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關(guān)于Logistic增長模型參數(shù)估計方法的再探討

2015-02-18 04:59楊益民付必謙
統(tǒng)計與決策 2015年13期
關(guān)鍵詞:中值折線觀測點

楊益民,付必謙

(1.北京工商大學(xué) 理學(xué)院,北京,100084;2.首都師范大學(xué) 生命科學(xué)學(xué)院,北京100084)

0 引言

是描述有限環(huán)境條件下生物種群S-型增長的最基本和最常用的模型,在種群數(shù)量動態(tài)研究中占有十分重要的地位。

在利用式(1)定量研究種群動態(tài)時,必須依據(jù)實驗觀測數(shù)據(jù)估計式中的K、r和a。較早提出且目前仍然十分常用的方法是將式(1)移項取對數(shù)后,轉(zhuǎn)化為線性方程

先根據(jù)原始數(shù)據(jù)和經(jīng)驗預(yù)先給定K,然后再利用一元線性回歸估計r和a[1~3]。后來一些學(xué)者認(rèn)為線性化方法主觀色彩較濃或遺漏“最優(yōu)”參數(shù)估計值的可能性較大,提出采用一些非線性最優(yōu)化方法如麥夸法和單純形加速法等[4,5],也有作者對利用數(shù)值方法擬合進(jìn)行了一些探討[6]。但是,無論是利用線性化還是非線性化方法(包括直接調(diào)用統(tǒng)計軟件包),在Logistic模型參數(shù)估計中均存在一些共同的需要特別重視的問題。此外,對現(xiàn)有線性化方法進(jìn)行改進(jìn),探討一種既簡便易行又客觀準(zhǔn)確的線性化方法,對于缺乏較深數(shù)學(xué)基礎(chǔ)的實際工作者仍不失一種較好的選擇。

本文對目前Logistic模型參數(shù)估計中的問題進(jìn)行了分析,并對線性化方法進(jìn)行了再探討,提出了一種新的線性化方法——“最佳”觀測點數(shù)定向搜索法。將該方法應(yīng)用于實例的分析,獲得了滿意的擬合效果。

1 Logistic增長模型中a的估計方法

對于Logistic增長模型的擬合,絕大多數(shù)作者均將式(1)中的a、K和r作為3個獨立的參數(shù)進(jìn)行估計。在統(tǒng)計軟件包相關(guān)教程中,Verhulst模型的表達(dá)式也為y=b1/(1+b3exp(-b2x)),其中bi(i=1,2,3)為待估計的參數(shù)[7]。利用這些方法估計參數(shù),計算得到的理論初值常與實測初值不等,甚至差異很大。雖然唐啟義等[8]曾對上述作法提出過質(zhì)疑,但似乎并未引起重視。

因此,Logistic模型參數(shù)估計所必須解決的一個重要問題是:能將a作為與K和r一樣的獨立的參數(shù)估計嗎?經(jīng)過擬合得到的理論初值是否應(yīng)與實測初值N0相同?

為探討上述問題,將Logistic增長模型:

則待擬合的方程應(yīng)為式(6)而非式(2)。

1 利用線性回歸分析估計參數(shù)K和r的新方法:“最佳”觀測點數(shù)定向搜索法

關(guān)于參數(shù)K和r的估計,許多線性化方法是首先估計一個K值,然后將其代入式(2)估計r,因此r的估計在很大程度上依賴于K的估計精度并受回歸分析采用的觀測點數(shù)目的影響。若K值估計精度不夠高或不確定性較大或選擇的觀測點數(shù)目不恰當(dāng),均可能嚴(yán)重影響最終擬合結(jié)果。萬昌秀和梁中宇[3]提出的枚舉選優(yōu)法將種群達(dá)到平衡后的最大和最小觀測值作為K的上、下界,分別將該范圍內(nèi)的每個整數(shù)作為K值,并對每個K值均分別從全部觀測值中選取前m個觀測值(m=4,5,6,…,n;n為觀測值總數(shù))進(jìn)行回歸分析估計可能的r值,然后逐一比較各組參數(shù)估計值對應(yīng)的SSe,以SSe最小為標(biāo)準(zhǔn)確定最終參數(shù)估計值。該方法考慮全面、穩(wěn)妥可靠,明顯提高了擬合優(yōu)度;但因計算量大(種群數(shù)量很大和觀測數(shù)據(jù)很多的實驗數(shù)據(jù)尤其如此)而需編制專門的計算機程序,并難以處理非整數(shù)型數(shù)據(jù)或種群未達(dá)平衡狀態(tài)便終止實驗的不完整的觀測數(shù)據(jù)。

針對上述問題,在提出利用式(6)作為擬合方程的基礎(chǔ)上,本文提出一種新的線性化方法——“最佳”觀測點數(shù)定向搜索法。該方法的要點為:(1)首先確定適當(dāng)?shù)腒值初始搜索區(qū)間;(2)利用該區(qū)間端點和中值確定一個在整個K值搜索過程中進(jìn)行線性回歸分析時均可采用的適宜的觀測點數(shù)目,從而不必對每個K值均選取前m個觀測值進(jìn)行分析;(3)利用黃金分割法定向搜索K的最優(yōu)估計值。

1.1 K值初始搜索區(qū)間[Ka,Kb]的確定

1.1.1 完整實驗數(shù)據(jù)初始搜索區(qū)間的確定

對于實驗數(shù)據(jù)相對完整、有多個觀測值圍繞平衡數(shù)量波動的情況,一般來講,參數(shù)K的最優(yōu)估計值K*應(yīng)在這些觀測值的平均值(Km)附近,因此可直接將Km作為初始搜索區(qū)間的中值Kmid來確定初始搜索區(qū)間[Ka,Kb](Kmid=(Ka+Kb)/2)。若在這些數(shù)據(jù)中存在個別觀測值明顯偏大或偏小,可去除這些觀測值后再計算Km。初始搜索區(qū)間應(yīng)稍大一些,最好包括圍繞平衡數(shù)量波動的所有觀測值(異常值除外)。

1.1.2 不完整實驗數(shù)據(jù)初始搜索區(qū)間的確定

若種群未達(dá)平衡狀態(tài)便終止了實驗,則無法依據(jù)上述方法確定Kmid和初始搜索區(qū)間,而需預(yù)先估計一個搜索區(qū)間,然后再行調(diào)整。

(1)初始搜索區(qū)間的預(yù)估。對于增長曲線上端已經(jīng)明顯變緩的實驗數(shù)據(jù),可直接通過目測預(yù)估初始搜索區(qū)間[K'a,K'b],計算中值K'mid。若實驗數(shù)據(jù)明顯不完整,難以估計上漸近線的大致位置,則可隨機選取3組等時間間距觀測數(shù)據(jù)依據(jù)Pearl和Reed的三點法十分方便地估計3個K值,計算其均值Km,以Km作為區(qū)間中值K'mid初步估計初始搜索區(qū)間[K'a,K'b]。初始搜索區(qū)間應(yīng)包括上述3個K值并向上、下有一定延伸;對于增長曲線上端已出現(xiàn)轉(zhuǎn)折的實驗數(shù)據(jù),還應(yīng)包括轉(zhuǎn)折段的觀測值,以減小遺漏K*的可能性。

1.2 回歸分析采用的“最佳”觀測點數(shù)(M★)的確定

在K值搜索過程中,若初始搜索區(qū)間[Ka,Kb]設(shè)置比較合理,K*一般應(yīng)位于區(qū)間中值Kmid附近,搜索過程中(尤其后期)大多數(shù)探測點的K值往往也距Kmid相對較近,因此可利用區(qū)間端點和中值探測一個在整個K值搜索過程中進(jìn)行回歸分析時均可采用的適宜觀測點數(shù)(“最佳”觀測點數(shù)M*)。具體方法如下:

(1)對于初始搜索區(qū)間[Ka,Kb],分別根據(jù)式(6)計算端點Ka、Kb及中值Kmid對應(yīng)的Y值,在同一圖中作3個K值對應(yīng)的Y-t折線,然后在圖中找到符合下列條件的一點:在該點和該點之前,不僅3條Y-t折線的線性關(guān)系均較強且比較類似,而且包括的觀測點數(shù)目盡可能多,使依據(jù)這些觀測數(shù)據(jù)估計r時能夠利用更多實驗數(shù)據(jù)的信息和獲得更高的擬合優(yōu)度??梢钥吹?,該點一般對應(yīng)于3條Y-t折線呈明顯“Y”形分離的分叉點(將其對應(yīng)的觀測點數(shù)記為ms),但有時也可能為分叉點之前或之后的一點,因此比較適宜的觀測點數(shù)分別為ms-1、ms和ms+1。

本方法的關(guān)鍵在于以Ka、Kb及Kmid對應(yīng)的3條Y-t折線確定ms,因此可稱為“三線定點法”。

“三線定點法”的合理性證明:

在初始搜索區(qū)間[Ka,Kb]中,設(shè) Kc=Ka+ΔK(0≤ΔK≤Kb-Ka),則對于任一Kc,均有

因此,在Y-t圖中,隨著觀測點數(shù)目的變化(反映N的變化),不僅特定K值對應(yīng)的Yc值的變化趨勢、而且不同K值對應(yīng)的Yc值彼此之間的大小關(guān)系均可能發(fā)生明顯改變,由此必然影響參數(shù)r的估計結(jié)果。隨著N的增加,各個Kc=Ka+ΔK對應(yīng)的Y-t折線將按照ΔK的大小依次向下發(fā)生轉(zhuǎn)折,直至Kc大于全部N值。在區(qū)間[Ka,Kb]中,Ka最小,因此在N<Ka的數(shù)據(jù)范圍內(nèi),各個K值對應(yīng)的Y-t折線不僅均處于上升段而且位于兩端點對應(yīng)的Y-t折線之間。若以區(qū)間中值Kmid對應(yīng)的Y-t折線作為參照線,則在Ka、Kb和Kmid對應(yīng)的3條Y-t折線均呈較強線性關(guān)系的觀測點范圍內(nèi),其他任一Kc值對應(yīng)的Y-t折線也應(yīng)保持類似關(guān)系,因此可在整個K值搜索過程中以同樣的觀測點數(shù)目進(jìn)行回歸分析估計r。

以Gause(1934)雙小核草履蟲種群增長實驗(添加一環(huán)細(xì)菌)[9]為例。該實驗數(shù)據(jù)完整,有多個觀測值圍繞平衡數(shù)量上下波動,因此可直接以這些觀測值的平均值(Km=448)作為中值Kmid確定初始搜索區(qū)間「418,478」。為了更加清晰地反映不同K值對應(yīng)的Y-t折線之間的關(guān)系,避免實測值在平衡數(shù)量附近的波動對圖形的影響,首先以唐啟義等[16]的預(yù)測值代替實測值進(jìn)行分析(圖1左圖)。在預(yù)測值中,N7=409<Ka,N8=429>Ka,Nmax=N16=439。由圖可見,在前8個觀測點范圍內(nèi),所有Kc=Ka+ΔK(0<ΔK≤Kb-Ka)對應(yīng)的Yc-t折線均位于Ya-t折線之下且與Ya的偏離程度隨△K的增大而增大。在該范圍之后,對于所有KC<Nmax=439,其對應(yīng)的Yc-t折線均隨N的增加依次向下轉(zhuǎn)折,最終的Yc值隨ΔK的增大而增大。而對于其他Kc值,因KC>Nmax,其對應(yīng)的Yc值單調(diào)增加直至穩(wěn)定,且隨ΔK的增大而減小。各條Y-t折線明顯“Y”形分叉點對應(yīng)的觀測點數(shù)ms=7。

若直接以實驗觀測值計算Yc,則得圖1右圖。實驗觀測值N8=396<Ka,N9=443>Ka。由圖可見,盡管該圖右部各Y-t折線波動劇烈,但在前9個觀測點范圍內(nèi),Y-t折線的排列卻十分有序,Yc與Ya的偏離程度隨ΔK的增大而增大。各條Y-t折線明顯“Y”形分叉點對應(yīng)的觀測點數(shù)也為ms=7。

圖1 “三線定點法”示意圖。依據(jù)Gause(1934)雙小核草履蟲種群增長數(shù)據(jù)(添加一環(huán)細(xì)菌)[9]作圖。左:利用唐啟義等預(yù)測值[8]計算Y;右:利用Gause實測值計算Y。

1.3 K的“最優(yōu)”估計值(K★)的定向搜索

黃金分割法是運籌學(xué)中單變量非線性最優(yōu)化的重要方法[18],該法具有搜索方向明確、收斂速度快、計算簡單且計算量小的優(yōu)點,而且適用于整數(shù)型或非整數(shù)型觀測數(shù)據(jù)。利用該法搜索K*的具體作法如下:

(1)對于初 始搜索區(qū)間[Ka,Kb],搜索區(qū)間 長度L=Kb-Ka。在搜索區(qū)間內(nèi)距兩個端點各0.382 L處對稱插入兩個內(nèi)插點Kc和Kd,下內(nèi)插點Kc=Ka+0.382L,上內(nèi)插點Kd=Kb-0.382L=Ka+0.618L。分別將Kc和Kd代入式(6),選取前M*個觀測數(shù)據(jù)進(jìn)行回歸分析估計r,然后計算對應(yīng)的SSe。

(2)比較兩內(nèi)插點對應(yīng)的SSe,若下內(nèi)插點Kc的SSe較大,則舍棄下端點Ka,將Kc作為新區(qū)間的端點,并在上內(nèi)插點Kd與上端點Kb之間插入一個新的上內(nèi)插點;反之,若上內(nèi)插點Kd的SSe較大,則舍棄上端點Kb,將Kd作為新區(qū)間端點,并在Kc與Ka之間插入新的下內(nèi)插點。仍按照(?。┲械姆椒ㄓ嬎阈聝?nèi)插點的K值(此時L應(yīng)為縮小后的搜索區(qū)間長度)。

(3)多次重復(fù)步驟(ⅱ),通過不斷舍棄端點來逐漸縮小搜索范圍(第n次搜索后,搜索長度將縮小為初始長度L的0.618n倍),同時不斷插入新內(nèi)插點以加大對重點區(qū)域的搜索密度。當(dāng)SSe下降十分緩慢或達(dá)到實驗要求的精度時,即可將此時的K值作為“最優(yōu)”估計值K*。

1.4 方法小結(jié)

綜上所述,“最佳”觀測點數(shù)定向搜索法的主要分析步驟如下:

(1)完整實驗數(shù)據(jù)的擬合。

①實驗觀測數(shù)據(jù)的預(yù)處理。若原始實驗數(shù)據(jù)的初始時間t0≠0,則以t'=t-t0代替t。

②選取圍繞平衡數(shù)量波動的觀測值計算其平均值Km,以Km作為中值Kmid,確定初始搜索區(qū)間[Ka,Kb]。。

③利用“三線定點法”確定一個在整個K值搜索過程中進(jìn)行線性回歸時均可采用的“最佳”觀測點數(shù)M*。

④利用黃金分割法定向搜索參數(shù)K的“最優(yōu)”估計值K*和相應(yīng)的r值。

⑤此外,搜索到K*值之后,還可對其進(jìn)一步調(diào)整回歸分析采用的觀測點數(shù)目,以提高參數(shù)r的估計精度、獲得更好的擬合效果。

⑥將K*和最終獲得的r估計值r*代入式(6)或式(1)(積分常數(shù)a據(jù)K*和實測初值N0由式(5)解出),即可獲得Logistic增長模型。

(2)不完整實驗數(shù)據(jù)的擬合。

若實驗數(shù)據(jù)不完整,則需首先預(yù)估一個K值搜索區(qū)間(具體方法見1.1.2步驟(ⅰ)),作該區(qū)間端點和中值對應(yīng)的Y-t圖,確定ms;然后分別將端點和中值代入式(6)估計r(因兩個端點的K值往往相差較大,一般直接由前ms個觀測數(shù)據(jù)進(jìn)行回歸分析即可),計算3個K值對應(yīng)的SSe。若一側(cè)端點的SSe最低,則以該端點作為新區(qū)間的中值,將搜索區(qū)間向該側(cè)平移。重復(fù)上述調(diào)整過程,直至中值的SSe最低,最終確定初始搜索區(qū)間[Ka,Kb]。

其他步驟與上述完整實驗數(shù)據(jù)的分析相同。

2 實例分析及結(jié)果

利用“最佳”觀測點數(shù)定向搜索法對7個實例進(jìn)行了分析。其中,Gause(1934)草履蟲種群增長實驗[9]是種群生態(tài)學(xué)中最為經(jīng)典和重要的實驗。

2.1 完整實驗數(shù)據(jù)的分析過程

仍以Gause(1934)雙小核草履蟲種群增長實驗(添加一環(huán)細(xì)菌)[9]為例。由前面分析可知,本例初始搜索區(qū)間[418,478],Kmid=448,ms=7。取Kmid=448,分別以前6、7、8個觀測數(shù)據(jù)估計r。3個r值對應(yīng)的SSe分別為17436、14504和14970。ms=7對應(yīng)的SSe最小,因此確定M*=7。以前7個觀測數(shù)據(jù)進(jìn)行回歸分析估計r,經(jīng)8次搜索(表1),得K*=438,r*=1.1532。

表1 Gause(1934)雙小核草履蟲實驗數(shù)據(jù)(添加一環(huán)細(xì)菌)[9]K值搜索過程

2.2 不完整實驗數(shù)據(jù)初始搜索區(qū)間的確定

以王振中和林孔勛花生銹病顯癥動態(tài)試驗(Ⅰ)前19天的實驗數(shù)據(jù)[12]為例。該例觀測時間為第9-19天,相應(yīng)的觀測值(孢子堆數(shù)目)依次為79、126、257、625、1856、4000、7389、12133、16057、18898和22361。首先將原觀測時間轉(zhuǎn)換為 t=0~10 ;然后分別選取t=(0,5,10)、(1,5,9)和(2,5,8)對應(yīng)的觀測值,按照三點法[1]計算K值,得K=21564、17843和19204。將3個K值的均值Km=19537作為K'mid,分別向上、下各延伸4000預(yù)估初始搜索區(qū)間,得[15537,23537]。分別作K=15537、19537和23537對應(yīng)的Y-t圖,3條折線的明顯“Y”形分叉點對應(yīng)于ms=7。選取前7個觀測數(shù)據(jù)進(jìn)行回歸分析估計3個K值對應(yīng)的r值,計算SSe,分別為107790143、33024912和4105099。由于上端點K=23537對應(yīng)的SSe最低,因此將其作為新區(qū)間的中值,將初始搜索區(qū)間平移至[19537,27537]。對新區(qū)間進(jìn)行類似分析,得ms=8;選取前8個觀測數(shù)據(jù)估計r,以中值對應(yīng)的SSe最小,因此確定初始搜索區(qū)間為[19537,27537]。

2.3 個實例的分析結(jié)果

表2給出了7個實例的分析結(jié)果,相應(yīng)的Y-t折線圖分別見圖1-圖7。獲得“最優(yōu)”估計值K*后,均對其進(jìn)一步調(diào)整m值,以期提高參數(shù)r的估計精度,但最終均以m=M*對應(yīng)的 SSe最低。

表2 “最佳”觀測點數(shù)定向搜索法應(yīng)用實例分析

周賽花[13]誤將鄔祥光[4]第17天的實測值23.50看作28.50,因此擬合結(jié)果存在一定偏差。但為與周賽花提出的逐次加密

搜索法進(jìn)行比較,本文仍按其給出的數(shù)據(jù)進(jìn)行擬合。

圖2 Gause(1934)雙小核草履蟲(添加半環(huán)細(xì)菌)[17]Y-t圖

圖3 Gause(1934)大草履蟲(添加一環(huán)細(xì)菌)[17]Y-t圖

圖4 Gause(1934)大草履蟲(添加半環(huán)細(xì)菌)[17]Y-t圖

圖5 Carlson(1913)酵母種群[19]Y-t圖

圖6 稻癭蚊黃柄黑蜂[8]Y-t圖

圖7 花生銹病顯癥動態(tài)試驗Ⅰ(前19天數(shù)據(jù))[7]Y-t圖

3 與其他作者擬合結(jié)果的比較

表3 Gause(1934)雙小核草履蟲種群增長實驗數(shù)據(jù)[17]擬合結(jié)果的比較*

表4 Gause(1934)大草履蟲種群增長實驗數(shù)據(jù)[17]擬合結(jié)果的比較*

表5 Carlson(1913)酵母種群增長實驗數(shù)據(jù)[19]擬合結(jié)果的比較*

表6 稻癭蚊黃柄黑蜂種群增長數(shù)據(jù)[8]擬合結(jié)果的比較*

表8 花生銹病顯癥動態(tài)試驗(Ⅰ)前19天實驗數(shù)據(jù)[7]擬合結(jié)果的比較*

由上可見,與其他擬合方法比較,本文提出的“最佳”觀測點數(shù)定向搜索法具有如下優(yōu)點:

(1)不僅可以滿足Logistic增長模型的初值條件,保證理論初值與實測初值相等,使參數(shù)K和r的估計更為客觀準(zhǔn)確,而且能夠獲得理想的擬合效果,擬合優(yōu)度與唐啟義等[16]以及SPSS非線性回歸模塊(依據(jù)式(4))采用麥夸法的結(jié)果十分接近。

(2)每一步的分析結(jié)果都比較明確,最終擬合結(jié)果的不確定性小。

(3)可用于完整或不完整、整數(shù)型或非整數(shù)型實驗數(shù)據(jù)的擬合,適用范圍較之前的很多線性化方法明顯拓廣。

(4)原理簡單,計算量小,僅靠Excel即可輕松完成全部計算,很適于不熟悉統(tǒng)計軟件包的研究者利用。

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折線
折線圖案
沉降觀測在信陽市中樂百花酒店B座沉降觀測中的應(yīng)用