徐小波, 馮 宇, 陸志強(qiáng), 胡東衛(wèi), 陳 哲
(1.江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧研究所,江蘇 南京 210014;2.江蘇省常熟市畜牧獸醫(yī)站,江蘇 常熟 215500)
控制豬產(chǎn)仔數(shù)的基因或標(biāo)記已報道的有雌激素受體基因(ESR)[1]、促卵泡素 β 亞基基因(FSHβ)[2]、催乳素受體基因(PRLP)[3]和表皮生長因子基因(EGF)[4]等。它們是母豬生殖調(diào)節(jié)的關(guān)鍵基因,是生殖激素的受體基因,參與調(diào)節(jié)豬生殖道、卵巢及泌乳等的生長發(fā)育等。二花臉豬是江蘇省最優(yōu)秀豬種之一,以繁殖力高、肉質(zhì)優(yōu)良而著稱于世。本試驗選擇FSHβ、ESR和PRLP 3個功能基因作為候選基因,采用PCR-RFLP進(jìn)行多態(tài)性檢測,同時對3個候選基因?qū)Χ権i的產(chǎn)仔與哺育性狀進(jìn)行相關(guān)性分析,以揭示二花臉豬高繁殖力的分子遺傳機(jī)理,為二花臉豬的種質(zhì)資源保護(hù)及開發(fā)利用提供依據(jù)。
試驗豬群為常熟市牧工商總公司二花臉保種豬場的育種核心群108頭母豬。母豬繁殖成績統(tǒng)計范圍為所有核心群母豬初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)的純種繁殖產(chǎn)仔哺育記錄。母豬群系譜資料完整,各胎配種與繁殖記錄齊全,仔豬哺乳期為35 d。
1.2.1 采樣與DNA提取 用豬用耳缺鉗夾取一小塊耳緣組織(約0.10~0.15 g),浸于EP管內(nèi)70%乙醇中,-20℃冷凍保存。采用苯酚法提取DNA。
1.2.2 引物設(shè)計 分別參照趙要風(fēng)等[2]、Short等[5]和 Drogemuller 等[6]的文獻(xiàn)設(shè)計 FSHβ、ESR、PRLR基因多態(tài)位點引物。FSHβ-F:5'-CCTTTAAGACAGTCAATGGC-3';FSHβ-R:5'-ACTGGTCTATTCATCCTCTC-3'。ESR-F:5'-CCTGTTTTTACAGTGACTTTTACAGAG-3';ESR-R:5'-CACTTCGAGGGTCAGTCCAATTAG-3'。PRLR-F:5'-CGTGGCTCCGTTTGAAGAACC-3';PRLR-R:5'-CTGAAAGGAGTGCATAAAGCC-3'。引物用去離子水溶解,-20℃保存。
1.2.3 PCR反應(yīng) 反應(yīng)總體積為25.0 μl,Premix Ex Taq 12.5 μl,兩端引物(100 μmol/L)各 0.5 μl,模板 DNA 1.0 μl,加純水至 25.0 μl。PCR 反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s、55℃退火45 s、72℃延伸45 s,32個循環(huán),最后72℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測后置于4℃保存。
1.2.4 酶切與電泳 ESR和PRLR基因擴(kuò)增產(chǎn)物分別用PvuⅡ和AluⅠ限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切。酶切反應(yīng)體系為:2.0 μl 10× NEB 緩沖液,0.2 μl 100 × BSA,0.5 μl內(nèi)切酶,PCR 產(chǎn)物 5.0 μl,加純水至20.0 μl。酶切反應(yīng)條件:37℃,反應(yīng)時間 4~6 h。ESR和PRLR基因經(jīng)酶切后進(jìn)行2%瓊脂糖凝膠電泳分析,F(xiàn)SHβ基因擴(kuò)增產(chǎn)物直接進(jìn)行電泳分析。
分別統(tǒng)計初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)的總產(chǎn)仔數(shù)(TNB)、產(chǎn)活仔數(shù)(NBA)、初生質(zhì)量(BW)和斷奶質(zhì)量(WW)。采用SPSS統(tǒng)計軟件包進(jìn)行統(tǒng)計分析。
二花臉豬FSHβ、ESR和PRLR基因的基因型和基因頻率分布見表1。經(jīng)卡方適合性檢驗,二花臉豬群體內(nèi)FSHβ基因只發(fā)現(xiàn)2種基因型,AA型和AB型,ESR和PRLR基因有AA型、AB型和BB型3種基因型,基因型分布均符合哈迪-溫伯格平衡(P >0.05)。
表1 FSHβ、ESR和PRLR基因在二花臉豬群中的基因型頻率和基因頻率Table 1 Gene and genotype frequencies of ESR,PRLR and FSHβ genes in Erhualian sows
FSHβ、ESR和PRLR各基因型初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)的總產(chǎn)仔數(shù)(TNB)和產(chǎn)活仔數(shù)(NBA)列于表2。FSHβ基因在二花臉豬群體中只檢測到AA型和AB型,AA型無論初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)TNB和NBA均顯著或極顯著高于AB型;ESR基因BB型個體的初產(chǎn)及經(jīng)產(chǎn)的TNB和NBA均顯著或極顯著高于AB型和AA型,AB型的初產(chǎn)NBA、經(jīng)產(chǎn)TNB和NBA均顯著或極顯著高于AA型;PRLR基因的AA型為有利基因型,AA型和AB型初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)TNB和NBA均極顯著高于BB型,AA型和AB型之間差異不顯著。
表2 不同基因型二花臉豬的總產(chǎn)仔數(shù)與產(chǎn)活仔數(shù)Table 2 Total number of born and number of born alive of different genotypes of Erhualian sows
FSHβ、ESR和PRLR各基因型初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)的初生質(zhì)量(BW)和斷奶質(zhì)量(WW)列于表3。FSHβ基因的AB型初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)BW和WW均顯著高于AA型。ESR基因的AA型初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)BW顯著高于AB和BB型,AA型的初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)WW顯著高于BB型,AA型是仔豬體質(zhì)量優(yōu)勢基因。PRLR基因的BB型初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)仔豬的WW均顯著高于AA型,其余差異不顯著,BB型為仔豬體質(zhì)量優(yōu)勢基因。
表3 不同基因型二花臉豬所產(chǎn)仔豬的初生質(zhì)量和斷奶質(zhì)量Table 3 Birth weight and weaning weight for different genotypes of Erhualian sows
趙要風(fēng)等[2]在二花臉豬和香豬內(nèi)只發(fā)現(xiàn)了FSHβ基因的A等位基因,本研究中未發(fā)現(xiàn)FSHβ基因的BB基因型,B等位基因頻率為0.22。陳克飛等[7]報道ESR基因的B等位基因在國內(nèi)豬種中占優(yōu)勢(0.73),在二花臉豬群體中也表現(xiàn)為B基因頻率較高。本研究PRLR基因多態(tài)性表現(xiàn)與李婧等[8]的檢測結(jié)果一致。群體的遺傳平衡檢測結(jié)果表明,二花臉豬尚處于穩(wěn)定遺傳平衡狀態(tài)。
趙要風(fēng)等[2]認(rèn)為 FSHβ是豬產(chǎn)仔性狀主效基因,AA基因型的產(chǎn)仔數(shù)明顯提高[8-9]。本研究的二花臉豬群體內(nèi),B基因的頻率很低,與其他地方豬種的基因頻率類似[9-11],本研究結(jié)果表明AA型的初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)總產(chǎn)仔數(shù)(TNB)和產(chǎn)活仔數(shù)(NBA)均較AB型略高,A基因為優(yōu)勢基因。
有研究者認(rèn)為ESR基因的每個B基因能提高產(chǎn)仔數(shù) 0.3 ~1.5 頭[1,10]。丁家桐等研究發(fā)現(xiàn),ESR基因?qū)NB和NBA的效應(yīng)在3個地方豬種中效應(yīng)極顯著,每個B基因?qū)NB和NBA的加性效應(yīng)分別為1.52頭和1.50頭[12]。本研究結(jié)果也表明,二花臉豬ESR基因BB型為優(yōu)勢基因型,B基因頻率達(dá)到0.817,且ESR基因的BB基因型個體初產(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)的TNB和NBA顯著高于AA型個體(P<0.01),與國內(nèi)其他豬種相似[7],說明ESR基因也是控制豬產(chǎn)仔數(shù)性狀的主效基因,而且二花臉豬有較高的繁殖性能的潛力。
關(guān)于PRLR基因與產(chǎn)仔數(shù)的關(guān)聯(lián)性研究結(jié)果存在一定分歧,部分研究者認(rèn)為A等位基因能顯著提高產(chǎn)仔數(shù)[13-14],但另一部分研究者則認(rèn)為B基因?qū)ωi產(chǎn)仔數(shù)更有利[6,15]。PRLR基因在不同豬種中的多態(tài)性及其與繁殖性狀的關(guān)系尚無定論。本研究與李婧等[10]的研究結(jié)果一致,PRLR基因的A等位基因為優(yōu)勢基因,AA基因型TNB和NBA均顯著高于BB基因型。
部分研究者認(rèn)為FSHβ、ESR和PRLR基因?qū)ψ胸i初生質(zhì)量(BW)和斷奶質(zhì)量(WW)沒有顯著影響[16-17],但也有研究者認(rèn)為,PRLR基因?qū)Τ跎C質(zhì)量有作用,且在國內(nèi)外豬種中的表現(xiàn)顯著不同[18]。本研究中,PRLR基因?qū)Τ醍a(chǎn)和經(jīng)產(chǎn)仔豬的WW效應(yīng)顯著,ESR基因?qū)Τ醍a(chǎn)、經(jīng)產(chǎn)的BW和WW均有顯著影響。本研究中二花臉豬的TNB和NBA與BW之間存在顯著的負(fù)相關(guān),這與在金華豬上的研究結(jié)果[19]一致。這為二花臉豬的分子標(biāo)記輔助選擇提供了新的依據(jù)和參考。
繁殖性狀遺傳率很低,受微效多基因調(diào)控,同時也受到品種、胎次、營養(yǎng)及環(huán)境等多方面的影響。通過對產(chǎn)仔數(shù)的表型選擇提高種群的產(chǎn)仔數(shù)收效甚微,但是通過對諸多與產(chǎn)仔數(shù)相關(guān)的候選基因的研究,將一些主效基因作為分子標(biāo)記進(jìn)行合并選擇,對提高種群產(chǎn)仔數(shù)將是一個有效的方法。
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