童琛曄 馮原 蔣冰瑩 查黎萍 唐艷紅
(上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院手術(shù)室,上海200025)
為了建立符合我國(guó)經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平的生物樣本庫(kù),促進(jìn)生物樣本庫(kù)建設(shè)過(guò)程中的有益知識(shí)和技術(shù)方法的傳播,我院手術(shù)室聯(lián)合乳腺疾病診治中心于2012年起開(kāi)始研究并構(gòu)建上海及周邊地區(qū)早期乳腺癌生物樣本庫(kù),用以完善乳腺癌相關(guān)臨床及基礎(chǔ)研究的進(jìn)行。我們參照2011年“中國(guó)醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會(huì)生物樣本庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)(試行)”(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“標(biāo)準(zhǔn)”),并結(jié)合自身的特點(diǎn),制定了一套符合我們醫(yī)院的乳腺腫瘤生物樣本采集、保存的標(biāo)準(zhǔn)化流程(SOP)。我們探討不同溫度的無(wú)菌生理鹽水對(duì)采集乳腺腫瘤組織標(biāo)本的影響,建立更加規(guī)范的生物樣本采集、保存的SOP。現(xiàn)報(bào)告如下。
1.1 一般資料 選取2012年10~12月乳腺癌腫瘤直徑≥2.5cm的組織標(biāo)本60例,由經(jīng)過(guò)培訓(xùn)的專(zhuān)人負(fù)責(zé)采集標(biāo)本。
1.2 材料準(zhǔn)備 上海長(zhǎng)征富民金山制藥公司生產(chǎn)的長(zhǎng)富牌無(wú)菌生理鹽水,500ml裝,玻璃瓶;潔定(GETINGE)公司加溫暖箱;三菱公司家用冰箱;海爾公司超低溫保存箱;滅菌溫度計(jì);經(jīng)過(guò)處理的無(wú)RNA酶的刀片、眼科剪和尺、鑷子等;手套,口罩等標(biāo)準(zhǔn)保護(hù)器材;其他材料:記號(hào)筆,標(biāo)簽,凍存管,采集標(biāo)本的操作臺(tái)等。
1.3 采樣方法 每次取樣前分別取無(wú)菌生理鹽水3瓶放于潔凈手術(shù)室室溫(22~26℃)、三菱公司冰箱冷藏室(4℃)、潔定公司加溫暖箱中(40℃),取材前準(zhǔn)備好標(biāo)有病例姓名縮寫(xiě)、住院號(hào)、腫瘤組織部位(T)、無(wú)菌生理鹽水漂洗液的溫度(C1、C2、C3)標(biāo)簽的凍存管。待標(biāo)本離體后,采集專(zhuān)員取出3瓶無(wú)菌生理鹽水并打開(kāi),用滅菌溫度計(jì)分別測(cè)試3瓶生理鹽水的溫度,4~8℃的無(wú)菌生理鹽水標(biāo)記為C1,22~26℃的無(wú)菌生理鹽水標(biāo)記為C2,37~41℃的無(wú)菌生理鹽水標(biāo)記為C3。在標(biāo)本離體后的30min內(nèi),更換器具切取腫瘤組織標(biāo)本的1/5,0.5cm×0.5cm×0.5cm,并平均分成3份,分別用C1、C2、C3的生理鹽水漂洗兩次以洗去血液與污漬,再分別裝入已編號(hào)的凍存管中,旋緊蓋子后放入-80°超低溫冰箱保存。于24h內(nèi)由專(zhuān)職人員將凍存管轉(zhuǎn)移至實(shí)驗(yàn)室由專(zhuān)職實(shí)驗(yàn)人員進(jìn)行標(biāo)本的總RNA提取鑒定。
1.4 鑒定標(biāo)準(zhǔn) 用紫外分光光度計(jì)對(duì)RNA樣品進(jìn)行量測(cè),若吸光度ODZ60/OD280>1.6,再用1%的瓊脂糖凝膠電泳后,可見(jiàn)明顯的28s和18s條帶,若28s亮度比18s要高1~2倍,則表明RNA標(biāo)本保存完好[2]。
1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 采用SPSS 11.5建立數(shù)據(jù)庫(kù),采用統(tǒng)計(jì)描述、χ2分析等方法進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。P<0.05為差異有顯著意義。
表1 不同溫度生理鹽水與腫瘤標(biāo)本質(zhì)量情況比較 (例)
表1提示,三組標(biāo)本RNA保存質(zhì)量有顯著性差異(P<0.01),使用C1漂洗過(guò)的標(biāo)本RNA保存質(zhì)量最高。
3.1 生理鹽水在采集乳腺腫瘤組織標(biāo)本中的作用
臨床生物樣本是基礎(chǔ)研究與臨床研究的寶貴資源,規(guī)范地采集、保存生物樣本可以避免樣本的損壞與流失,節(jié)約資源。根據(jù)“標(biāo)準(zhǔn)”中所提及的在采集標(biāo)本前需對(duì)標(biāo)本進(jìn)行生理鹽水漂洗以去除其表面的血液及污物也是保證生物樣本質(zhì)量的一個(gè)重要手段。手術(shù)中的離體標(biāo)本不可避免有血液污染,血液也有其DNA/RNA,若不進(jìn)行漂洗而直接采集標(biāo)本,則可能導(dǎo)致將來(lái)抽取腫瘤標(biāo)本的DNA/RNA時(shí),會(huì)受到血液DNA/RNA的影響,而影響最終的研究結(jié)果。如果采用其他溶液漂洗腫瘤標(biāo)本,如滅菌注射用水,則可能會(huì)導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞腫脹破裂死亡,而最終無(wú)法抽取腫瘤細(xì)胞的DNA/RNA,無(wú)法開(kāi)展進(jìn)一步的研究。因此,對(duì)于腫瘤標(biāo)本漂洗溶液的選擇當(dāng)然是應(yīng)該選擇等滲、不影響腫瘤細(xì)胞活性、又不會(huì)添加其他成分的0.9%無(wú)菌生理鹽水。
3.2 不同溫度的生理鹽水對(duì)采集乳腺腫瘤組織標(biāo)本的影響 通過(guò)此次研究發(fā)現(xiàn),用不同溫度生理鹽水漂洗腫瘤標(biāo)本,對(duì)標(biāo)本的采集、保存是有影響的。鑒定標(biāo)本的保存質(zhì)量主要看標(biāo)本的總RNA,并用紫外分光光度計(jì)對(duì)RNA樣品進(jìn)行檢測(cè)[2]。有研究發(fā)現(xiàn)樣本取材時(shí)間對(duì)樣本RNA質(zhì)量存在著關(guān)鍵影響,眾多文獻(xiàn)推薦在樣本切除后30min內(nèi)取材[2-3]。因此,在此次實(shí)驗(yàn)中,我們嚴(yán)格控制取材時(shí)間<30min,并由專(zhuān)人負(fù)責(zé)采集、送檢、檢驗(yàn)標(biāo)本,力求控制影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果的所有變量,僅僅觀察用不同溫度生理鹽水漂洗后,標(biāo)本總RNA的質(zhì)量。由表1可看出,用不同溫度生理鹽水漂洗腫瘤標(biāo)本后,RNA保存質(zhì)量存在顯著性差異(P<0.01),用冷的甚至是冰的生理鹽水漂洗腫瘤標(biāo)本更能完好的保存腫瘤細(xì)胞的RNA。這是因?yàn)闇囟仍降?,越有利于降低?xì)胞活性,避免腫瘤細(xì)胞基因組DNA、RNA和蛋白的降解。
3.3 建立乳腺腫瘤組織標(biāo)本采集、保存的標(biāo)準(zhǔn)化流程 參照“標(biāo)準(zhǔn)”,并結(jié)合此次的實(shí)驗(yàn)結(jié)果、自身的特點(diǎn),我們制定了一套符合我們醫(yī)院的乳腺腫瘤生物樣本采集、保存的標(biāo)準(zhǔn)化流程。我們強(qiáng)調(diào)采集專(zhuān)員在取材前準(zhǔn)備好標(biāo)有病例姓名縮寫(xiě)、住院號(hào)、組織部位(T/P/N)的標(biāo)簽的凍存管和包埋盒,組織塊取下后,先用4~8℃的無(wú)菌生理鹽水漂洗標(biāo)本以去除血液與污漬。
綜上所述,在采集乳腺癌腫瘤組織標(biāo)本的過(guò)程中,使用4~8℃的無(wú)菌生理鹽水漂洗標(biāo)本后對(duì)腫瘤標(biāo)本的RNA保存質(zhì)量影響最小,可增添至生物樣本采集、保存的標(biāo)準(zhǔn)化流程中。
[1]《中國(guó)醫(yī)藥生物技術(shù)協(xié)會(huì)生物樣本庫(kù)標(biāo)準(zhǔn)(試行)》[J].中國(guó)醫(yī)藥生物技術(shù),2011,6(1):71-79.
[2]季加孚.北京大學(xué)臨床腫瘤學(xué)院標(biāo)本庫(kù)的建設(shè)[J].北京大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版),2005,37(3):229-330.
[3]Mager SR,Oomen MH,Morente MM,et al."Standard operating produre for the collection of flesh frozen tissue samples[J].Eur J Cancer,2007,43(5):828-834.