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Hsa-miR-106a在胃癌組織中的表達及其臨床意義

2014-11-20 09:45王文靜趙凌宇常素娥童東東宋土生黃辰
山西醫(yī)科大學學報 2014年1期
關(guān)鍵詞:癌癥引物胃癌

郭 波,王文靜,趙凌宇,常素娥,童東東,楊 陽,宋土生,黃辰,3*

(1西安交通大學醫(yī)學院遺傳學與分子生物學系,西安 710061;2西安交通大學醫(yī)學院第一附屬醫(yī)院肝膽外科;3西安交通大學醫(yī)學院心血管研究中心;*通訊作者,E-mail:hchen@mail.xjtu.edu.cn)

胃癌是世界范圍內(nèi)最常見的惡性腫瘤之一。據(jù)2000年資料統(tǒng)計,全球每年新發(fā)胃癌876 000例,占所有新發(fā)癌癥病例的9%,僅次于肺癌、乳腺癌和腸癌,位居第4位。每年約有647 000人因胃癌死亡,位居癌癥死因的第2位[1]。我國是胃癌高發(fā)大國,約有35%的胃癌病例發(fā)生在中國,中國人群胃癌死亡率高達24.65/10萬[2]。由于其惡性程度高、發(fā)病隱匿、病情進展快、易復發(fā)、易轉(zhuǎn)移等生物學特性,且大部分胃癌患者臨床確診時已屬晚期,所以手術(shù)、放療、化療等各種治療方法效果均不佳,胃癌已成為威脅人類健康最難治療的疾病之一,且其發(fā)病率和死亡率呈逐年升高的趨勢。因此,研究胃癌的發(fā)生機制、尤其是胃癌發(fā)生過程中基因網(wǎng)絡(luò)調(diào)節(jié)機制,對尋找胃癌治療的新藥物,提高胃癌患者的預后具有重要意義。

微小RNA(microRNA)是一類進化上高度保守的單鏈非編碼RNA小分子,由21-25個核苷酸組成,廣泛存在于真核生物中[3]。主要通過抑制mRNA翻譯或促進其降解從而調(diào)控基因表達,調(diào)節(jié)細胞增殖、分化、侵襲轉(zhuǎn)移及凋亡,參與機體的發(fā)育、代謝以及腫瘤的發(fā)生、發(fā)展等生物學過程,其與癌癥發(fā)生的關(guān)系更是癌癥研究新的熱點內(nèi)容[4]。因此,本研究采用real-time PCR方法檢測了hsa-miR-106a在胃癌組織及正常對照組織中的表達情況,以分析hsamiR-106a對胃癌發(fā)生機制、發(fā)展過程的影響,為探討胃癌發(fā)病機制和診斷治療的研究提供新的思路。

1 材料和方法

1.1 材料

19對胃癌及正常對照組織(距離癌灶邊緣5 cm以上,病理證實為非腫瘤組織)標本取自西安交通大學第一附屬醫(yī)院2011-03~2011-11間手術(shù)患者,平均年齡為(61.55±2.18)歲。所有患者均為原發(fā)性病灶切除,術(shù)前未經(jīng)放化療處理,簽署知情同意書。經(jīng)術(shù)后病理檢查證實后,對19例患者的臨床病理資料進行整理分析。標本采集后經(jīng)甲醛固定通過石蠟包埋進行長期保存。

1.2 引物設(shè)計與合成

miRNA與內(nèi)參的反轉(zhuǎn)錄及real-time PCR引物序列由本實驗室設(shè)計提供,引物合成由生工生物工程(上海)公司完成,序列見表1。

1.3 RNA的提取與鑒定

每個樣本的石蠟包埋組織取20μm厚度3-4張切片脫蠟,按石蠟組織試劑盒(RecoverAllTMTotal Nucleic Acid Isolation Kit,USA,Ambion 公司)說明書方法操作并檢測OD值,A260/A280比值均在1.8-2.2之間,為高純度 RNA,并調(diào)整 RNA濃度,置于-80℃保存。

表1 miRNA反轉(zhuǎn)錄與定量PCR引物Table 1 Primers for reverse transcription(RT)quantitative polymerase chain reaction of microRNAs and U6

1.4 逆轉(zhuǎn)錄PCR

利用本實驗已設(shè)計的帶有莖環(huán)結(jié)構(gòu)的特異性RT引物,逆轉(zhuǎn)錄獲取cDNA。按試劑盒(PrimeScript? RT reagent Kit Perfect Real Time,JAP,TAKARA 公司)說明反應(yīng)體系共10μl,RNA 約為40 ng,2μl 5×PrimeScript? Buffer,0.5 μl PrimeScript? RT Enzyme MixⅠ,1μl Reverse transcription引物,添加 RNase Free water調(diào)整體系至10μl。反應(yīng)條件37℃ 15 min,85℃ 5 s,反應(yīng)產(chǎn)物保存于4℃。

1.5 實時熒光定量PCR

采用試劑盒(SYBR? Premix Ex TaqTMⅡ(Perfect Real Time),TAKARA),反應(yīng)體系為20 μl:1 μl逆轉(zhuǎn)錄 PCR產(chǎn)物,10μl 2×SYBR? Premix Ex TaqTMII,上下游引物各1 μl,加 RNase Free water調(diào)整體系至20μl,設(shè)置U6做為內(nèi)參,每組樣本均做3個重復,反應(yīng)在IQ-5型(Bio-Rad)實時熒光定量PCR儀上進行。

1.6 數(shù)據(jù)分析

讀取定量 PCR 反應(yīng) Ct值,計算 2-ΔΔCt(ΔCt=CtmiRNA-CtU6,microRNA 的相對表達量以 2-ΔΔCt計)。采用SPSS 18.0統(tǒng)計軟件進行分析,以±s表示,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。采用單因素方差分析,比較miR-106a在不同臨床分期和病理分級胃癌中表達的差異,P<0.05視為有統(tǒng)計學差異。

2 結(jié)果

2.1 real-time PCR結(jié)果分析

將19對標本一一對應(yīng),分別計算出癌組織相對于正常對照組織的2-ΔΔCt,結(jié)果表明miR-106a在癌組織中有14例高表達,5例低表達(見圖1),統(tǒng)計學分析表明,兩組間具有統(tǒng)計學差異(P<0.01,見圖2)。

圖1 miR-106a在19例胃癌組織中表達Figure 1 Expression of miR-106a in 19 cases of gastric cancer

圖2 miR-106a表達在胃癌組織中顯著高于正常組織Figure 2 Expression of miR-106a in gastric cancer and normal tissues

2.2 胃癌組織中miR-106a表達與臨床病理特征的關(guān)系

分析結(jié)果顯示,在已獲得胃癌組織中miR-106a的表達量與腫瘤分化程度有相關(guān)性(P<0.05),但與年齡、性別、侵襲度、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠端轉(zhuǎn)移和病理分期等都無關(guān)(見表2)。

3 討論

胃癌的發(fā)生是一種多因素參與、多基因改變的事件,抑癌基因失活、DNA修復基因丟失、基因突變導致細胞周期改變、基因抑制細胞凋亡等均可導致胃癌發(fā)生,與胃癌相關(guān)的癌基因就多達400多種。已有研究證實,k-ras、p53 和e-Cadherin 基因的突變[5,6],cmet、cyclin-E 以及 ERBB2 的擴增[7,8],EGFR、TGF-beta、VEGF 基因的過表達均與胃癌發(fā)生有關(guān)[9,10]??傊?,多種因素相互疊加,最終導致胃癌發(fā)生。

表2 胃癌中miR-106a與臨床病理特征的關(guān)系(±s)Table 2 Correlation of of miR-106a expression with clinicopathological factors(±s)

表2 胃癌中miR-106a與臨床病理特征的關(guān)系(±s)Table 2 Correlation of of miR-106a expression with clinicopathological factors(±s)

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微小RNA(microRNA)大部分由基因的內(nèi)含子部位產(chǎn)生,主要通過抑制mRNA翻譯或促進其降解從而調(diào)控基因表達。目前的研究表明,miRNA分子通過兩種不同機制調(diào)節(jié)蛋白的表達。當miRNA和編碼蛋白質(zhì)的mRNA幾乎完全配對時,miRNA誘導mRNA降解,這種miRNA介導的基因沉默機制在植物中比較普遍。當miRNA和編碼蛋白質(zhì)的mRNA不完全配對時,miRNA通過不完全的堿基配對結(jié)合mRNA的3’非編碼區(qū)(3’UTR),在轉(zhuǎn)錄水平上抑制基因翻譯[11]。從而調(diào)節(jié)細胞增殖、分化、侵襲轉(zhuǎn)移及凋亡,參與機體的發(fā)育、代謝以及腫瘤的發(fā)生、發(fā)展等生物學過程,其與癌癥發(fā)生的關(guān)系更是癌癥研究新的熱點內(nèi)容。對胃癌中人類let-7a進行定量,結(jié)果顯示胃癌組織中的表達水平顯著比正常組織低,并通過與RAB40C基因3’UTR結(jié)合影響胃癌細胞生物學特性,提示let-7a在胃癌的發(fā)展中起重要作用[12]。

近期的研究表明,miR-106a在結(jié)腸直腸癌[13]、卵巢癌[14]、惡性膠質(zhì)瘤[15]等多種類型的腫瘤組織中高表達,其表達調(diào)控的信號通路在調(diào)節(jié)細胞的增殖、分化、凋亡等過程中發(fā)揮著重要作用。而在星形細胞瘤中,通過對84例瘤體及20例癌旁正常組織中miR-106a表達量的檢測,發(fā)現(xiàn)miR-106a的低表達與患者的預后存在密切的關(guān)系[16]。正是基于以上事實,本研究利用qRT-PCR方法檢測了miR-106a在胃癌及其正常組織中的表達量,發(fā)現(xiàn)miR-106a在胃癌組織相對于正常組織有明顯的表達上調(diào),這種趨勢與已有的研究報道一致[17],同時這種差異表達與臨床病理指征有密切相關(guān)性。而最新的研究結(jié)果[18]表明,miR-106a不僅在胃癌組織中存在普遍的上調(diào),還能通過FAS介導的信號通路調(diào)控胃癌細胞的生長,抑制miR-106a表達不僅能阻滯腫瘤細胞的增殖,還能誘導腫瘤細胞的凋亡。

本研究中采用real-time PCR檢測miR-106a在胃癌組織中的表達情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miR-106a在胃癌中的表達較正常組織明顯升高(P<0.01)。同時,miR-106a的高表達與腫瘤分化程度有著密切的相關(guān)性(P<0.05)。以上結(jié)果說明miR-106a可能參與了胃癌的發(fā)生和發(fā)展過程,受限于樣本數(shù)量較少,未能就miR-106a與胃癌的病理分級、臨床分期及預后情況等進行深入的分析。但本實驗結(jié)果為我們提供了在胃癌分子機制研究中一個潛在的靶點,下一步,我們將就miR-106a與其靶基因在胃癌細胞系中的效應(yīng)進行深入分析和實驗驗證,為進一步理解胃癌的發(fā)生和發(fā)展機制,尋找對胃癌診斷、判斷預后和治療靶標有價值的分子標志物奠定良好的基礎(chǔ)。

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