国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

線(xiàn)粒體自噬調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展

2015-04-09 04:42:56王志舒譚曉榮劉洹洹
生物技術(shù)通報(bào) 2015年6期
關(guān)鍵詞:胞質(zhì)磷酸化酵母

王志舒 譚曉榮 劉洹洹

(河南工業(yè)大學(xué)生物工程學(xué)院,鄭州 450001)

線(xiàn)粒體自噬調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展

王志舒 譚曉榮 劉洹洹

(河南工業(yè)大學(xué)生物工程學(xué)院,鄭州 450001)

線(xiàn)粒體為細(xì)胞正常生命運(yùn)動(dòng)提供能量和物質(zhì);然而各種因素會(huì)導(dǎo)致線(xiàn)粒體損傷,衰老及功能紊亂,它們是細(xì)胞潛在的危險(xiǎn)因素,必需及時(shí)清除,線(xiàn)粒體自噬可以起到這一作用,維持細(xì)胞穩(wěn)態(tài)。當(dāng)細(xì)胞處于惡劣環(huán)境時(shí),線(xiàn)粒體自噬可通過(guò)降解線(xiàn)粒體補(bǔ)充生命必需物質(zhì),從而度過(guò)危機(jī)維持生存。另外線(xiàn)粒體自噬會(huì)在某些情況下通過(guò)降解正常線(xiàn)粒體來(lái)維持線(xiàn)粒體質(zhì)量和數(shù)量的平衡。不同生物中具有不同的線(xiàn)粒體自噬途徑和機(jī)制,酵母中主要通過(guò)Atg32磷酸化調(diào)控線(xiàn)粒體自噬;哺乳動(dòng)物中則存在分別由Parkin-PINK1、Nix、FUNDC1等不同蛋白介導(dǎo)的線(xiàn)粒體自噬調(diào)控機(jī)制;植物線(xiàn)粒體自噬的研究主要集中在擬南芥,其途徑及具體調(diào)控機(jī)制尚不明確。綜述了近年來(lái)酵母、動(dòng)物和植物中線(xiàn)粒體自噬的作用機(jī)制及調(diào)控因子等方面的研究進(jìn)展。

線(xiàn)粒體自噬;酵母;哺乳動(dòng)物;植物

1 自噬

1.1 自噬的過(guò)程及分類(lèi)

自噬具有保守性,存在于大部分真核細(xì)胞中。營(yíng)養(yǎng)缺乏、氧化脅迫、鹽脅迫或感染等不利條件,均會(huì)誘導(dǎo)自噬發(fā)生。根據(jù)包裹物和運(yùn)輸方式的不同,可以將自噬分為巨自噬(Macroautophagy)、微自噬(Microautophagy)、分子伴侶介導(dǎo)的自噬(Chaperonemediated autophagy),后面提到的自噬均指巨自噬。其大概過(guò)程是,首先在胞質(zhì)中形成一個(gè)獨(dú)立的雙層膜結(jié)構(gòu)——吞噬泡,在各種蛋白質(zhì)的協(xié)助下延伸,最終包裹胞質(zhì),向溶酶體(動(dòng)物)或液泡(植物和酵母)移動(dòng)并與其融合,所包裹的物質(zhì)在水解酶的作用下降解成小分子物質(zhì),再釋放到胞質(zhì)中被重新利用[1,2]。根據(jù)其對(duì)降解對(duì)象的選擇性,可分為非選擇性自噬和選擇性自噬。前者非選擇性的降解胞質(zhì)中的成分,后者選擇性的降解細(xì)胞器和蛋白質(zhì)。選擇性自噬主要包括Cvt(Cytoplasm to vacuole targeting)途徑、線(xiàn)粒體自噬(Mitophagy)、過(guò)氧化酶體自噬(Peroxisome)等。

1.2 線(xiàn)粒體自噬

線(xiàn)粒體是胞內(nèi)活性氧(reactive oxygen species,ROS)的主要來(lái)源,包括超氧陰離子(O2.-)、過(guò)氧化氫(H2O2)等。當(dāng)線(xiàn)粒體受到ROS攻擊,其DNA、蛋白質(zhì)、脂質(zhì)損傷時(shí),線(xiàn)粒體的電子傳遞鏈發(fā)生異常,可能會(huì)導(dǎo)致ROS的進(jìn)一步積累及線(xiàn)粒體損傷。受損、衰老、功能紊亂的線(xiàn)粒體破壞細(xì)胞穩(wěn)態(tài),可能導(dǎo)致ATP無(wú)法水解,產(chǎn)生過(guò)量ROS,并釋放死亡相關(guān)蛋白[3],非常危險(xiǎn),必需及時(shí)清除,而線(xiàn)粒體自噬正好可以實(shí)現(xiàn)這一功能。

線(xiàn)粒體自噬是一個(gè)復(fù)雜的生理過(guò)程,能夠維持線(xiàn)粒體質(zhì)量和數(shù)量的平衡,在饑餓及惡劣條件下維持細(xì)胞生存,并具有維持細(xì)胞內(nèi)環(huán)境穩(wěn)定等功能[4]。例如,線(xiàn)粒體分裂時(shí)產(chǎn)生的一些子代線(xiàn)粒體膜電位較低,功能紊亂,會(huì)優(yōu)先被線(xiàn)粒體自噬降解[5]。線(xiàn)粒體自噬可以通過(guò)清除一部分線(xiàn)粒體而維持細(xì)胞內(nèi)線(xiàn)粒體的數(shù)量和質(zhì)量的平衡。線(xiàn)粒體自噬不僅清除受損的線(xiàn)粒體,也會(huì)降解正常的線(xiàn)粒體,當(dāng)細(xì)胞處于惡劣環(huán)境時(shí),線(xiàn)粒體數(shù)量過(guò)多會(huì)加重運(yùn)行的負(fù)擔(dān),此時(shí)會(huì)降解正常的線(xiàn)粒體而維持生存[6]。

在酵母、植物和動(dòng)物中,均存在線(xiàn)粒體自噬,其誘導(dǎo)和調(diào)控機(jī)制有相似之處也各有不同。酵母線(xiàn)粒體自噬始于位于液泡附近的自噬體組裝位點(diǎn)/自噬吞噬前體(Pre-autophagosomal structure/Phagophore assembly site,PAS),且PAS只存在于酵母中,通過(guò)磷酸化自噬相關(guān)基因ATG32(AuTophaGy(ATG)-related genes),使PAS定位到特定線(xiàn)粒體。哺乳動(dòng)物紅細(xì)胞中Nix具有相似于ATG32的作用,且與ATG32具有相似序列,介導(dǎo)體細(xì)胞受損線(xiàn)粒體降解和網(wǎng)織紅細(xì)胞成熟過(guò)程中線(xiàn)粒體的清除。同時(shí)PINK1和E3連接酶Parkin以及FUNDC1也可以調(diào)控受損線(xiàn)粒體清除途徑[7]。不同條件下線(xiàn)粒體自噬的誘導(dǎo)方式不同,不同類(lèi)型細(xì)胞中的線(xiàn)粒體自噬機(jī)制也不同。對(duì)于植物中的線(xiàn)粒體自噬的研究還很少。研究表明擬南芥中也存在TOR基因,且對(duì)自噬起負(fù)調(diào)控作用[8],但是線(xiàn)粒體自噬調(diào)控因子尚不清楚。另有研究表明氧化脅迫不僅誘導(dǎo)小麥根細(xì)胞發(fā)生巨自噬,而且會(huì)誘導(dǎo)其發(fā)生線(xiàn)粒體自噬,降解受損及產(chǎn)生過(guò)量ROS的線(xiàn)粒體,而這可能是細(xì)胞在氧化脅迫條件下生存的策略之一[9]。目前植物線(xiàn)粒體自噬相關(guān)機(jī)制尚有待于進(jìn)一步研究[4]。

2 線(xiàn)粒體自噬調(diào)控機(jī)制

2.1 酵母線(xiàn)粒體自噬調(diào)控機(jī)制

酵母線(xiàn)粒體自噬主要由ATG32介導(dǎo),ATG32是酵母線(xiàn)粒體外膜蛋白,由529個(gè)氨基酸組成,推測(cè)具有單一的跨膜結(jié)構(gòu),其N(xiāo)端和C端分別暴露在胞質(zhì)和線(xiàn)粒體間質(zhì)中[10]。ATG32與ATG8、 ATG11相互作用,構(gòu)成啟動(dòng)聚合體,啟動(dòng)線(xiàn)粒體自噬,尤其在氮饑餓條件下,ATG32-ATG11作用增強(qiáng),誘導(dǎo)線(xiàn)粒體自噬的發(fā)生[11]。ATG32是酵母線(xiàn)粒體自噬所特有的,作為一種受體蛋白,ATG32磷酸化使線(xiàn)粒體自噬特異性的降解受損或多余的線(xiàn)粒體[4,11,12]。ATG32的敲除并不能影響非選擇性自噬、Cvt途徑、過(guò)氧化酶體自噬的發(fā)生,但完全抑制線(xiàn)粒體自噬的發(fā)生。線(xiàn)粒體受損后,線(xiàn)粒體膜ATG32上Ser-114與Ser-119磷酸化,尤其是Ser-114的磷酸化,介導(dǎo)了ATG32-ATG11復(fù)合體的形成和線(xiàn)粒體自噬。ATG32與 ATG11結(jié)合構(gòu)成復(fù)合物,可以募集線(xiàn)粒體到PAS,一般認(rèn)為ATG32-ATG11的結(jié)合是線(xiàn)粒體降解的第一步。在募集線(xiàn)粒體過(guò)程中,ATG32同時(shí)與ATG8相互作用,其作用是促進(jìn)吞噬膜包裹線(xiàn)粒體[13]。酵母雙雜交和免疫沉淀反應(yīng)試驗(yàn)證明ATG32可以與ATG11和ATG8結(jié)合。ATG11是選擇性自噬中的一種銜接蛋白,與自噬小體上的受體蛋白識(shí)別定位。ATG8與吞噬泡的擴(kuò)張有關(guān),而LC3(Light Chain 3)是ATG8在哺乳動(dòng)物中的同系物,且LC3參與自噬體膜來(lái)源和目標(biāo)識(shí)別過(guò)程[14],ATG8與LC3分別與ATG19和p62結(jié)合,類(lèi)似于酵母中的ATG8-PE的作用[15,16]。在ATG32 N-端裸露在胞質(zhì)的區(qū)域有一段WXXI/L/V序列(又稱(chēng)為WQAI結(jié)構(gòu)域)[17]是ATG8結(jié)合域,同樣存在于ATG19、p62[18-20]。

2005年,已報(bào)道ATG11C端的第4個(gè)α螺旋結(jié)構(gòu)域與ATG19相互作用介導(dǎo)Cvt途徑的發(fā)生[21],且其在真核生物中沒(méi)有同源序列[22]。2011年,Yoshimasa等[23]證明在線(xiàn)粒體自噬中,ATG11同一區(qū)域與磷酸化的ATG32相互作用,介導(dǎo)線(xiàn)粒體自噬的發(fā)生,通過(guò)控制ATG32磷酸化酶的活性或定位可以調(diào)控線(xiàn)粒體自噬。但是關(guān)于ATG32磷酸化酶還沒(méi)有相關(guān)的報(bào)道。當(dāng)ATG32缺失時(shí),在利用非發(fā)酵性碳作為碳源時(shí),細(xì)胞生長(zhǎng)正常,且胞內(nèi)ROS水平不變,這意味著存在另一條不依賴(lài)于ATG32的線(xiàn)粒體自噬途徑[22]。

2.2 哺乳動(dòng)物線(xiàn)粒體自噬調(diào)控機(jī)制

2.2.1 Parkin和PINK1介導(dǎo)的線(xiàn)粒體自噬機(jī)制 帕金森?。≒arkinson’s disease,PD)相關(guān)基因中有兩個(gè)與線(xiàn)粒體自噬相關(guān)的基因,PINK1(PTEN-induced putative kinase protein 1,PINK1)和Parkin,分別由PARK2和PARK6編碼[24],它們介導(dǎo)多細(xì)胞動(dòng)物中多種類(lèi)型細(xì)胞線(xiàn)粒體自噬[25],且更傾向于清除去極化線(xiàn)粒體。

PINK1介導(dǎo)有缺陷的線(xiàn)粒體清除。在正常線(xiàn)粒體中,PINK1(64 kD)的表達(dá)量維持在很低的水平;PINK1在胞質(zhì)內(nèi)表達(dá),由581個(gè)氨基酸組成,其N(xiāo)端有與線(xiàn)粒體識(shí)別的區(qū)域線(xiàn)粒體靶向序列(mitochondrial targeting sequences,MTS)、TM、Kinase[13];PINK1通過(guò)與線(xiàn)粒體外膜上線(xiàn)粒體外膜轉(zhuǎn)運(yùn)酶(translocase outer menbrane,TOM)復(fù)合物作用,進(jìn)入線(xiàn)粒體膜間腔,隨后與內(nèi)膜上的TIM(translocase inner menbrane)復(fù)合物作用,并且迅速的被內(nèi)膜上的早老素相關(guān)菱形蛋白(Presenilin-associated rhomboidlike protein,PARL)分解,這個(gè)過(guò)程使具有極性的線(xiàn)粒體中PINK1的水平較低,抑制線(xiàn)粒體自噬在正常線(xiàn)粒體中進(jìn)行[26]。而當(dāng)線(xiàn)粒體受損或功能障礙時(shí),線(xiàn)粒體膜電勢(shì)減弱,PINK1不能與TOM正常結(jié)合,但仍能與線(xiàn)粒體外膜的結(jié)合,大量的在線(xiàn)粒體外膜上聚集,并且從胞質(zhì)中募集Parkin到線(xiàn)粒體膜上。

Parkin是由PARK6基因(又稱(chēng)為PARKIN基因)編碼的含有465個(gè)氨基酸的E3泛素連接酶。它介導(dǎo)受損線(xiàn)粒體的清除(線(xiàn)粒體自噬),在PINK1誘導(dǎo)途徑下游起作用。Parkin過(guò)量表達(dá)產(chǎn)物聚集在線(xiàn)粒體外膜,使多種外膜蛋白泛素化,如線(xiàn)粒體融合蛋白(mitochondrial fusion proteins和mitofusin)MFN1、MFN2。Parkin能夠通過(guò)介導(dǎo)哺乳動(dòng)物細(xì)胞中MFN1、 MFN2的降解阻止線(xiàn)粒體的融合,從而使去極化線(xiàn)粒體與正常線(xiàn)粒體區(qū)分開(kāi)[27],其主要作用是去極化線(xiàn)粒體的識(shí)別。同時(shí)Parkin也可以使蒼蠅中MARF(mitochondrial assembly regulatory factor) 和 VDAC1(voltage dependent anion channel 1)[28,29]等蛋白泛素化,但MARF和VDAC1的降解過(guò)程還不清楚。

當(dāng)PINK1在線(xiàn)粒體外膜積累時(shí),Parkin可以與3種PINK1的異構(gòu)體結(jié)合,具體的分子機(jī)理還不清楚。但采用系列突變?cè)囼?yàn)證明PINK1通過(guò)磷酸化Parkin(目前還沒(méi)有證據(jù)證明PINK1可以直接使Parkin磷酸化)[30,31]和加強(qiáng)E3泛素連接酶的功能[32]控制Parkin在特定線(xiàn)粒體上的聚集。隨后,Parkin使線(xiàn)粒體外膜蛋白泛素化,泛素化的蛋白被受體蛋白p62識(shí)別,p62標(biāo)記在去極化的線(xiàn)粒體上,LC3通過(guò)與p62結(jié)合定位于去極化的線(xiàn)粒體上,使其被自噬小泡包裹。p62的作用至今還具有爭(zhēng)議性,Huang等[33]證明p62的敲除使線(xiàn)粒體自噬減弱,稱(chēng)p62是Parkin介導(dǎo)的線(xiàn)粒體自噬中所必需的,但其他途徑誘導(dǎo)的線(xiàn)粒體自噬中是否具有相同的作用還有待于進(jìn)一步研究證明。與此同時(shí),Ambra1與Parkin結(jié)合,并作用于PI3KIII,在識(shí)別的線(xiàn)粒體周?chē)纬尚碌耐淌膳?,隨后的吞噬泡的延展與LC3相關(guān)[34,35]。

2.2.2 FUNDC1介導(dǎo)的線(xiàn)粒體自噬機(jī)制 Liu和Chen等[36]2012年發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的介導(dǎo)哺乳動(dòng)物細(xì)胞線(xiàn)粒體自噬的受體分子FUNDC1。FUNDC1由155個(gè)氨基酸組成,在果蠅到人類(lèi)的大部分哺乳動(dòng)物中具高度保守性。通過(guò)分餾法和FUNDC1抗體的免疫染色法確定FUNDC1位于線(xiàn)粒體上,并且具有3個(gè)α-螺旋,是一種跨膜蛋白。其中膜外的N端氨基序列中包含一段保守LIR(LC3-interaction region):Y(18)xxL(21),可以與LC3相互作用,介導(dǎo)低氧誘導(dǎo)的線(xiàn)粒體自噬。通過(guò)LIR保守結(jié)構(gòu)域突變或敲除實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)此結(jié)構(gòu)域失活后能夠抑制FUNDC1與LC3的相互作用和線(xiàn)粒體自噬發(fā)生。為進(jìn)一步了解FUNDC1與LC3相互作用和線(xiàn)粒體自噬調(diào)控機(jī)制,通過(guò)大量的光譜分析發(fā)現(xiàn)LIR中的Tyr 18 是一個(gè)可磷酸化位點(diǎn),而且低氧條件下磷酸化水平降低。推測(cè)在正常情況下,F(xiàn)UNDC1能被Src激酶磷酸化。低氧情況下,Src激酶的活性降低,導(dǎo)致FUNDC1磷酸化水平降低,從而促進(jìn)其與LC3相互作用和線(xiàn)粒體自噬。

2.2.3 Nix介導(dǎo)線(xiàn)粒體自噬機(jī)制 Nix是Bcl-2家族中的一種類(lèi)NIP3蛋白(NIP3-like protein X,NIX,又稱(chēng)為BNIP3L)。Nix可以作為一種線(xiàn)粒體受體蛋白與ATG8的同系物L(fēng)C3和GABARAP(receptorassociated protein)[37]相互作用。在哺乳動(dòng)物紅細(xì)胞的成熟過(guò)程中,Nix介導(dǎo)的線(xiàn)粒體自噬對(duì)于線(xiàn)粒體的移除起到至關(guān)重要的作用[7],是一種不可或缺的物質(zhì),它的功能類(lèi)似于酵母線(xiàn)粒體自噬中的ATG32,但又不盡相同。ATG32的N端有一段WXXI/L/V序列,Nix的N端也存在一段WXXL序列。Nix的WXXL結(jié)構(gòu)域可以與ATG8同系物連接,特別是與LC3和GABARAP作用時(shí),Nix的結(jié)合程度更強(qiáng)。在體外培養(yǎng)的細(xì)胞中,Nix通過(guò)自身LC3結(jié)合域使GABARAP-L1聚集到受損線(xiàn)粒體,在紅細(xì)胞中,Nix:LC3/GABARAP結(jié)合受阻,線(xiàn)粒體自噬增強(qiáng)[37]。

Nix可以引起細(xì)胞死亡和自噬。Nix最初的發(fā)現(xiàn)源于它與BNIP3的cDNA具有56%的相似性。Nix在功能上也與BNIP3具有相似性,它們的C端跨膜域通過(guò)與BCL2和BCL-XL作用,誘發(fā)細(xì)胞凋亡。當(dāng)然也有不同之處[38]。對(duì)于Nix的功能,目前主要有3種假說(shuō)。一是Nix引起線(xiàn)粒體去極化,激活自噬清除線(xiàn)粒體。有證據(jù)支持這種假說(shuō):體外培養(yǎng)Nix缺陷網(wǎng)織紅細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)線(xiàn)粒體的清除受阻[39]。第二,Nix具有一種新功能,募集自噬相關(guān)的組分;獨(dú)立于它的另一種功能,使線(xiàn)粒體去極化。Nix與酵母中其他的自噬相關(guān)蛋白不具同源性[40],而且在真核細(xì)胞中,Nix缺陷并不能減弱自噬強(qiáng)度,但卻使線(xiàn)粒體與自噬泡的識(shí)別受阻[41]。第三,Ivan Dikic認(rèn)為Nix作為一種銜接蛋白,可以與LC3互作,將相關(guān)的蛋白募集到線(xiàn)粒體[42],并與自噬體膜的延伸有關(guān)[37]。Zhang等[42]通過(guò)小鼠實(shí)驗(yàn)得出的結(jié)論支持Nix受體假說(shuō),并進(jìn)一步說(shuō)明起作用的功能域中具有3個(gè)連續(xù)的疏水氨基殘基并且側(cè)端帶電。最后一種假說(shuō)中,Nix在細(xì)胞死亡和自噬這兩個(gè)過(guò)程中共同作用[43]。

2.3 植物線(xiàn)粒體自噬調(diào)控機(jī)制通路

目前,植物自噬、線(xiàn)粒體自噬研究較多地集中于擬南芥和簡(jiǎn)單藻類(lèi)。植物在營(yíng)養(yǎng)饑餓時(shí)通過(guò)自噬降解一些物質(zhì)緩解壓力[44];自噬可調(diào)控細(xì)胞死亡以應(yīng)對(duì)病原體免疫反應(yīng)[45]。當(dāng)植物細(xì)胞受到氧化脅迫時(shí)會(huì)通過(guò)自噬降解特定的蛋白,同時(shí)通過(guò)線(xiàn)粒體自噬降解一部分線(xiàn)粒體緩解胞內(nèi)氧化脅迫[8]。在小麥根中,氧化脅迫不僅引起非選擇性自噬也可引起線(xiàn)粒體自噬[4]。植物中參與線(xiàn)粒體自噬的蛋白及因子尚不清楚,但已知擬南芥中不具有明顯的ATG11、ATG32和ATG33同源物[4]。但最新研究在擬南芥中發(fā)現(xiàn)ATG11,且證明ATG11(也可能是ATG101)在巨自噬和線(xiàn)粒體自噬中為ATG1/13復(fù)合體起到重要的支架連接作用,ATG11缺乏植株提前衰老且對(duì)C和固定C缺乏異常敏感[46]?,F(xiàn)在已知的植物中存在ATG8、ATG3、ATG6等自噬相關(guān)蛋白,但目前只發(fā)現(xiàn)一種與線(xiàn)粒體自噬相關(guān)的蛋白——ATG4。一些線(xiàn)粒體毒性物質(zhì)尤其是抗霉素A處理可導(dǎo)致植物體內(nèi)ATG4表達(dá)大幅度增加(最高達(dá)6倍),由此推測(cè)ATG4在線(xiàn)粒體自噬中具有一定的作用[46]。ATG4是自噬小泡膜蛋白[47],在植物細(xì)胞受到氧化脅迫時(shí),ATG4識(shí)別受損線(xiàn)粒體,使自噬小泡定位到特定線(xiàn)粒體上,但ATG4的受體蛋白仍不清楚。ATG4是一種半胱氨酸蛋白酶,可以通過(guò)剪切和去脂作用調(diào)節(jié)ATG8蛋白的脂化修飾。已發(fā)現(xiàn)在擬南芥ATG4存在兩個(gè)拷貝——AtAtg4a和AtAtg4b。AtAtg8在擬南芥中具有9個(gè)拷貝(AtAtg8a-i)[48],這兩種AtAtg4對(duì)9個(gè)AtAtg8的不同處理過(guò)程現(xiàn)在還不清楚。目前為止,植物線(xiàn)粒體自噬調(diào)控機(jī)制尚未明確,但根據(jù)已知的酵母或哺乳動(dòng)物線(xiàn)粒體自噬過(guò)程推測(cè)。

3 結(jié)語(yǔ)

人類(lèi)多數(shù)癌癥、腫瘤[45]、肌肉性疾?。?5]、神經(jīng)變性疾病的發(fā)病機(jī)理與線(xiàn)粒體是否穩(wěn)定有關(guān)?,F(xiàn)已證明帕金森病、阿爾茨海默病、亨廷頓病的發(fā)病與線(xiàn)粒體功能紊亂有關(guān)。線(xiàn)粒體是細(xì)胞能量代謝和細(xì)胞存活、死亡的重要調(diào)控器。線(xiàn)粒體損傷使ROS積累、ATP產(chǎn)生異常,并進(jìn)一步導(dǎo)致線(xiàn)粒體DNA損傷,發(fā)生功能紊亂。線(xiàn)粒體自噬可清除功能紊亂的線(xiàn)粒體,以減弱細(xì)胞內(nèi)ROS的積累,降低細(xì)胞癌化率,避免細(xì)胞凋亡、壞死。線(xiàn)粒體自噬機(jī)理的研究可為現(xiàn)階段癌癥、腫瘤、神經(jīng)變性等疾病提供新的治療方向,如可通過(guò)調(diào)控線(xiàn)粒體自噬而防止或減輕病變。已有研究證明,通過(guò)誘導(dǎo)線(xiàn)粒體自噬發(fā)生,促使腫瘤細(xì)胞死亡是一種可行的腫瘤治療方案,如低強(qiáng)度超聲波可在姜黃素存在條件下誘導(dǎo)線(xiàn)粒體自噬,從而促進(jìn)鼻咽癌CNE2細(xì)胞死亡[49]。利用誘導(dǎo)多能干細(xì)胞治療腫瘤是近年來(lái)新的研究方向,而Vazquez-Martin發(fā)現(xiàn)線(xiàn)粒體自噬參與誘導(dǎo)多能干細(xì)胞的轉(zhuǎn)化過(guò)程,從而為通過(guò)調(diào)控線(xiàn)粒體自噬治療腫瘤提供了又一思路[26]。由于不同的因素誘導(dǎo)的線(xiàn)粒體自噬具有不同的途徑,在不同組織發(fā)生的線(xiàn)粒體自噬的機(jī)制也不盡相同。但具體的誘導(dǎo)信號(hào)通路還未明確,有待進(jìn)一步的深入研究。近幾十年來(lái),已逐漸弄清酵母及哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的線(xiàn)粒體自噬調(diào)控機(jī)制,而植物中的研究尚處于探索階段,線(xiàn)粒體自噬是否參與植物免疫反應(yīng)及植物抗病,尚待進(jìn)一步研究。

[1] Nakatogawa H, Kamada Y, Kamada Y. Dynamics and diversity in autophagy mechanisms:lessons from yeast[J]. Nat Rev Mol Cell Biol, 2009, 10(7):458-467.

[2] Yang Z, Klionsky DJ. Eaten alive:a history of macroautophagy[J]. Nat Cell Biol, 2010, 12(9):814-822.

[3] Kim I, Rodriguez-Enriquez S, LemastersJJ. Selective degradation of mitochondria by mitophagy[J]. Arch Biochem Biophys, 2007,462:245-253.

[4] MinibayevaF, Dmitrieva S, Ponomareva A. Oxidative stressinduced autophagy in plants:the role of mitochondria[J]. Plant Physiology and Biochemistry, 2012, 59:11-19.

[5] Twig G, Elorza A, Molina A, et al. Fission and selective fusion govern mitochondrial segregation and elimination by autophagy[J]. EMBO Journal, 2008, 27(2):433-446.

[6] Bhatia-Kissova I, Camougrand N. Mitophagy:a process that adapts to the cell physiology[J]. Int J Biochem Cell Biol, 2013, 45:30-33.

[7] Ashrafi G, Schwarz TL. The pathways of mitophagy for quality control and clearance of mitochondria[J]. Cell Death Differ, 2013, 20(1):31-42.

[8] Liu Y, Bassham DC. TOR is a negative regulator of autophagy in Arabidopsis thaliana[J]. PLoS One, 2010. 5(7):e11883.

[9] Okamoto K, Kondo-Okamoto N, Ohsumi Y. Mitochondria-anchored receptor Atg32 mediates degradation of mitochondria via selective autophagy[J]. Dev Cell, 2009, 17(1):87-97.

[10] Kondo-Okamoto N, Noda NN, Suzuki SW, et al. Autophagyrelated protein 32 acts as autophagic degron and directly initiates mitophagy[J]. J Biol Chem, 2012, 287(13):10631-10638.

[11] Kanki T, Klionsky DJ, Okamoto K. Mitochondria autophagy in yeast[J]. Antioxid Redox Signal, 2011, 14(10):1989-2001.

[12] Kanki T, Wang K, Cao Y, et al. Atg32 is a mitochondrial protein that confers selectivity during mitophagy[J]. Dev Cell, 2009, 17(1):98-109.

[13] Hirota Y, Kang D, Kanki T. The physiological role of mitophagy:new insights into phosphorylation events[J]. Int J Cell Biol,2012, 2012:354914.

[14] Kabeya Y, Mizushima N, Ueno T, et al. LC3, a mammalian homologue of yeast Apg8p, is localized in autophagosome membranes after processing[J]. EMBO J, 2000, 19:5720-5728.

[15] Ichimura Y, Kirisako T, Takao T, et al. A ubiquitin-like system mediates protein lipidation[J]. Nature, 2000, 408:488-492.

[16] Mizushima N, Levine B, Cuervo AM, Klionsky DJ. Autophagy fights disease through cellular self-digestion[J]. Nature, 2008, 451(7182):1069-1075.

[17] Kanki T, Wang K, Baba M, et al. A genomic screen for yeast mutants defective in selective mitochondria autophagy[J]. Mol Biol Cell, 2009, 20(22):4730-4738.

[18] Noda NN, Kumeta H, Nakatogawa H, et al. Structural basis of target recognition by Atg8/LC3 during selective autophagy[J]. Genes Cells, 2008, 13(12):1211-1218.

[19] Pankiv S, Clausen T, Lamark T, et al. p62/SQSTM1 binds directly to Atg8/LC3 to facilitate degradation of ubiquitinated protein aggregates by autophagy[J]. J Biol Chem, 2007, 282(33):24131-24145.

[20] Ichimura Y, Kumanomidou T, Sou Y, et al. Structural basis for sorting mechanism of p62 in selective autophagy[J]. J Biol Chem, 2008, 283(33):22847-22857.

[21] Yorimitsu T, Klionsky DJ. Atg11 links cargo to the vesicle-forming machinery in the cytoplasm to vacuole targeting pathway[J]. Mol Biol Cell, 2005, 16(4):1593-1605.

[22] Ashrafi G, Schwarz TL. The pathways of mitophagy for quality control and clearance of mitochondria[J]. Cell Death and Differentiation, 2013, 20(1):31-42.

[23] Aoki Y, Kanki T, Hirota Y, et al. Phosphorylation of Serine 114 on Atg32 mediates mitophagy[J]. Mol Biol Cell, 2011, 22(17):3206-3217.

[24] Springer W, Kahle PJ. Regulation of PINK1-Parkin-mediated mitophagy[J]. Autophagy, 2011, 7(3):266-278.

[25] Youle RJ, Narendra DP. Mechanisms of mitophagy[J]. Nat Rev Mol Cell Biol, 2011, 12(1):9-14.

[26] Vazquez-Martin A, Cufi S, Corominas-Faja B, et al. Mitochondrial fusion by pharmacological manipulation impedes somatic cell reprogramming to pluripotency:new insight into the role of mitophagy in cell stemness[J]. Aging, 2012, 4(6):393-401.

[27] Jin SM, Youle RJ. PINK1- and Parkin-mediated mitophagy at a glance[J]. J Cell Sci, 2012, 125(Pt 4):795-799.

[28] Gegg ME, Cooper JM, Chau KY, et al. Mitofusin 1 and mitofusin 2 are ubiquitinated in a PINK1/parkin-dependent manner upon induction of mitophagy[J]. Hum Mol Genet, 2010, 19(24):4861-4870.

[29] Journo D, Mor A, Abeliovich H. Aup1-mediated regulation of Rtg3 during mitophagy[J]. J Biol Chem, 2009, 284:35885-35895.

[30] Kim Y, Park J, Kim S, et al. PINK1 controls mitochondrial localization of Parkin through direct phosphorylation[J]. Biochem Biophys Res Commun, 2008, 377(3):975-980.

[31] Moriwaki Y, Kim YJ, Ido Y, et al. L347P PINK1 mutant that fails to bind to Hsp90/Cdc37 chaperones is rapidly degraded in a proteasome-dependent manner[J]. Neurosci Res, 2008, 61(1):43-48.

[32] Sha D, Chin LS, Li L. Phosphorylation of parkin by Parkinson disease-linked kinase PINK1 activates parkin E3 ligase function and NF-kappaB signaling[J]. Hum Mol Genet, 2010, 19(2):352-363.

[33] Huang C, Andres AM, Ratliff EP, et al. Preconditioning involves selective mitophagy mediated by Parkin and p62/SQSTM1[J]. PLoS One, 2011, 6(6):20975-20975.

[34] Van Humbeeck C, Cornelissen T, Vandenberghe W. Ambra1:a Parkin-binding protein involved in mitophagy[J]. Autophagy,2011, 7(12):1555-1556.

[35] Van Humbeeck C, Cornelissen T, Hofkens H, et al. Parkin interacts with Ambra1 to induce mitophagy[J]. J Neurosci, 2011, 31(28):10249-10261.

[36] Liu L, Feng D, Chen M, et al. Mitochondrial outer-membrane protein FUNDC1 mediates hypoxia-induced mitophagy in mammalian cells[J]. Nat Cell Biol, 2012, 14(2):177-185.

[37] Novak I, Kirkin V, McEwan DG, et al. Nix is a selective autophagy receptor for mitochondrial clearance[J]. EMBO Rep, 2010, 11(1):45-51.

[38] Chen G, Cizeau J, Velde C, et al. Nix and Nip3 form a subfamily of pro-apoptotic mitochondrial proteins[J]. J Biol Chem, 1999, 274(1):7-10.

[39] Sandoval H, Thiagarajan P, Dasgupta SK, et al. Essential role for Nix in autophagic maturation of erythroid cells[J]. Nature, 2008,454(7201):232-235.

[40] Yorimitsu T, Klionsky DJ. Autophagy:molecular machinery for self-eating[J]. Cell Death Differ, 2005, 12:1542-1552.

[41] Schweers RL, Zhang J, Randall MS, et al. NIX is required for programmed mitochondrial clearance during reticulocyte maturation[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2007, 104(49):19500-19505.

[42] Zhang J, Ney PA. Role of BNIP3 and NIX in cell death, autophagy,and mitophagy[J]. Cell Death Differ, 2009, 16(7):939-946.

[43] Maiuri MC, Tasdemir E, Criollo A, et al. Control of autophagy by oncogenes and tumor suppressor genes[J]. Cell Death Differ,2009, 16(1):87-93.

[44] Xiong Y, Contento A, Nguyen PQ, et al. Degradation of oxidized proteins by autophagy during oxidative stress in Arabidopsis[J]. Plant Physiol, 2007, 143(1):291-299.

[45] Lisanti MP, Martinez-Outschoorn UE, Chiavarina B, et al. Understanding the “l(fā)ethal” drivers of tumor-stroma co-evolution:emerging role(s)for hypoxia, oxidative stress and autophagy/ mitophagy in the tumor micro-environment[J]. Cancer Biol Ther,2010, 10(6):537-542.

[46] Li F, Chung T, Vierstra RD. AUTOPHAGY-RELATED11 plays a critical role in general autophagy- and senescence-induced mitophagy in Arabidopsis[J]. Plant Cell, 2014, 26:788-807.

[47] Betin VM, Lane JD. Atg4D at the interface between autophagy and apoptosis[J]. Autophagy, 2009, 5(7):1057-1059.

[48] Woo J, Park E, andDinesh-Kumar SP. Differential processing of Arabidopsis ubiquitin-like Atg8 autophagy proteins by Atg4 cysteine proteases[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 2014, 111(2):863-868.

[49] Wang X, Leung AW, Luo J, Xu C. TEM observation of ultrasoundinduced mitophagy in nasopharyngeal carcinoma cells in the presence of curcumin[J]. Exp Ther Med, 2012, 3:146-148.

(責(zé)任編輯 狄艷紅)

Research Advances in the Regulation Mechanism of Mitophagy

Wang Zhishu Tan Xiaorong Liu Huanhuan
(College of Biological Engineering,Henan University of Technology,Zhengzhou 450001)

Mitochondria provide energy and materials for cells, while a variety of factors can lead to damage, aging and dysfunction of mitochondria, and they are potentially dangerous for the cells and must be cleared promptly. Mitophagy can fulfill above task and maintain cell homeostasis. Under some severe conditions, mitophagy supplies living-essentials by degrading mitochondria and helps the cells survive. Additionally mitophagy may play a role in controlling the quantity and quality of mitochondria through degrading some normal mitochondria. There are different pathways and mechanisms in different organisms. In yeast, mitophagy is mainly regulated by phosphorylation of Atg32. In mammals, mitophagy is protein-mediated by Parkin-PINK1, Nix and FUNDC1 respectively. Research on mitophagy in plants is mainly focused on Arabidopsis thaliana only, and the mechanism is not well understood yet. Here we review the research advances in mitophagy in yeast,mammals and plants, with focus on the mechanisms and factors involved.

mitophagy;yeast;mammal;plant

10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2015.06.005

2014-11-09

國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(.31201409)

王志舒,女,碩士,研究方向:植物自噬;E-mail:15038138706@163.com

譚曉榮,女,博士,副教授,研究方向:活性氧和自噬相關(guān)研究;E-mail:tanxr2012@gmail.com

猜你喜歡
胞質(zhì)磷酸化酵母
ITSN1蛋白磷酸化的研究進(jìn)展
酵母抽提物的研究概況
酵母魔術(shù)師
Vav1在胃癌中的表達(dá)及其與預(yù)后的相關(guān)性
人CyclinD1在畢赤酵母中的表達(dá)
MAPK抑制因子對(duì)HSC中Smad2/3磷酸化及Smad4核轉(zhuǎn)位的影響
生物量高的富鋅酵母的開(kāi)發(fā)應(yīng)用
survivin胞內(nèi)定位表達(dá)在胸部腫瘤鑒別診斷中的意義
多細(xì)胞系胞質(zhì)分裂阻滯微核細(xì)胞組學(xué)試驗(yàn)法的建立與應(yīng)用
組蛋白磷酸化修飾與精子發(fā)生
遺傳(2014年3期)2014-02-28 20:59:01
弥勒县| 来宾市| 娄烦县| 漳浦县| 大石桥市| 老河口市| 河南省| 石家庄市| 木里| 清新县| 女性| 抚远县| 虞城县| 彰化县| 临漳县| 黑河市| 内乡县| 河源市| 类乌齐县| 东乡族自治县| 华安县| 麦盖提县| 女性| 嘉黎县| 东兴市| 胶南市| 海阳市| 资溪县| 灵宝市| 成安县| 新宁县| 凉山| 新安县| 班玛县| 依安县| 南漳县| 出国| 宁蒗| 莎车县| 富平县| 商洛市|