biāo)本的采集:采用布旗法收集游離蜱標(biāo)本,分類鑒定后保存待用。血標(biāo)本的采集:采集當(dāng)?shù)鼐用裱簶?biāo)本,在知情同意的情況下,從被調(diào)查對(duì)象肘靜脈處采靜脈血5 mL,靜置或離心分離出血清后置4℃冰箱待檢。

1.1.2病原體DNA的提取: 蜱標(biāo)本中病原體DNA的提取,將已定種的單只蜱標(biāo)本,用75%酒精浸泡20 min,用無(wú)菌濾紙吸干,用生理鹽水漂洗3次,用無(wú)菌濾紙吸干蜱體表水份,置EP管中,加入DNA提取緩沖液 (10 mmol/L Tris, pH 8.0, 2 mmol/L EDTA, 0.1% SDS, 500 μg of proteinase K/mL) 200 μL,用滅菌的槍頭進(jìn)行充分研磨,置56 ℃孵育2 h,置100 ℃水中煮10 min,移至4 ℃離心機(jī)中,5 000 r/ min 離心5 min,上清液于- 20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.1.3PCR擴(kuò)增: 標(biāo)本使用4對(duì)引物檢測(cè)(表1),其中FNA8L/FNA2L及FNA7L/FNA1L為兩對(duì)巢式PCR引物,擴(kuò)增土拉弗菌的fopA基因(Fulopetal., 1996);C6/C8引物為種特異性引物,通過擴(kuò)增片段的長(zhǎng)度不同來區(qū)分土拉弗菌A、B兩亞種。對(duì)fopA基因擴(kuò)增陽(yáng)性的標(biāo)本采用9F/9R引物擴(kuò)增土拉弗氏菌基因中的SSTR9區(qū)進(jìn)行基因型擴(kuò)增。所用引物由TaKaRa公司合成。所有擴(kuò)增均在ABI2700 PCR儀上進(jìn)行。

表 檢測(cè)用引物序列及PCR反應(yīng)條件Tab.1 Primers and PCR condition used in the study

* A亞種擴(kuò)增片段長(zhǎng)度為250 bp,B亞種為220 bp。

1.2 血清學(xué)檢測(cè)

在采樣地點(diǎn)收集當(dāng)?shù)鼐用竦难鍢?biāo)本,進(jìn)行血清學(xué)檢測(cè)。利用膠體金試紙條(軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所研制)檢測(cè)人群血清中土拉弗氏菌IgG抗體。

1.3 統(tǒng)計(jì)分析

應(yīng)用χ2檢驗(yàn)比較不同地區(qū)、不同媒介感染率的差異性,統(tǒng)計(jì)處理應(yīng)用SPSS (9.0)軟件。

2 結(jié)果

2.1 蜱中土拉弗氏菌的檢測(cè)

陜西省富縣、隴縣共采集3個(gè)蜱種:達(dá)吉斯坦革蜱Dermacentorqinghaiensis、日本血蜱Haemaphysalisjaponica、嗜群血蜱H.concinna,共1 116只蜱標(biāo)本。共有3個(gè)蜱種25只蜱標(biāo)本檢測(cè)陽(yáng)性(擴(kuò)增出400 bp左右片段,圖1),總陽(yáng)性率為2.24%。不同蜱種陽(yáng)性率有差別(χ2=20.91,P=0.00),其中以日本血蜱的陽(yáng)性率最高,達(dá)到15.39%(表2)。

2.2 土拉弗氏菌亞種鑒定

采用亞種特異性引物(C6/C8)對(duì)擴(kuò)增陽(yáng)性的標(biāo)本進(jìn)行土拉弗氏菌的亞種鑒定,所有陽(yáng)性標(biāo)

圖1 蜱標(biāo)本中土拉弗氏菌擴(kuò)增陽(yáng)性結(jié)果Fig. 1 The result of positive samples 1: 陰性對(duì)照;2~4,9~13:檢測(cè)陰性標(biāo)本; 5,7,8:檢測(cè)陽(yáng)性標(biāo)本,6:100 bp ladder Marker。 1: Negative control; 2-4,9-13: Negative sample; 5,7,8: Positive samples; 6: 100 bp ladder Marker.

表2 陜西省富縣、隴縣不同蜱種土拉弗氏菌感染檢測(cè)結(jié)果弗氏菌感染檢測(cè)結(jié)果Tab.2 Prevalence of F. tularensis in ticks

本擴(kuò)增出220 bp條帶。25份標(biāo)本中選取10份,其中達(dá)吉斯坦革蜱3份,日本血蜱2份、嗜群血蜱5份,進(jìn)行序列測(cè)序,獲得核酸序列,經(jīng)在檢索,與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中土拉弗氏菌holarctica 亞種參考菌株序列AF247690.2 100%同源。

2.3 陽(yáng)性標(biāo)本SSTR9位點(diǎn)的分析

SSTR9區(qū)域是一9 bp(AAAACAAAGAC、AATAAGGAT及AATAAAGAC三種組合方式)的重復(fù)單元,有不同的序列組合,但此位點(diǎn)雖然存在不同的序列組合,但其并不影響氨基酸的排列。對(duì)25份陽(yáng)性標(biāo)本進(jìn)行擴(kuò)增,其中5份標(biāo)本未擴(kuò)增出目的片段,20份標(biāo)本擴(kuò)增出目的片段。SSTR9區(qū)共有6種不同的拷貝數(shù)分別為7,8,9, 16,18及21(圖2)。這表明此位點(diǎn)存在6種不同的基因型,6種基因型中以拷貝數(shù)為9的占多數(shù)(40.00%)。

圖2 SSTR9區(qū)擴(kuò)增結(jié)果Fig. 2 The results of SSTR9 region 1:陰性對(duì)照;2:50 bp Marker; 3-8:不同基因型 1: Negative; 2: 50 bp Marker: 3-8: Different genotype.

2.4 基于SSTR9區(qū)序列陽(yáng)性標(biāo)本聚類分析

基于陽(yáng)性標(biāo)本的SSTR9區(qū)序列, 利用Plylip3. 63 軟件包中SEQBOOT 分析,重復(fù)數(shù)為1 000;然后采用Jukes-cantor 距離模式,選用Neighbor-Joining(NJ)建樹方法,依次運(yùn)用DNADIST、NEIGHBOR 和CON-SENSE 程序得到系統(tǒng)發(fā)生樹。20份標(biāo)本主要分為兩大群(圖3)。

圖3 基于SSTR9區(qū)的聚類分析Fig.3 The cluster analysis based on SSTR9 region

2.5 血清學(xué)檢測(cè)

陜西省富縣、隴縣土拉弗氏菌病血清流行病學(xué)調(diào)查共采集到當(dāng)?shù)鼐用裱鍢?biāo)本725份,檢測(cè)土拉弗氏菌病血清IgG抗體,陽(yáng)性者37份,陽(yáng)性率為5.10%(表3)。

表3 不同地區(qū)人群土拉弗氏菌病血清學(xué)檢測(cè)結(jié)果Tab.3 The seroprevelence of tularemia from different regions

3 討論

土拉弗氏菌傳染力、致病力強(qiáng),易于傳播,美國(guó)等許多西方國(guó)家已將其與炭疽、鼠疫、天花等一起列入A類生物恐怖病原,而我國(guó)一直未引起足夠重視。本研究首次在陜西省子午嶺山區(qū)從蜱中檢測(cè)到土拉弗氏菌DNA片段,并發(fā)現(xiàn)當(dāng)?shù)厝巳褐幸嘤懈腥菊?,這些證據(jù)在一定程度上說明陜西省可能存在土拉弗氏菌的自然疫源地,目前迫切需要從病原學(xué)、媒介、宿主動(dòng)物等多方面進(jìn)行詳盡的流行病學(xué)調(diào)查,以闡明該病在陜西的分布及流行病學(xué)特征;對(duì)疫源地應(yīng)進(jìn)行長(zhǎng)期監(jiān)測(cè),了解其變化情況,并采取積極的措施防患于未燃。

相關(guān)研究顯示土拉弗氏菌主要分布在北緯30°以北的廣大地區(qū)(Dennisetal., 2001),我國(guó)許多省區(qū)都位于該范圍之內(nèi),其中包括陜西省。本研究共調(diào)查檢測(cè)了4個(gè)蜱種1 117只蜱標(biāo)本,總陽(yáng)性率為2.24%,其中以日本血蜱的陽(yáng)性率為最高,達(dá)到15.39%,不可否認(rèn)的是此數(shù)據(jù)可能存在偏移,因其采集的數(shù)量有限,同時(shí)目前尚不能確定日本血蜱為其媒介,相關(guān)的傳播動(dòng)力學(xué)實(shí)驗(yàn)尚未開展,今后應(yīng)擴(kuò)大此蜱種的樣本量,并從傳播動(dòng)力學(xué)方面開展相關(guān)研究以闡明上述問題。

研究共采集到當(dāng)?shù)鼐用裱鍢?biāo)本725份,共有37份標(biāo)本顯示為陽(yáng)性,總陽(yáng)性率為5.10%,這說明當(dāng)?shù)鼐用裰写嬖谧匀桓腥镜那闆r,這在一定程度上更加說明了該病在陜西省的存在,一直沒有病例報(bào)告,究其原因可能一方面大多數(shù)人并不了解該病,其癥狀不典型而被誤診或漏診;另一方面,該病治療簡(jiǎn)單,對(duì)普通抗生素有效而未上報(bào)。事實(shí)上,該病在陜西省的存在并不奇怪,陜西省與甘肅省鄰近,兩地區(qū)的自然環(huán)境亦非常相似,而后者早就有該病的報(bào)道,今后應(yīng)系統(tǒng)地開展土拉弗氏菌病的相關(guān)研究。

土拉弗氏菌包括4個(gè)亞種, 各亞種在地理分布、宿主動(dòng)物、毒力及傳播途徑等流行病學(xué)特征方面差異較大。其中土拉弗氏菌土拉亞種即A亞種和土拉弗氏菌全北區(qū)即B亞種是主要的分離株,人間土拉菌病的爆發(fā)大多數(shù)與這兩個(gè)亞種有關(guān)。A亞種為高毒亞種,10個(gè)菌體即可引起人或動(dòng)物(如家兔)致病,幾乎嚴(yán)格分布于北美。B亞種毒力較A亞種弱,家兔對(duì)其敏感性較小,一般達(dá)109~1 010個(gè)/mL方可引起家兔死亡,B亞種主要分布在歐洲和亞洲,也見于北美部分地區(qū)。中國(guó)目前所有分離株經(jīng)生化、毒力檢測(cè)等均判定為B亞種。雖然土拉弗菌主要有2個(gè)亞種,但亞種內(nèi)變異和差別較大,當(dāng)疾病發(fā)生時(shí)病原體的快速溯源尤為重要,此時(shí)快速高效的分析方法往往起到事半功倍的效果。短串聯(lián)重復(fù)序列是DNA復(fù)制過程中鏈滑動(dòng)的結(jié)果,在原核和真核生物中廣泛存在,以該序列多態(tài)性為基礎(chǔ)的分型方法已被成功地應(yīng)用于多種病原體的分型。Johanson等(2004)已成功地將此法應(yīng)用于土拉弗氏菌,取得了較好的效果。本研究中利用該方法,選取最常用的兩個(gè)基因區(qū),對(duì)檢測(cè)陽(yáng)性的標(biāo)本進(jìn)行基因型別分析。研究結(jié)果顯示盡管檢測(cè)到的土拉弗氏菌均為B亞種,但存在6種不同的基因型別,這也說明陜西省土拉弗氏菌基因型別的多樣性。聚類分析結(jié)果顯示出了陽(yáng)性標(biāo)本基因型別與地域分布有一定的關(guān)聯(lián)的特點(diǎn),這可能與蜱種的地區(qū)分布特點(diǎn)有關(guān),這與Goethert(2004)的研究結(jié)果一致。由于本研究中陽(yáng)性標(biāo)本數(shù)量有限,目前的研究結(jié)果尚達(dá)不到根據(jù)地區(qū)準(zhǔn)確劃分基因型的要求,今后擴(kuò)大采樣,擴(kuò)大陽(yáng)性標(biāo)本的數(shù)量,甚至分離病原體可能利于該問題的闡明。但本研究的結(jié)果提示了我國(guó)西北地區(qū)的土拉弗氏菌基因型別的復(fù)雜性和系統(tǒng)地開展相關(guān)研究的必要性。

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