董燕 賈李蓉 朱彥 李敬華 高博
SNOMED CT(Systematized Nomenclature of Medicine-Clinical Terms,醫(yī)學(xué)系統(tǒng)命名法-臨床術(shù)語)是結(jié)構(gòu)化的臨床術(shù)語集,每個概念有基于含義的邏輯表示,并有唯一標(biāo)示的代碼。概念的邏輯定義通過建立概念間的“關(guān)系”來實現(xiàn)?!瓣P(guān)系”包括了:“|IS-A|關(guān)系”與“屬性關(guān)系”。而這些“關(guān)系”歸于“連接概念(Linkage concept)”下。SNOMED CT的頂層概念根據(jù)研究發(fā)展而調(diào)整。了解分類結(jié)構(gòu)變化以及“關(guān)系”和概念定義,可為構(gòu)建中醫(yī)臨床術(shù)語系統(tǒng)的提供參考和借鑒。
2010年1月時,在技術(shù)預(yù)覽中提出了“元數(shù)據(jù)層級”[1]。2013年公布的SNOMED CT新增的頂層概念是“SNOMED CT模型組件”(SNOMED CT Model Component),調(diào)整后的頂層概念仍是19個[2],見表1。之前頂層概念“連接概念”以及“特殊概念”的亞類“命名空間概念”被移到“SNOMED CT模型組件”下作為亞類,
新增的“SNOMED CT模型組件”也被稱為“頂層元數(shù)據(jù)(Top Level Metadata)”,其下又包含 4個亞類:“核心元數(shù)據(jù)概念”(Core metadata concept)、“基礎(chǔ)元數(shù)據(jù)概念”(Foundation metadata concept)、“連接概念”(Linkage concept)、“命名空間概念”(Namespace concept)。
“核心元數(shù)據(jù)概念”的子類可提供支持國際發(fā)布數(shù)據(jù)的結(jié)構(gòu)信息。支持信息包括枚舉值集,這些枚舉值用于概念、描述和關(guān)系屬性。“基礎(chǔ)元數(shù)據(jù)概念”的子類為包括參考集在內(nèi)的派生結(jié)構(gòu)提供支撐元數(shù)據(jù)和結(jié)構(gòu)信息。“命名空間概念”每個子類概念有一個整數(shù)術(shù)語,是一種分配擴(kuò)展名稱空間標(biāo)識符?!斑B接概念”用于連接兩個或兩個以上的概念來表達(dá)組合含義。所有能被用來作為“關(guān)系類型”的概念都收在“連接概念”中。
表1 SNOMED CT(2013)19個頂層概念名稱
“連接概念”將兩個概念連起來,形成一個可以表達(dá)明確意義的短句,也就是說多個概念通過“連接概念”相連即可形成一個概念表達(dá)充分的醫(yī)學(xué)語句。批準(zhǔn)使用的即為“概念模型屬性”。
“連接概念”下有兩個亞類:“連接聲明”(Link assertion)和“屬性關(guān)系”(Attribute)?!斑B接聲明”下有7個子類;“屬性關(guān)系”下的4個子類,見表2。其中“概念歷史屬性”下含7個子類,“概念模型屬性”下共含65個子類,“事實角色”下含1個子類,“未批準(zhǔn)屬性”下共含196個子類。
“連接聲明”亞類允許SNOMED CT概念用于HL7語句之間的關(guān)系維護(hù)。目前,該內(nèi)容支持英國國家衛(wèi)生服務(wù)部(NHS)衛(wèi)生聯(lián)絡(luò)機(jī)構(gòu)為在英國實施HL7版本3的關(guān)系編碼要求。
“屬性”亞類的概念用于SNOMED CT概念間的關(guān)系構(gòu)建,也稱為概念間的“關(guān)系類型”。一些“屬性”(即“關(guān)系類型”)可用來邏輯地定義一個概念,這稱為“定義屬性”。定義屬性示例:(1)“| is a |關(guān)系”。(2)|概念模型屬性 |(Concept model attribute):|偏側(cè)性 |(Laterality),|操作部位 |(Procedure site),|發(fā)現(xiàn)部位 |(Finding site),|相關(guān)形態(tài)學(xué) |(Associated morphology)。
“屬性”下還包括“非定義屬性”,非定義屬性示例:(1)|未批準(zhǔn)屬性 |(Unapproved attribute):|因……緩解 |(Relieved by),|評估 |(Has assessment)。(2)|概念歷史屬性 |(Concept history attribute) :|被……替代|(REPLACED BY),|與……相同|(SAME AS)?!案拍钅P蛯傩浴毕鹿埠?5個子類,不屬于“定義屬性”有6個[3]:|一般認(rèn)為|(Commonly considered)、|有生活環(huán)境 |(Has life circumstance)、|有生理狀態(tài) |(Has physiologic state)、|包括子標(biāo)本 |(Includes sub-specimen)、|部分|(Part of)、|信息主題|(Subject of information)。
表2 連接概念的二級、三級子類
“定義屬性”(即“關(guān)系類型”)用來邏輯地定義一個“概念”。SNOMED CT目前使用60個“定義屬性”來構(gòu)建概念定義模型:“|is a|關(guān)系”(也稱為“父-子關(guān)系”或“上下位關(guān)系”)和“概念模型屬性”中的59個“關(guān)系類型”。
每個“定義屬性”通常屬于一個層級,有少數(shù)屬于多個層級,一個屬性可以應(yīng)用的層級被稱為屬性的“域”(domain)。也就是說,“域”是特定的“關(guān)系類型”可應(yīng)用的層級,例如:“臨床發(fā)現(xiàn)”是|相關(guān)形態(tài)學(xué)|的“域”。每個屬性可以被賦予一組有限的值,這個值域集被稱為屬性的“值域(范圍)”(range)。例如,|相關(guān)形態(tài)學(xué)|的“值域(范圍)”是|形態(tài)異常結(jié)構(gòu)(形態(tài)學(xué)異常)|及其子類;|發(fā)現(xiàn)部位|的“值域(范圍)”是|身體結(jié)構(gòu)|層級結(jié)構(gòu)下的|解剖或獲得身體結(jié)構(gòu)(身體結(jié)構(gòu))|及其子類。
同一個“關(guān)系類型”可以用于不同的“域”?!案拍钅P蛯傩浴敝械?9個“關(guān)系類型”應(yīng)用的“域”的情況:“臨床所見”16個,“操作”23個,“操作”6個,“具有明確語境”6個,“事件”5個,“標(biāo)本”5個,“藥物/生物制品”2個,“身體結(jié)構(gòu)”1個,“物理性物體”1個。其中,應(yīng)用于“事件”概念類的5個“關(guān)系類型”同時也用于 “臨床所見”;“has active ingredient”同時用于“物理性物體”和“藥品/生物制品”。
圖1 肺炎|發(fā)現(xiàn)部位|肺組織
SNOMED CT中每個概念都有邏輯定義,通過“關(guān)系”與其他概念連接?!皘is a|關(guān)系”和“定義屬性關(guān)系”被稱為SNOMED CT概念的定義性特征,通過與其他概念建立“關(guān)系”,在邏輯上代表一個概念。
除了“根概念”,每個活躍概念至少有一個“|is a|關(guān)系”與其父概念關(guān)聯(lián)。“|is a|關(guān)系”是SNOMED CT的層次結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ),見圖2。一個概念可以有不止一個“|is a|關(guān)系”與其他概念相連。在同一頂層結(jié)構(gòu)下,一個概念可有多個父概念,子類型關(guān)系可以多層級化,見圖3。
圖2 “|IS A|關(guān)系”層級關(guān)系
圖3 “|IS A|關(guān)系”
“屬性關(guān)系”是兩個“概念”之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系,用于指定某個概念的“定義特征”(源關(guān)系)。每個“屬性關(guān)系”有名稱(關(guān)系類型)和值(目標(biāo)關(guān)系)。
“|is a|關(guān)系”和“屬性關(guān)系”(即“關(guān)系類型”)組合通過表述某一“概念”的邏輯定義與該“概念”相關(guān)聯(lián)。邏輯概念定義包括一個或多個“上位類型”(由“|is a|關(guān)系”描述)和一組“定義屬性”,以區(qū)別于其他概念定義。完全定義概念|細(xì)菌性肺炎(疾?。﹟表示見圖4,每一行表示一個有值的“定義屬性”。圖5則是用圖形的方式來說明部分關(guān)系。
圖4 |細(xì)菌性肺炎(疾病)|的定義
圖5 “定義關(guān)系”屬性圖解
SNOMED CT(2013)的頂層概念19個,新增一個頂層概念“SNOMED CT模型組件”,“連接概念”為其亞類?!斑B接概念”用來連接兩個概念,形成對某一概念的表達(dá)。每個概念是邏輯定義,通過“關(guān)系”與其他概念連接:“|is a|關(guān)系”用于連接一個“概念”與同類型的更一般的概念;“屬性關(guān)系”(例如|發(fā)現(xiàn)部位|和|病原體|)用于連接“概念”與其他子類型中的相關(guān)值。需要特別注意,對“連接概念”的使用是非標(biāo)準(zhǔn)的,是探索性和試驗性的。
SNOMED CT的體系構(gòu)建的原則與工作方法,適用于“中醫(yī)臨床術(shù)語集”的構(gòu)建[4]。“中醫(yī)臨床術(shù)語集”經(jīng)過幾年的建設(shè),目前也面臨著結(jié)構(gòu)調(diào)整的需要,研究SNOMED CT的結(jié)構(gòu)調(diào)整和概念間“關(guān)系”,將為中醫(yī)臨床術(shù)語系統(tǒng)的完善提供有力的參考和借鑒。
[1]董燕,崔蒙,賈李蓉.SNOMED CT層次結(jié)構(gòu)與標(biāo)識符[J].中國數(shù)字醫(yī)學(xué),2012,7(2):68-72.
[2]IHTSDO.SNOMED CT Technical Implementation Guide January 2013 International Release (US English)[OL][2013-01].http://ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].
[3]IHTSDO.SNOMED CT User Guide January 2013 International Release(US English)[OL][2013-01].http://ihtsdo.org/fileadmin/user_upload/doc/[2013-04-28].
[4]郭玉峰,劉保延,姚乃禮,等.基于SNOMED CT核心構(gòu)架研究的中醫(yī)臨床術(shù)語集標(biāo)準(zhǔn)化特征要素初探[J].中國中醫(yī)藥信息雜志,2008,15(9):96-97.