譚 偉,謝芝勛
(廣西壯族自治區(qū)獸醫(yī)研究所,廣西畜禽疫苗新技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣西南寧530001)
流感病毒屬于正黏病毒科,是單股負(fù)鏈、分節(jié)段的RNA 病毒。流感病毒基因組約為13kb,含有8個基因節(jié)段,分別編碼血凝素(haemagglutinin,HA)、神經(jīng)氨酸酶(neuraminidase,NA)、M1 基質(zhì)蛋白(matrix protein 1,M1)、M2 離子通道蛋白(M2ion-channel protein,M2)、NP核蛋白(nucleoprotein,NP)、NS 非結(jié)構(gòu)蛋白(nonstructural proteins,NS1、NS2)及RNA 聚合酶復(fù)合體(PB1蛋白、PB2蛋白、PA 蛋白)[1-3]。按照甲型流感病毒基因的大小,可將它們分為8個基因節(jié)段,即節(jié)段1(PB2基因)、節(jié)段2(PB1 基因)、節(jié)段3(PA 基因)、節(jié)段4(HA 基因)、節(jié)段5(NP 基因)、節(jié)段6(NA 基因)、節(jié)段7(M 基因)和節(jié)段8(NS基因)[1]。
目前的研究發(fā)現(xiàn)流感病毒至少可編碼15種病毒蛋白[4],其中PB2基因、HA 基因、NP基因和NA基因只能分別編碼1種蛋白,它們分別是PB2、HA、NP及NA 蛋白。而PB1基因、PA 基因、M 基因和NS基因則能分別編碼2種或2種以上的病毒蛋白,如PB1基因可以編碼PB1、PB1-F2及PB1-N40 3種蛋白;PA 基因能編碼PA、PA-X、PA-N155 和PAN182 4種蛋白;M 基因可以編碼M1、M2和M42 3種蛋白;而NS 基因則能編碼NS1 和NS2 2 種蛋白[4]。
M 基因在未經(jīng)剪接的情況下產(chǎn)生mRNA1 轉(zhuǎn)錄體,只編碼M1 基質(zhì)蛋白。2012 年Wise H M等[4-5]發(fā) 現(xiàn) 流 感 病 毒M 基 因 經(jīng)mRNA 選 擇 性 剪 接后可產(chǎn)生3 種不同結(jié)構(gòu)的mRNAs,即mRNA2、mRNA3和mRNA4。mRNA2可編碼由97個氨基酸(amino acid,aa)組成的M2離子通道蛋白;mRNA3可能會編碼由9 個aa 組成的一個短肽;而mRNA4則編碼一個新的流感病毒蛋白,即M42蛋白,由99個aa所組成[5]。本文將對流感病毒M 基因所編碼的M1、M2及M42蛋白進(jìn)行深入介紹。
流感病毒M 基因含1 027 個核苷酸(nucleotides,nt),編碼由252個aa組成的、分子質(zhì)量約為28ku的M1蛋白[1]。M1蛋白在流感病毒顆粒中的含量最高,每個病毒顆粒大約含有3 000 個M1 蛋白[1]。M1蛋白位于病毒囊膜下,起到連接病毒囊膜和核衣殼的作用,并可影響病毒的形態(tài)及構(gòu)型。M1蛋白在病毒感染細(xì)胞的后期才被合成,能與病毒核糖核蛋白體(viral ribonucleoproteins,vRNPs)相互作用,抑制病毒mRNA 的轉(zhuǎn)錄,并協(xié)助vRNPs從細(xì)胞核轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞漿[6]。M1蛋白與流感病毒復(fù)制有關(guān),能與HA 及NA 蛋白相互作用,并參與病毒子粒的裝配及釋放[6-7]。
在流感病毒感染的細(xì)胞內(nèi),大部分M1蛋白與鑲嵌于細(xì)胞膜中的HA 及NA 蛋白的C 末端相結(jié)合,而另一部分M1蛋白則可以進(jìn)入細(xì)胞核,這是因?yàn)镸1 蛋白含有核定位信號(nuclear localization signal,NLS)[6-7]。M1 蛋 白 可 分 為3 個 區(qū),即N 末端區(qū)、中間區(qū)和C 末端區(qū)。N 末端區(qū)(aa1-aa86)含有 核 外 運(yùn) 信 號(nuclear export signal,NES)(59ILGFVFTLTV68)[8];中間區(qū)(aa87-aa164)有一富含堿性氨基酸的區(qū)域,內(nèi)有1 個 NLS(95KAVKLYRKLKR105)及與NS2蛋白結(jié)合的位點(diǎn);C 末 端 區(qū)(aa165-aa252)能 與vRNPs 相 互 作用[6]。在成熟的病毒顆粒內(nèi),M1蛋白以2種形式存在,與鋅結(jié)合和不與鋅結(jié)合的形式,提示鋅可能參與調(diào)節(jié)M1蛋白的功能[9];另外,M1蛋白的磷酸化狀態(tài)也會影響M1蛋白的功能,從而影響流感病毒復(fù)制[10-11]。
與大多數(shù)RNA 病毒不同,流感病毒是在被感染細(xì)胞的核內(nèi)進(jìn)行復(fù)制的[12]。在流感病毒感染細(xì)胞的早期階段,vRNPs需要從細(xì)胞漿進(jìn)入細(xì)胞核;而在病毒感染的晚期階段,vRNPs則需要從細(xì)胞核被運(yùn)送到細(xì)胞漿,參與新的病毒顆粒的裝配。vRNPs的主要成分包括病毒RNA、NP 蛋白及RNA 聚合 酶 復(fù) 合 體(PB1、PB2、PA)[6-7]。據(jù) 報 道,M1蛋白、NS2 和NP 蛋白均參與將流感病毒的vRNPs從細(xì)胞核轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞漿的過程[8,13-15]。
M1蛋白的NES富含亮氨酸,在甲型流感病毒中很保守,但在乙型或丙型流感病毒的M1蛋白中沒有發(fā)現(xiàn)類似的NES[8],提示乙型和丙型流感病毒的M1蛋白可能含有不同的NES,或與其他的蛋白相互作用被運(yùn)出細(xì)胞核。NS2蛋白又被稱作核外運(yùn)蛋白(nuclear export protein,NEP),其N 末端含有NES(11DILLRMSKMQLES23)[7]。在 細(xì) 胞 核 內(nèi),當(dāng)M1蛋白的C末端與vRNPs結(jié)合后,M1蛋白的N 末端能與NS2蛋白的C 末端相結(jié)合。NS2蛋白N 末端的NES 可以和染色體區(qū)維持蛋白1(chromosome region maintenance protein 1,CRM1)結(jié)合,而CRM1通過與RanGTP 蛋白結(jié)合,就可以將vRNPs-M1-NS2-CRM1-RanGTP 復(fù) 合 體 運(yùn) 送 至 細(xì)胞漿[7,16]。目前還不清楚有多少M(fèi)1-NS2聚合體能與vRNPs結(jié)合。另外,M1-NS2只能與含流感病毒負(fù)鏈RNA 的vRNPs結(jié)合,而不能與含病毒正鏈RNA 的vRNPs結(jié)合,但M1-NS2聚合體是如何區(qū)分病毒的負(fù)鏈和正鏈RNA 的機(jī)制目前還不清楚。
M2蛋白是Lamb等于1981年首次發(fā)現(xiàn)的,由mRNA2轉(zhuǎn)錄體所編碼,而此轉(zhuǎn)錄體是由編碼M1蛋白的mRNA1 經(jīng)過選擇性剪接而產(chǎn)生的。mRNA1含有3個剪接供位(splice donor site,SD),分別是SD1、SD2和SD3[5]。若將含有mRNA1 的表達(dá)載體轉(zhuǎn)染細(xì)胞,則能檢測到mRNA3的表達(dá),但很難測到mRNA2轉(zhuǎn)錄體的表達(dá);只有當(dāng)流感病毒感染細(xì)胞的時候,才能檢測到mRNA2的表達(dá),這是由于流感病毒的聚合酶復(fù)合體可以封閉SD1,同時激活SD2,并啟動mRNA2的表達(dá)[17]。
mRNA1與mRNA2 的5′末端所含的51 個核苷酸是相同的,但它們的3′末端序列則不同。M2是由97個氨基酸殘基組成的膜蛋白,分子質(zhì)量約為15ku,而28ku 的M1 蛋白則位于病毒囊膜之下[1,4]。M2與M1蛋白N 末端的9個氨基酸相同(MSLLTEVET),但C 末端的氨基酸序列卻不同[18]。M2蛋 白 可 分 為3 個 功 能 區(qū)[18]:①N 末 端區(qū),含24個氨基酸,暴露于病毒囊膜表面;②跨膜區(qū),由19個氨基酸組成;③胞漿區(qū),由54個氨基酸組成。M2蛋白除了與病毒脫殼有關(guān),還參與病毒子粒的裝配并影響病毒的形態(tài)結(jié)構(gòu)[5]。
M2蛋白是除HA 及NA 蛋白之外的又一個病毒表面蛋白,但它并不是流感病毒復(fù)制所必需的[5]。雖然M2在病毒顆粒表面的數(shù)量有限,但很容易在流感病毒感染的細(xì)胞表面檢測到M2蛋白[19]。M2蛋白可形成由同源四聚體組成的陽離子通道,此通道受pH 調(diào)節(jié),能夠在酸性條件下被激活[20-22],導(dǎo)致病毒顆粒內(nèi)部的pH 下降,促使M1蛋白構(gòu)像發(fā)生改變并與vRNPs分離,病毒脫殼后vRNPs被釋放到細(xì)胞漿中[7,23]。
M2蛋白與HA 蛋白的成熟有關(guān),并能與M1蛋白相互作用參與新的病毒顆粒的裝配[4]。金剛烷胺(amantadine)是M2 蛋白的抑制劑,Davies等最先報道了金剛烷胺具有抗流感病毒的作用,隨后Hay A J等[24]證明金剛烷胺的作用靶位是M2蛋白。由于流感病毒容易突變,常產(chǎn)生對金剛烷胺的耐藥性,所以一般不首選金剛烷胺類藥物治療流感病人[25]。M2蛋白的N 末端含有24個氨基酸,暴露在病毒囊膜表面或存在于被流感病毒感染的細(xì)胞表面,這24個氨基酸被稱作M2e。M2e的氨基酸序列相對不易突變,在甲型流感病毒株中高度保守,尤其是其N末端的8個氨基酸(aa2~aa9:SLLTEVET)在幾乎所有亞型的甲型流感病毒中都是不變的,因此它也是研制流感通用疫苗的主要候選免疫原之一[26]。
流感病毒M 基因經(jīng)細(xì)胞的mRNA 選擇性剪接后可以產(chǎn)生mRNA4轉(zhuǎn)錄體,它可以編碼一個與M2相關(guān)的蛋白,即M42 蛋白[5]。通過M 基因產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄體mRNA2、mRNA3及mRNA4含有相同的3′端剪接受位(splice acceptor site,SA),但它們5′端的剪接供位卻不盡相同[4-5]。M1與M2蛋白所使用的是同一個翻譯起始密碼子 AUG1(nt26 ~nt28)[5],但此起始密碼子AUG1 附近的核苷酸與Kozak序列略有不同,即AUG1并非處于蛋白翻譯所需的最佳序列環(huán)境。距離AUG1起始密碼子-3位上的核苷酸雖是A,但+4 位上的核苷酸卻不是G。根據(jù)蛋白質(zhì)合成的漏過掃描翻譯模式,位于AUG1下游的AUG 也有可能作為翻譯起始密碼子啟動蛋白的合成,而M42蛋白正是使用了位于114位的AUG2(nt114~nt116)作為其蛋白翻譯的起始密碼子[5]。
M2蛋白可以編碼97個氨基酸,而M42蛋白可以編碼99個氨基酸。由于M2和M42蛋白合成使用了不同的起始密碼子和不一樣的翻譯閱讀框架,所以這兩種蛋白的氨基酸序列有所不同。M2蛋白的外膜部分含有24個氨基酸,而M42蛋白的外膜部分則含有26個氨基酸。這兩個蛋白的外膜部分有15個氨基酸是相同的,而外膜的其余部分則不一樣,因此M42與M2蛋白的外膜部分的抗原性有所不同[5]。但從M2蛋白N 末端的第10個氨基酸(也就是從M42蛋白N 末端的第12 個氨基酸)開始,M42蛋白與M2蛋白的序列是相同的,這可能就是為什么M42蛋白能夠替代M2蛋白,并具有M2蛋白的功能的主要原因[5]。
Wise H M 等[5]發(fā) 現(xiàn),mRNA2 的 表 達(dá) 水 平 與mRNA4的表達(dá)量呈負(fù)相關(guān),當(dāng)mRNA2 表達(dá)量變低時,mRNA4的表達(dá)量會增高,而且mRNA4編碼的M42蛋白可在體內(nèi)和體外試驗(yàn)中替代M2 蛋白的功能。mRNA4最初是在甲型流感病毒A/WSN/33(WSN)株中被發(fā)現(xiàn),但卻未能在A/Udorn/72(Udorn)/(H3N2)株中檢測到[27],說明mRNA4的表達(dá)可能受到某些細(xì)胞因子的調(diào)控。M42蛋白不是流感病毒復(fù)制所必需的,因?yàn)镸42蛋白僅在一些流感病毒株中表達(dá)[5]。由于mRNA4 是通過mRNA選擇性剪接所產(chǎn)生的,而哺乳動物細(xì)胞內(nèi)的mRNA選擇性剪接具有種屬和細(xì)胞特異性,因此mRNA4的表達(dá)可能僅限于被流感病毒感染的某些特定種屬的動物或細(xì)胞類型。
M42蛋白與M2 蛋白具有相同的跨膜區(qū),可M42蛋白是否具有依賴于pH 的陽離子通道作用目前還不太清楚。Wise H M 等[5]的研究發(fā)現(xiàn),在實(shí)驗(yàn)室構(gòu)建的流感病毒株P(guān)R8 MUd能表達(dá)M42 蛋白,而不表達(dá)M2蛋白,但此毒株對藥物金剛烷胺敏感,提示M42蛋白可能也具有介導(dǎo)陽離子轉(zhuǎn)運(yùn)的功能。M42被認(rèn)為是流感病毒的輔助蛋白,但它可以提高流感病毒在體外細(xì)胞培養(yǎng)中的繁殖效率。M42蛋白在病毒囊膜外的抗原性與M2蛋白不同,但它在體內(nèi)和體外試驗(yàn)中均可表現(xiàn)出與M2蛋白類似的功能。M42蛋白和M2蛋白在感染細(xì)胞內(nèi)的分布是不同的,M2蛋白鑲嵌在被感染細(xì)胞膜中,而M42蛋白則主要是位于高爾基氏體內(nèi)[5]。
目前研究人員已發(fā)現(xiàn),流感病毒的PB2、HA、NP和NA 4個基因分別只能編碼一種病毒蛋白,而其余的4個基因(PB1、PA、M 和NS)則分別可編碼2種或2種以上的病毒蛋白,說明流感病毒的一個基因并非總是編碼一個蛋白。通過利用細(xì)胞的mRNA 剪接機(jī)制,流感病毒M 基因至少可以產(chǎn)生3種不同形式的病毒mRNA,其中mRNA4編碼的M42蛋白是近年來新發(fā)現(xiàn)的又一個流感病毒蛋白,很有可能流感病毒基因組編碼的某些蛋白至今仍未被發(fā)現(xiàn)。
由于細(xì)胞內(nèi)mRNA 剪接形式及蛋白翻譯機(jī)制的不同,僅僅依賴病毒基因組或mRNA 的信息仍不足以全面地了解流感病毒基因組所能編碼的全部蛋白。今后有望通過病毒的蛋白質(zhì)組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)等技術(shù)方法,發(fā)現(xiàn)更多的流感病毒相關(guān)基因節(jié)段所編碼的新蛋白成員,這對深入了解和揭示流感病毒的蛋白組成、功能、病毒蛋白與細(xì)胞之間的相互作用,對病毒的診斷、抗病毒藥物和疫苗的研發(fā)將具有重要的理論和實(shí)踐意義。
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