劉英玉,夏利寧,劉俊飛,姚 剛,何啟蓋
(1.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,新疆烏魯木齊830052;2.新疆天康畜牧科技有限公司,新疆昌吉830011;3.華中農(nóng)業(yè)大學(xué)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,湖北武漢430070)
副豬嗜血桿菌(Haemophilus parasuis,HPS)是豬群上呼吸道的一種常在菌,但在特定條件下可以侵入機(jī)體并引起嚴(yán)重的全身性疾病,以纖維素性多發(fā)性漿膜炎、關(guān)節(jié)炎和腦膜炎為特征,該病又稱為Glasser′s disease[1]。蔡旭旺等[2]對HPS做 了生化鑒定,大多數(shù)生化反應(yīng)較弱,對糖類發(fā)酵多不穩(wěn)定,可發(fā)酵葡萄糖、蔗糖、果糖、半乳糖、D-核糖和麥芽糖,不發(fā)酵甘露糖、木糖、L-阿拉伯糖、蜜三糖,少數(shù)菌株發(fā)酵乳糖。
β-半乳糖苷酶(β-galactosidase,BgaC)又稱乳糖酶,是一種能把乳糖水解成葡萄糖和半乳糖的酶,是白色或淡黃色粉末,無臭,微甜,分子質(zhì)量為100ku~850ku。在水中呈混沌液(大部分溶解),不溶于乙醇、丙酮。該酶主要分布在植物、微生物及哺乳動(dòng)物腸內(nèi),其與食品工業(yè)、醫(yī)藥衛(wèi)生較為密切,因而研究較多。不同來源的微生物BgaC 在酶學(xué)性質(zhì)上差別較大,如分子質(zhì)量、最適溫度、最適pH 和熱穩(wěn)定性等。一般說來,霉菌產(chǎn)生的BgaC 是胞外酶,較耐熱、耐酸,不需要活化劑和穩(wěn)定劑,穩(wěn)定性較高,最適pH 偏酸性,一般在3~4 左右[3]。細(xì)菌BgaC 通常也是胞內(nèi)酶,最適pH 中性附近,最適溫度比酵母菌稍高,但高溫菌BgaC 的最適溫度可以很高,熱穩(wěn)定性也較好。大腸埃希菌(Escherichia coli)BgaC 是迄今為止研究最深入、了解最透徹的一種酶,商品化產(chǎn)品已大量應(yīng)用于生化分析中。近年來,肺炎鏈球菌β-半 乳 糖 苷 酶 的 研 究 比 較 多,Campuzano S 等[4]對輕型鏈球菌NCTC 12261菌株進(jìn)行β-半乳糖苷酶的克隆表達(dá)和酶活性特性研究,該酶編碼2 411個(gè)氨基酸,分子質(zhì)量為268ku,推測該蛋白包含1 個(gè)N-末端的信號肽和C-末端的膽堿結(jié)合域由5 個(gè)固定重復(fù)結(jié)構(gòu)組成,此結(jié)構(gòu)便于定向?yàn)榧?xì)胞壁分泌酶。酶比活力為2 500U/mg,最適pH 為6.0~6.5,最適溫度為30 ℃~40 ℃,在生物技術(shù)領(lǐng)域應(yīng)用具有特有的特性。
β-半乳糖苷酶基因被廣泛應(yīng)用于分子生物學(xué)研究當(dāng)中,包括載體的構(gòu)建、轉(zhuǎn)基因研究、基因治療等多個(gè)領(lǐng)域。不同來源BgaC 在性質(zhì)上的差異為尋找優(yōu)良特性的酶源提供了可能性。副豬嗜血桿菌SH0165 菌株基因組DNA(GenBank accession number:CP001321)已完成測序[5]。通過序列分析,發(fā)現(xiàn)存在BgaC 基因,本研究進(jìn)一步對BgaC氨基酸序列進(jìn)行了生物信息學(xué)分析,并通過原核表達(dá)和β-半乳糖苷酶的活性測定來研究其的酶學(xué)特性,為其生產(chǎn)和應(yīng)用提供科學(xué)依據(jù)。
1.1.1 菌株和質(zhì)粒 副豬嗜血桿菌SH0165用胰蛋白胨大豆瓊脂(Tryptic Soy Agar,TSA)培養(yǎng)基中加入煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(nicotinamide adenine dinucleotide,NAD+)和新生牛血清來培養(yǎng),培養(yǎng)條件是在37 ℃,靜置培養(yǎng)24h~48h。E.coli菌株用LB 固體或液體培養(yǎng)基培養(yǎng)。副豬嗜血桿菌SH0165、質(zhì)粒pET32a、大腸埃希菌BL21(DE3)和感受態(tài)細(xì)菌DH5α,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)微生物學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室動(dòng)物病原分子流行病學(xué)室保存。
1.1.2 主要試劑和儀器 鄰硝基苯β-D-半乳吡喃糖苷(o-nitropheyl-β-D-galactopyranoside,ONPG)、β-巰基乙醇、異丙基硫代半乳糖苷(IPTG)、氨芐青霉素,Sigma公司產(chǎn)品;限制性內(nèi)切酶(BamHⅠ和HindⅢ)、T4DNA 連接 酶、TaqDNA 聚合酶、DNA Marker,寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品;新生牛血清,四季青公司產(chǎn)品;膠回收試劑盒、小提質(zhì)粒試劑盒,Omega公司產(chǎn)品;PCR 儀、SDS-PAGE垂直電泳儀、酶標(biāo)儀、TSA,Bio-Rad公司產(chǎn)品;凝膠電泳儀,北京六一儀器廠產(chǎn)品;凝膠成像系統(tǒng),Gene Company公司產(chǎn)品;NAD,中國上?;瘜W(xué)試劑公司產(chǎn)品;Ni-NTA 親和層析樹脂,Invitrogen公司產(chǎn)品。
1.2.1 BgaC 基因的克隆和分析 參考GenBank中HPS SH0165基因組的序列設(shè)計(jì)BgaC 基因的全長引物,引物序列為BgaC-S:CGGGATCCATGCCTTTCCAAATCGGCGAAA;BgaC-A:GGAAGC TTTTATAAGTTCTTCGTATTCAAC。引物序列增加了酶切位點(diǎn)BamHⅠ和HindⅢ,引物濃度10 μmol/L。通過煮沸法提取副豬嗜血桿菌SH0165的模板,反應(yīng)體系50μL:10×buffer 5μL dNTPs 4μL,Taq 酶0.25μL,模板4μL,引物各1μL,H2O 46.75μL。反應(yīng)條件:94 ℃5 min;94℃30s,58 ℃30s,72 ℃2min,35循環(huán);72 ℃10 min。取7μL反應(yīng)液進(jìn)行10g/L瓊脂糖凝膠電泳,若出現(xiàn)目的條帶則用天根公司的膠回收試劑盒回收目的條帶,將目的片段用BamHⅠ和HindⅢ進(jìn)行雙酶切,與經(jīng)過同樣酶切處理的pET-32a進(jìn)行連接,轉(zhuǎn)化大腸埃希菌DH5α,以PCR 和限制性酶切篩選獲得陽性克隆進(jìn)行測序,將測序得到的序列進(jìn)行拼接,然后利用Blastn對核苷酸序列進(jìn)行比對,用Blastp及ExPASy在線分析軟件對蛋白序列進(jìn)行分析,用Mega軟件對B-Gal基因推導(dǎo)的氨基酸序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析。
1.2.2 BgaC基因的表達(dá)和純化 測序正確的質(zhì)粒轉(zhuǎn)入受體菌BL21,采用限制性酶切篩選獲得陽性克隆的BL21菌體培養(yǎng)至OD 600nm≈0.6,加終濃度為0.1mmol/L的異丙基硫代半乳糖苷(IPTG)進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)5h,收集菌液,6 500r/min離心5min,去上清后用0.1倍體積的ddH2O 將菌體混懸均勻,在冰上用超聲波破碎菌體,12 000r/min離心30min,收集上清液。用Ni-NTA 親和層析樹脂(Invitrogen)純化含有(his)6標(biāo)簽的重組蛋白,參照產(chǎn)品說明書進(jìn)行。蛋白的純度用聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)進(jìn)行分析驗(yàn)證,純化后的蛋白采用1976年由Bradford建立的考馬斯亮蘭法(Bradford法)測定[6],蛋白含量以牛血清白蛋白為標(biāo)準(zhǔn)物。最終,重組蛋白HP0245EC凍存于-20 ℃。
1.2.3 β-半乳糖苷酶活性的測定 酶活性測定方法根據(jù)文獻(xiàn)[6]:將BgaC 蛋白用1mL 反應(yīng)液中[Z buffer,每50 mL:0.80 g Na2HPO4·7H2O(0.06mol/L),0.28 g NaH2PO4·H2O(0.04 mol/L),0.5mL KCl(0.01mol/L);0.05mL Mg-SO4(0.001 mol/L),0.135 mLβ-巰基乙醇(BME)(0.05mol/L),加入40mL H2O 后調(diào)整pH 為7.0,定容至50mL,保存于4 ℃]混勻后,加入0.1mL生色底物ONPG(0.008g/mL);在37 ℃下孵育30 min;加入0.5mL終止液(1mol/L Na2CO3)終止反應(yīng);取溶液上清,測量420nm 和550nm 下的吸光度。酶活性測定采用一式3 份。1 個(gè)酶活性單位(U)是指在特定條件下,在1 min內(nèi)能水解1nmol底物的酶量。比活性為每毫克蛋白質(zhì)所具有的酶活力單位數(shù),一般用U/mg蛋白質(zhì)表示。
測定反應(yīng)液pH 對重組菌酶活性作用的影響,根據(jù)酶活性測定方法選擇pH5~9,孵育30min來測定420nm 和550nm 下的吸光度,其中pH5~5.5用弱鹽酸溶液調(diào)節(jié),pH6~9用低濃度NaOH 調(diào)節(jié)。測定溫度對重組菌酶活性作用的影響,根據(jù)酶活性測定方法選擇溫度范圍在0 ℃~64 ℃[7],孵育30min測定420nm和550nm 的吸光度。酶活性測定采用一式3份。
2.1.1 副豬嗜血桿菌BgaC 氨基酸序列同源性分析 通過BgaC-S和BgaC-A 引物擴(kuò)增副豬嗜血桿菌SH0165 菌 株,得 到1 791bp 的DNA 條 帶,將PCR 產(chǎn)物酶切后與載體pET-32a進(jìn)行連接后,轉(zhuǎn)入大腸埃希菌DH5α,挑取鑒定正確的重組菌進(jìn)行測序,測序結(jié)果與NCBI 數(shù)據(jù)庫中副豬嗜血桿菌SH0165 的BgaC 基 因 序 列(ACL31886.1)具 有100%的符合率。Blastp比對結(jié)果表明,副豬嗜血桿菌BgaC 氨基酸序列與NCBI數(shù)據(jù)庫中其他微生物的BgaC基因氨基酸序列的相似性不高。其中,副豬嗜血桿菌BgaC 氨基酸序列與溶血性曼氏桿菌A1/A6PKL10BgaC(EXI62636.1)的相似性最高為82%。ExPASy 在線分析表明,副豬嗜血桿菌BgaC氨基酸序列是屬于糖苷水解酶家族35(glycoside hydrolase family 35,CH35)的成員家族,EC 3.2.1.-,催化質(zhì)子的供體是谷氨酸(Glu),β-半乳糖苷酶有1個(gè)TIM 筒結(jié)構(gòu)和2個(gè)完整的β區(qū)域。
所有序列是通過NCBI數(shù)據(jù)庫下載的(NCBI數(shù)據(jù)庫網(wǎng)址:www.ncbi.nlm.nih.gov)。多序列比對是根據(jù)Cheng W[8]和Jeong J K[9],使用的軟件是Lasergene7.1和MEGA6。如圖1 所示,采用黑色三角形標(biāo)記半乳糖結(jié)合位點(diǎn)的氨基酸,采用黑色圓形標(biāo)記3 個(gè)芳香族殘基位點(diǎn)色氨酸240 和色氨酸243,酪氨酸455,環(huán)LA(Trp240-Asp255)和環(huán)LB(Glu448-Ala461)結(jié)構(gòu)采用黑色箭頭表示,守衛(wèi)在活性位點(diǎn)口袋狀區(qū)域的表面啞鈴型通道處,且發(fā)現(xiàn)3個(gè)芳香族殘基位點(diǎn)色氨酸240和色氨酸243,酪氨酸455是此通道的峽部。副豬嗜血桿菌BgaC 有7 個(gè)高度保守的區(qū)域,采用灰色方框標(biāo)記,2個(gè)氨基末端區(qū)域(domains 1 和2),3 個(gè) 小 的 中 心 區(qū) 域 群(domains 3,4和5),2個(gè)小的羧基末端區(qū)域(domains 6和7)和NHL 同源序列(the NHL repeat homologous domain)。
圖1 序列比較不同病原體的BgaC同源性Fig.1 BgaC homology of sequence comparison of various organisms
2.1.2 副豬嗜血桿菌BgaC氨基酸序列系統(tǒng)進(jìn)化分析 用Mega 6.0軟件對β-半乳糖苷酶基因的氨基酸序列與GenBank中已登錄的其他細(xì)菌的β-半乳糖苷酶基因氨基酸序列進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,如圖2所示,12類的β-半乳糖苷酶基因被聚為3個(gè)大類群,副豬嗜血桿菌SH0165BgaC 基因與溶血性曼氏桿菌PKL10 親緣關(guān)系最近,并且與糞腸球菌DENG1(BgaB)、肺炎鏈球菌TIGR4、科里氏桿菌屬PW2、蘇云金芽胞桿菌和糞腸球菌DENG1(LacZ)聚為一類,擬南芥、大熊貓、芽胞桿菌、鏈霉菌屬M(fèi)g1和多形擬桿菌VPI-5482聚為一類,而乳酸桿菌單獨(dú)成一類,與副豬嗜血桿菌SH0165的親緣關(guān)系最遠(yuǎn)。
2.2.1 重組pET-32a+BgaC 基因克隆與表達(dá) 將重組質(zhì)粒pET32a+BgaC轉(zhuǎn)入受體菌BL21,經(jīng)PCR鑒定轉(zhuǎn)化成功后,用IPTG 對重組菌進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá),收集菌體后進(jìn)行破碎,離心取上清作為粗體重組菌pET32a+BgaC。用His標(biāo)簽純化樹脂純化離心后的上清,最后洗脫的蛋白是攜帶His標(biāo)簽的BgaC蛋白。通過SDS-PAGE 檢測重組菌pET32a+BgaC和純化后BgaC 蛋白的表達(dá)情況(圖3),pET32a+BgaC重組菌表達(dá)蛋白為82.4ku。
圖2 不同來源β-半乳糖苷酶基因的氨基酸序列聚類分析(括號中為各物種氨基酸序列GenBank登錄號)Fig.2 The cluster analysis based on alignment of amino acid sequences among UPGMA and some publishedβ-Gal genes of other species in GenBank database.Amino acid sequences accession №in GenBank of different species is in brackets
圖3 SDS-PAGE鑒定誘導(dǎo)表達(dá)pET32a+BgaC重組蛋白和純化BgaC蛋白Fig.3 Identification of induced expression of pET32a+BgaC recombinant protein and purified BgaC protein by SDS-PAGE
2.2.2 測定純化BgaC蛋白的酶活性和pET-32a+BgaC重組蛋白的生物學(xué)特征 采用考馬斯亮藍(lán)法做出標(biāo)準(zhǔn)蛋白的標(biāo)準(zhǔn)曲線,R2=0.978 4。在OD 595nm 處分別測定pET32a+BgaC 重組蛋白和BgaC 純 化 蛋 白 的 含 量 為3.8 mg/mL 和0.7 mg/mL。按照酶活性測定方法取4μL BgaC純化蛋白(0.7mg/mL)作為底物來測定酶的活性,該酶的活性單位為5U,酶比活力為1 795U/mg。
取6μL 粗提的pET32a+BgaC 重組蛋白(3.8 mg/mL)測定pH5~9范圍內(nèi)的酶活性(圖4),pH6~7時(shí)的酶活性可達(dá)到180U,在此pH 范圍內(nèi)副豬嗜血桿菌的BgaC活性能夠起到較理想的催化作用。取6 μL 粗 提 的pET32a+BgaC 重 組 蛋 白(3.8 mg/mL)測定溫度在0℃~64℃的酶活性(圖5),溫度在30 ℃~37 ℃時(shí)的酶活性可達(dá)到180 U,30 ℃~37 ℃時(shí)副豬嗜血桿菌的BgaC活性的最佳溫度。
圖4 不同pH 的酶活性測定Fig.4 Detection of enzyme activities in various pHs
圖5 測定不同溫度的酶活性Fig.5 Detection of enzyme activities in various temperatures
β-半乳糖苷酶(EC 3.2.1.23)廣泛的應(yīng)用于乳品工業(yè)和分子生物學(xué)研究[10-11]。β-半乳糖苷酶是糖苷水解酶的一種,可以將乳糖等含β-半乳糖苷雙糖和寡糖降解為單糖,為生物提供可利用的碳素營養(yǎng)[12]。經(jīng)過長期的自然進(jìn)化,微生物為了適應(yīng)不同的生活環(huán)境,自然界的廣泛分布的β-半乳糖苷酶被分成了許多種類。根據(jù)氨基酸序列的相似性和系統(tǒng)進(jìn)化分析,β-半乳糖苷酶可以分別歸入糖苷水解酶1、2、35 和42 家 族(glycoside hydrolase family,GHF)[13]。家族之間的氨基酸序列相似性很低,每個(gè)家族具有獨(dú)特的保守結(jié)構(gòu)域。為了方便研究糖苷酶的作用機(jī)理,Henrissat B[14]提出了一種新的序列分類法,該方法具有方便獲取糖苷酶結(jié)構(gòu)、功能和作用機(jī)理信息,顯示酶之間相互進(jìn)化關(guān)系,預(yù)測未知酶的功能區(qū)域的優(yōu)點(diǎn)。隨著細(xì)菌全基因組測序的進(jìn)行,在更多的細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)了該酶。副豬嗜血桿菌BgaC是屬于CH35家族的成員,但其具體生物活性研究還沒有報(bào)道。Jeong J K 等[15]報(bào)道肺炎鏈球菌BgaC的序列比較,發(fā)現(xiàn)肺炎鏈球菌BgaC 氨基酸序列中存在7個(gè)高度保守的區(qū)域,2個(gè)氨基末端區(qū)域,3個(gè)小的中心區(qū)域群,2個(gè)小的羧基末端區(qū)域和NHL同源序列[9],通過構(gòu)建突變株研究發(fā)現(xiàn)BgaC蛋白在鏈球菌的黏附性和致病性方面具有重要意義。副豬嗜血桿菌BgaC氨基酸序列與肺炎鏈球菌TIGR4β-半乳糖苷酶的相似性雖然只有54%,但通過多序列比對,發(fā)現(xiàn)副豬嗜血桿菌BgaC也存在7個(gè)高度保守的區(qū)域,與肺炎鏈球菌報(bào)道的一致。越來越多的證據(jù)證明感染肺炎球菌可以導(dǎo)致宿主中聚糖發(fā)生變化,肺炎鏈球菌可以通過胞外糖苷酶活性修飾N 端-連接的聚糖,O 端-連接的聚糖和氨基多糖途徑。鏈球菌和副豬嗜血桿菌都是上呼吸道病原菌,且都是營養(yǎng)苛刻性細(xì)菌,菌落形態(tài)相似,豬只感染后臨床癥狀會(huì)出現(xiàn)關(guān)節(jié)積液,胸膜炎和腦膜炎的癥狀,預(yù)測肺炎鏈球菌與副豬嗜血桿菌在β-半乳糖苷酶具有類似的功能,值得我們進(jìn)一步研究。
1998年β-半乳糖苷酶被中國食品添加劑標(biāo)準(zhǔn)化委員會(huì)列為食品添加劑新酶種。目前應(yīng)用于乳品工業(yè)的β-半乳糖苷酶多來自于酵母、曲霉菌或乳酸菌。Nguyen等提純了嗜酸乳桿菌R22菌株的LacLM,通過研究酶學(xué)特性確認(rèn)該酶可用于乳品工業(yè)[16]。BgaC除參與乳糖的消化吸收外,也是水解蛋白多糖的重要水解酶。主要用于乳品工業(yè),加入乳品中可使乳糖分解為半乳糖和果糖而促進(jìn)其消化的酶,降低乳糖結(jié)晶析出并增加甜度。Campuzano S等[4]對慢型鏈球菌NCTC 12261菌株進(jìn)行β-半乳糖苷酶的研究,發(fā)現(xiàn)β-半乳糖苷酶由2 411個(gè)氨基酸編碼,分子質(zhì)量為268ku,酶比活力為2 500U/mg,最適pH為6.0~6.5,最適溫度為30 ℃~40 ℃。本研究發(fā)現(xiàn)原核表達(dá)的副豬嗜血桿菌β-半乳糖苷酶分子質(zhì)量為82.4ku,酶比活力為1 795 U/mg,最適pH 為6.0~7.0,最適溫度為30 ℃~37 ℃。與慢型鏈球菌NCTC 12261菌的BgaC進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)副豬嗜血桿菌BgaC 蛋白的分子質(zhì)量較小,但酶比活力、最適pH 和最適溫度的差別不是很大。副豬嗜血桿菌BgaC蛋白具有糖苷酶活性,能夠介導(dǎo)糖蛋白的降解。
β-半乳糖苷酶可用作酶免分析的標(biāo)記酶,中性β-半乳糖苷酶(SA-β-gal)是一種很好的可用于體內(nèi)外衰老研究的生物學(xué)標(biāo)志[3]。β-半乳糖苷酶基因在基因工程中的應(yīng)用包括作為報(bào)告基因構(gòu)建載體轉(zhuǎn)基因研究和基因治療等多個(gè)分子生物學(xué)研究領(lǐng)域。目前分子生物學(xué)研究中使用的克隆載體一般都具有一段大腸埃希菌β-半乳糖苷酶的啟動(dòng)子及其α肽鏈的DNA 序列,可通過藍(lán)白菌的顏色變化篩選出陽性重組載體菌[17]。在基因治療方面,F(xiàn)ukui T 等[18]為了探討基因治療用于口腔癌的可能性,將含β-半乳糖苷酶基因的腺伴隨病毒載體轉(zhuǎn)染人口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞株,通過檢測β-半乳糖苷酶的表達(dá)情況來研究轉(zhuǎn)染的效率。Terra V S等[19]研究表明肺炎鏈球菌中β-半乳糖苷酶能夠從宿主糖苷類代謝中獲得能量,證明宿主體內(nèi)有效的糖蛋白降解與肺炎球菌的毒力有關(guān),該蛋白可用于分子診斷和亞單位疫苗的候選基因。副豬嗜血桿菌β-半乳糖苷酶是分子質(zhì)量較小的糖苷酶蛋白,在氨基酸序列上存在高度保守的區(qū)域,該蛋白也具有較高糖苷酶活性,因此,在生物技術(shù)領(lǐng)域具有廣泛的應(yīng)用前景。
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