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基于主成分與聚類分析的小豆品種綜合評(píng)價(jià)

2015-05-30 19:06:00劉振興周桂梅陳健李秋艷
農(nóng)學(xué)學(xué)報(bào) 2015年9期
關(guān)鍵詞:小豆相關(guān)分析綜合評(píng)價(jià)

劉振興 周桂梅 陳健 李秋艷

摘要:為簡(jiǎn)化評(píng)價(jià)體系、客觀地評(píng)價(jià)小豆品種的優(yōu)劣,采用相關(guān)、主成分及聚類方法,對(duì)30個(gè)小豆品種11個(gè)主要性狀進(jìn)行分析。結(jié)果表明,11個(gè)性狀的變異系數(shù)在5.66%~26.38%,其中主莖分枝的變異系數(shù)最大,莢長(zhǎng)的變異系數(shù)最小。相關(guān)分析表明,單株產(chǎn)量與全生育期、生育后期、株高、主莖分枝、單株莢數(shù)呈極顯著正相關(guān)。主成分分析表明,11個(gè)主要性狀可用5個(gè)主成分來表述(累積貢獻(xiàn)率達(dá)92.3955%)。主成分聚類,篩選出單莢粒數(shù)、單株莢數(shù)、主莖分枝、生育前期、株高和百粒重6個(gè)因子來代替原有的11個(gè)性狀指標(biāo)。因此,對(duì)小豆進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)時(shí),可只考慮單莢粒數(shù)、單株莢數(shù)、主莖分枝、生育前期、株高和百粒重這6個(gè)因子,簡(jiǎn)化了評(píng)價(jià)體系;經(jīng)綜合評(píng)價(jià),唐山本地的2個(gè)品種排在前2位,綜合性狀最好;來自東北的幾個(gè)品種位居最后。

關(guān)鍵詞:小豆;相關(guān)分析;主成分分析;聚類分析;綜合評(píng)價(jià)

中圖分類號(hào):S521.04

文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

論文編號(hào):cjas15020017

0引言

小豆(Vigna angularis)起源于中國(guó),屬于醫(yī)食同源作物,是國(guó)內(nèi)傳統(tǒng)的出口創(chuàng)匯產(chǎn)品,也是現(xiàn)代農(nóng)業(yè)種植結(jié)構(gòu)調(diào)整的重要經(jīng)濟(jì)作物及欠發(fā)達(dá)地區(qū)脫貧致富的主要經(jīng)濟(jì)來源。但生產(chǎn)上用種較混雜,優(yōu)良品種推廣較少,限制了小豆產(chǎn)量和品質(zhì)的提高。因此引育高產(chǎn)、穩(wěn)產(chǎn)優(yōu)良新品種是育種工作的首要任務(wù)。

綜合評(píng)價(jià)是衡量一個(gè)品種優(yōu)劣的手段,它避免了以產(chǎn)量定標(biāo)準(zhǔn)的片面性。在小豆品種綜合評(píng)價(jià)方法上,不少學(xué)者采用了灰色關(guān)聯(lián)度法、基于熵權(quán)的多目標(biāo)決策法、GGE法,為小豆資源的合理利用及新品種示范推廣提供了理論依據(jù)。然而,這些方法沒有考慮相關(guān)性狀間的相互影響,評(píng)價(jià)結(jié)果與生產(chǎn)實(shí)際存在著一定的偏差。申慧芳和周桂梅運(yùn)用了主成分和因子分析方法,把多個(gè)相關(guān)性狀結(jié)合起來,綜合評(píng)價(jià)了小豆品種的優(yōu)劣,但沒能進(jìn)一步地進(jìn)行性狀主成分、主因子的聚類,評(píng)價(jià)指標(biāo)較多,因此,這2種綜合評(píng)價(jià)體系還有待進(jìn)一步優(yōu)化。本研究在相關(guān)性狀分析的基礎(chǔ),運(yùn)用主成分分析法對(duì)30個(gè)小豆品種進(jìn)行了綜合評(píng)價(jià),并對(duì)主成分進(jìn)行了聚類,簡(jiǎn)化評(píng)價(jià)因子,旨在為進(jìn)一步優(yōu)化品種綜合評(píng)價(jià)體系提供參考。

1材料與方法

1.1試驗(yàn)材料

參試材料為近年來國(guó)內(nèi)各育種單位育成的小豆新品種(系)和個(gè)別優(yōu)異的地方品種,共30份,品種名稱及選育單位見表1。

1.2試驗(yàn)設(shè)計(jì)

試驗(yàn)于2013-2014年在唐山市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院試驗(yàn)地進(jìn)行,數(shù)據(jù)分析采用2年試驗(yàn)結(jié)果的平均值。試驗(yàn)設(shè)30個(gè)處理,4行區(qū),行長(zhǎng)5m,行距0.5m,株距16.7cm。3次重復(fù),隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì)。成熟后,小區(qū)內(nèi)隨機(jī)選取10株進(jìn)行田間和室內(nèi)考種。田間調(diào)查和室內(nèi)考種方法參照程須珍等。生長(zhǎng)期間田間調(diào)查全生育期(growing period,GP)、生育前期(days beforeflowering,DBF)和生育后期(days after flowering,DAF),室內(nèi)考種調(diào)查株高(plant height,PH)、主莖分枝數(shù)(numbers of branches,NOB)、主莖節(jié)數(shù)(node numberof main stem,NOS)、單株莢數(shù)(pod number per plant,PNP)、莢長(zhǎng)(pod length,PL)、單莢粒數(shù)(seed number perpod,SNP)、百粒重(100-seed weight,SW)和單株粒重(yield per plant,YPP)等。

1.3數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

利用Excel進(jìn)行數(shù)據(jù)平均值、標(biāo)準(zhǔn)差及變異系數(shù)的分析;利用DPS 7.05軟件進(jìn)行相關(guān)性、主成分及聚類分析;依據(jù)方差累計(jì)貢獻(xiàn)率≥90%的標(biāo)準(zhǔn)提取主成分,以各主成分對(duì)應(yīng)的方差貢獻(xiàn)率作為權(quán)重,對(duì)主成分得分和相應(yīng)的權(quán)重進(jìn)行線性加權(quán),構(gòu)建小豆品種評(píng)價(jià)函數(shù);主成分聚類分析按歐式距離類平均法進(jìn)行系統(tǒng)聚類。

2結(jié)果與分析

2.1不同品種小豆性狀分析

30個(gè)小豆品種的性狀統(tǒng)計(jì)見表2。生育期指標(biāo)中,參試小豆品種全生育期范圍76~100天,生育前期36~53天,生育后期28~64天。其中,‘白紅3號(hào)的全生育期最短,僅為76天;‘唐紅37的最長(zhǎng),全生育期為100天;‘唐山紅小豆和‘唐紅372個(gè)品種生育前期最短,僅為36天,而生育后期最長(zhǎng),分別為63、64天。這2個(gè)品種生殖生長(zhǎng)期較其他品種長(zhǎng),為高產(chǎn)奠定了基礎(chǔ)。在農(nóng)藝性狀指標(biāo)中,株高的變幅39.0~79.7cm,主莖分枝2.1~6.1個(gè),主莖節(jié)數(shù)13.7~18.9個(gè)。其中,‘吉紅7號(hào)的株高最矮,‘唐山紅小豆最高;‘白紅3號(hào)的主莖分枝最小,‘唐山紅小豆的分枝最多;‘龍小豆3號(hào)的主莖節(jié)數(shù)最小,‘唐山紅小豆的主莖節(jié)數(shù)最大。在產(chǎn)量性狀指標(biāo)中,單株結(jié)莢數(shù)范圍25.7~62.1個(gè),莢長(zhǎng)6.1-8.0cm,單莢粒數(shù)5.2~8.0個(gè),百粒重9.4~18.7g,單株產(chǎn)量14.7~38.0g。其中,‘吉紅10號(hào)的單株結(jié)莢最少,‘唐山紅小豆結(jié)莢最多;‘保紅2001-15的莢長(zhǎng)最短,‘泥河灣小豆的結(jié)莢最長(zhǎng);‘保紅876-16、‘冀紅0001-7的單莢粒數(shù)最少,‘唐紅37的單莢粒數(shù)最多;‘白紅3號(hào)的百粒重最小,‘蘇紅11-1的最大;‘品紅2000-33的單株產(chǎn)量最低,‘唐紅37的單株產(chǎn)量最高。

變異系數(shù)是衡量性狀表現(xiàn)差異程度、變異范圍的量。參試的30個(gè)小豆品種性狀的變異系數(shù)存在明顯差異,變異系數(shù)由大到小依次為:主莖分枝>單株產(chǎn)量>單株結(jié)莢數(shù)>百粒重>株高>生育后期>單莢粒數(shù)>生育前期>主莖節(jié)數(shù)>全生育期>莢長(zhǎng)。主莖分枝、單株產(chǎn)量、單株結(jié)莢數(shù)、百粒重、株高和生育后期的變異系數(shù)較高,均在16%以上,這與河北省紅小豆品種資源、‘唐山紅小豆地方品種數(shù)量性狀遺傳變異基本一致,說明這些性狀選擇的潛力大,受環(huán)境影響較大。莢長(zhǎng)、全生育期及主莖節(jié)數(shù)的變異系數(shù)較小,說明這些性狀受本身內(nèi)在因素決定,受環(huán)境因素的影響較小。因此,改善環(huán)境,提高分枝數(shù)、單株結(jié)莢數(shù)、百粒重及控制株高是實(shí)現(xiàn)小豆高產(chǎn)的有效途徑。

2.2不同品種小豆性狀間的相關(guān)分析

由表3可知,株高與生育后期的正相關(guān)性最大(γ=0.8402),說明生育后期越長(zhǎng),小豆植株越高;單株莢數(shù)與生育期負(fù)相關(guān)最大(γ=-0.6585),說明小豆生育前期越短,單株結(jié)莢數(shù)就越多。小豆的生育后期與全生育期呈極顯著的正相關(guān),與生育前期呈極顯著的負(fù)相關(guān);株高與全生育期、生育后期呈極顯著正相關(guān),與生育前期呈極顯著負(fù)相關(guān);主莖分枝與全生育期、生育后期、株高呈極顯著正相關(guān);主莖節(jié)數(shù)與生育后期、株高高度正相關(guān);單株結(jié)莢數(shù)與全生育期、生育后期、株高、主莖分枝、主莖節(jié)數(shù)呈極顯著正相關(guān);單株粒重與全生育期、生育后期、株高、主莖分枝、單株結(jié)莢數(shù)呈極顯著正相關(guān)。

可見,生育后期、株高、主莖分枝和單株結(jié)莢數(shù)是小豆最主要的形態(tài)性狀,與其他性狀保持高度正相關(guān),這與申慧芳、韓粉霞、曾玲玲等的研究基本一致。因此,在小豆的種質(zhì)創(chuàng)新中,應(yīng)把這4個(gè)性狀作為首要性狀進(jìn)行選擇,然后再考慮莢粒數(shù)、百粒重等其他性狀;在生產(chǎn)中,應(yīng)優(yōu)化小豆栽培條件,調(diào)控株高,促進(jìn)主莖分枝能力,增加單株結(jié)莢數(shù),延長(zhǎng)葉片功能期,為高產(chǎn)創(chuàng)造條件。

2.3不同品種小豆性狀間的主成分分析

對(duì)小豆品種的主要性狀進(jìn)行主成分分析,結(jié)果顯示前5個(gè)主成分的累積貢獻(xiàn)率為92.3955%(表4),表明前5個(gè)主成分已基本包含了小豆性狀的全部信息,可用前5個(gè)主成分對(duì)其進(jìn)行綜合評(píng)價(jià)。第1主成分的特征值為5.4725,貢獻(xiàn)率為49.7504%。決定第1主成分的主要是生育后期,其次為單株結(jié)莢數(shù)、株高、單株粒重和主莖分枝,稱為生育期因子。第2主成分的特征值為1.9478,貢獻(xiàn)率為17.7075%。決定第2主成分的主要是百粒重,其次為生育前期、生育期及單株粒重,稱之為粒重因子。第3主成分的特征值為1.5528,貢獻(xiàn)率為14.1162%,起決定作用的是單株結(jié)莢數(shù),稱為莢數(shù)因子。第4主成分的特征值為0.6503,貢獻(xiàn)率為5.9118%,起決定作用的為單莢粒數(shù),稱為莢粒數(shù)因子。第5成分的特征值為0.5401,貢獻(xiàn)率為4.9096%,起決定作用的是主莖分枝,稱為分枝因子。

2.4不同小豆品種的綜合評(píng)價(jià)

以各主成分對(duì)應(yīng)的方差貢獻(xiàn)率作為權(quán)重,對(duì)主成分得分和相應(yīng)的權(quán)重進(jìn)行線性加權(quán),構(gòu)建小豆品種評(píng)價(jià)函數(shù)γ=49.7504γ1+17.7075γ2+14.1162γ3+5.9118γ4+4.9096γ5,計(jì)算各品種的綜合評(píng)價(jià)分值,分值越高表示該品種綜合評(píng)價(jià)越好。由表5可知,30個(gè)小豆品種中,‘唐紅37綜合評(píng)價(jià)最好,其次為‘唐山紅小豆和‘保紅947,‘白紅3號(hào)綜合評(píng)價(jià)最差。品種優(yōu)良排序結(jié)果與因子分析結(jié)果略有不同。

2.5小豆性狀指標(biāo)的主成分聚類

根據(jù)主成分分析結(jié)果,對(duì)5個(gè)主成分中11個(gè)性狀指標(biāo)的特征向量采用歐式距離類平均法(UPGMA)進(jìn)行系統(tǒng)聚類。同居于一類的性狀間具有密切的相關(guān)系,可用一個(gè)因素代表同一類中的其他因素;單一性狀單獨(dú)聚類的具有相對(duì)獨(dú)立性。聚類結(jié)果表明,在最大距離為0.8788時(shí)將11個(gè)性狀指標(biāo)劃分為5類(圖1):(1)全生育期、莢長(zhǎng)、主莖節(jié)數(shù)、生育后期、株高、單株粒重和百粒重;(2)生育前期;(3)主莖分枝;(4)單株莢數(shù);(5)單莢粒數(shù)。結(jié)合性狀間的相關(guān)性分析結(jié)果,最終確定單莢粒數(shù)、單株莢數(shù)、主莖分枝、生育前期、株高和百粒重6個(gè)因子來綜合評(píng)價(jià)小豆品種的優(yōu)劣。

3結(jié)論與討論

小豆主要性狀的變異系數(shù)在5.66%~26.38%,說明性狀間存在豐富的多樣性;主莖分枝、單株產(chǎn)量、單株結(jié)莢數(shù)、百粒重、株高和生育后期的變異系數(shù)較大,且生育后期、株高、主莖分枝和單株結(jié)莢數(shù)與其他性狀保持高度正相關(guān),因此,在品種選育上,應(yīng)把這4個(gè)性狀作為首要性狀進(jìn)行選擇;在生產(chǎn)中,應(yīng)優(yōu)化小豆栽培條件,調(diào)控株高,促進(jìn)主莖分枝能力,增加單株結(jié)莢數(shù),延長(zhǎng)葉片功能期,為高產(chǎn)創(chuàng)造條件。

綜合評(píng)價(jià)結(jié)果顯示,‘唐紅37和‘唐山紅小豆綜合評(píng)價(jià)排名前2位,東北的幾個(gè)品種排在最后。劉振興曾指出‘唐紅37和‘唐山紅小豆株型高大、生育期偏長(zhǎng)的性狀不適應(yīng)當(dāng)代育種目標(biāo),更不適合大面積生產(chǎn)利用,但它們具有良好的產(chǎn)量性狀,具有單獨(dú)保存的價(jià)值,可作為優(yōu)異資源進(jìn)行保留,王麗俠也提出同名種質(zhì)的‘唐山紅小豆具有單獨(dú)保存的價(jià)值。因此,在本地區(qū)大面積推廣的品種應(yīng)為排在第3位的‘保紅947,‘唐紅37和‘唐山紅小豆作為優(yōu)異資源進(jìn)行單獨(dú)保存。

試驗(yàn)結(jié)果表明,11個(gè)主要性狀可簡(jiǎn)化為生育期、粒重、莢數(shù)、莢粒數(shù)、分枝5個(gè)相互獨(dú)立的主成分,這5個(gè)主成分對(duì)變異的累積貢獻(xiàn)率達(dá)92.3955%。在此基礎(chǔ)上對(duì)30個(gè)小豆品種進(jìn)行綜合評(píng)價(jià),評(píng)價(jià)結(jié)果與因子分析的結(jié)果基本一致。對(duì)主成分進(jìn)行聚類,結(jié)合性狀間的相關(guān)性分析,確定單莢粒數(shù)、單株莢數(shù)、主莖分枝、生育前期、株高和百粒重作為小豆品種綜合評(píng)價(jià)的指標(biāo),簡(jiǎn)化了評(píng)價(jià)體系。

但是,小豆屬短日照作物,光溫敏感,性狀表現(xiàn)受外界環(huán)境影響較大。所以,基于表型性狀的綜合評(píng)價(jià)呈一定的地域性,評(píng)價(jià)結(jié)果也是相對(duì)的。主成分分析是將原來較多、彼此相關(guān)的因子轉(zhuǎn)換少量且彼此獨(dú)立的因子,從而達(dá)到簡(jiǎn)化多指標(biāo)分析的一種方法。在具體的評(píng)價(jià)中,由于所選的群體和研究的性狀不同,用主成分構(gòu)造的綜合性狀是有區(qū)別的。所選數(shù)據(jù)越多,評(píng)價(jià)結(jié)果越準(zhǔn)確。本試驗(yàn)是以小豆生育期及形態(tài)性狀為原始指標(biāo),缺乏籽粒色澤這一主要的商品指標(biāo)及營(yíng)養(yǎng)成分含量,評(píng)價(jià)結(jié)果存在一定的局限性,下一步將小豆籽粒的粒型、粒色及養(yǎng)分含量納入評(píng)價(jià)指標(biāo),以完善小豆品種綜合評(píng)價(jià)體系。

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