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應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光RT—PCR法檢測(cè)水產(chǎn)品中諾如病毒

2015-05-30 17:03紀(jì)衍瑾孫雯雯祝喆楊松濤
中國(guó)現(xiàn)代醫(yī)生 2015年19期
關(guān)鍵詞:水產(chǎn)品

紀(jì)衍瑾 孫雯雯 祝喆 楊松濤

[摘要] 目的 建立水產(chǎn)品樣品中的諾如病毒檢測(cè)方法。 方法 優(yōu)化甘氨酸緩沖液處理水產(chǎn)品勻漿液,摸索PEG沉淀濃縮病毒的濃度,提取病毒RNA,采用熒光定量RT-PCR方法進(jìn)行諾如病毒檢測(cè)。 結(jié)果 應(yīng)用優(yōu)化后的方法檢測(cè)72份樣品,并用核苷酸序列測(cè)定法對(duì)陽(yáng)性PCR產(chǎn)物進(jìn)行驗(yàn)證,所得陽(yáng)性PCR產(chǎn)物經(jīng)核苷酸序列測(cè)序證實(shí)為諾如病毒。 結(jié)論 本研究方法可以應(yīng)用于水產(chǎn)品中的諾如病毒檢測(cè),撫順市海鮮市場(chǎng)上的水產(chǎn)品很少存在諾如病毒的污染。

[關(guān)鍵詞] 諾如病毒;水產(chǎn)品;富集;熒光定量RT-PCR

[中圖分類號(hào)] R450 [文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼] B [文章編號(hào)] 1673-9701(2015)19-0130-03

諾如病毒(norovirus,NoV)是引起兒童急性胃腸炎的主要誘因,可出現(xiàn)食物腹瀉、嘔吐、頭痛、腹痛和發(fā)熱等中毒癥狀,在世界公共衛(wèi)生安全中嚴(yán)重威脅著人類的生命安全[1]。最初,在檢測(cè)諾如病毒的過(guò)程中,檢測(cè)方法有很大的局限性,人們對(duì)諾如病毒對(duì)人類所能造成的影響和危害缺少正確的認(rèn)識(shí),并且低估了諾如病毒所能造成的危害性。

諾如病毒屬于人類杯狀病毒科,呈球形,無(wú)包膜,可通過(guò)人-人直接接觸傳播、食物性傳播(生吃海產(chǎn)品尤為主要)、水源性傳播等多種傳播途徑傳播[3]。諾如病毒有高度的變異性,在同一時(shí)期、同一地區(qū)就可能存在不同遺傳特性的毒株。諾如病毒抗體保護(hù)力弱,不能實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)期免疫保護(hù),所以非常易造成反復(fù)感染。食品和飲料很容易被諾如病毒感染,100個(gè)病毒就能造成人們發(fā)病。諾如病毒在體外很難繁殖,如果一遇到食品和水,極易引起人們發(fā)病。當(dāng)人們生食或食用加熱不徹底的貝類時(shí),也可能受到感染,近年來(lái)有很多外國(guó)媒體已報(bào)道,許多胃腸炎暴發(fā)疫情都與生吃牡蠣等貝類食物有關(guān)[3,4]。另外,有些產(chǎn)品比如色拉和冰凍水果也可能在來(lái)源地被污染,進(jìn)而引起人們發(fā)病。2012年,德國(guó)有1萬(wàn)多名小學(xué)生和托兒所的兒童在學(xué)校疑似吃了中國(guó)進(jìn)口的冷凍草莓而發(fā)生食物中毒。后來(lái),由羅勃特科赫研究院在一包草莓樣品中檢測(cè)到可引起非細(xì)菌性胃腸炎的諾如病毒[5]。由于諾如病毒在食物中含量很低,因此,在檢測(cè)各類樣品時(shí),還應(yīng)考慮到諾如病毒感染樣品的復(fù)雜性、病毒的高度變異性和混合感染等因素,尤其是在對(duì)蛋白、脂類等PCR反應(yīng)抑制物含量高的食品樣品的前處理上以及檢測(cè)混合感染的細(xì)菌或其它病毒、濃縮低含量樣品、降低假陽(yáng)性率等方面要多加注意,確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的科學(xué)性和可靠性[6-8]。

1 材料與方法

1.1樣品的運(yùn)輸與保存

標(biāo)本采集后確保在2 h內(nèi)完成轉(zhuǎn)運(yùn),運(yùn)輸過(guò)程中使用冰袋進(jìn)行冷藏,使樣品所處溫度在0℃~5℃。病毒在4℃保存不可超過(guò)3 d,因而實(shí)驗(yàn)室收到樣品后應(yīng)盡快進(jìn)行檢測(cè),如不能及時(shí)進(jìn)行檢測(cè),需將樣品置于-20℃保存,如能置于-70℃超低溫冰箱中冷凍保存最好。

1.2 儀器與試劑

NuAire NU425-400E Ⅱ級(jí)生物安全柜(美國(guó)),貝克曼Microfuge22R冷凍離心機(jī)(美國(guó)),ABI 7500Fast全自動(dòng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(美國(guó)),海爾低溫冰箱,Heidolph漩渦振蕩器(德國(guó)),RNeasy Mini Kit核酸提取盒(德國(guó)QIAGEN公司),1.5 mL無(wú)核酸離心管,甘氨酸緩沖液,PEG8000,組織勻漿器(美國(guó)Thremo公司),100~1000 μL可調(diào)移液器。

1.3病毒提取的預(yù)處理(病毒的富集)

無(wú)菌取樣,在5 g檢樣中加入35 mL甘氨酸緩沖液(樣品重量與緩沖液體積之比為1∶7);組織勻漿器中高速勻漿3 min,充分破碎混勻;將所有均質(zhì)液轉(zhuǎn)移到50 mL離心管中,37℃孵育30 min或室溫下振蕩30 min;4℃,10000×g離心30 min;取上清,加入10 mL氯仿,充分振搖,放置10 min,中間振搖一次,4℃,10000×g離心30 min;取上清至另一清潔的100 mL離心管中,加入等體積的PEG 8000溶液(PEG終濃度為8%),上下顛倒離心管以充分混勻;冰?。罕戏胖弥辽? h,4℃,10000×g離心5 min。棄去上清,保留沉淀。

1.4 實(shí)時(shí)熒光RT-PCR反應(yīng)體系

本實(shí)驗(yàn)采用實(shí)時(shí)熒光RT-PCR方法進(jìn)行檢測(cè),RT-PCR 反應(yīng)體系采用中山達(dá)安基因生物公司的商品化病毒核酸檢測(cè)試劑盒(PCR熒光探針?lè)℅Ⅱ型),PCR反應(yīng)操作流程嚴(yán)格按照試劑盒使用說(shuō)明書(shū)進(jìn)行。本試劑盒適用于諾沃克病毒GⅡ型的病毒核酸檢測(cè)。體系配制參考試劑說(shuō)明書(shū)。反應(yīng)條件:50℃,15 min,1個(gè)循環(huán)→95℃,15 min,1個(gè)循環(huán)→94℃,15 s,55℃,45 s(收集熒光),45個(gè)循環(huán)。

1.5 判定標(biāo)準(zhǔn)

以試劑提供的諾如病毒陽(yáng)性質(zhì)控品為陽(yáng)性對(duì)照,以試劑提供的陰性質(zhì)控品作為陰性對(duì)照。所檢測(cè)樣品的Ct值≤30時(shí),且擴(kuò)增曲線有明顯對(duì)數(shù)增長(zhǎng)期,則測(cè)定結(jié)果有效,可直接報(bào)告樣品為陽(yáng)性;若3035時(shí),可報(bào)告樣品為陰性。

2 結(jié)果

通過(guò)檢測(cè)2014年1~12月期間撫順市各水產(chǎn)品經(jīng)銷處貝類樣品72份,對(duì)實(shí)時(shí)熒光PCR反應(yīng)結(jié)果進(jìn)行分析,可以發(fā)現(xiàn)陽(yáng)性對(duì)照的Ct值為19且曲線有明顯對(duì)數(shù)增長(zhǎng)期,而所采集的樣品的檢測(cè)結(jié)果均無(wú)擴(kuò)增曲線,所采集樣品中未發(fā)現(xiàn)GⅡ型諾如病毒呈陽(yáng)性的樣品。以1月份所采集樣品的PCR檢測(cè)結(jié)果為例見(jiàn)圖1,檢測(cè)數(shù)據(jù)見(jiàn)表1。

圖1 2014年1月所采集樣品檢的測(cè)結(jié)果

將該方法應(yīng)用于2014年1~12月從撫順市海鮮市場(chǎng)上購(gòu)買(mǎi)的72份海產(chǎn)品(包括牡蠣46份、生蠔10份、扇貝8份、蟶子8份)樣本檢測(cè),所檢測(cè)樣品中無(wú)GⅡ型諾如病毒陽(yáng)性樣品,陽(yáng)性對(duì)照有明顯的擴(kuò)增曲線,說(shuō)明該方法可應(yīng)用于海產(chǎn)品樣品中諾如病毒的核酸檢測(cè),也提示撫順市海鮮市場(chǎng)上的海產(chǎn)品很少存在諾如病毒的污染。

3 討論

諾如病毒可通過(guò)多種途徑傳播,是成人、嬰幼兒以及兒童發(fā)生急性胃腸炎的主要病原之一[6]。“諾如病毒”感染性腹瀉屬于自限性疾病,沒(méi)有疫苗和特效藥物,公眾搞好個(gè)人衛(wèi)生、食品衛(wèi)生和飲水衛(wèi)生是預(yù)防本病的關(guān)鍵,要養(yǎng)成勤洗手、不喝生水、生熟食物分開(kāi)、避免交叉污染等健康生活習(xí)慣。目前,科學(xué)家已對(duì)上百種諾如病毒進(jìn)行基因測(cè)序[9]。本研究結(jié)果表明,出現(xiàn)的地區(qū)不同,流行時(shí)間不同的諾如病毒基因序列比較保守一些。許多流行病學(xué)研究提示GⅡ型諾如病毒在急性胃腸炎感染中占主要地位,并且GⅡ4型為最常見(jiàn),而GⅡ4/2006b型是目前的流行株[10-12]。

Jiang X的研究團(tuán)隊(duì)在1992年成功研究出檢測(cè)諾如病毒的RT-PCR方法。目前諾如病毒的檢測(cè)方法主要是ELISA法、常規(guī)RT-PCR法和實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR法[13]。如今,常規(guī)RT-PCR技術(shù)易于操作,靈敏度較高,是目前檢測(cè)諾如病毒應(yīng)用最廣泛的方法,被稱為檢測(cè)諾如病毒的“金標(biāo)準(zhǔn)”。有學(xué)者所用引物為RNA多聚酶區(qū)的JV12/JV13,并對(duì)模擬水樣進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果表明,RT-PCR產(chǎn)物長(zhǎng)度為327 bp,在模擬水樣中檢測(cè)靈敏度為200 ng/L,該實(shí)驗(yàn)所建立的方法對(duì)水質(zhì)控制起到了很好的監(jiān)測(cè)作用。目前,運(yùn)用ELISA法已上市的諾如病毒檢測(cè)試劑盒有IDEIATM Norovirus 試劑盒、Ridascreen Norovirus等。試劑盒相對(duì)于PCR技術(shù)更加簡(jiǎn)單方便,但由于存在抗體抗原的特異性,該方法可能出現(xiàn)假陽(yáng)性或假陰性結(jié)果[14,15]。實(shí)時(shí)熒光RT-PCR技術(shù)敏感性較高,較常規(guī)RT-PCR省時(shí),逐漸取代了常規(guī)PCR技術(shù)。同時(shí),也可用于監(jiān)測(cè)水體及貝類中的諾如病毒,保障公共食品衛(wèi)生安全。

本次實(shí)際樣本的檢測(cè)全部為諾如病毒陰性,可能是海產(chǎn)品帶毒率低,也可能與采樣的時(shí)間、采樣溫度及樣品量有關(guān),需要我們進(jìn)一步進(jìn)行系統(tǒng)監(jiān)測(cè),以深入了解諾如病毒的分子流行病學(xué)特征,傳播的來(lái)源、途徑及污染的高危食物,為預(yù)防和控制諾如病毒的爆發(fā)和流行提供科學(xué)依據(jù)。

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(收稿日期:2015-04-02)

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