侯曉婉 胡偉 顏彥 徐碧玉 金志強(qiáng)
摘 要 水通道蛋白(AQPs)是細(xì)胞間和細(xì)胞內(nèi)水分運輸?shù)闹饕ǖ溃?對于植物細(xì)胞的水分穩(wěn)態(tài)和脅迫響應(yīng)具有重要作用。本研究從香蕉中克隆了一個水通道蛋白基因MaPIP2-2。序列分析結(jié)果表明,該基因的開放閱讀框(ORF)為846 bp,編碼281個氨基酸。多序列比對和進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,該基因編碼的蛋白與其它植物中水通道蛋白具有較高的一致性,并且與擬南芥AtPIP2-2和AtPIP2-3的親緣關(guān)系最近。亞細(xì)胞定位表明該基因定位在細(xì)胞膜上。實時熒光定量PCR分析結(jié)果表明,該基因能夠在轉(zhuǎn)錄水平響應(yīng)甘露醇、低溫、NaCl脅迫和ABA信號。這些結(jié)果表明MaPIP2-2可能參與了非生物逆境脅迫應(yīng)答,為進(jìn)一步研究MaPIP2-2基因的功能鑒定了基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞 水通道蛋白;PIP;香蕉;克隆;亞細(xì)胞定位;熒光定量PCR
中國分類號 Q344.13 文獻(xiàn)標(biāo)識碼 A
Abstract Water channel protein,(Aquaporins, AQPs), which was the main water transport corridor, plays a major role in maintaining water steady state and the stress response. In the present study, a AQP gene designated MaPIP2-2 from banana was isolated. MaPIP2-2 ORF was 846 bp, encoding 281 amino acids. Comparison of amino acid sequences and phylogenetic analysis indicated that MaPIP2-2 was closely related with AtPIP2-2 and AtPIP2-3. Subcellular localization assays showed that the MaPIP2-2 protein was present in the plasma membrane. Real-time quantitative polymerase chain reaction(QPCR)assay revealed that MaPIP2-2 participated in the response of abiotic stresses at transcriptional level. These results indicated that MaPIP2-2 might be involved in abiotic stress responses. The study would lay a foundation for further investigating the function of MaPIP2-2.
Key words Aquaporins; PIP; Banana; Cloning; Subcellular localization; Quantitative RT-PCR
doi 10.3969/j.issn.1000-2561.2015.07.014
水是生物體的主要組成部分,對生命至關(guān)重要。植物體的生長很大程度上取決于植物對水分的吸收和運輸,然而高鹽、干旱、低溫等環(huán)境脅迫導(dǎo)致植物體內(nèi)水分的缺失,嚴(yán)重影響植物的生長發(fā)育[1]。香蕉作為世界第四大糧食作物,因其特有的淺根和需要大量水份維持的永久性綠色樹冠,對任何條件引起的水份缺失異常敏感[2],因此研究香蕉如何響應(yīng)非生物脅迫顯得尤為重要。
水分在植物體不同組織之間的運輸主要是通過質(zhì)外體和共質(zhì)體途徑[3]。水通道蛋白AQPs(Aquaporin, AQP)參與了水分共質(zhì)體途徑的運輸,負(fù)責(zé)水分的快速跨膜轉(zhuǎn)運,扮演著“細(xì)胞的水管工”,介導(dǎo)植物種子萌發(fā)、細(xì)胞伸長、氣孔運動、韌皮部的裝卸及逆境應(yīng)答等多個生理過程[4-5]。AQP通過快速改變植物膜的通透性以應(yīng)對外界環(huán)境的變化,在植物對逆境脅迫的應(yīng)答中發(fā)揮著重要作用[6-7]。已有的報道表明,來自于水稻、小麥、擬南芥等多個物種的AQP家族基因能夠在轉(zhuǎn)錄水平響應(yīng)非生物脅迫及相關(guān)信號分子,但香蕉中AQP家族基因功能的研究還非常有限。
水通道蛋白(AQP)屬于膜內(nèi)嵌蛋白MIP(a class of major intrinsic proteins,MIP)的一個大的亞家族,是由四聚體組成的沙漏狀結(jié)構(gòu)。由5個短環(huán)(A-E 環(huán))連接的6個跨膜a-螺旋組成,其中B、D 環(huán)各有一段高度保守的天冬酰胺-脯氨酸-丙氨酸(Asn-Pro-Ala,NPA)元件,它們與其他跨膜區(qū)域共同形成通道[3,8-9]。根據(jù)結(jié)構(gòu)和定位,AQP被分為4類,分別為質(zhì)膜內(nèi)嵌蛋白(the plasma membrane intrinsic proteins,PIPs)、液泡膜內(nèi)嵌蛋白(the tonoplast intrinsic proteins,TIPs)、小分子堿性膜內(nèi)嵌蛋白(the recently characterized small basic intrinsic proteins,SIPs)和類NOD 26膜內(nèi)嵌蛋白(the NOD-26-like intrinsic proteins,NIPs)[10-13]。
本研究從香蕉中克隆了一個MaPIP2-2基因,并對其在逆境脅迫以及ABA處理下的表達(dá)模式進(jìn)行了研究。研究結(jié)果表明,克隆得到的MaPIP2-2基因編碼的蛋白具有AQP家族蛋白的基本特征;MaPIP2-2基因的表達(dá)能夠響應(yīng)非生物逆境脅迫及ABA信號。本研究的結(jié)果為進(jìn)一步研究MaPIP2-2基因的功能奠定了基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 植物材料 生長正常的五葉一心巴西蕉(Musa AAA Cavendish cv. Brazilian)幼苗取自中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院儋州組培中心。
1.1.2 主要試劑 PEG6000、NaCl、ABA、AS、MES等生化試劑購自上海生工生物工程有限公司;氯仿、異戊醇等各種分析純試劑購自廣州化學(xué)試劑公司;限制性內(nèi)切酶、反轉(zhuǎn)錄試劑盒、實時熒光定量PCR試劑盒購自TaKaRa公司;T4連接酶購自BioLab試劑公司,膠回收試劑盒、質(zhì)粒提取試劑盒購自O(shè)MEGA試劑生物公司,PCR試劑購自康為試劑生物公司。
1.2 方法
1.2.1 目的基因的獲得 從香蕉A基因組測序數(shù)據(jù)庫中得到一個AQP家族基因,根據(jù)ORF序列設(shè)計一對引物(5'- CATGCCATGGCGATGTCGAAGGA
GGTCAGTGA-3';5'-GGACTAGTGTTGGTGGGGTT
GCTCCG-3')擴(kuò)增MaPIP2-2 cDNA全長序列。PCR擴(kuò)增程序為:變性,94 ℃,40 s;退火,55 ℃,40 s;延伸,72 ℃,1 min 30 s;共35個循環(huán)。擴(kuò)增體系為20 μL體系:Mix,10 μL;Primer F,1 μL;Primer R,1 μL;cDNA,1 μL;ddH2O,7 μL。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物回收、連接、轉(zhuǎn)化后,挑取單克隆在LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)并進(jìn)行PCR鑒定。對已鑒定的陽性克隆進(jìn)行測序分析。
1.2.2 生物信息學(xué)分析 在NCBI中利用BLASTX進(jìn)行序列同源性分析,從中選取相似性較高的同源序列用DNAMAN軟件進(jìn)行氨基酸序列的多重比對。另外,為了確認(rèn)與其他物種中同源基因的親緣關(guān)系,利用MEGA軟件對擬南芥AQP基因家族和克隆出的MaPIP2-2基因一起構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.2.3 MaPIP2-2亞細(xì)胞定位分析 (1)瞬時表達(dá)載體構(gòu)建。根據(jù)目的基因MaPIP2-2序列設(shè)計帶有酶切位點NcoⅡ/SpeⅠ和不含終止子的載體引物:5'-CATGCCATGGCGATGTCGAAGGAGGTCAGTGA-3';5'-GGACTAGTGTTGGTGGGGTTGCTCCG-3'。擴(kuò)增產(chǎn)物回收后連接到克隆載體pMD18-T上,獲得重組質(zhì)粒,陽性克隆測序正確后,用NcoⅡ/SpeⅠ進(jìn)行雙酶切并回收目的片段。同時,利用NcoⅡ/SpeⅠ雙酶切并回收的pCAMBIA1302載體大片段。利用T4連接酶將目的片段和載體片段進(jìn)行連接,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α后,挑取單克隆擴(kuò)大培養(yǎng),經(jīng)PCR和質(zhì)粒雙酶切驗證后,進(jìn)行測序分析,從而成功構(gòu)建植物表達(dá)載體pCAMBIA1302-MaPIP2-2-GFP。將測序正確的陽性克隆的質(zhì)粒以及pCAMBIA1302空載體質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌LBA4404中。
(2)農(nóng)桿菌法介導(dǎo)的亞細(xì)胞定位。利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的瞬時轉(zhuǎn)化法將pCAMBIA1302-MaPIP2-2-GFP和空載體(pCAMBIA1302-GFP)導(dǎo)入洋蔥表皮細(xì)胞中[14]。隨后將洋蔥表皮放在鋪有濾紙的MS固體培養(yǎng)基上,25 ℃暗培養(yǎng)16~24 h,然后制作裝片,通過FluoViewTM FV1000激光掃描共聚焦顯微鏡觀察熒光信號。
1.2.4 基因表達(dá)分析 將生長一致的五葉一心巴西蕉分成4組,將第1組用300 mmol甘露醇(Mannitol)處理7、10、15、17 d;第2組用300 mmol NaCl處理8、12、24、32 d;第3組在8 ℃冷害下培養(yǎng)10、22、47 h,之后將處理47 h的幼苗置于人工氣候培養(yǎng)箱中恢復(fù)一周;第4組用100 μmol的ABA處理2、6、12、24 h。參照淦國英[15]改良的CTAB法提取每個處理時間點的香蕉葉片RNA,用自帶DNA消化酶的cDNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒反轉(zhuǎn)成cDNA。以反轉(zhuǎn)錄的cDNA第一鏈為模板,用TaRaKa公司的實時熒光定量PCR試劑盒中的SYBR Green、ROX染料進(jìn)行實時熒光定量PCR擴(kuò)增,反應(yīng)在吉泰生物科技有限公司Mx3005P熒光定量PCR儀上進(jìn)行。以香蕉RPS2基因為內(nèi)參。定量方法為2-△△CT法:ΔΔCT=(CT, Target-CT, Actin)Timex-(CT, Target-CT, Actin)Time0[16]。設(shè)計引物參考TaKaRa實時熒光定量標(biāo)準(zhǔn)說明書。為了保證引物的特異性,引物設(shè)計在非翻譯區(qū),PCR產(chǎn)物的長度維持在300 bp以內(nèi),并進(jìn)行了測序分析。設(shè)計引物完成后(MaPIP2-2-3F:5'-TCGGCTTTGCTGTGTTCA-3';MaPIP2-6-3R:5'-TCAGTTGGTGGGGTTGCT-3';MuRPS2F:5'-TAGGGATTCCGACGATTTGTTT-3';MuRPS2 R:5'-TAGCGTCATCATTGGCTGGGA-3'),送上海生工生物工程有限公司合成。熒光定量PCR的反應(yīng)程序如下:95 ℃預(yù)變性3 min;95 ℃變性10 s,50 ℃退火15 s,72 ℃延伸30 s,循環(huán)40次。
2 結(jié)果與分析
2.1 MaPIP2-2基因的克隆及生物信息學(xué)分析
根據(jù)香蕉A基因組測序數(shù)據(jù)庫中的信息,從香蕉栽培品種巴西蕉中克隆到一個AQP家族基因,其ORF為846 bp,編碼281個氨基酸。從GenBank中選擇擬南芥的全部35個AQP家族成員及筆者所克隆的香蕉AQP基因的氨基酸序列,利用MEGA5.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖1),結(jié)果表明本研究克隆得到的AQP基因所編碼的氨基酸序列與AtPIP2-2和AtPIP2-3具有較近的親緣關(guān)系,蛋白序列比對表明它們之間的相似度分別為74.39%和73.68%,故將該基因命名為MaPIP2-2。BLASTX分析表明,MaPIP2-2編碼的氨基酸序列與姜花的HcPIP2(AEF32110.1)、海棗PdPIP2-6(XP_008809438.1)、桑樹MnPIP2-7(XP010107654.1)、可可TcPIP2-8(XP007041804.1)的氨基酸序列具有較高的一致性,分別為93%、89%、88%和88%(圖2)。多序列比對分析表明,MaPIP2-2具有PIP亞家族蛋白的基本特征,其氨基酸序列有6個保守的跨膜螺旋,5個短環(huán),1個高度保守的氨基酸序列‘HINPAVTFG和2個‘NPA元件。這些結(jié)果表明本研究克隆的MaPIP2-2為香蕉PIP亞家族的成員(圖2)。
2.2 MaPIP2-2蛋白的亞細(xì)胞定位分析
以構(gòu)建的MaPIP2-2基因的植物表達(dá)載體pCAMBIA1302-MaPIP2-2-GFP,利用農(nóng)桿菌介導(dǎo)的瞬時轉(zhuǎn)化法將其和空載體(pCAMBIA1302-GFP)導(dǎo)入洋蔥表皮細(xì)胞中,對MaPIP2-2蛋白在植物亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)中的分布進(jìn)行研究。激光共聚焦顯微鏡下觀察綠色熒光蛋白信號在細(xì)胞內(nèi)的分布,結(jié)果顯示35S∶GFP綠色熒光蛋白在洋蔥表皮細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核和細(xì)胞膜上均有表達(dá),35S∶MaPIP2-2-GFP在洋蔥表皮細(xì)胞的細(xì)胞膜上表達(dá)(圖3)。這一結(jié)果表明MaPIP2-2蛋白定位在細(xì)胞膜上。
2.3 MaPIP2-2基因在非生物逆境脅迫及ABA處理下的表達(dá)分析
利用實時熒光定量PCR對MaPIP2-2基因在NaCl、甘露醇(Mannitol)、低溫、ABA處理下的表達(dá)模式分析的結(jié)果表明,在NaCl處理下,與對照相比較,MaPIP2-2基因的表達(dá)在處理8~24 d顯著被誘導(dǎo)了1.3~2.3倍(圖4-A)。在甘露醇處理下,與對照相比較,MaPIP2-2基因的表達(dá)在處理7~17 d被抑制(圖4-B)。在低溫處理下,與對照相比較,MaPIP2-2基因的表達(dá)在處理10 h被顯著誘導(dǎo)了2倍,達(dá)到最大值2.076 68,隨后逐漸下降(圖4-C)。在ABA處理下,MaPIP2-2基因的表達(dá)在處理2 h時被顯著誘導(dǎo),隨后在處理6 h時卻又下降到1.127 14,而在處理6~24 h時逐漸升高并達(dá)到最大值3.759 61,與對照相比較,ABA處理下,MaPIP2-2基因整體呈顯著誘導(dǎo)趨勢(圖4-D)。
3 討論與結(jié)論
近年來水通道蛋白(AQP)家族基因的功能已經(jīng)廣泛被報道,但是關(guān)于香蕉中水通道蛋白(AQP)家族基因的研究非常有限。本研究從香蕉中克隆了一個AQP基因(MaPIP2-2),該基因編碼的氨基酸序列具有AQP家族蛋白的基本特征,與其它物種中AQP家族成員具有較高的一致性,與擬南芥AtPIP2-2和AtPIP2-3具有較近的進(jìn)化關(guān)系。亞細(xì)胞定位分析表明,MaPIP2-2定位于細(xì)胞膜上,與MaPIP1;1和TaAQP7等AQP基因的細(xì)胞定位結(jié)果一致[1,18],進(jìn)一步說明了MaPIP2-2具有PIP蛋白的特征。因此,可以推測本研究所克隆的基因是AQP家族中PIP亞類中的一個成員。
大量的研究表明AQP家族基因能夠調(diào)節(jié)植物體內(nèi)水分的平衡,保持植物細(xì)胞水分穩(wěn)態(tài),并且能夠快速響應(yīng)環(huán)境脅迫,在植物對逆境脅迫的應(yīng)答中發(fā)揮著重要作用。因此,本研究運用實時熒光定量PCR的方法研究了香蕉MaPIP2-2基因在轉(zhuǎn)錄水平對甘露醇、低溫、高鹽和ABA信號的應(yīng)答。結(jié)果表明,在高鹽和ABA處理下,MaPIP2-2基因的表達(dá)趨勢基本一致,均被顯著誘導(dǎo)。這一結(jié)果與在高鹽處理下香蕉MaPIP1;1、小麥TaNIP和TaAQP8基因的表達(dá)趨勢一致,同時小麥TaNIP、TaAQP8被證實能夠增強(qiáng)轉(zhuǎn)基因植株對干旱、高鹽和低溫脅迫的耐受性[1,18-19];而在ABA處理下的表達(dá)趨勢與水稻OsPIP1-1、OsPIP1-2、OsPIP2-1、OsPIP2-3、OsPIP2-4和OsPIP2-5的一致,同時水稻OsPIP1-1被證明能夠顯著提高植物對高鹽和干旱的耐受性[20]。這些結(jié)果表明一些水通道蛋白家族成員在高鹽和ABA處理下發(fā)揮著正向調(diào)控作用。因此,MaPIP2-2基因可能在植物響應(yīng)高鹽脅迫和ABA信號過程中起著重要作用。
在甘露醇處理下,MaPIP2-2基因的表達(dá)被顯著抑制。這一結(jié)果與Guo等[20]報道的PEG6000處理下水稻葉片中OsPIP2-4和根系中OsPIP1-2,OsPIP1-3,OsPIP2-2的表達(dá)趨勢一致。在低溫處理下,MaPIP2-2基因的表達(dá)被早期誘導(dǎo),表明巴西蕉對低溫脅迫的響應(yīng)較為敏感,在處理初期就能達(dá)到最大值。這一結(jié)果與Huang等[21]研究的TaAQP7在低溫脅迫下的研究結(jié)果一致,而TaAQP7在煙草中過表達(dá)增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因植株對干旱、高鹽和低溫脅迫的耐受性[17]。因此,MaPIP2-2基因可能參與了植物對低溫和甘露醇的耐受過程。
綜上所述,MaPIP2-2基因編碼的蛋白具備PIP亞家族蛋白的基本結(jié)構(gòu)特征,是AQP家族中PIP亞類的一個成員。MaPIP2-2基因能夠在轉(zhuǎn)錄水平響應(yīng)甘露醇、低溫、NaCl和ABA信號,這些結(jié)果表明MaPIP2-2能夠參與非生物逆境脅迫應(yīng)答,并在其中發(fā)揮重要作用。為進(jìn)一步研究MaPIP2-2基因的功能奠定了基礎(chǔ)。
參考文獻(xiàn)
[1] Xu Y, Hu W, Liu J H, et al. A banana aquaporin gene, MaPIP1;1, is involved in tolerance to drought and salt stresses[J]. BMC Plant Biology, 2014, 14(1): 59.
[2] Van Asten P, Fermont A, Taulya G. Drought is a major yield loss factor for rainfed East African highland banana[J]. Agric Water Manage, 2011, 98(4): 541-552.
[3] Sreedharan S, Upendra K S S, Ganpathi T. Transgenic banana plants overexpressing a native plasma membrane aquaporin MusaPIP1;2 display high tolerance levels to different abiotic stresses[J]. Plant Biotechnology Journal, 2013, 11(3): 948.
[4] 劉迪秋, 王繼磊, 葛 鋒, 等. 植物水通道蛋白生理功能的研究進(jìn)展[J]. 生物學(xué)雜志, 2009, 26(5): 63-66.
[5] 朱美君, 康 蘊, 陳 珈, 等. 植物水通道蛋白及其活性調(diào)節(jié)[J]. 植物學(xué)通報, 1999, 16(1): 44-50.
[6] Vera-Estrella R, Barkla B, Bohnert H J, et al. Novel regulation of aquaporins during osmotic stress[J]. Plant Physiol, 2004, 135(4): 2 318-2 329.
[7] Maurel C, Verdoucq L, Luu D.-T, et al. Plant aquaporins: membrane channels with multiple integrated functions[J]. Annu Rev Plant Biol, 2008(59): 595-624.
[8] 李 軍, 乙 引 植物水通道蛋白的運輸和調(diào)節(jié)[J]. 植物生理學(xué)通訊, 2010, 46(5): 493-498.
[9] Chaumont F, Barrieu F, Wojcik E, et al. Aquaporins constitute a large and highly divergent protein family in maize[J]. Plant Physiology, 2001(12): 1 206-1 215.
[10] Johansson U, Karlsson M, Johansson I, et al. The complete set of genes encoding major intrinsic proteins in Arabidopsis provides a framework for a new nomenclature for major intrinsic proteins in plants[J]. Plant Physiology, 2001, 126(4): 1 358-1 369.
[11] Johansson U, Karlsson M, Johansson I, et al. The role of aquaporins in cellular and whole plant water balance[J]. BBA-Biomembranes, 2000, 1 465(1-2): 324-342.
[12] Maurel C. Aquaporins and water permeability of plant membranes[J]. Annual Review of Plant Physiology and Plant Molecular Biology, 1997(48): 399-429.
[13] Rivers R L, Dean R M, Chandy G, et al. Functional analysis of nodulin 26, an aquaporin in soybean root nodule symbiosomes[J]. Journal of Biological Chemistry, 1997, 272(26): 16 256-16 261.
[14] 邢文婷. 香蕉MaMYB基因克隆及抗旱功能研究[D]. ??冢?海南大學(xué), 2014.
[15] 淦國英, 漆艷香, 蒲金基, 等. 改良CTAB 法提取高質(zhì)量香蕉葉片總RNA[J]. 廣東農(nóng)業(yè)科學(xué), 2009(7): 192-195.
[16] Liva K J, Schmittgen T D. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2-ΔΔCt method[J]. Method, 2001, 25(4): 402-408.
[17] Zhou S Y, Hu W, Deng X M, et al. Overexpression of the wheat aquaporin gene, TaAQP7, enhances drought tolerance in transgenic tobacco[J]. Plos One, 2012(7): 1-14.
[18] Gao Z X, He X L, Zhao B C, et al. Overexpressing a putative aquaporin gene from wheat, TaNIP, enhances salt tolerance in transgenic Arabidopsis[J]. Plant Cell Physiol, 2010, 51(5): 767-775.
[19] Hu W, Yuan Q Q, Wang Y, et al. Overexpression of a wheat aquaporin gene, TaAQP8, enhances salt stress tolerance in transgenic tobacco[J]. Plant Cell Physiol, 2012, 53(12): 2 127-2 141.
[20] Guo L, Wang Z Y, Lin H, et al. Expression and functional analysis of the rice plasma-membrane intrinsic protein gene family[J]. Cell Research, 2006, 16(3): 277-286.
[21] Huang C, Zhou S, Hu W, et al The wheat aquaporin gene TaAQP7 confers tolerance to cold stress in transgenic tobacco[J]. Zeitschrift Für Naturforschung Section C-A Journal of Biosciences, 2014, 69(3-4): 142-148.